Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g097850.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199UE17_ANACO)
Sequence	ATGCTTGTTCCCTCGTCTTTGCCTCCAAAACTTTCAAACTCAGCCCTGTTTCACATTTGC TTCAAATCCAGTTCCTTCTTCGCTTTCTTCACTTCATCAACGCCATTGCTAAGAGCAGTA GTTCCTTCTTCTTTTACTCAATTACTCAAACAATGCAAGTCTTGTATCAAGGCAAAACTT GTCGTCGCCGGCGTCTTTTCACCCTCAGCAGACCTCACTACATGGTCGTCTCAGGTTGTG TTCTATTGGAATAACCTCATCAAACGCTGTGTTCTTCTCCGACATCACGAGAGTGCTCTG GTCCTCTTCCGCGAAATGCTGAGACTTGATTGGAACCCAGATGGCTACACATACCCTTAT ATCCTCAAGGCATGTGGTGAGCTTCGGTTCCTCCTTTTCGGTGAATCTGTTCATTCCTTG ATTCTATCATCTGGGTTGGATTCCAATGTGTTTGTATGTAATGGTCTCATTGCTATGTAT GGGAAATGTGGGCTGTTAGGTCATGCACGCCAGGTGTTTGATAAAACGGTTGAGAGAGTA ACTGCTGATGTTATTTCATGGAATTCAATAGTGGCGGCTTACGTACAGAAGGATGAGGAT AAGAAAGTTTTGGAGTTGTTTGATTTGATGGTTGCGTTGAATAGTTTTGAGCTGCGGCCT GATGCTGTTAGTTTAGTTAATGTACTTCCAGCTTGTGGTTCTTTAGGGGCATGGAAACGT GGAAAACAACTTCAGGGTTATGCGATACGGAGATGTTTGCATGAGGACATTTTTGTAGGA AATGCAATTGTGGATATGTATGCAAAATGTAAGCGTTTGGATGATGCTAACAAGGTTTTT GAGCTAATGGAGGTGAAAGACGTGGTTTCTTGGAACGCATTGGTCACTGGGTACTCTCAG ATTGGAAGATTTGATGAGGCTTTGGGATTGTTTGAGAGAATGAGGGAAGAAAAGATTGAT TTGAATGTCGTAACATGGAGTGCTGTGATTTCAGGGTATGCACAGAGGGATTTAGGCTAT GAAGCACTCAATATCTTTAAGGAGATGAGGCTTTCTGGGGCTGAGCCAAACGTGATCACT CTTGTTTCTGTGCTTTCAGGTTGCGCTGCTATTGGAGCACTGCGTCAAGGGAAGGAAACT CATTGCTATGCCATTAAACAAATATTGAGTTTGGAAGGCAGCAATACTGAGGAGGATCTC ATGGTGACTAATGCTCTGATTGACATGTATGCAAAGTGCAAGGAGATGAAAATTGCTCAG GCCATGTTTGATGATATTGACAGGAGAGGTAGGAATGTTGTCACATGGACAGTCATGATA GGTGGATATGCTCAGCATGGCGATGCAAATGATGCTTTAGAACTTTTTTCAGCAATGCTG AAGGATGAGTACTCTGTAATCCCAAATGCATATACTATATCTTGTGCTCTGGTGGCTTGC GCTCGTCTGTCTAGTCTTAGGATTGGTAGGCAAATTCATGCATATGTGTTACGACAAGGG TGTGAACCTACAAAAGTCTTTGTGGCTAACTGTCTCATTGACATGTACTCCAAATCTGGA GATGTTGATGCAGCTAGACTTGTGTTCGATAACATGAGCCAGAGGAATGCTGTCTCATGG ACATCCCTGATGACTGGCTATGGAATGCATGGTCGGGGCGAGGAGGCTCTCCAAGTGTTT AACGTAATGAGAGGAGAAGGTCTGCCCATAGATGGTGTAACTTTTCTTGTTGTGCTATAT GCTTGTAGCCACTCTGGAATGGTTGATGAGGGTATGAATTACTTCAACCATATGCAGGGG GATTTTGGAGTTGTTCCTGGGGCTGAACACTATGCATGCATGATTGATATTTTGGGTCGT GCTGGTCGACTGGATGAAGCTATGAAGCTCATTGAACGCATGCCAATGGAACCAACCTCA GTAGTATGGGTTGCACTGCTTAGTGCTTGTAGAGTCCATAAAAATGTGGATCTTGCGGAG CATGCCGCTGCAAAGCTGTCAAAATTGGAAACTGAGAATGATGGGACTTATACACTTCTT TCAAATATATATGCTAATGCCAAACGTTGGAAAGATGTGGCTCGGATTAGATCTCTTATG AAACATTCTGGCATAAGGAAGAGACCTGGATGTAGTTGGGTTCAAGGAAAGAAGGAGACT GTTACATTTTTTGTCGGGGACAGATGTCATCCATTGTCTGAAAAGATATATGATCTCCTC GAAAACCTAATTCACCGTATCAAAGCAATGGGCTATGTTCCGGAGACAAGTTTTGCGCTT CATGATGTAGATGATGAGGAGAAAGGTGATCTTCTTATTGAACATAGTGAAAAGTTGGCC CTTGCTTATGGCATTCTCACGTCAGCTCCTGGAGTGCCTATCAGAATAACCAAGAACCTG CGAGTTTGTGGAGATTGTCATACTGCAATGACATACATATCCAAAATCATTGAGCATGAA ATTATACTGAGGGACTCAAGTCGCTTTCATCATATCAAGAATGGATCTTGCTCTTGTAGA GGGTTTTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g097850.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199UE17_ANACO)
Sequence	MLVPSSLPPKLSNSALFHICFKSSSFFAFFTSSTPLLRAVVPSSFTQLLKQCKSCIKAKL VVAGVFSPSADLTTWSSQVVFYWNNLIKRCVLLRHHESALVLFREMLRLDWNPDGYTYPY ILKACGELRFLLFGESVHSLILSSGLDSNVFVCNGLIAMYGKCGLLGHARQVFDKTVERV TADVISWNSIVAAYVQKDEDKKVLELFDLMVALNSFELRPDAVSLVNVLPACGSLGAWKR GKQLQGYAIRRCLHEDIFVGNAIVDMYAKCKRLDDANKVFELMEVKDVVSWNALVTGYSQ IGRFDEALGLFERMREEKIDLNVVTWSAVISGYAQRDLGYEALNIFKEMRLSGAEPNVIT LVSVLSGCAAIGALRQGKETHCYAIKQILSLEGSNTEEDLMVTNALIDMYAKCKEMKIAQ AMFDDIDRRGRNVVTWTVMIGGYAQHGDANDALELFSAMLKDEYSVIPNAYTISCALVAC ARLSSLRIGRQIHAYVLRQGCEPTKVFVANCLIDMYSKSGDVDAARLVFDNMSQRNAVSW TSLMTGYGMHGRGEEALQVFNVMRGEGLPIDGVTFLVVLYACSHSGMVDEGMNYFNHMQG DFGVVPGAEHYACMIDILGRAGRLDEAMKLIERMPMEPTSVVWVALLSACRVHKNVDLAE HAAAKLSKLETENDGTYTLLSNIYANAKRWKDVARIRSLMKHSGIRKRPGCSWVQGKKET VTFFVGDRCHPLSEKIYDLLENLIHRIKAMGYVPETSFALHDVDDEEKGDLLIEHSEKLA LAYGILTSAPGVPIRITKNLRVCGDCHTAMTYISKIIEHEIILRDSSRFHHIKNGSCSCR GFW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g097850.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199UE17_ANACO)
Sequence	ATGCTTGTTCCCTCGTCTTTGCCTCCAAAACTTTCAAACTCAGCCCTGTTTCACATTTGC TTCAAATCCAGTTCCTTCTTCGCTTTCTTCACTTCATCAACGCCATTGCTAAGAGCAGTA GTTCCTTCTTCTTTTACTCAATTACTCAAACAATGCAAGTCTTGTATCAAGGCAAAACTT GTCGTCGCCGGCGTCTTTTCACCCTCAGCAGACCTCACTACATGGTCGTCTCAGGTTGTG TTCTATTGGAATAACCTCATCAAACGCTGTGTTCTTCTCCGACATCACGAGAGTGCTCTG GTCCTCTTCCGCGAAATGCTGAGACTTGATTGGAACCCAGATGGCTACACATACCCTTAT ATCCTCAAGGCATGTGGTGAGCTTCGGTTCCTCCTTTTCGGTGAATCTGTTCATTCCTTG ATTCTATCATCTGGGTTGGATTCCAATGTGTTTGTATGTAATGGTCTCATTGCTATGTAT GGGAAATGTGGGCTGTTAGGTCATGCACGCCAGGTGTTTGATAAAACGGTTGAGAGAGTA ACTGCTGATGTTATTTCATGGAATTCAATAGTGGCGGCTTACGTACAGAAGGATGAGGAT AAGAAAGTTTTGGAGTTGTTTGATTTGATGGTTGCGTTGAATAGTTTTGAGCTGCGGCCT GATGCTGTTAGTTTAGTTAATGTACTTCCAGCTTGTGGTTCTTTAGGGGCATGGAAACGT GGAAAACAACTTCAGGGTTATGCGATACGGAGATGTTTGCATGAGGACATTTTTGTAGGA AATGCAATTGTGGATATGTATGCAAAATGTAAGCGTTTGGATGATGCTAACAAGGTTTTT GAGCTAATGGAGGTGAAAGACGTGGTTTCTTGGAACGCATTGGTCACTGGGTACTCTCAG ATTGGAAGATTTGATGAGGCTTTGGGATTGTTTGAGAGAATGAGGGAAGAAAAGATTGAT TTGAATGTCGTAACATGGAGTGCTGTGATTTCAGGGTATGCACAGAGGGATTTAGGCTAT GAAGCACTCAATATCTTTAAGGAGATGAGGCTTTCTGGGGCTGAGCCAAACGTGATCACT CTTGTTTCTGTGCTTTCAGGTTGCGCTGCTATTGGAGCACTGCGTCAAGGGAAGGAAACT CATTGCTATGCCATTAAACAAATATTGAGTTTGGAAGGCAGCAATACTGAGGAGGATCTC ATGGTGACTAATGCTCTGATTGACATGTATGCAAAGTGCAAGGAGATGAAAATTGCTCAG GCCATGTTTGATGATATTGACAGGAGAGGTAGGAATGTTGTCACATGGACAGTCATGATA GGTGGATATGCTCAGCATGGCGATGCAAATGATGCTTTAGAACTTTTTTCAGCAATGCTG AAGGATGAGTACTCTGTAATCCCAAATGCATATACTATATCTTGTGCTCTGGTGGCTTGC GCTCGTCTGTCTAGTCTTAGGATTGGTAGGCAAATTCATGCATATGTGTTACGACAAGGG TGTGAACCTACAAAAGTCTTTGTGGCTAACTGTCTCATTGACATGTACTCCAAATCTGGA GATGTTGATGCAGCTAGACTTGTGTTCGATAACATGAGCCAGAGGAATGCTGTCTCATGG ACATCCCTGATGACTGGCTATGGAATGCATGGTCGGGGCGAGGAGGCTCTCCAAGTGTTT AACGTAATGAGAGGAGAAGGTCTGCCCATAGATGGTGTAACTTTTCTTGTTGTGCTATAT GCTTGTAGCCACTCTGGAATGGTTGATGAGGGTATGAATTACTTCAACCATATGCAGGGG GATTTTGGAGTTGTTCCTGGGGCTGAACACTATGCATGCATGATTGATATTTTGGGTCGT GCTGGTCGACTGGATGAAGCTATGAAGCTCATTGAACGCATGCCAATGGAACCAACCTCA GTAGTATGGGTTGCACTGCTTAGTGCTTGTAGAGTCCATAAAAATGTGGATCTTGCGGAG CATGCCGCTGCAAAGCTGTCAAAATTGGAAACTGAGAATGATGGGACTTATACACTTCTT TCAAATATATATGCTAATGCCAAACGTTGGAAAGATGTGGCTCGGATTAGATCTCTTATG AAACATTCTGGCATAAGGAAGAGACCTGGATGTAGTTGGGTTCAAGGAAAGAAGGAGACT GTTACATTTTTTGTCGGGGACAGATGTCATCCATTGTCTGAAAAGATATATGATCTCCTC GAAAACCTAATTCACCGTATCAAAGCAATGGGCTATGTTCCGGAGACAAGTTTTGCGCTT CATGATGTAGATGATGAGGAGAAAGGTGATCTTCTTATTGAACATAGTGAAAAGTTGGCC CTTGCTTATGGCATTCTCACGTCAGCTCCTGGAGTGCCTATCAGAATAACCAAGAACCTG CGAGTTTGTGGAGATTGTCATACTGCAATGACATACATATCCAAAATCATTGAGCATGAA ATTATACTGAGGGACTCAAGTCGCTTTCATCATATCAAGAATGGATCTTGCTCTTGTAGA GGGTTTTGGTAG