Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g112230.3.1
CDS Infomation	Ubiquitin-associated/TS-N domain protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A072V0X9_MEDTR)
Sequence	ATGGCTATGGAGTCATCTATTGTGATCAAGGTCAAGTATGAAGAGACACTCAGACGGTTC AATGCTTGTGTCATCAATGAGAAACTTGATCTTGACATTGGTGGATTGAGAGACAAGATT ATTCGACTTTTCAATTTCGCTCATGATGCTGAAATCACACTAACATATATCGATGAGGAT GGAGATGTAGTCACACTTGTTGATGATGCGGATCTGCAGGACGTTGTGAGGCAAGACCTG AATCCCTTGAGAATATCAGCGAGGTTGAATGCTGCTGAAAGAAGCGGCAGAGCTTCAGCT AGATCTAGTGGAAATTCTACCCCTTTACGATCACCTCGGGTTCAGCCTCCATTTCTAAAC TTGAATTCCCGTGTTTCTGACGTTCTCAAGTACATTCCAGAACCCCTGCGTGAATCTGTG ATGAAGGTCTGTTCTGATGTGACTGCATCAGCCTCATCCTCTGCTCCCATCCTAGCTGAG CTTGTTGATGCTATGTGTGAGTTGGGGCTATCTCACTACCAAAATCAGGTTTCAGGGCCT CAGCCTGTCAAAGAAGCTGGCTCCTGTAGTGGCATATCTAAAGGAAATGCTATGAGTGCT GATGGGGTAATGCCGAATGTCAAAATTGGAGAGTCATCCGCAAAGAAGAATGGGCCTCTC ACAGCAGTACATGGTGAGGAGCCAACTTTGAAGACTACAGAACCAAAACCTAATGCCTCC AATGCAGCTGTAGATGCCTCAGTCAAGCTAGTATCTAAATCAGAAACTTTGGAAGGTGAT CGAACCAAGGCTCAGTCATCATCATTCGAAGCTTCTAAAGCTCAGAAGGATAAGAAATTT GATGTTCGCAGTCTTGACGGAAGGACTATTGGCTATGGATATGCGAGAAACTCACCTATT CCACCAGAAAAGACTTCTGATGAGCAGCCCAGCAAGGGACATCCTGTAGCTAAGCCGGTT GATTTGGGTGGCTCTGCAAGTTCCAGTAATGTGAAACAATGCAACTGGGATTCCCTTAAT GCAGATTCCAGTGGCAGTTTAATCAACATACCTTATGATGGCTTCACCCCTTCACATGTA GTTCATCTGAACACTGTAAATGTTAATGATTCCCATAATGCAGGTTCCAGTGGCAGTTCA ATGAAGATGCCGTATGATGGCTACATACCTGCTGTACGTCATCTAGGTCCACTGATTCCT GTGAATGCGTGTCCGTTTTCTGGGATGCCAACAGAAAATAACCCTATTCCACCTCAGAAC TTCTCTTTTGAGGTCCCACTTAAAAGGAGCCATAATCACAGTGATGGGACTGGGACTATT TTCCATAAAGGTGTTCGCTGTGATGGTTGTGGGGTTCATCCGATAACTGGACCTAGGTTC ATATCTAAAGTGAAGGAGAACTACGATCTCTGCAGCATATGTTTTGCTGAAATGGGAAAT GATGCTGATTACTTCAGAATGGATCGTCCTCTAACTTACCCGCATCCCTGGTCTTTCAAG GGTTTACATGATCTGCATGGGAGGTTGCGTCCCCGTCCCCCAACTGTCCCACAAGTCATT CGAGGCTTTGGGTTGAAAGCAGGTCGGCCGAAGCTTGACAGCCGCTTCATACAGGATGTC AATGTCCTGGATGGAACCATCATGGCCCCCTTGACTCAATTTACCAAGATCTGGAGAATG AAGAACAATGGTAATCTCGTTTGGCCTCAAGGAACTCAACTGGTTTGGATTGGCGGTGAT AAATTAAGTGATAGATTCTCTGTTGAATTAGAGATGACTACAGCTGGCTTGGCTGTTGAC CAGGAGCTTGATGTGGCGGTTGATTTTGCTGCTCCTGAGCATCCTGGCAGGTACATATCC TACTGGAGGTTGGCTTCACCTTCAGGACAGAAATTTGGCCAGCGTGTATGGGTGCTTATC CAGAATGTCCGATCCTTGTTCATGAAGGTTGATGCTTTATTAAGCCTTCCAAAAAGGGGG TTGGTCCATGAAGCTTTTCAGGGGTTAAACTTGAATTTACCTCCTGCCAGCAGTGGTGTA TCTGGAGCTGATATTATAAATGTGAATTCAGAACCTCATAATGTCGTTCCTGAGCCTAAG AGCTCGAACACAATGGAGTTGGTTGATTCAGTGGCTGAAGTAAACCAAAACATGGAGCAG GAGGTCAAGTTTCCAATTAATGATAGCTTGTTGGTTGGTTTTGGTGACAAGTCAAGTTCT CCATCTGCTTCTGGTTCAACAATTTCATATCCAATTATTGATTTAACCAAGGAACCACCA TCGGAGGACTCTTCCATGCAACCATCAGCTGTTGTAGCTATGCAGGCACCACCACTCCAG GATGCCAGAGGAAATTTTGAAGTTGAGACGTCCCTCCTGCAGGAGCTGGAGGAAATGGGT TTCAAGCAGGTAGATCTGAATAAAGAGATCTTGAGGAAGAATGAGTATGATTTGGAGCAG TCAGTTGATGATCTCTGTGGTGTTGCTGAGTGGGATCCTATCCTTGAAGAGCTGAAGGAT ATGGGTTTCTGTAACAAGGAAATGAACAAGAAGCTGCTTAAGAAGAACAACGGAAGCATC AAGCGTGTCGTCATGGATCTTATTGCTGGAGAGCAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g112230.3.1
PEP Infomation	Ubiquitin-associated/TS-N domain protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A072V0X9_MEDTR)
Sequence	MAMESSIVIKVKYEETLRRFNACVINEKLDLDIGGLRDKIIRLFNFAHDAEITLTYIDED GDVVTLVDDADLQDVVRQDLNPLRISARLNAAERSGRASARSSGNSTPLRSPRVQPPFLN LNSRVSDVLKYIPEPLRESVMKVCSDVTASASSSAPILAELVDAMCELGLSHYQNQVSGP QPVKEAGSCSGISKGNAMSADGVMPNVKIGESSAKKNGPLTAVHGEEPTLKTTEPKPNAS NAAVDASVKLVSKSETLEGDRTKAQSSSFEASKAQKDKKFDVRSLDGRTIGYGYARNSPI PPEKTSDEQPSKGHPVAKPVDLGGSASSSNVKQCNWDSLNADSSGSLINIPYDGFTPSHV VHLNTVNVNDSHNAGSSGSSMKMPYDGYIPAVRHLGPLIPVNACPFSGMPTENNPIPPQN FSFEVPLKRSHNHSDGTGTIFHKGVRCDGCGVHPITGPRFISKVKENYDLCSICFAEMGN DADYFRMDRPLTYPHPWSFKGLHDLHGRLRPRPPTVPQVIRGFGLKAGRPKLDSRFIQDV NVLDGTIMAPLTQFTKIWRMKNNGNLVWPQGTQLVWIGGDKLSDRFSVELEMTTAGLAVD QELDVAVDFAAPEHPGRYISYWRLASPSGQKFGQRVWVLIQNVRSLFMKVDALLSLPKRG LVHEAFQGLNLNLPPASSGVSGADIINVNSEPHNVVPEPKSSNTMELVDSVAEVNQNMEQ EVKFPINDSLLVGFGDKSSSPSASGSTISYPIIDLTKEPPSEDSSMQPSAVVAMQAPPLQ DARGNFEVETSLLQELEEMGFKQVDLNKEILRKNEYDLEQSVDDLCGVAEWDPILEELKD MGFCNKEMNKKLLKKNNGSIKRVVMDLIAGEQ*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g112230.3.1
Transcript Infomation	Ubiquitin-associated/TS-N domain protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A072V0X9_MEDTR)
Sequence	AAGCGATAGTTCTACACATAACATTTGGGTTTTTCCAGTGAGAGAAGCGCGGCTTACGGT TACGCGTGTATTCATTGCTTTCACCGTTTTTGTCGCTTGAACTGTTCTTTCTCAATTTCT AGGGCTAGGTTTTTGTTATCATCTGTTTTATATCGTTCTGCGGGCTTACCTGGAACGATA ATCTCTACTCGATTGTATACTGAAATCTCACTCTACCTAGCCATGGCTATGGAGTCATCT ATTGTGATCAAGGTCAAGTATGAAGAGACACTCAGACGGTTCAATGCTTGTGTCATCAAT GAGAAACTTGATCTTGACATTGGTGGATTGAGAGACAAGATTATTCGACTTTTCAATTTC GCTCATGATGCTGAAATCACACTAACATATATCGATGAGGATGGAGATGTAGTCACACTT GTTGATGATGCGGATCTGCAGGACGTTGTGAGGCAAGACCTGAATCCCTTGAGAATATCA GCGAGGTTGAATGCTGCTGAAAGAAGCGGCAGAGCTTCAGCTAGATCTAGTGGAAATTCT ACCCCTTTACGATCACCTCGGGTTCAGCCTCCATTTCTAAACTTGAATTCCCGTGTTTCT GACGTTCTCAAGTACATTCCAGAACCCCTGCGTGAATCTGTGATGAAGGTCTGTTCTGAT GTGACTGCATCAGCCTCATCCTCTGCTCCCATCCTAGCTGAGCTTGTTGATGCTATGTGT GAGTTGGGGCTATCTCACTACCAAAATCAGGTTTCAGGGCCTCAGCCTGTCAAAGAAGCT GGCTCCTGTAGTGGCATATCTAAAGGAAATGCTATGAGTGCTGATGGGGTAATGCCGAAT GTCAAAATTGGAGAGTCATCCGCAAAGAAGAATGGGCCTCTCACAGCAGTACATGGTGAG GAGCCAACTTTGAAGACTACAGAACCAAAACCTAATGCCTCCAATGCAGCTGTAGATGCC TCAGTCAAGCTAGTATCTAAATCAGAAACTTTGGAAGGTGATCGAACCAAGGCTCAGTCA TCATCATTCGAAGCTTCTAAAGCTCAGAAGGATAAGAAATTTGATGTTCGCAGTCTTGAC GGAAGGACTATTGGCTATGGATATGCGAGAAACTCACCTATTCCACCAGAAAAGACTTCT GATGAGCAGCCCAGCAAGGGACATCCTGTAGCTAAGCCGGTTGATTTGGGTGGCTCTGCA AGTTCCAGTAATGTGAAACAATGCAACTGGGATTCCCTTAATGCAGATTCCAGTGGCAGT TTAATCAACATACCTTATGATGGCTTCACCCCTTCACATGTAGTTCATCTGAACACTGTA AATGTTAATGATTCCCATAATGCAGGTTCCAGTGGCAGTTCAATGAAGATGCCGTATGAT GGCTACATACCTGCTGTACGTCATCTAGGTCCACTGATTCCTGTGAATGCGTGTCCGTTT TCTGGGATGCCAACAGAAAATAACCCTATTCCACCTCAGAACTTCTCTTTTGAGGTCCCA CTTAAAAGGAGCCATAATCACAGTGATGGGACTGGGACTATTTTCCATAAAGGTGTTCGC TGTGATGGTTGTGGGGTTCATCCGATAACTGGACCTAGGTTCATATCTAAAGTGAAGGAG AACTACGATCTCTGCAGCATATGTTTTGCTGAAATGGGAAATGATGCTGATTACTTCAGA ATGGATCGTCCTCTAACTTACCCGCATCCCTGGTCTTTCAAGGGTTTACATGATCTGCAT GGGAGGTTGCGTCCCCGTCCCCCAACTGTCCCACAAGTCATTCGAGGCTTTGGGTTGAAA GCAGGTCGGCCGAAGCTTGACAGCCGCTTCATACAGGATGTCAATGTCCTGGATGGAACC ATCATGGCCCCCTTGACTCAATTTACCAAGATCTGGAGAATGAAGAACAATGGTAATCTC GTTTGGCCTCAAGGAACTCAACTGGTTTGGATTGGCGGTGATAAATTAAGTGATAGATTC TCTGTTGAATTAGAGATGACTACAGCTGGCTTGGCTGTTGACCAGGAGCTTGATGTGGCG GTTGATTTTGCTGCTCCTGAGCATCCTGGCAGGTACATATCCTACTGGAGGTTGGCTTCA CCTTCAGGACAGAAATTTGGCCAGCGTGTATGGGTGCTTATCCAGAATGTCCGATCCTTG TTCATGAAGGTTGATGCTTTATTAAGCCTTCCAAAAAGGGGGTTGGTCCATGAAGCTTTT CAGGGGTTAAACTTGAATTTACCTCCTGCCAGCAGTGGTGTATCTGGAGCTGATATTATA AATGTGAATTCAGAACCTCATAATGTCGTTCCTGAGCCTAAGAGCTCGAACACAATGGAG TTGGTTGATTCAGTGGCTGAAGTAAACCAAAACATGGAGCAGGAGGTCAAGTTTCCAATT AATGATAGCTTGTTGGTTGGTTTTGGTGACAAGTCAAGTTCTCCATCTGCTTCTGGTTCA ACAATTTCATATCCAATTATTGATTTAACCAAGGAACCACCATCGGAGGACTCTTCCATG CAACCATCAGCTGTTGTAGCTATGCAGGCACCACCACTCCAGGATGCCAGAGGAAATTTT GAAGTTGAGACGTCCCTCCTGCAGGAGCTGGAGGAAATGGGTTTCAAGCAGGTAGATCTG AATAAAGAGATCTTGAGGAAGAATGAGTATGATTTGGAGCAGTCAGTTGATGATCTCTGT GGTGTTGCTGAGTGGGATCCTATCCTTGAAGAGCTGAAGGATATGGGTTTCTGTAACAAG GAAATGAACAAGAAGCTGCTTAAGAAGAACAACGGAAGCATCAAGCGTGTCGTCATGGAT CTTATTGCTGGAGAGCAGTAGAAGATATATATATATATATATATATATTTATGTTTATCC TATCGTGTGATATGGTTAGTTTGATATGAATAAGTGGTTGGATGCTACTGTGTTTTTACT ATGTTTTTGGCTTCTGTTCGTCGACTATGATTCGACAAACTCCTTTAAGTTATGTCATTA CTTGAACTGGCTTATGTAAATATAATATTATGGTAGTAGTCGTATCTGGTAACATTTGGT ATGTACTGTTCAATGAATATATGAATGTTTTTCTTCATAGTTG