Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g113740.3.1
CDS Infomation	anaphase-promoting complex subunit 8 (AHRD V3.3 *** AT3G48150.2)
Sequence	ATGTGGCTACGCCGACTGTACCGGAGGATGATAACGAAGCCATTGACAGCGATTTTTACC TGCTCGCTAAGTCCTACTTCGATTGTCGGGAGTACCGGCGGGCAACCCATGTGCTCCGTG ATCAGACTGGCAAGAAAGCTGTGTTTTTGCGCTGTTATGCCCTTTTCTTGTGTAGAAATG AATCATCAACCAAAAGAAGAGAATACATATCAGAATAGTGCCGGTGAAAAGAGAAAAGAA GAGGAGATGATAGAACTCGAGGGACCCTTAGGCAAGAGCGATGTTGTGAACCTCGAACTG GTTTCTATTGAGCGGGAGTTGTCTGCACTTCGAAAAAATGGAAGCATTGATTCCTTTGGC CTGTACTTGTATGGTCTTGTTCTTAAGCAGAAAGGCAGTGACAATCTTGCTAGGACAGTT CTTGTTGATTCAGTAAATAGCTACCCGTGGAACTGGAGTGCTTGGTCTGAGCTGCAGTTG TTGTGCACCACAGCTGAGACATTGAACAGTTTAAACCTTAATAACCACTGGATGAAAGAC TTCTTTCTAGCCAATGCTTACCAAGAGCTTCGTATGCACAGTGAGTCATTGGTGAAGTAT GAAAATTTGCAAGGGACTTTCAGTTTTAGCAATTACATCCAGGCCCAGATTGCTAAAGCT CAATACAGTCTTAGAGAATTTGAACAAGTAGAAGTTATATTTGAAGAACTTCTAAGAAAT GACCCTTACAGGATTGAAGACATGGATATGTATTCCAATGTGCTATATGCAAAGGAATGT TTTTCAGCCTTAAGTTATCTTGCACATAGGGTATTTTTAACGGATAAATACAGGCCAGAG TCTTGTTGCATTATTGGGAACTATTACAGTTTGAAGGGGCAGCATGAGAAATCTGTAATG TATTTTCGGAGGGCTCTTAAGTTGAATAAAAATTATTTATCAGCTTGGACACTTATGGGT CATGAGTACGTAGAGATGAAAAACACTCCAGCAGCAGTTGATGCCTATAGGCGGGCTGTG GACATAAATCCATGTGATTATCGAGCCTGGTATGGATTAGGACAAGCATATGAGATGATG GGGATGCCATTTTATGCTCTCCATTATTTTAAAAAGTCCGTGTTCTTGCAGCCGAGTGAT TCTCGATTATGGATTGCAATGGCCCAGTGTTTTGAAACGGAACAGCTTCATATGCTTGAG GAGGCAATAAAATGTTACAGAAGGGCTGCAAATTGTAATGACAGAGAAGCAATTGCTCTT CACCAGCTAGCAAAACTGCATGCTGAACTTGGTCGTTCCGAAGAAGCTGCATTTTACTAC AAGAAAGATTTGGAGATTATGGAAGCTGAAGAACGGGAAGGTCCTAACCTCGTTGAAGCT TTAATGTTTCTTGCAAGATATTATAAAGCTCAAAAGAGATTTGAAGATGCAGAGGTTTAT TGCACCCGCCTTCTAGATTATTCTGGCCCAGAGAAGGAAACAGCAAAGAGTCTACTTAGA GGAATAAGATATGAAATGGATGTTGAGCATCTTCCACCCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g113740.3.1
PEP Infomation	anaphase-promoting complex subunit 8 (AHRD V3.3 *** AT3G48150.2)
Sequence	MWLRRLYRRMITKPLTAIFTCSLSPTSIVGSTGGQPMCSVIRLARKLCFCAVMPFSCVEM NHQPKEENTYQNSAGEKRKEEEMIELEGPLGKSDVVNLELVSIERELSALRKNGSIDSFG LYLYGLVLKQKGSDNLARTVLVDSVNSYPWNWSAWSELQLLCTTAETLNSLNLNNHWMKD FFLANAYQELRMHSESLVKYENLQGTFSFSNYIQAQIAKAQYSLREFEQVEVIFEELLRN DPYRIEDMDMYSNVLYAKECFSALSYLAHRVFLTDKYRPESCCIIGNYYSLKGQHEKSVM YFRRALKLNKNYLSAWTLMGHEYVEMKNTPAAVDAYRRAVDINPCDYRAWYGLGQAYEMM GMPFYALHYFKKSVFLQPSDSRLWIAMAQCFETEQLHMLEEAIKCYRRAANCNDREAIAL HQLAKLHAELGRSEEAAFYYKKDLEIMEAEEREGPNLVEALMFLARYYKAQKRFEDAEVY CTRLLDYSGPEKETAKSLLRGIRYEMDVEHLPP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g113740.3.1
Transcript Infomation	anaphase-promoting complex subunit 8 (AHRD V3.3 *** AT3G48150.2)
Sequence	AAGTAATTGGAAAACCCAAATATCATGACGATGATAACGTCTTAGAAAGGTCAACATTTC CACGAAGATCTACTTAATCACAAAATGAATTTATAATTGATAATGTTTTTTGCTAAAATT ATTTATATTAAACCTAAATTCCTCCAACAATGATAGCTCGTCTTCAAAAATTGTTGAGCC ACTTTCATTGATGATGGTGAACGCGAATTGAAAGCCCTACATCAAAGAACACGAACGGAA TTCTAGGATTCCACGGTTGAAATGATGTCATTGGAGTCGCGTTAATCTGGATAGAAATTT CCGCTTGCTAGATAGAAAATCACCCATAAGACGTTAAATTACTTCGTCATTGATAGAAAA TCTAAAAATCGTTAATTACAGTAAAATTCTGATCAAATCAACTTTTTTTTTTGAATTGTT TAGTCCCAAAATTGATTGGAGATTTACATACACAACATTTAAAATATTTTTCTTGAAAAA GATACTGAAAATTGATGGAAATCAAGGAGGATACAAGAAATAGCTTTGATTTGTTGAGCC AAGACAACAAATGAATGAATGAATATTTTTTGATTTAAAAATAAAATAAAAAATAATAAA TATTTTGTTAGCTCAAAAATACGATGATATAATAAAAATGTATGTTATTTTAAAGTATAA CGAATGCTATATTCATACTAATTTTGAAAATTAAAGGTATATTTAATTCTTCTTCATTTT TTTATTAATAATTTTGAATAAAAAACGTTTAATCAAAACAATTTATTATTAAGTCGATGG GTTTAATAGAAATATGAAAATTAGTAAATGTAAAATACAGACATGTTTAATTTATTTCTT AACAAGTTACAAAACTTTGAAATATAATTTGATGCTATCAAGAATGGAGTACAAAACCAT ATTTCATCCAGCGCAGCAGTAGCTACAAGTACAAAAATTTGAAAAAGCAGCTAACCCGCG CAGTCATCTTGCCGGCGGCGACCTCAATTCGCCCATTTTATCCAAATTTGTGTTCTAACT CCGGCGAGCCCTTCCTATTCTCGCCGTCAATTTAATAGTAGCAGTTTGTATGTAAAAGTT TTACTACTACACAGATCCATCGAATGGGTATTAAAGAAAATTGCAGAAACGAGCTCCGAG CCGCCGTCCGTCAGCTCAGTGACCGCTGTCTCTACTCAGCCTCCAAATGGTATATCTTCT TTCTCCTAAAAAACCCTAAAAATTTCACCTTTTTCTTGAAATCTTAAATTGGGATTTTCC ATTGGGCACAGGGCTGCAGAACAGTTAGTGGGAATTGAGCAAGACCCAGCAAAGTACACC CCGTCTCACACAAGATTCCAGCGTGGAAGCTCCAGCATCCGTCGCCGGTTCCGCACAGCC ACGGAAGCTGCTTTCACTTCAACTCCTGCTGCGGGAGTATCACATGTGGCTACGCCGACT GTACCGGAGGATGATAACGAAGCCATTGACAGCGATTTTTACCTGCTCGCTAAGTCCTAC TTCGATTGTCGGGAGTACCGGCGGGCAACCCATGTGCTCCGTGATCAGACTGGCAAGAAA GCTGTGTTTTTGCGCTGTTATGCCCTTTTCTTGTGTAGAAATGAATCATCAACCAAAAGA AGAGAATACATATCAGAATAGTGCCGGTGAAAAGAGAAAAGAAGAGGAGATGATAGAACT CGAGGGACCCTTAGGCAAGAGCGATGTTGTGAACCTCGAACTGGTTTCTATTGAGCGGGA GTTGTCTGCACTTCGAAAAAATGGAAGCATTGATTCCTTTGGCCTGTACTTGTATGGTCT TGTTCTTAAGCAGAAAGGCAGTGACAATCTTGCTAGGACAGTTCTTGTTGATTCAGTAAA TAGCTACCCGTGGAACTGGAGTGCTTGGTCTGAGCTGCAGTTGTTGTGCACCACAGCTGA GACATTGAACAGTTTAAACCTTAATAACCACTGGATGAAAGACTTCTTTCTAGCCAATGC TTACCAAGAGCTTCGTATGCACAGTGAGTCATTGGTGAAGTATGAAAATTTGCAAGGGAC TTTCAGTTTTAGCAATTACATCCAGGCCCAGATTGCTAAAGCTCAATACAGTCTTAGAGA ATTTGAACAAGTAGAAGTTATATTTGAAGAACTTCTAAGAAATGACCCTTACAGGATTGA AGACATGGATATGTATTCCAATGTGCTATATGCAAAGGAATGTTTTTCAGCCTTAAGTTA TCTTGCACATAGGGTATTTTTAACGGATAAATACAGGCCAGAGTCTTGTTGCATTATTGG GAACTATTACAGTTTGAAGGGGCAGCATGAGAAATCTGTAATGTATTTTCGGAGGGCTCT TAAGTTGAATAAAAATTATTTATCAGCTTGGACACTTATGGGTCATGAGTACGTAGAGAT GAAAAACACTCCAGCAGCAGTTGATGCCTATAGGCGGGCTGTGGACATAAATCCATGTGA TTATCGAGCCTGGTATGGATTAGGACAAGCATATGAGATGATGGGGATGCCATTTTATGC TCTCCATTATTTTAAAAAGTCCGTGTTCTTGCAGCCGAGTGATTCTCGATTATGGATTGC AATGGCCCAGTGTTTTGAAACGGAACAGCTTCATATGCTTGAGGAGGCAATAAAATGTTA CAGAAGGGCTGCAAATTGTAATGACAGAGAAGCAATTGCTCTTCACCAGCTAGCAAAACT GCATGCTGAACTTGGTCGTTCCGAAGAAGCTGCATTTTACTACAAGAAAGATTTGGAGAT TATGGAAGCTGAAGAACGGGAAGGTCCTAACCTCGTTGAAGCTTTAATGTTTCTTGCAAG ATATTATAAAGCTCAAAAGAGATTTGAAGATGCAGAGGTTTATTGCACCCGCCTTCTAGA TTATTCTGGCCCAGAGAAGGAAACAGCAAAGAGTCTACTTAGAGGAATAAGATATGAAAT GGATGTTGAGCATCTTCCACCCTGATAAGTTTCTTTTTCCTTAACAAACCTGTGTATGAA TTTTGAGACACCAACTGAACAAACAGCTAAGAAGCTGGACAGTTCAGTCGAACAGCCAAA AAGTTGAGAATCTAAGCTGGCACCTTCGTTAAAAGTTATCTTGTTGATTTCATGATCAAA GAAACGTCTCTGTGGTATGAGATATTTCCCTTGTTTGAAACGCTCAGGAACAAGCTTAGG AGCAAAAGAATGCAGATATAGTTATGTATCTTAGTTTCTCCTATTACATGTGGTTCTGTT TTTCAGATGATTTCATGGACTACCGCCATGTCCGCATTTTATATAATTAATGTGATACAT ACAGGATAAACTGCATGCTTAGAGTAGTTGGTTGCACCTTGAGTTTCATTCAGAAATACA TTTGACATACAAACTGTCACAGAGGAACCTATTTTACAGACACATCGATACATCCAGCAC AACAGATTACCGTCATGGTCACATTACATTCCAAATCACACCATTATAATGATGAAGTCT GATAACTTTATTCTAACCAAGTTACAGGTGCTTAATTCTTTTGAGGGTCACTGAAGAACC TATTAAGGTTAGGGAAAATTTCTGGTGGCCTACTACGAGCAAACTTTCTGATGGCATGTT CAGCATATTTCTCTCCCTCCTCAAAATTCTCCAGGATGCCAGCAGCTCTTTTCTCCTTGT TTACCCTGCCCACGAAAAAAGAAAGAATCCATAACCTGCTTCCATCTGCCTGTCCTAAAT TGAGTACCTGGAAGTGCCTACTACACTATTAACAAGGAATTGACCAACAGAAATGCAAAC TACTCGTATTTCCAGGGTTGATACGCATATTACGAACCAATTGAAGTCCACAGATTCCGA TGGCAACTCCAACGGCAGCAAATAGTGGATAAACCTACTCGATCATTCATTTTGCTTAGA AATTCCCCAAAAAGTTGAGAAAACAAATAGTAATAACGTGGAAAGATAGAAAATACCTCG GGCCTGAGCCAGCGATTAGTAGCCATGGAACAAGACGAAGAAGTTTGGTTTGATTACAGA GAGACCGATGAGATAAAGATTGAGGAGGAGTAAGAACAATAATGGGAGCAATAAACAACT TTATCTTGTTTCAGAAAAAAAAAATAAACTAATATTTTTTAAGGAAGATGAT