Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g111797.1.1
CDS Infomation	Sieve element occlusion a (AHRD V3.3 *** E2FKJ8_9SOLN)
Sequence	ATGGCAAGTCATGCTTTGGTGCCTGCAGCAGCAACAACTCGCGGTATGAAGCCAACTCAA CAGGCAATGACTAAGCGAGAACGCCCCGTTTTCTCCTTGTCTGATGATCATGCTATGTCT AAGAAAATCCTGGATACTCACAATCCTGATGGTCGTGAAGTTGATGTTAATGTCATTCTC CACATTGTTGAGGACGTGTTTCAACATTCCTATCCTGCTGCCATGGATGGCGTGCTTAAT GGAGCGGGAGCTCATCATCTTGAAGGTAATATTGAAGCATTGAAGTTGGAAGAAAAGGCC TCACTTGCTTTCGATGGCATACTCGAAGGATTGGCTTATATCATACACAAAGTCTCTTGC GAGTTAACATGCAAGTGCTCAAGTGGAGGTCATGATGCGCATTCAACAACAATGTCAGTC TTAGGGATGCTCTCTGGCTACCAATGGGACGCGAAACTAGTCATATCTTTAGCAGCATTT GCCGTTACTTATGGTGAATTCTGGCTGGTGGCTCAGATGTTTGCCACTCATCCCTTGGCC AAATCTGTGGCCATCTTAAAACAACTACCAGACATCATGGAACATAGTGCTAGCCTCAGG TCTCGATTCGATGCCATCAATGAACTCATCAAGGCCATTTTGGAAGTAACCAAAATCATA ATGGAATTCAAGAAGCTTCCTTCTCAGTACATTACTGAAGATCAACCACCTTTGTCTGTC GCGATCAGTCACATTCCTACTGCTGTTTATTGGACTATTAAAAGTATTGTTGCTTGTGCT TCCCAACTAACTACCCTTCTTGGAATGAGCTATGACATGATAGTAGCTACCACAGCAGAC ACATGGGAAATGTCAAGCTCCACACACAAGCTGAAAAACATAAGCGAACACCTCAGAGTT GAACTAAACCGTTGCTATGCTCATATTCAGGAAAAGATGCACGTCGAGTACTTCCAAATG CTGGTGCACCTCTTTGAGGCAACACAATTTGACAACATGAAGATAATGAGGGCGATGATT TATATCAAGGATGATTTACTTCCACTTGAAGTCGGAACTACTCACACAAGGGCTAGTGTT GAAGTGCTAAGAAGAAAGACTGTTCTACTGCTGCTGTCAGATCTTGATGCTAGCCATGAG GAGATATTAGTACTGTCTCAAATTTACCTTGAGTCAAGGTCAAGGCCAGAATTTCAATAC GAAATAGTGTGGCTTCCAATTGTGGATCGATCAAAGGGATGGAATGACGCGCAGGAACAA AAATTTAAGGAGTTGCAAGCACTTATGCCGTGGTACACATTGCACCATCCATCCTTGTTA GAGCCAGCAATCGTCAAATTCGTCAAAGAGAAGTGGCATTTCACAAAGAAAATGATGCTT GTAACCTTGGATCCACAACAGGGCAAAGTTGCCTGTCCCAATGCTATTCACATGGCTTGG ATTTGGGGAAATTTGGCCTATCCCTTCACTCTTTCAAAAGAGGAATCTCTCTGGAATATG GAATCTTGGAGACTTGAGCTCGTTGTTGATGGCATTGATCCCAACTTAATCGATTGGATG GCAAGTGGTAAATTTATCTGTTTATATGGAGGAGAAGACATGGATTGGATCCGTAATTTC ACAAAATCCGCACGAAGCGTGGCACAGAGAGCTGGGATCGACCTACAAATGTTATATGTA GGAAAGAGCAACAACAAGGAGAGAGTCAGAAGGATCAACAGCATGATAACCGCAGAAAAT CTGAGTTACTGTTTGATGGACTTAACATCAGTTTGGTACTTCTGGACAAGAATTGAGAGC ATGTTCTACTCAAAAATGCAGCTAGGAAAAACCATCCAAGAGGATAAAGTTATGCAAGAA GTGTTGACAATGCTGAGCTTCGATGGAAGTGATCAAGGATGGGCACTCATAAGCAGGGGA TCATTCGAGATGGCTCGAGCTAAAAGCCAGATAATTACCAAGACATTGGACGATTACACA GTCTGGGAAGAAGACGCTAGAGTTAAAGGATTTGTGCCAGCACTTATTGAATATTTCTTG CAATTGCATACTCCTGAGCATTGCAATCGCTTAATTCTTCCAGGACTTGATGGCGATATT CCTGAAATGATTGTTTGTGCTGAATGTGGAAGGCCAATGGAGAGGTTCTTCATGTACCGT TGCTGCACTGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g111797.1.1
PEP Infomation	Sieve element occlusion a (AHRD V3.3 *** E2FKJ8_9SOLN)
Sequence	MASHALVPAAATTRGMKPTQQAMTKRERPVFSLSDDHAMSKKILDTHNPDGREVDVNVIL HIVEDVFQHSYPAAMDGVLNGAGAHHLEGNIEALKLEEKASLAFDGILEGLAYIIHKVSC ELTCKCSSGGHDAHSTTMSVLGMLSGYQWDAKLVISLAAFAVTYGEFWLVAQMFATHPLA KSVAILKQLPDIMEHSASLRSRFDAINELIKAILEVTKIIMEFKKLPSQYITEDQPPLSV AISHIPTAVYWTIKSIVACASQLTTLLGMSYDMIVATTADTWEMSSSTHKLKNISEHLRV ELNRCYAHIQEKMHVEYFQMLVHLFEATQFDNMKIMRAMIYIKDDLLPLEVGTTHTRASV EVLRRKTVLLLLSDLDASHEEILVLSQIYLESRSRPEFQYEIVWLPIVDRSKGWNDAQEQ KFKELQALMPWYTLHHPSLLEPAIVKFVKEKWHFTKKMMLVTLDPQQGKVACPNAIHMAW IWGNLAYPFTLSKEESLWNMESWRLELVVDGIDPNLIDWMASGKFICLYGGEDMDWIRNF TKSARSVAQRAGIDLQMLYVGKSNNKERVRRINSMITAENLSYCLMDLTSVWYFWTRIES MFYSKMQLGKTIQEDKVMQEVLTMLSFDGSDQGWALISRGSFEMARAKSQIITKTLDDYT VWEEDARVKGFVPALIEYFLQLHTPEHCNRLILPGLDGDIPEMIVCAECGRPMERFFMYR CCTD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g111797.1.1
Transcript Infomation	Sieve element occlusion a (AHRD V3.3 *** E2FKJ8_9SOLN)
Sequence	ATCATAAACAAAGCTTAGTAAATTAAACCAATCTTTTTTTTTCTTCAATTAAAATCCCAA ATTAGCAACAAAAAATGGCAAGTCATGCTTTGGTGCCTGCAGCAGCAACAACTCGCGGTA TGAAGCCAACTCAACAGGCAATGACTAAGCGAGAACGCCCCGTTTTCTCCTTGTCTGATG ATCATGCTATGTCTAAGAAAATCCTGGATACTCACAATCCTGATGGTCGTGAAGTTGATG TTAATGTCATTCTCCACATTGTTGAGGACGTGTTTCAACATTCCTATCCTGCTGCCATGG ATGGCGTGCTTAATGGAGCGGGAGCTCATCATCTTGAAGGTAATATTGAAGCATTGAAGT TGGAAGAAAAGGCCTCACTTGCTTTCGATGGCATACTCGAAGGATTGGCTTATATCATAC ACAAAGTCTCTTGCGAGTTAACATGCAAGTGCTCAAGTGGAGGTCATGATGCGCATTCAA CAACAATGTCAGTCTTAGGGATGCTCTCTGGCTACCAATGGGACGCGAAACTAGTCATAT CTTTAGCAGCATTTGCCGTTACTTATGGTGAATTCTGGCTGGTGGCTCAGATGTTTGCCA CTCATCCCTTGGCCAAATCTGTGGCCATCTTAAAACAACTACCAGACATCATGGAACATA GTGCTAGCCTCAGGTCTCGATTCGATGCCATCAATGAACTCATCAAGGCCATTTTGGAAG TAACCAAAATCATAATGGAATTCAAGAAGCTTCCTTCTCAGTACATTACTGAAGATCAAC CACCTTTGTCTGTCGCGATCAGTCACATTCCTACTGCTGTTTATTGGACTATTAAAAGTA TTGTTGCTTGTGCTTCCCAACTAACTACCCTTCTTGGAATGAGCTATGACATGATAGTAG CTACCACAGCAGACACATGGGAAATGTCAAGCTCCACACACAAGCTGAAAAACATAAGCG AACACCTCAGAGTTGAACTAAACCGTTGCTATGCTCATATTCAGGAAAAGATGCACGTCG AGTACTTCCAAATGCTGGTGCACCTCTTTGAGGCAACACAATTTGACAACATGAAGATAA TGAGGGCGATGATTTATATCAAGGATGATTTACTTCCACTTGAAGTCGGAACTACTCACA CAAGGGCTAGTGTTGAAGTGCTAAGAAGAAAGACTGTTCTACTGCTGCTGTCAGATCTTG ATGCTAGCCATGAGGAGATATTAGTACTGTCTCAAATTTACCTTGAGTCAAGGTCAAGGC CAGAATTTCAATACGAAATAGTGTGGCTTCCAATTGTGGATCGATCAAAGGGATGGAATG ACGCGCAGGAACAAAAATTTAAGGAGTTGCAAGCACTTATGCCGTGGTACACATTGCACC ATCCATCCTTGTTAGAGCCAGCAATCGTCAAATTCGTCAAAGAGAAGTGGCATTTCACAA AGAAAATGATGCTTGTAACCTTGGATCCACAACAGGGCAAAGTTGCCTGTCCCAATGCTA TTCACATGGCTTGGATTTGGGGAAATTTGGCCTATCCCTTCACTCTTTCAAAAGAGGAAT CTCTCTGGAATATGGAATCTTGGAGACTTGAGCTCGTTGTTGATGGCATTGATCCCAACT TAATCGATTGGATGGCAAGTGGTAAATTTATCTGTTTATATGGAGGAGAAGACATGGATT GGATCCGTAATTTCACAAAATCCGCACGAAGCGTGGCACAGAGAGCTGGGATCGACCTAC AAATGTTATATGTAGGAAAGAGCAACAACAAGGAGAGAGTCAGAAGGATCAACAGCATGA TAACCGCAGAAAATCTGAGTTACTGTTTGATGGACTTAACATCAGTTTGGTACTTCTGGA CAAGAATTGAGAGCATGTTCTACTCAAAAATGCAGCTAGGAAAAACCATCCAAGAGGATA AAGTTATGCAAGAAGTGTTGACAATGCTGAGCTTCGATGGAAGTGATCAAGGATGGGCAC TCATAAGCAGGGGATCATTCGAGATGGCTCGAGCTAAAAGCCAGATAATTACCAAGACAT TGGACGATTACACAGTCTGGGAAGAAGACGCTAGAGTTAAAGGATTTGTGCCAGCACTTA TTGAATATTTCTTGCAATTGCATACTCCTGAGCATTGCAATCGCTTAATTCTTCCAGGAC TTGATGGCGATATTCCTGAAATGATTGTTTGTGCTGAATGTGGAAGGCCAATGGAGAGGT TCTTCATGTACCGTTGCTGCACTGATTGATTCAACTCCTTTTCTTCTATTGATTGCTTTG GTTTTCTATATTTTTGTTGTTCTCTAAAATAATTGGTTGGTCTTTTTTACCACTTACGTT TTTACCATTATGTTGTAATGTCTGGTTATCAAAGAATTCCATGTCTTTGATCTGCTCTAG ACTACTTTTTCAGTGTGTAATAATTTATAGGTAATGAAATTGAAGGCACCTTCTTTTTTT TCCCCTAACTTTCATTCAAGAGTACTCATCATCAATAGTTAAACGTTCAATATCAACAAC AACAACTATGTCTCAGTTACAACAAGATATCAAAGATAAAGGACTTAGTCGTGTCAAAAT TAAGGTGCATCTAGATTCACTGTTTTCCTAAGCCTAGCACAACATGAAATTTGTGGCTTA ATATAAACACAGAAACTTTAACATTCGAATCGATTATGTAGGTAATTAGTAATTCTTCTA ATTACATCTTTTCATTGAAGTTCAAGTTGAACATATTACACCATCTACTAGTAAGAGCGA GTTTTAGAATAGCATAAATATTACTTACAATTTGGGAGTCACCCCTTTGATTGTTATCGT TTGTCATCCTAAATGAATGTCATGTGGGCTGTCATCACTTGGCTAAGTGAATAACTTCCT AATGGACGAGTGTTAATTTGTATATTACTTCTTGGCTATAAATAGCAATTACTTTCACTC ACAAAAGAGATGATAAAAATAAAGTTTGGAATTAGTATTATATTTAGTCAATTGATGCAT GATCATGAGTTCATAGAAATTTAGCTCCTAACTATAAGGTCCCTCAAACCAATCAAAGGA GAGTTATTTCTTTTGCCATATTTCCCTTATCTCTTTCCTTTTCCGTCCATATCATTCACT AAAAAAATATTGTTCTTTTCTTAATTCATCCCACTTTAGCCTTGCTTAAGGCTTACTAGC CA