Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g113610.3.1
CDS Infomation	Protein CLP1 homolog (AHRD V3.3 - W1PAU8_AMBTC)
Sequence	ATGGCGTCCTTTGTCGACGATGAGTTTCAATCAGCTAACATATTCATACCGGAGGAGTGG TCCGATGCTGCCGACTCTGTAGCCTATGATTCTAACACTTCGCCGCCGCCGGTTGCGTTT GTCTGCGGTCCCAAAAATAGCGGCAAAACCACTTTCTCTCGCGTCCTTGTCAATGTTCTT CTTCAGAGATACAAGAAAGTCGCTTATTTGGATACAGATGTCGGGCAGACAGAGTTCACT CCACCTGGTTTATTATCGCTTACCACAATTGACAAAATAACTTCAGATCTGTCAATTCCA TGCCTAAAAACTCCTGAGAGATGCTTCTTTTTTGGTGACATATCCTCTAAAAGGGATCCC AAAACATATTTGGCTTATATTTTTGCCTTGTATGATCACTACCGGAGAACGTACCTGTTG AGCAATGGCGGAAGTCCTGGAAATGCTGGGGTGCCTCTTGTCATTAACACAACGGGCTGG GTCAAAGGTATTGGCTATGACATTCTTGTGGATATTATCAAATACATCTCTCCTACACAT GTTGTTAAGATTTGCATATCGTCTGTGAGCAAGAACCTTCCGGCTGGTGCATTTTGGTTG GATGATGATAATAGTGATGTTCCAACTGTAGTTGAGGTCAACTCTGCTCGTCGGGACTCT TTTAACAGATCGGTTCTTGTACAGAAGGATGCACGTCTTTTGCGTGATCTACGTGTCATG GCCTATTTCAGACAATGCTTTCCAAGTGATATGAAAATCACAACAATCAAGGAACTCTCT CGAGCATTAGCTGCTCACCCTCCATATGAGATTCCTATATCAAGTATCAAAATTAAACAC CTTCATTGTGAGGTTCCTAAGAATGAGGTTTTGTACAGCTTGAATGCAACTATTGTTGGC TTGGCAGTTGATTCTGAAAATTTTCCTGACTGCATGGGCTTGGGAATCGTGCGTGCCATT GACACTCTCAAGCACGTACTCTATGTACTTACCCCTGTCCCAAAAAGCAGTCTGCAGAAG GTGGATCTTCTGTTGCAGGGCTTTGTCGAAATTCCAACTTGTTTGTTGCAGGTACAAGGC TGCATCTCACCTTACATGTCTGCCGATGTATTGCCTTCAGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g113610.3.1
PEP Infomation	Protein CLP1 homolog (AHRD V3.3 - W1PAU8_AMBTC)
Sequence	MASFVDDEFQSANIFIPEEWSDAADSVAYDSNTSPPPVAFVCGPKNSGKTTFSRVLVNVL LQRYKKVAYLDTDVGQTEFTPPGLLSLTTIDKITSDLSIPCLKTPERCFFFGDISSKRDP KTYLAYIFALYDHYRRTYLLSNGGSPGNAGVPLVINTTGWVKGIGYDILVDIIKYISPTH VVKICISSVSKNLPAGAFWLDDDNSDVPTVVEVNSARRDSFNRSVLVQKDARLLRDLRVM AYFRQCFPSDMKITTIKELSRALAAHPPYEIPISSIKIKHLHCEVPKNEVLYSLNATIVG LAVDSENFPDCMGLGIVRAIDTLKHVLYVLTPVPKSSLQKVDLLLQGFVEIPTCLLQVQG CISPYMSADVLPSA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g113610.3.1
Transcript Infomation	Protein CLP1 homolog (AHRD V3.3 - W1PAU8_AMBTC)
Sequence	TTGGACAAATTTAATGTGAAGAGAGATTCAATAAGATGTCTATAAATAAAGTGTTTTTCA TTAACGAAAATATTATTGACTTTCAAAATAATAAAGTTATAACTGAATAATATGAATTTA AAATTAAAGTCCTAGTTAAAATCGATTTCATAATTTTAAAATATTATACACTAATTAAAT TAAAGCTAAACAAAAGAAATAATTTTTTTTGAACATGTTTGAAGCAGGCACATCGACATA GATGTGCTTGCTTCAACGCGAATTAAAAACTAAAAGTCATAACTAAAGTGAATCCCATAA TTTTGAAAATATTTATACAATAATCGAATTAAAAATAAAATTAAAAAATATACATTTTTC AGAAACACACTAAAGCAGATACATCGACGAACATGTTTGTTTTAGCATATAGTCTCATAT ACAATAAGAAAAAATACTTTAAATATTTAAACCCTCTCGCGTTTGACTATGATTTTAAAA GTTTTTTTAAAAAAATTAGAAATATATTTATTGTTCATGAAATTTGATATATTTTTTAAA ATTTATTTTCGTAAAGTTTACAAAATCCTAAAATTTATCCTCCTTTCCAAGTAAAAACAT GTTGAAAATTGGTTTAAAATATAAAAAAGTTATTAAGAAAGTTCATATATTTATTTTTAA AATTTTAATTAAATTTATGATCAAACATTAATTTAAATGTTAAAAGTATATGAGTTGACT CAAGCCTAACATAAGTGCTAATTATTTATTTTAAATCGTTAACATTCAATTTCAAAAATT CATAAAGATTTGCAAGATCGTTAATGATTAATCATCAAAGCTCAGAAGTTTTGCCAATAG TTTAATTTACATAAGGATTTGCAAGATCGTTAATGATTAATCATCAAAGCTCAGAAGTTT TGCCAATAGTTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGGTGAACTC ATGCTTTGATTTGAAGATGAAGAGTGTCCACCAAGGACCAATGCACGTTAATCAAGTATG TTATCTAATACCAATTCCTGTGATAATTTTATGAAGCATAAAATTATAAAACTAATGTAT TAACTTATAAATATGAATTAAATGACCTTGCTAAATGAAGTTTACTTTGTGAATTAGCGA TTTTAAATTTCATGTCGCAAGTTTAAGATCAGTCATCCTCTCATATTGAAAAATGCACGC TCTAAATCATCTCAATTAAATAGTTTAAATCTTTGGTACTTCATAAAATATATCTTATAT AAATATATATAATTTTTTTCAAAGAATATAAATTGAACAAGAATATTTTATTAAATTGAA GTGTTTTATTAGAACAAAAATAAAAATTCATGATCTAAATAAAACATATTTGTCAAGTCT AAAAGGCTATAGAATATTGGGATATATTCAGCTTATTTTTTAAAAATATGTTGGAAGTTC TCCAAAGATTACAAAGGAACGCAAAAAAGTATTAGAAAAAGGGAATAAAAGTAGAGCATC AATTACTTCGGGGTTACTATTTAGTACCCGACCCGCTACATCACACGAAGAACGTGCTTT TTTGTGTGTTTCGGTTTTTTTACCCATAAACACGCCTACACACTTCGCTGCTGCAGACTC AGAGAAAGAGAGGGAAAACATGGCGTCCTTTGTCGACGATGAGTTTCAATCAGCTAACAT ATTCATACCGGAGGAGTGGTCCGATGCTGCCGACTCTGTAGCCTATGATTCTAACACTTC GCCGCCGCCGGTTGCGTTTGTCTGCGGTCCCAAAAATAGCGGCAAAACCACTTTCTCTCG CGTCCTTGTCAATGTTCTTCTTCAGAGATACAAGAAAGTCGCTTATTTGGATACAGATGT CGGGCAGACAGAGTTCACTCCACCTGGTTTATTATCGCTTACCACAATTGACAAAATAAC TTCAGATCTGTCAATTCCATGCCTAAAAACTCCTGAGAGATGCTTCTTTTTTGGTGACAT ATCCTCTAAAAGGGATCCCAAAACATATTTGGCTTATATTTTTGCCTTGTATGATCACTA CCGGAGAACGTACCTGTTGAGCAATGGCGGAAGTCCTGGAAATGCTGGGGTGCCTCTTGT CATTAACACAACGGGCTGGGTCAAAGGTATTGGCTATGACATTCTTGTGGATATTATCAA ATACATCTCTCCTACACATGTTGTTAAGATTTGCATATCGTCTGTGAGCAAGAACCTTCC GGCTGGTGCATTTTGGTTGGATGATGATAATAGTGATGTTCCAACTGTAGTTGAGGTCAA CTCTGCTCGTCGGGACTCTTTTAACAGATCGGTTCTTGTACAGAAGGATGCACGTCTTTT GCGTGATCTACGTGTCATGGCCTATTTCAGACAATGCTTTCCAAGTGATATGAAAATCAC AACAATCAAGGAACTCTCTCGAGCATTAGCTGCTCACCCTCCATATGAGATTCCTATATC AAGTATCAAAATTAAACACCTTCATTGTGAGGTTCCTAAGAATGAGGTTTTGTACAGCTT GAATGCAACTATTGTTGGCTTGGCAGTTGATTCTGAAAATTTTCCTGACTGCATGGGCTT GGGAATCGTGCGTGCCATTGACACTCTCAAGCACGTACTCTATGTACTTACCCCTGTCCC AAAAAGCAGTCTGCAGAAGGTGGATCTTCTGTTGCAGGGCTTTGTCGAAATTCCAACTTG TTTGTTGCAGGTACAAGGCTGCATCTCACCTTACATGTCTGCCGATGTATTGCCTTCAGC TTAGGCAACAATGGGAGCTCGTCTATCTGGATAACTTCACTCTATCTTGTACAGCTTAAT AGAAGTCATTCGAGAAGGTTGGTTATGCTAAGTTATATATACTTCCTGAACAATTGCCTT ATTTATGAGGTAGACTTAAGAAACTTCTTATGAACTATCGACCTTATAGGTTGCTACTTG GTTTGTAAAACTTAATTGAGTTTAGGGTGATAACTGTGTCTTTGTTGGACAGCAAACTTT TTCCGTGTATGTACAATTTAATCTGTTGGAATCATCCTGTTATTTTGGAATTTCTGGTCA TCCTAGCATCGGTTGCTCTACCATTTATGATGGCTTGACGCACAATCATTGTACTTGATT TGTATCCTCGTCTGCACTCTGCTGTGGCTTTCTCTGATGAAAGCCTTGAGGAGTTGGAGA AGCTTATGATTTTGGTGCAGAAGCCTAAATTGGTACTATAGCCAGCTCTTATCAAAGGCA TTAGCATTATGTTTTGACGGAATATTTCATTCCCTCGTATAAAAGAGGAAATGAAAATGG TAAAAAGAAAAGATTCTAGTAAATTGAGGCTTTAGGAACCTAATAAATGTCTCTTGAGTG GGAAAGAAAGATAAGTAATGCATGAGAGGATTAGAACCATTATATGCTCACTCACACCTT CCACTGTGATCGTTTAATGAATGACTAAGTTACATTATCTGCTAAACAAGCATGTGTGTA CAAGTACAACTGCTGTCAGTGAAATTCCTGTCGTAGCATCTGATGAAACAACAAGTCTAA AATAGATGGTCAAGGGAGGTGAATATCTTACAAATATATAACCATCTATATGCATTTACA TTAGACAAAACTAGTTGTTCGTTTCTCATTTAGAGTCTTCCTGTGAATCCATAATGCCTT TTGCTGGACTATTTCAAAGTTTTCTGGTTCCAAGCCAATTTCACCTGCAAAGCAGTATTA ATCACTACCTGTAGATCAAGTGTTTGCATATTAAGCCATATACCTTTTCAACAAAAGCTT AGAAGTAGTATATTTTTGGGAGAAAAATACTTTAAAATAGGAGGTTTGTAGGTCAATAAG AACCCATTTAAGTTAATAGTACTTGTTTCTAAGGAGATTATCCTTTAAAAATACATCAAT CTAGCACATATATTCAATCCTCACCTAGAAAGGAGAAGTTTAAACCAATCATTTTTCTTT GGATCCTTTACTCGGTCCATTCCAGAATGATATTAACACATCCCAATATGTATTTACTTT CCTTCTCAAAATTTGGAAAGAAATTGGCTTATGCCTAGTGAATATACTAGCATGCTATAG AATATTACCTGAAGAACCTCAAGCCCCTCTTAGTAATGAGAAGTAAAGCTCATGGGAAAT GCCAAAGCTGAAGCCTTCAGGGCTCCTTCTTTAACTGTACATCCTAAATATGGAAGAACA GGAGAGAGGAAAAGAAAAAAGAGAACTGCAAAAAACACTTGTTACATTACTGACTCCTGC TGCAATTAGCAGTTAAATTGCAACTCAAAATGGAAATGATGAATTGATACACTTATCTTC TTTAATTTAATTACCTATGAAATATTCAAGGTCGTTGTAGCAGCATCTTGGTAAACCAGG CCCTTAAGAGCGCGACCACAAAAAGTTGTCAGCAATGTTCTGCAGACTTCTAGGAGCATT AAGCTTCCAGTGATAAGGGAACTGACAAATGACATGAAACATAAATGCAAAAATTCTGAA AACACGACCAACAAGTTTATTGTTGGAGTTAAATATTAGCTAAAAGTATGAATGGTTCTG TACTTCTGTAGCTCTTGAACACTCCTCTTTGGAAAATTTACACCATACATAACTGCATAA CTTTCTAATTCTTATCATTTCGTTGCTTTAAAGAAATTCTAGTACATTCGGCTATCAACT AAGAAGAGAGCTCACTAGGGAAGAATCACCTTTTTGGACAAAAGTCATGCATCTGCAACT TCTGTTGCTGTATCTCTGTGTCTAAGCTCCCGCAGATGTTGAGCTATCTCAGTCAAGAGT TTGGTTCCGTCTCCACCCCTCTGTAATGTCATGGCGGCGTGTTTCAAGAAACCACTTTCT GCTTCAACAGCTCTCAATCTCTCTCTAAGTAGAGAGACTTCTCTTGTAAGTATAACCTTA TTATCATTTCCTAAGAAGAGAACTTGATATTTAGTATCTGGTAGTCTTTAACTAAGAATG AAAAGAAAAAGAAGGCTGGTAAATAGAGAAAGCAAAGACTCATATATACCTTTGTCTTGA ATCACATTTGATTCTAGCACATGAGAGTCAACATCAGGAGGTATTTTGATCTGCTTTTCA AGGGTTGTTAACAAACCCTGTAGATAAGATCTCTCGTTCTCAAAATCAAGGTTTGATTCA TCAATATTTTCATCTCTATATTCCCCAGGACATCCAATATGGAATCCATTTACTCCATTA TGATCTGCTTGACGAGGACTGCTACAGTCGGATCTTCCATCGAAGGATGATGCAGACTGA GATCTCAACTCTTGATAATCATCATCTGCATCAACTTCACAAACCTCACTACCGACTTTC TTGATAATTCCATATCTCTCCCTGTAGCTGCCTTCTCTGCTTGCAAACGTGTGATCATGG CCATGGCATTGTTAGCTGCCACAGCAGAGGCACTTCTTTCTTCATCCAATTCCATGTATA ATTCCATAAGAGACTTTCTGTCCAGACGAACCTGCCTCTTCAAGCTATGCACAATGTCAT CATCTGCTTCGTTTACTGCACTCGCGTCATTAGCATCTGAGATGAATTCACTCTTATCAC CACCCAATTTTCTGGGCTTATTAGGCCACTTTGGACTAGCTTGAGCGGAGTCTGTTAATG GGATCCCAAAGAACTTGTTTCTTGCAGAAACTGGGGTTTTGCTAGATTCCTCATGAATGT CCTCGGGATCTGGTAGCAGCGGGGCAGTAGCAGCTTTAATATCCTCTCTACCTGCTACAC ATTGAAAATATAGTTCGACTCTTAACACAAATATTATAACTATCCCCTTCAACAATGACA GTCTTGTACGTGCGCTATCAGAGACTGAGATTGTTAGTCATCTTGATAATTGTGAGATTT AAGTTGTGTACACTGAAGAGTGAGAGTTGATAGATGTTGAGCTCTAATTGTAAAAATTGC AGAGTTAAGATGAAAGAGCTTCCCCTTTTTTTCTTTTTACCTCAATACAGATAATGCAGA AAACTTTAAGCCAAAAGAAATAGTAAAGACAAATAGATACCTGCATTCTGGTGTCCCTCA TCATCTGGTAGAATCGATTCATTATCTGAGGAAAACTTGAGCTTTGTATACTGGATACGA GGCAATTCCATATTGCCGGATTCCTCATTTTTCCACGTTAACGGAGATCGAGGAGATGAG GCAGGAGCTTGAGTGTAGTGATTTCCATTTATGGATGAGTTCCTGGCATATTTAGTCCTC AATTTCAGAGGTTCCCCACAGCAAGAACAGTTCCGAAGCACAACACTTGCAGTTTTGATA ACCTCTTCTTCGTTCTTAACTGATTTTATCGACATTCTCTTATCATCATCCACAAAGCAA TCAATGTCCTTGTGCAAAATCCCAACTAACGACTTGTACTTATCACAATCTGCTTCTTTC TCTGTTGCAAAAGAGAGAAGACACCCTTCACACATGTTTCTTATATCAGAAAGCTTCTTG TGGACATGACAATACGCGAGGGAAGATATGTCTTTCTTGTGACCCTCACAAATGGACTCG TTGTAATAGAAACTAGAGTTCCTCTTTATGAAAATATGATCGATCCTTGTGCAGAGCAAA CAGGGGACTTTCAATTCAAAAAACTTCGCAAATTCATTGGTGAAAAGTGCAAGAAAACCA TCAATGAAAAGAAGAAGGATCATCACCCATTCAAGAACAGCATATACACAGAAAACCCCA ACTCTCCCAAGCTTTTGTTCAACCAAGCATTTGAAAGATCGCGAAGCCATTTCTTTCCTT TTTACCTTAATTTTTTTTTTCTAATAAAAATACCCCTAACAATATTCAAGACAAAGATTG ATGATCAAAAGGCAAACAATGAAAGGAGATGAATCATGATCATGGTGGCTAAAATAAACC CCAGATCATGATCACCCTCTTTTTTTTTCTCTCTAGTTTCTTTCTGTGAAGAAGGAAGAA AGAAGTTTAGTTTTCCCTAATGCAAAAGTTTCAAAATGTTTAACTAATTAATAGGAAAGT GCTTGGCGGATCAATTAACTATATTAACGGTCGTCAATCATGCTCCCTTTAAAGCATACA CG