Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g097460.3.1
CDS Infomation	integrator complex subunit (AHRD V3.3 *** AT3G07530.3)
Sequence	ATGAAGCTTACATGTTTAAGTGAGGGCAGGGGCTACTATTTCCCACCATGCCACATAGTT AATATATGTGGTTTCCGGGTGTTACTTGACTGCCCTTTGGACCTTTCAGCCCTAGCTGTA TTTTCTCCCCTACCAATTGTTATTTCTTCCCTGCTTGATGAGAAAGCTTCTATTCATAGC GGCCAAAGTTCATCAAATTCAGAGTCTGTAAGACAGGAAGTTTCGGAGCTTCTTGATTCC AAAAAATTGATTCAGGCTGAGCCTTGGTATAAAACTGTGAAAAGTTTGCAGCTTTGGAGT ATTTATTCCATAGATGTGGTACTAATCTCAAGTCCGATGGGTATGCTAGGGTTACCTTTT CTTACCCGCCTCAAAGACTTCAGAGCAAAGATATATGCAACGGAAGCAGCTTCCAGACTA GGAAAACTGATGATGGAGGACCTGATTTCCATGCATATGGAGTTGAGACAATTCTATGGA CCTGAAGAGTCTGGTTGCCCTCAATGGATGACATGGGAAAAACTTGAACTACTTCCTAGG GCACTAAAGGATATTGTTTTAGGCAGTGACAGGACAGAGCTCGGTGGATGGATGTCCATA TACAGTGCAGCTGATATGAAGGGTTGCATGGAGAAGGTTCAATTCCTCAAGTATGCTGAA GAAGCCTGCTATAATGGCTCATTGACCATAAAAGCACTGAGTTCTGGTTTAGAGATAGGT GCTTGTAATTGGAATATTCTAAGTCCAAAAGGAAACATTATTTATCTTTCTGGCTCTGTT TTTGCATCAGCAACTGCAACCAGTTTCGATTACAAAGCTCTTGAAGACAGTGATGTTCTA TTATATTCAGACTTCGCAGCCTGCAATGATGTTGATGGTGAAAAGAACGATTTCCCTCCT GCTACTGGCAGTTCCTATTCAAGTAATATTGGTAGTTGTTGGGAAACAATACCTGAATCG TGGCTGGATTCAGATGAGTACTCTGAAGAGATGGAAAAAGTATCTTTTATATGTTCATGT GTGTTGGACACTATTAGTGATGGAGGATCAGTCCTTATTCCCATTGGACGGCCCGGAGTC ATGTTGCAGCTGTTGGAGAACATATCACTTTCACTAGAATCTTCAAATTTAAAGGTTCCT ATATACTTCGTTTCTTCTGTGGCGGAAGAGTTGTTGGCATTTTCCAATATCATACCTGAA TGGCTGTCCAGTCAACTGCAAGAAAGATTTTGTTCTGGGCAACCACTATTCACGCATATT CAGCTGTCAAACGAGAAAAAACTCTTCGTATCTCCTGCAATACATTCTTCGAAATTCCTA ACAAGTTGGCAGGAACCTTGCATAGTATTCTGTCCTCACTGGAGTTTGAGACTTGGCCCT GTTTTCCATCTCCTTCAACGTTGGTGTGCAGATCCTAACTCGTTGCTTATCATTGAGGAA AGAGCTGATATCAAGTTGGCTTTGTTGCCTTTTGAGCCAATGTCAATGAAGGTCCTTCAA TGTTCATTCATCTCTGGAATAAAGCTAAAGAAAGCTATACCTTTACTAAAGATATTACAA CCTAAACACGTGCTGGTCCCTGAGAGTTTGAGGCCCCATATCAGCTGTTGGAACCCCAAA TTTTCGGTCCAAAGTTTCTCCGAGAATGAAACTGTAGTTGTGCCCAAGTTGAAAGCATTT GCAGATATGGACATTGCCATGGACGTGGCTTCTGAGCTGCTCATTGATACAAAAATGATA GAGGGAAAAAATATTGCAAGATTAAAGGGAGAGTTGCTCATTGAGCAGGGAAAGTATCGG TGTGTTGTTAGAAACAAGCAAGTGCTTTCTTCCCAAGTTAGGCCATTGCTATTTGTGGGT AGAGTTGACTTGGACTCCCTTTTGATGGCTTTAAAGAAGATGGGGATGAAAGTAGCTGCC CAGAGTAGTGGTGGATCAGAACATGTATCACTTATATTCATCTCGGAGCCCAGTGAAGCC TTGATAGAGGTTACATCAACTCAAACCACCATAAGCGTTGGTGATGAGACTACTGCTTCC TTGATTTCTGAGGCTGTTCGTAGCACTTCAGTTTGTTTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g097460.3.1
PEP Infomation	integrator complex subunit (AHRD V3.3 *** AT3G07530.3)
Sequence	MKLTCLSEGRGYYFPPCHIVNICGFRVLLDCPLDLSALAVFSPLPIVISSLLDEKASIHS GQSSSNSESVRQEVSELLDSKKLIQAEPWYKTVKSLQLWSIYSIDVVLISSPMGMLGLPF LTRLKDFRAKIYATEAASRLGKLMMEDLISMHMELRQFYGPEESGCPQWMTWEKLELLPR ALKDIVLGSDRTELGGWMSIYSAADMKGCMEKVQFLKYAEEACYNGSLTIKALSSGLEIG ACNWNILSPKGNIIYLSGSVFASATATSFDYKALEDSDVLLYSDFAACNDVDGEKNDFPP ATGSSYSSNIGSCWETIPESWLDSDEYSEEMEKVSFICSCVLDTISDGGSVLIPIGRPGV MLQLLENISLSLESSNLKVPIYFVSSVAEELLAFSNIIPEWLSSQLQERFCSGQPLFTHI QLSNEKKLFVSPAIHSSKFLTSWQEPCIVFCPHWSLRLGPVFHLLQRWCADPNSLLIIEE RADIKLALLPFEPMSMKVLQCSFISGIKLKKAIPLLKILQPKHVLVPESLRPHISCWNPK FSVQSFSENETVVVPKLKAFADMDIAMDVASELLIDTKMIEGKNIARLKGELLIEQGKYR CVVRNKQVLSSQVRPLLFVGRVDLDSLLMALKKMGMKVAAQSSGGSEHVSLIFISEPSEA LIEVTSTQTTISVGDETTASLISEAVRSTSVCF*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g097460.3.1
Transcript Infomation	integrator complex subunit (AHRD V3.3 *** AT3G07530.3)
Sequence	ATATTTTTTGGAACCAAAAAATATATTTATTATACTTAGAAAATTGCATGACGTTTTAAG TTAAGAGTAATATTGTAACTAACCTATAATAATAATTGATGCCTTAGTATGTTTAGAAAA TTGCATGCCGTTTTAAGTTAAGAGTAATATTGTAACTAACCTATAATAATAATTGATGGC TTAATACGTGTGTCAAAGTGGATAACTAATAGGGACAGAGAGGAGTATAACTTTGACAAG AAATATTAAGTCACACTGACACACACGCACACTACACTAATTTTTTATTGAATATTTGGA ACTACACCTATGTATATAAGATTAATTGCTCAAAATTTTGGCGCAATACTGTATTTATTT ATTTTAAGAAAACCTGATGCCCTGATTGAGAATTGGGAATTAGGATTAAAGCCCTAGTAC CGAAGACAGTAAGTTCTTGAGTTCACTGCTCTCATCGCCGGTCGCTGGTCGCCTGTTGCC GTTAACTCTACTCACGGCTACTACGGGATTCATGGTTAAAAATGGTAGATTTGGTTCTGT GATGGATAAGGAGTTGCTGACTCTGGTTTTTCTTTGTGCAATGCTTTGGACTTGGCTACA GTTTGCCAAACTTTTTACTGAAAATGTCAAACTGGGTTGAACCATGCTAATCAGCAATTT GGGTTATTCTTTGCCTGTTAATGATGCGAGTATACCTATTAAAGAAAAGCTGAAATGGCC AGTTGATGCTTTGCTTTATTTTGTTGGGGGTGGGGAGAGTTTCCAATTCTTAAGCTCTAC ACATTTCTATTCATATTGATGGGCCAAATTTTCTGTTGGATTCAAGGAATCCCAAAGTTC ACTATCCTTAAGATTTTCTGCTGATGGACACAAATAGAGCACACGACCAAGGAAAAAAGG CAATGAAAAACATAGTAGAGGTCTCATAGCTTAGTATTCATAGCAAAAGAGAAGAAAACT AGTAGACCATCTATATGCTATACCATTTTATACTATTGGAGGATTGATCTGTATATTTCG AAGGGTCAATTCTGGATTTCAAAAATTCAAGTGCAAATGCGGGCTTTATAAAAAAGAGAA GAAAAATGAAAAAGAGAGTGACATCATGGACTCACGGGCATTACATCAGCAACAACAATG GGATAGGAAAAAACAGGATAATTGTAGAATGAAATCAGTGACGTGAAGGAAGTGATTCTT TTATTTAGATTTTTGGTTCAAGTGGTTGTTTATATCTGCAATTCTCCTTGGTATTCTGTT GGGTGCAAGGAGACCGCCAAATCAGTACTTCTTCCAATGCCTGCTCCTTTTTGATATGGA CTTCCTTACTGGTAGTAGGTATGGACTTAATTTCCTCAATCAACTGTGCACCCGATAAAT TTGTTTCCTTAACAGGAAGTACAAAGAGGCTGATATCCTTCGGAACATTAAGATATCCTG TTTGCTGAGAAACTTTAGCAATCTTCAATTCCATGAAGCTTACATGTTTAAGTGAGGGCA GGGGCTACTATTTCCCACCATGCCACATAGTTAATATATGTGGTTTCCGGGTGTTACTTG ACTGCCCTTTGGACCTTTCAGCCCTAGCTGTATTTTCTCCCCTACCAATTGTTATTTCTT CCCTGCTTGATGAGAAAGCTTCTATTCATAGCGGCCAAAGTTCATCAAATTCAGAGTCTG TAAGACAGGAAGTTTCGGAGCTTCTTGATTCCAAAAAATTGATTCAGGCTGAGCCTTGGT ATAAAACTGTGAAAAGTTTGCAGCTTTGGAGTATTTATTCCATAGATGTGGTACTAATCT CAAGTCCGATGGGTATGCTAGGGTTACCTTTTCTTACCCGCCTCAAAGACTTCAGAGCAA AGATATATGCAACGGAAGCAGCTTCCAGACTAGGAAAACTGATGATGGAGGACCTGATTT CCATGCATATGGAGTTGAGACAATTCTATGGACCTGAAGAGTCTGGTTGCCCTCAATGGA TGACATGGGAAAAACTTGAACTACTTCCTAGGGCACTAAAGGATATTGTTTTAGGCAGTG ACAGGACAGAGCTCGGTGGATGGATGTCCATATACAGTGCAGCTGATATGAAGGGTTGCA TGGAGAAGGTTCAATTCCTCAAGTATGCTGAAGAAGCCTGCTATAATGGCTCATTGACCA TAAAAGCACTGAGTTCTGGTTTAGAGATAGGTGCTTGTAATTGGAATATTCTAAGTCCAA AAGGAAACATTATTTATCTTTCTGGCTCTGTTTTTGCATCAGCAACTGCAACCAGTTTCG ATTACAAAGCTCTTGAAGACAGTGATGTTCTATTATATTCAGACTTCGCAGCCTGCAATG ATGTTGATGGTGAAAAGAACGATTTCCCTCCTGCTACTGGCAGTTCCTATTCAAGTAATA TTGGTAGTTGTTGGGAAACAATACCTGAATCGTGGCTGGATTCAGATGAGTACTCTGAAG AGATGGAAAAAGTATCTTTTATATGTTCATGTGTGTTGGACACTATTAGTGATGGAGGAT CAGTCCTTATTCCCATTGGACGGCCCGGAGTCATGTTGCAGCTGTTGGAGAACATATCAC TTTCACTAGAATCTTCAAATTTAAAGGTTCCTATATACTTCGTTTCTTCTGTGGCGGAAG AGTTGTTGGCATTTTCCAATATCATACCTGAATGGCTGTCCAGTCAACTGCAAGAAAGAT TTTGTTCTGGGCAACCACTATTCACGCATATTCAGCTGTCAAACGAGAAAAAACTCTTCG TATCTCCTGCAATACATTCTTCGAAATTCCTAACAAGTTGGCAGGAACCTTGCATAGTAT TCTGTCCTCACTGGAGTTTGAGACTTGGCCCTGTTTTCCATCTCCTTCAACGTTGGTGTG CAGATCCTAACTCGTTGCTTATCATTGAGGAAAGAGCTGATATCAAGTTGGCTTTGTTGC CTTTTGAGCCAATGTCAATGAAGGTCCTTCAATGTTCATTCATCTCTGGAATAAAGCTAA AGAAAGCTATACCTTTACTAAAGATATTACAACCTAAACACGTGCTGGTCCCTGAGAGTT TGAGGCCCCATATCAGCTGTTGGAACCCCAAATTTTCGGTCCAAAGTTTCTCCGAGAATG AAACTGTAGTTGTGCCCAAGTTGAAAGCATTTGCAGATATGGACATTGCCATGGACGTGG CTTCTGAGCTGCTCATTGATACAAAAATGATAGAGGGAAAAAATATTGCAAGATTAAAGG GAGAGTTGCTCATTGAGCAGGGAAAGTATCGGTGTGTTGTTAGAAACAAGCAAGTGCTTT CTTCCCAAGTTAGGCCATTGCTATTTGTGGGTAGAGTTGACTTGGACTCCCTTTTGATGG CTTTAAAGAAGATGGGGATGAAAGTAGCTGCCCAGAGTAGTGGTGGATCAGAACATGTAT CACTTATATTCATCTCGGAGCCCAGTGAAGCCTTGATAGAGGTTACATCAACTCAAACCA CCATAAGCGTTGGTGATGAGACTACTGCTTCCTTGATTTCTGAGGCTGTTCGTAGCACTT CAGTTTGTTTCTGATAAAAGATGGTGGCCCTTGTATATACCTAGATGCCAATGGCTCCAA AAAAGAATCTCTTACCAAAGCTGAAAATGTTTTCGAAATGAAAATCAGACAGATTTGGGA ACACATAGTTAAATGTCTTCCAAGGAGTTTCTTAAATTTTTCAAGAAATGCCAATGGAAC AGTTGAGGTTGAAGCAATGTCACATAAATCATGTCCAAGTTTGACTAAACTAATGCCAAA ATGGTCTTAAATGAAAAATGACACCTCTTTCTACTGTTTTATATATGGCATTATATGAAA ACATTTTTCTTAATTTAGGATACAATACAAGTTCAAACAGGATCGGTTTTATAGTGACTT GCTCTATATAAAGCTCCTCTCCTTATGCTCAAAGTAAACTAAGTCTCTCATTCTAGTA