Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g114660.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XYK3_CYNCS)
Sequence	ATGTTCACGCTGGCGAGCTTCCCCACGGCTGCGCCGTCGCCTGCGTCGAACTCATGCTGC CGCCACCAGCCCCAATTTCAAACCGTCAAAGTTAGTCCAAGACCCAACAAATTACGCTCG TTTGCAACTACCTCCGTTTCAAAATCGGCAGGTTCAATTTGCACCCCAACACCTGAGGAA GATTCTATAACTGCAAAATCAACTTTGAAGAATCAGCTCAAGAACCCATTAACGCTATCC GAAGAGATCACGCAACTATGCGAAACCAAAAGTTTGTCGGAAGTTTTCCGTACATTTCAA GAATACCTCGAAAACGCCTTCTACCACTCGTCGGAAAAATCCGAGGCCTTAGGCGTACTC TTACAAGCATGTGGTAAACAGAAGGACATTGAAACGGGTCGTAAAGTCCATGAAATGGTT ACTTCGTTGACCCGATCGAAAGATGACGTTATACTCTGTACGCGGCTCATCACGATGTAC TCCATGTGTGGGTATCCTTCTGATTCTCGCTCTGTTTTCCATCAATTACGAAGCAAGAAA CTGTACCAATGGAATGTTCTTATGAGTGGGTACACAAAGAATGAACTTTGGGTTGCTGTT ATTTGTTTGTTTATTGAGTTGATGACTTCAACCCAGGAAAAGCCAGACAATTTTACCTTT CCTTTGGTTATCAAGGCTTGTGGAGGGGTTCTTGATGTGGGTATGGGGAAAGCTATTCAT GGGATGGCATCAAAGATGGGTTTGGTTGGCGATGTCTTTGTAAGCAATGCGTTAATTTCC ATGTATGGGAAGTTTGGTCTTGCTGAGGAAGCTATGAAAGTGTTTGAGTATATGCCTGAG AGGAATCTGGTTTCGTGGAACTCCATGATTTCTGTGTTCTCAGCGAATGGATATATTGAA CAAAGTTTTGATCTTTTCAGAAATATATTTACAGGGGATGAAGTTCTTGTTCCAGACACG ACTACCATGGTTATTATGCTGCCAATTTGTGCAGCAGCAGAAGAAGTGGAATTTGGGAAG ATTATTCATGATTTAGCTGTAAAGCTAGGATTATCTGACGAGTTAACAGTGAATAATTCT TTAGTGGATATGTATTGCAAAGTTGGATACCTTTCTGATGCACAAATTCTGTTTGAGAAA AATGAGAGCAAAAGTGCGGTCTCTTGGAACTCCATTATCGGGGGTTATTCAAGAGAAGGA GATGATAGAGGAACATTTCATCTTATGAGAAGGATGCAAAGTACTGAGGAGTACATGAAG GCGAATGAGGTTACTCTACTGAATGTTTTGTCCGTTTGCCTAGAGGAGTCAGAGCAGTTG ATAGTGAAAGAACTGCATGGCTACTCGCTTAGAAATGGTCTTGAATACCATGAGTTGTTA ACAAATGCTTTTATAGCTGCCTATGCGAACTGTGGATTGCTCAGATATGCGGAGCTTGTA TTCCACGGAGTGGCGAACAAGACAGTAAGCTCTTGGAATGCACTGATAAGAGGCTATGCT CAGAATGAGGATCCATCTAAGGCTTTGACTCTGTCCTCTAAAATGATGAAGTCTGGCTTG CGTCCTGACTGGTTCACTATTGGTAGCCTTCTGTTTGCTTGTTCCCACTTAAAACTGCTA CATTGTGGTACACTAGTTCACGGTTTTGTACTTAGAAATAGTCTAGAAACAGATATGTCT ACACTAGTTTCCCTAGTTTCATTCTACATGACTTGTGGAAAACCAGAGCTAGCACAACGT CTGTTTGACAGGATAGAAGATAAAAATGTGGTATCCTGGAACGTAATGATAGCTGGTTAT TTGCAGAATGCACTACCAGATAAAGCCTTTTGTCTGCTTCGTGATATGGTATCTCATAGA TTTCAACCTGATGAAATTTCTGTGACAAGTGTTTTAGGGGCTTGTTCAACATTGTCTGCT GTCAGGCTGGGGAAAGAAGTTCATTGCTTTGCACTGAAATCCAACCTTATAGAGGATAGT TTTGTCCATTGCTCAATCATAGACATGTATGCAAAATCTGGATTCTTAGGAATGTCCAAG TATGTTTTTGACTATATTCCACTCAAAGATATAGCATCATGGACAGCTATGATTACTGGA TATGCAGTTCATGGACTTGGAATGGAGGCCATCGAGCTATTTCAGGAAATGCAGAAATCG GGCTTCATCCCAGCCAGCTTGACATATGTCTCTATTTTAATGGCATGTAACCATGCGGGG CTCATTGAAGAAGGTCGGCAATATGTTAAAGAGATGCAGACATTGCATGGTCTCAAACCT GAATTGGAGCATTATGCATGTGTGATTGACATGCTGGCTCGTGCTGGACAGTTTGATGAT GCCCTAAATCTCATGGCTGAGATGCCTATGCAGCCAGATTCTCAAATTTGGTGTTCGTTG CTCAATTCATGTATAGTTCACGCCCAGTCAAATCTTGGGATGAAATGCGCTAACAAGTTA CTGGAATTGGAACCAAAGAGAGCAGAAATCTATGTTTTAGTATCCAATTTTTTTGCTAGA TATGGGGACTGGGACTCTGTTAGACAGGTGAGGGACAAGATGAAGGAATTAGGCTTGCAA AAAGAAATTGGTTGCAGTCAGATTGAAATAGGAGGAAAAAACTATAACTTTGCTGTTGGC AATATGTTTTCCAAGCCATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g114660.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XYK3_CYNCS)
Sequence	MFTLASFPTAAPSPASNSCCRHQPQFQTVKVSPRPNKLRSFATTSVSKSAGSICTPTPEE DSITAKSTLKNQLKNPLTLSEEITQLCETKSLSEVFRTFQEYLENAFYHSSEKSEALGVL LQACGKQKDIETGRKVHEMVTSLTRSKDDVILCTRLITMYSMCGYPSDSRSVFHQLRSKK LYQWNVLMSGYTKNELWVAVICLFIELMTSTQEKPDNFTFPLVIKACGGVLDVGMGKAIH GMASKMGLVGDVFVSNALISMYGKFGLAEEAMKVFEYMPERNLVSWNSMISVFSANGYIE QSFDLFRNIFTGDEVLVPDTTTMVIMLPICAAAEEVEFGKIIHDLAVKLGLSDELTVNNS LVDMYCKVGYLSDAQILFEKNESKSAVSWNSIIGGYSREGDDRGTFHLMRRMQSTEEYMK ANEVTLLNVLSVCLEESEQLIVKELHGYSLRNGLEYHELLTNAFIAAYANCGLLRYAELV FHGVANKTVSSWNALIRGYAQNEDPSKALTLSSKMMKSGLRPDWFTIGSLLFACSHLKLL HCGTLVHGFVLRNSLETDMSTLVSLVSFYMTCGKPELAQRLFDRIEDKNVVSWNVMIAGY LQNALPDKAFCLLRDMVSHRFQPDEISVTSVLGACSTLSAVRLGKEVHCFALKSNLIEDS FVHCSIIDMYAKSGFLGMSKYVFDYIPLKDIASWTAMITGYAVHGLGMEAIELFQEMQKS GFIPASLTYVSILMACNHAGLIEEGRQYVKEMQTLHGLKPELEHYACVIDMLARAGQFDD ALNLMAEMPMQPDSQIWCSLLNSCIVHAQSNLGMKCANKLLELEPKRAEIYVLVSNFFAR YGDWDSVRQVRDKMKELGLQKEIGCSQIEIGGKNYNFAVGNMFSKP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g114660.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XYK3_CYNCS)
Sequence	ATGTTCACGCTGGCGAGCTTCCCCACGGCTGCGCCGTCGCCTGCGTCGAACTCATGCTGC CGCCACCAGCCCCAATTTCAAACCGTCAAAGTTAGTCCAAGACCCAACAAATTACGCTCG TTTGCAACTACCTCCGTTTCAAAATCGGCAGGTTCAATTTGCACCCCAACACCTGAGGAA GATTCTATAACTGCAAAATCAACTTTGAAGAATCAGCTCAAGAACCCATTAACGCTATCC GAAGAGATCACGCAACTATGCGAAACCAAAAGTTTGTCGGAAGTTTTCCGTACATTTCAA GAATACCTCGAAAACGCCTTCTACCACTCGTCGGAAAAATCCGAGGCCTTAGGCGTACTC TTACAAGCATGTGGTAAACAGAAGGACATTGAAACGGGTCGTAAAGTCCATGAAATGGTT ACTTCGTTGACCCGATCGAAAGATGACGTTATACTCTGTACGCGGCTCATCACGATGTAC TCCATGTGTGGGTATCCTTCTGATTCTCGCTCTGTTTTCCATCAATTACGAAGCAAGAAA CTGTACCAATGGAATGTTCTTATGAGTGGGTACACAAAGAATGAACTTTGGGTTGCTGTT ATTTGTTTGTTTATTGAGTTGATGACTTCAACCCAGGAAAAGCCAGACAATTTTACCTTT CCTTTGGTTATCAAGGCTTGTGGAGGGGTTCTTGATGTGGGTATGGGGAAAGCTATTCAT GGGATGGCATCAAAGATGGGTTTGGTTGGCGATGTCTTTGTAAGCAATGCGTTAATTTCC ATGTATGGGAAGTTTGGTCTTGCTGAGGAAGCTATGAAAGTGTTTGAGTATATGCCTGAG AGGAATCTGGTTTCGTGGAACTCCATGATTTCTGTGTTCTCAGCGAATGGATATATTGAA CAAAGTTTTGATCTTTTCAGAAATATATTTACAGGGGATGAAGTTCTTGTTCCAGACACG ACTACCATGGTTATTATGCTGCCAATTTGTGCAGCAGCAGAAGAAGTGGAATTTGGGAAG ATTATTCATGATTTAGCTGTAAAGCTAGGATTATCTGACGAGTTAACAGTGAATAATTCT TTAGTGGATATGTATTGCAAAGTTGGATACCTTTCTGATGCACAAATTCTGTTTGAGAAA AATGAGAGCAAAAGTGCGGTCTCTTGGAACTCCATTATCGGGGGTTATTCAAGAGAAGGA GATGATAGAGGAACATTTCATCTTATGAGAAGGATGCAAAGTACTGAGGAGTACATGAAG GCGAATGAGGTTACTCTACTGAATGTTTTGTCCGTTTGCCTAGAGGAGTCAGAGCAGTTG ATAGTGAAAGAACTGCATGGCTACTCGCTTAGAAATGGTCTTGAATACCATGAGTTGTTA ACAAATGCTTTTATAGCTGCCTATGCGAACTGTGGATTGCTCAGATATGCGGAGCTTGTA TTCCACGGAGTGGCGAACAAGACAGTAAGCTCTTGGAATGCACTGATAAGAGGCTATGCT CAGAATGAGGATCCATCTAAGGCTTTGACTCTGTCCTCTAAAATGATGAAGTCTGGCTTG CGTCCTGACTGGTTCACTATTGGTAGCCTTCTGTTTGCTTGTTCCCACTTAAAACTGCTA CATTGTGGTACACTAGTTCACGGTTTTGTACTTAGAAATAGTCTAGAAACAGATATGTCT ACACTAGTTTCCCTAGTTTCATTCTACATGACTTGTGGAAAACCAGAGCTAGCACAACGT CTGTTTGACAGGATAGAAGATAAAAATGTGGTATCCTGGAACGTAATGATAGCTGGTTAT TTGCAGAATGCACTACCAGATAAAGCCTTTTGTCTGCTTCGTGATATGGTATCTCATAGA TTTCAACCTGATGAAATTTCTGTGACAAGTGTTTTAGGGGCTTGTTCAACATTGTCTGCT GTCAGGCTGGGGAAAGAAGTTCATTGCTTTGCACTGAAATCCAACCTTATAGAGGATAGT TTTGTCCATTGCTCAATCATAGACATGTATGCAAAATCTGGATTCTTAGGAATGTCCAAG TATGTTTTTGACTATATTCCACTCAAAGATATAGCATCATGGACAGCTATGATTACTGGA TATGCAGTTCATGGACTTGGAATGGAGGCCATCGAGCTATTTCAGGAAATGCAGAAATCG GGCTTCATCCCAGCCAGCTTGACATATGTCTCTATTTTAATGGCATGTAACCATGCGGGG CTCATTGAAGAAGGTCGGCAATATGTTAAAGAGATGCAGACATTGCATGGTCTCAAACCT GAATTGGAGCATTATGCATGTGTGATTGACATGCTGGCTCGTGCTGGACAGTTTGATGAT GCCCTAAATCTCATGGCTGAGATGCCTATGCAGCCAGATTCTCAAATTTGGTGTTCGTTG CTCAATTCATGTATAGTTCACGCCCAGTCAAATCTTGGGATGAAATGCGCTAACAAGTTA CTGGAATTGGAACCAAAGAGAGCAGAAATCTATGTTTTAGTATCCAATTTTTTTGCTAGA TATGGGGACTGGGACTCTGTTAGACAGGTGAGGGACAAGATGAAGGAATTAGGCTTGCAA AAAGAAATTGGTTGCAGTCAGATTGAAATAGGAGGAAAAAACTATAACTTTGCTGTTGGC AATATGTTTTCCAAGCCATAA