Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g098420.3.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y1J2_CYNCS)

Sequence

ATGGGAAATTCAAGAGCTAAAAATCCATGGGGTGCAATTAGAATGTTCTCCAAGAGATTT
TATTGTGTCTTCAGTGAAAGCATTGTTGATGTTCCAGTAGATGCCCGCATTGTGAAAACG
GGTTTTGACCCAGAAATCTCTCGTTTTAACTTCAAACTGAAGGATTTGATAAGAGAAAAT
CAAATAGCAAAGGCACGTGAACTGTTTGATGAAATGCCTTACAGAAACACTAGCTCAGTT
AACATGATGGTTTCGGGTTATGTGAAGTCTCACAATCTTTTTCGTGCTAGGGAGTTGTTT
GATAGCATGTTCTCTCGTAATGAAATTTCATGGACTATAATGATTGGTGGTTACTCTCAG
AACAATCAGCCTAAAGAAGCTTTTAATCTTTACACTGAGATGTTTAGGTCGGGGGTTAAG
CCGGATCATATCACCTTTGCAACTCTATTATCGGGTTCTGATGATACAACTACTTTAAAA
GAAGTACTTCAGATTCACTCCCATATCATTAGATTTGGATTTAGTGCAAGTCTTATTGTT
TTCAACAGTCTGATAGATTCATACTGCAAAACTTGCTGCCTCGATATAGCGTCTCAGCTC
TTCAGTGAAATGCCAACTAAAGATTCAGTAAGCTTCAATGTGATGATAACAGGGTACACA
AAATATGGTTTTCGTGAAGAAGCATTGAAACTTTTTATGCAAATGCGGAATATGGATTTT
CAGCCTTCAGGTTTTACTTTTGCAGCAATGCTAGGTATGAGTGTTGGATCAGAGGAAGTT
ATTTTTGGCCAGCAAATTCATGGACTTGCTATCAAGACAAGCTATGTCTGGGACATATTT
GTTGCAAATGCATTGCTTGATTTCTACTCTAAGCATGACTATATAGATTTAGCAAAGAAT
CTCTTTGATGAGATGCCCGAGTTAGATGGTGTTTCGTATAACATAATTATCACAGGTTAT
GCATGGAATGGGCAGTATGAGAAATTGTTTGATATCTTCAAAAGGCTACAGGGTACATCA
TTTGACAGAAAGAATTTTCCTTTTGCCACAATGTTGAGTGTAGCTGCGGCAGAACTAAAT
TTAGCAATGGGAAGACAAACCCATGCACAGGCAGTGGTGACAACAGCTATTTCAGAAGTA
CAAGTAGGAAATGCCCTTGTTGACATGTATGCAAAGTGTGAAAAATTTGAGGATGCCAAC
AGAATATTTACAAATCTTGCCTACAGAAACTCTGTTCCATGGACAGCCATAATCTCAATA
TATGTTCAGAAGGGTTTTCATGAGGAGGCACTCAAAATGTTCAAGGAGATGAATAGAGAA
AATGTTCACGGTGACCAGGCAACTTTTGCTAGCACTTTAAAAGCTTCAGCTAATTTGGCT
TCAGTTTCTCTTGGGAAGCAATTACACTCAGCTGTGATCAGACTGGGATTATTGTCTAGT
GTTTTTTCTGGCAGTGTTCTTGTAGACATGTATGCAAATTGTGGGTCCATGAAAGATTCT
ATTAAAGTTTTCAAAGAGATGCCTGAAAGGAATATAGTATGTTGGAATGCACTGATTTCG
GCATATGCTCAGAATGGTGATGCTGAAGCCACATTTAACTCCTTCGCAGATATGATTGAA
TCAGGTCTCTACCCTGATTCTGTTAGTTTCCTCAGTGTACTAACTGCCTGCAGCCACCGT
GGGCTTGTTGAAAAGGCATTATGGTATTTTAATTCCATGACTCAAGTATATAATCTTGAT
CCAAGGAGAAAACATTATGCAACGATGATTGACGTGTTATGTAGAAGTGGACGATTCAAT
GAAGCAGAGAATCTGATTTCTGAAATGCCATTTGAACCGGATGAGGTCATGTGGTCCTCA
GTTTTAAACTCATGCAGAATTCATAAGAATCAAGACCTCGCCAAAAAGGCTGCTGACCAA
CTTTTCAAGATGGACGCTCTTAGAGATGCTGCTGCTTATGTCAACATGTCTAACATCTAT
GCAGAAGCAGGCAAGTGGGAAAATGCGGCAAAAGTCAAGAAGGCTATGAGGGAACGGGGA
GTTAAAAAGGTCACTGCCTATAGCTGGGTTGAGATTGACCACAGAGTTCATGTATTCACT
GCAAACGATAGGACCCATCCACAAACTGAGCAGATTAGAAGAAAAATTAACTCATTGGTT
GAGCTAATGGACAAGGAAGGACACAAACCTGATACAAGTTGTACCCTTCAAAATGTGGAT
GAAGAAATGAAAATAGAATCACTCAAATATCACAGTGAGAGGTTGGCCATTGCGTTTGCA
TTAATTAATACTCCAGAAGGATCACCCATTATTATTATGAAAAACTTGCGAGCTTGTGTG
GATTGTCATGCTGCAATTAAAGTTATCTCAAAAATAGTTGGAAGGGAGATCACTGTGCGA
GATTCAAGTAGGTTCCATCACTTTAGAGATGGATCATGTTCATGTGGGGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g098420.3.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y1J2_CYNCS)

Sequence

MGNSRAKNPWGAIRMFSKRFYCVFSESIVDVPVDARIVKTGFDPEISRFNFKLKDLIREN
QIAKARELFDEMPYRNTSSVNMMVSGYVKSHNLFRARELFDSMFSRNEISWTIMIGGYSQ
NNQPKEAFNLYTEMFRSGVKPDHITFATLLSGSDDTTTLKEVLQIHSHIIRFGFSASLIV
FNSLIDSYCKTCCLDIASQLFSEMPTKDSVSFNVMITGYTKYGFREEALKLFMQMRNMDF
QPSGFTFAAMLGMSVGSEEVIFGQQIHGLAIKTSYVWDIFVANALLDFYSKHDYIDLAKN
LFDEMPELDGVSYNIIITGYAWNGQYEKLFDIFKRLQGTSFDRKNFPFATMLSVAAAELN
LAMGRQTHAQAVVTTAISEVQVGNALVDMYAKCEKFEDANRIFTNLAYRNSVPWTAIISI
YVQKGFHEEALKMFKEMNRENVHGDQATFASTLKASANLASVSLGKQLHSAVIRLGLLSS
VFSGSVLVDMYANCGSMKDSIKVFKEMPERNIVCWNALISAYAQNGDAEATFNSFADMIE
SGLYPDSVSFLSVLTACSHRGLVEKALWYFNSMTQVYNLDPRRKHYATMIDVLCRSGRFN
EAENLISEMPFEPDEVMWSSVLNSCRIHKNQDLAKKAADQLFKMDALRDAAAYVNMSNIY
AEAGKWENAAKVKKAMRERGVKKVTAYSWVEIDHRVHVFTANDRTHPQTEQIRRKINSLV
ELMDKEGHKPDTSCTLQNVDEEMKIESLKYHSERLAIAFALINTPEGSPIIIMKNLRACV
DCHAAIKVISKIVGREITVRDSSRFHHFRDGSCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g098420.3.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y1J2_CYNCS)

Sequence

ACTTAACTTTGTTAAATACTTTTTGTGTTGATTAAATACTACAACTAATTTTTGTGCTTA
CTGAACTTTTTTTCCTTGCCAGAAAGTAGGGTTTCTGTCTTCTTGGTTTTTTGAACTTGT
AAAAATTTAATCTTTTTTGTTATTCTTGCACCACAATGGGAAATTCAAGAGCTAAAAATC
CATGGGGTGCAATTAGAATGTTCTCCAAGAGATTTTATTGTGTCTTCAGTGAAAGCATTG
TTGATGTTCCAGTAGATGCCCGCATTGTGAAAACGGGTTTTGACCCAGAAATCTCTCGTT
TTAACTTCAAACTGAAGGATTTGATAAGAGAAAATCAAATAGCAAAGGCACGTGAACTGT
TTGATGAAATGCCTTACAGAAACACTAGCTCAGTTAACATGATGGTTTCGGGTTATGTGA
AGTCTCACAATCTTTTTCGTGCTAGGGAGTTGTTTGATAGCATGTTCTCTCGTAATGAAA
TTTCATGGACTATAATGATTGGTGGTTACTCTCAGAACAATCAGCCTAAAGAAGCTTTTA
ATCTTTACACTGAGATGTTTAGGTCGGGGGTTAAGCCGGATCATATCACCTTTGCAACTC
TATTATCGGGTTCTGATGATACAACTACTTTAAAAGAAGTACTTCAGATTCACTCCCATA
TCATTAGATTTGGATTTAGTGCAAGTCTTATTGTTTTCAACAGTCTGATAGATTCATACT
GCAAAACTTGCTGCCTCGATATAGCGTCTCAGCTCTTCAGTGAAATGCCAACTAAAGATT
CAGTAAGCTTCAATGTGATGATAACAGGGTACACAAAATATGGTTTTCGTGAAGAAGCAT
TGAAACTTTTTATGCAAATGCGGAATATGGATTTTCAGCCTTCAGGTTTTACTTTTGCAG
CAATGCTAGGTATGAGTGTTGGATCAGAGGAAGTTATTTTTGGCCAGCAAATTCATGGAC
TTGCTATCAAGACAAGCTATGTCTGGGACATATTTGTTGCAAATGCATTGCTTGATTTCT
ACTCTAAGCATGACTATATAGATTTAGCAAAGAATCTCTTTGATGAGATGCCCGAGTTAG
ATGGTGTTTCGTATAACATAATTATCACAGGTTATGCATGGAATGGGCAGTATGAGAAAT
TGTTTGATATCTTCAAAAGGCTACAGGGTACATCATTTGACAGAAAGAATTTTCCTTTTG
CCACAATGTTGAGTGTAGCTGCGGCAGAACTAAATTTAGCAATGGGAAGACAAACCCATG
CACAGGCAGTGGTGACAACAGCTATTTCAGAAGTACAAGTAGGAAATGCCCTTGTTGACA
TGTATGCAAAGTGTGAAAAATTTGAGGATGCCAACAGAATATTTACAAATCTTGCCTACA
GAAACTCTGTTCCATGGACAGCCATAATCTCAATATATGTTCAGAAGGGTTTTCATGAGG
AGGCACTCAAAATGTTCAAGGAGATGAATAGAGAAAATGTTCACGGTGACCAGGCAACTT
TTGCTAGCACTTTAAAAGCTTCAGCTAATTTGGCTTCAGTTTCTCTTGGGAAGCAATTAC
ACTCAGCTGTGATCAGACTGGGATTATTGTCTAGTGTTTTTTCTGGCAGTGTTCTTGTAG
ACATGTATGCAAATTGTGGGTCCATGAAAGATTCTATTAAAGTTTTCAAAGAGATGCCTG
AAAGGAATATAGTATGTTGGAATGCACTGATTTCGGCATATGCTCAGAATGGTGATGCTG
AAGCCACATTTAACTCCTTCGCAGATATGATTGAATCAGGTCTCTACCCTGATTCTGTTA
GTTTCCTCAGTGTACTAACTGCCTGCAGCCACCGTGGGCTTGTTGAAAAGGCATTATGGT
ATTTTAATTCCATGACTCAAGTATATAATCTTGATCCAAGGAGAAAACATTATGCAACGA
TGATTGACGTGTTATGTAGAAGTGGACGATTCAATGAAGCAGAGAATCTGATTTCTGAAA
TGCCATTTGAACCGGATGAGGTCATGTGGTCCTCAGTTTTAAACTCATGCAGAATTCATA
AGAATCAAGACCTCGCCAAAAAGGCTGCTGACCAACTTTTCAAGATGGACGCTCTTAGAG
ATGCTGCTGCTTATGTCAACATGTCTAACATCTATGCAGAAGCAGGCAAGTGGGAAAATG
CGGCAAAAGTCAAGAAGGCTATGAGGGAACGGGGAGTTAAAAAGGTCACTGCCTATAGCT
GGGTTGAGATTGACCACAGAGTTCATGTATTCACTGCAAACGATAGGACCCATCCACAAA
CTGAGCAGATTAGAAGAAAAATTAACTCATTGGTTGAGCTAATGGACAAGGAAGGACACA
AACCTGATACAAGTTGTACCCTTCAAAATGTGGATGAAGAAATGAAAATAGAATCACTCA
AATATCACAGTGAGAGGTTGGCCATTGCGTTTGCATTAATTAATACTCCAGAAGGATCAC
CCATTATTATTATGAAAAACTTGCGAGCTTGTGTGGATTGTCATGCTGCAATTAAAGTTA
TCTCAAAAATAGTTGGAAGGGAGATCACTGTGCGAGATTCAAGTAGGTTCCATCACTTTA
GAGATGGATCATGTTCATGTGGGGATTATTGGTGA