Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g112420.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XY30_CYNCS)
Sequence	ATGTTCATCCCCTTCAACTCCCTTGTTGCTCAACTCTCAAAGCTGAAGCTTCCAATCTCA AGAACCAAAGAGCTTCACGCTTTCATAATCAAGACTCATCTCTCACAAGACCCATTTTAC GCTACAAAAATTATAAGATTCTATGCTCTAAACAACGACATCATCTCTGCACACAAAGTG TTTGATAAAACTCCTCATCGAACCATTTACCTCTGGAACTCCTTAATTCGAGGTTATGCC AGAGCCCACAAGTTTAGAAATGCATTTTCGCTGTTTAATGATATGCTTCATTCTCAAATA ATGCCTGATAACTTCACTTATGCATGCCTTGTAAAAGCCAGCTCTGAGAATTTTGATTTG CACAGCTTGAGAGTTTTACATGGAGGGGTTGTTCTATCTGGGTTGCGGTTGGACTTTATC TGTAGTAGTCAACTGGTAAGTGCTTATTCAAGATTAGGCTGTATAGCTGATGCAAGCAAG GTGTTTTCTGGGATAACGGAGCCGGATTTGGTCTTATGGAATTCAATGTTATCAGGTTAT GGGGGTCTTGGGGAATTGGAGAAAGGGATAGCGTTGTTTAGTAAAATGCAGATAATGGGG GTGAGGCCTGATGAGTACTCGATGGTAGGCCTGATTATGACTATAGATGATTCTAGTGTG TTGGAAACAGGTGAAGCAATCCATGGATTTTGTTTAAAACTTGGTGTAGAGTCAAATGAT CATGTAACCAGTCTTCTTGTTAGTATGTATTCTAGGTGTAAATGTATAGATTCAGCATTT ATTGTCTTTGGTAGTCTTGTAGAACCTGATTTAGTTACATGGTCTGCTTTAATAAGCGGT ATTTCGCTGTGTGGCGATAGTGTCAATGCCTTGGATTTCTTCAGAGAAATGAATATGAAA GGTGGGAAGGCAGATGCGTCGCTGATTGCCAATGTACTGACTGCTTGTACTCAGTTGGCA AATGTGCAGCCAGGCATTGAGATACATGGTTATGCTTTTCGACATGGATATCACTCGGAA GTTATGGTCTCCTCTGCTCTACTTGACATGTACTCGAAATGTGGGTTCTTGGAATTTGGC TATCAAGTTTATGAGACTATGGTTTTCAAGAATATTGTTTCATACAATTCAATTATTTCA AGTCTTGGTTTACATGGACTTGCATCTCATGCCTTTCAGATATTCGAGAAGGCACTGGAG GAAGGGCACAAACCAGATGAAGCTACATTTTCTGCACTCCTTTGTGCATGTTGTCATGCT GGTCTTGTCAATGACGGACGAGAATATTTTAGAAAAATGAAAGATCACTTTGGCATCTTA GCTAACACTGAACATTATATTTACATGGTAAAGCTTCTTGGAATGGAAGGACAATTAAGA GAAGCTTATGAACTTGTTCAGTCACTGCAAGAACCAATTGACTCCGGCATTTGGGGAGCA CTATTATCATGCTGTGATGCTCATCGAAATTATGAGTTGGCAGATATTGTAGCTTGTCGT CTTTTTGGGAATAAGCTAGAGAATAGTAGTTACAGAATTATGCTTTCAAATATGTATGCT AGTGATGGGAGGTGGGATTTGGTAAATAAGTTGAGAGTAGATTCTGAGATAACAAAGTTG AAACTTCCTGGAAAAAGCTGGATTACTATTGCTGAATCTAGGATCAGAAGCTGTGAGAGG AGGTGGGATCGATCTAATTGTCTTGTCACAAAAGGGAATGTTATCATAAAATCTGTGGAT CATCCTAAAGCTACAGTTAAAGGACTTGATGTTTGGAGGCTTGAAGAAATCCTGGATCAT AAATTCAGTTGCCCGACAAATCTGCTACTTCAAGAAAAGAAGAAAACATTATGGCAACAC AAAGCATCAAAGCTGAAGTTAGTATTTGGTATTGTACTTATCCTTCTGCAAAGTGATAAC TATGCTGCTTGTGATGAGATCCTTGTAACAGCCTCTTTCTTGAACGCTGGAAGACAACAA TTACTGGAGAAGTATAGCTGTAAAGGCTTCTCCATCATGATAACGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g112420.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XY30_CYNCS)
Sequence	MFIPFNSLVAQLSKLKLPISRTKELHAFIIKTHLSQDPFYATKIIRFYALNNDIISAHKV FDKTPHRTIYLWNSLIRGYARAHKFRNAFSLFNDMLHSQIMPDNFTYACLVKASSENFDL HSLRVLHGGVVLSGLRLDFICSSQLVSAYSRLGCIADASKVFSGITEPDLVLWNSMLSGY GGLGELEKGIALFSKMQIMGVRPDEYSMVGLIMTIDDSSVLETGEAIHGFCLKLGVESND HVTSLLVSMYSRCKCIDSAFIVFGSLVEPDLVTWSALISGISLCGDSVNALDFFREMNMK GGKADASLIANVLTACTQLANVQPGIEIHGYAFRHGYHSEVMVSSALLDMYSKCGFLEFG YQVYETMVFKNIVSYNSIISSLGLHGLASHAFQIFEKALEEGHKPDEATFSALLCACCHA GLVNDGREYFRKMKDHFGILANTEHYIYMVKLLGMEGQLREAYELVQSLQEPIDSGIWGA LLSCCDAHRNYELADIVACRLFGNKLENSSYRIMLSNMYASDGRWDLVNKLRVDSEITKL KLPGKSWITIAESRIRSCERRWDRSNCLVTKGNVIIKSVDHPKATVKGLDVWRLEEILDH KFSCPTNLLLQEKKKTLWQHKASKLKLVFGIVLILLQSDNYAACDEILVTASFLNAGRQQ LLEKYSCKGFSIMIT*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g112420.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XY30_CYNCS)
Sequence	ATGTTCATCCCCTTCAACTCCCTTGTTGCTCAACTCTCAAAGCTGAAGCTTCCAATCTCA AGAACCAAAGAGCTTCACGCTTTCATAATCAAGACTCATCTCTCACAAGACCCATTTTAC GCTACAAAAATTATAAGATTCTATGCTCTAAACAACGACATCATCTCTGCACACAAAGTG TTTGATAAAACTCCTCATCGAACCATTTACCTCTGGAACTCCTTAATTCGAGGTTATGCC AGAGCCCACAAGTTTAGAAATGCATTTTCGCTGTTTAATGATATGCTTCATTCTCAAATA ATGCCTGATAACTTCACTTATGCATGCCTTGTAAAAGCCAGCTCTGAGAATTTTGATTTG CACAGCTTGAGAGTTTTACATGGAGGGGTTGTTCTATCTGGGTTGCGGTTGGACTTTATC TGTAGTAGTCAACTGGTAAGTGCTTATTCAAGATTAGGCTGTATAGCTGATGCAAGCAAG GTGTTTTCTGGGATAACGGAGCCGGATTTGGTCTTATGGAATTCAATGTTATCAGGTTAT GGGGGTCTTGGGGAATTGGAGAAAGGGATAGCGTTGTTTAGTAAAATGCAGATAATGGGG GTGAGGCCTGATGAGTACTCGATGGTAGGCCTGATTATGACTATAGATGATTCTAGTGTG TTGGAAACAGGTGAAGCAATCCATGGATTTTGTTTAAAACTTGGTGTAGAGTCAAATGAT CATGTAACCAGTCTTCTTGTTAGTATGTATTCTAGGTGTAAATGTATAGATTCAGCATTT ATTGTCTTTGGTAGTCTTGTAGAACCTGATTTAGTTACATGGTCTGCTTTAATAAGCGGT ATTTCGCTGTGTGGCGATAGTGTCAATGCCTTGGATTTCTTCAGAGAAATGAATATGAAA GGTGGGAAGGCAGATGCGTCGCTGATTGCCAATGTACTGACTGCTTGTACTCAGTTGGCA AATGTGCAGCCAGGCATTGAGATACATGGTTATGCTTTTCGACATGGATATCACTCGGAA GTTATGGTCTCCTCTGCTCTACTTGACATGTACTCGAAATGTGGGTTCTTGGAATTTGGC TATCAAGTTTATGAGACTATGGTTTTCAAGAATATTGTTTCATACAATTCAATTATTTCA AGTCTTGGTTTACATGGACTTGCATCTCATGCCTTTCAGATATTCGAGAAGGCACTGGAG GAAGGGCACAAACCAGATGAAGCTACATTTTCTGCACTCCTTTGTGCATGTTGTCATGCT GGTCTTGTCAATGACGGACGAGAATATTTTAGAAAAATGAAAGATCACTTTGGCATCTTA GCTAACACTGAACATTATATTTACATGGTAAAGCTTCTTGGAATGGAAGGACAATTAAGA GAAGCTTATGAACTTGTTCAGTCACTGCAAGAACCAATTGACTCCGGCATTTGGGGAGCA CTATTATCATGCTGTGATGCTCATCGAAATTATGAGTTGGCAGATATTGTAGCTTGTCGT CTTTTTGGGAATAAGCTAGAGAATAGTAGTTACAGAATTATGCTTTCAAATATGTATGCT AGTGATGGGAGGTGGGATTTGGTAAATAAGTTGAGAGTAGATTCTGAGATAACAAAGTTG AAACTTCCTGGAAAAAGCTGGATTACTATTGCTGAATCTAGGATCAGAAGCTGTGAGAGG AGGTGGGATCGATCTAATTGTCTTGTCACAAAAGGGAATGTTATCATAAAATCTGTGGAT CATCCTAAAGCTACAGTTAAAGGACTTGATGTTTGGAGGCTTGAAGAAATCCTGGATCAT AAATTCAGTTGCCCGACAAATCTGCTACTTCAAGAAAAGAAGAAAACATTATGGCAACAC AAAGCATCAAAGCTGAAGTTAGTATTTGGTATTGTACTTATCCTTCTGCAAAGTGATAAC TATGCTGCTTGTGATGAGATCCTTGTAACAGCCTCTTTCTTGAACGCTGGAAGACAACAA TTACTGGAGAAGTATAGCTGTAAAGGCTTCTCCATCATGATAACGTAG