Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g095450.3.1

CDS Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G01960.1)

Sequence

ATGGATACTTCTGAGAATAATGCAAATGGTTCTCTTTCATCTCCTACAAGTTCCAATTTG
ACGGCTTTTGGAGTACAATTCACACCGCTTCGGTTCTTCCAATCCCCTGTTTCCACTTTG
CTTGAGTATTCCGGACTCTTTACGGTTCGACCCGATAACCCAGAAATGGACCCTCTTGTA
GTTGATGATACTGTTACTAACGAGGCTGAATCCAGTAGCAATGTTGGTGGAGGTAATAGT
AGCAGTGGGGAGGTTTCAATTAGGATAATTGGTGCTGGGGAGAATCAAGGGATAGGGGGT
GAGGATGAAGATGATGGGTCGGTGATGGATGGTGAGGAAGGGGGTGCTGTTGAGGAAAGG
GGTTCTGGTGTGGACGCGTCGTCTATGGTGGCTGATGATGATGCTGGTAATGCTAGTAGG
GATTCGTCGTACCAAAGATTTGATATACAGCAAGTTGCTAGGTGGATTGAGCAGATTCTT
CCATTTTCCCTTCTTCTCTTGTTTGTTTTCATACGCCAGCATTTGCAAGGTTTCTTTGTC
ACAATTTGGATAACTGCTGTCATGTTCAAGTCAAATGACATTCTTCGGAAGCAGACAGCT
TTAAAGGGAGAGAGAAAAATAGATGTCCTTGTTGGTTATTTTGTGGTTTTTGTGATACAT
GTTACTGGAATCTACTGGTGGTATCACAATGATGAACTTTTCTATCCATTACTAATGGTT
CCTCCGAAGGTTATCCCACCTTTCTGGCATGCTATTTTCATCATCCTGGTAAATGATACC
ATGGTGCGGCAGGCAGCAATGGCTTTGAAGTTGGTGCTGCTTATGTATTACAAGAATGGC
AGGGGCCACAACTTTCGTAGACAGGGTCAAATCCTGACTCTGGTGGAGTACATGCTGTTG
TTATACCGTGCTTTGTTACCAACTCCTGTGTGGTATAGATTCTTTCTCAATAAAGAATAC
GGAAGCCTTTTCTCATCACTGACAACGGGATTGTACTTAACGTTTAAGCTTACCTCAATT
GTTGAGAAGGTAAAATCATTCTATACTGCTTTGAAGGCATTGTCAAAAAAGGAAGTCCAT
TATGGGTCTCATGCCACACCTGAGCAGGTGAATGCGGCTGGTGATTTGTGCGCTATTTGC
CAGGAGAAGATGCATGCACCAATTTTGTTACGTTGCAAACACCTCTTCTGTGAAGACTGT
GTCTCAGAATGGTTCGAAAGAGAAAGAACATGCCCTCTGTGCAGAGCGTTGGTCAGACCG
GCTGATCTAAGATCGTTTGGTGATGGATCCACTAGCCTTTTCTTCCAGTTATTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g095450.3.1

PEP Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G01960.1)

Sequence

MDTSENNANGSLSSPTSSNLTAFGVQFTPLRFFQSPVSTLLEYSGLFTVRPDNPEMDPLV
VDDTVTNEAESSSNVGGGNSSSGEVSIRIIGAGENQGIGGEDEDDGSVMDGEEGGAVEER
GSGVDASSMVADDDAGNASRDSSYQRFDIQQVARWIEQILPFSLLLLFVFIRQHLQGFFV
TIWITAVMFKSNDILRKQTALKGERKIDVLVGYFVVFVIHVTGIYWWYHNDELFYPLLMV
PPKVIPPFWHAIFIILVNDTMVRQAAMALKLVLLMYYKNGRGHNFRRQGQILTLVEYMLL
LYRALLPTPVWYRFFLNKEYGSLFSSLTTGLYLTFKLTSIVEKVKSFYTALKALSKKEVH
YGSHATPEQVNAAGDLCAICQEKMHAPILLRCKHLFCEDCVSEWFERERTCPLCRALVRP
ADLRSFGDGSTSLFFQLF*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g095450.3.1

Transcript Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G01960.1)

Sequence

ATGTTATGTTTGAAGATATTTGTCTCCAAAAAAGGAAGAAAAATTACGTTACACGTTAAT
GTTTAATGCTTCATCTCTCCCTAAAACCCTTCTCTCTATAACTCTCTTCTGCTAAAAAGC
TCTGTTCTTTTACATCTTTCTCTGATATTTTTATTCTTCTGTCAGTATCTGAACATTAAT
TTTCTTTACTTTTGTTAGATTTAATAGTATATTTATATCAAGATTTCTCACTCATCTGAC
TTCTCTTACAATTTGAACATTTCTTTGCGAGATTCTTGTGTCAAATACCCTATTCTTCAT
CTTCAAGTAATACCCCATAAAGCCATTCTTGGATCAGTACAAATTACATAATCATCTATC
TCTGTAACACCGACTGACCCTTTTGATGGATACTTCTGAGAATAATGCAAATGGTTCTCT
TTCATCTCCTACAAGTTCCAATTTGACGGCTTTTGGAGTACAATTCACACCGCTTCGGTT
CTTCCAATCCCCTGTTTCCACTTTGCTTGAGTATTCCGGACTCTTTACGGTTCGACCCGA
TAACCCAGAAATGGACCCTCTTGTAGTTGATGATACTGTTACTAACGAGGCTGAATCCAG
TAGCAATGTTGGTGGAGGTAATAGTAGCAGTGGGGAGGTTTCAATTAGGATAATTGGTGC
TGGGGAGAATCAAGGGATAGGGGGTGAGGATGAAGATGATGGGTCGGTGATGGATGGTGA
GGAAGGGGGTGCTGTTGAGGAAAGGGGTTCTGGTGTGGACGCGTCGTCTATGGTGGCTGA
TGATGATGCTGGTAATGCTAGTAGGGATTCGTCGTACCAAAGATTTGATATACAGCAAGT
TGCTAGGTGGATTGAGCAGATTCTTCCATTTTCCCTTCTTCTCTTGTTTGTTTTCATACG
CCAGCATTTGCAAGGTTTCTTTGTCACAATTTGGATAACTGCTGTCATGTTCAAGTCAAA
TGACATTCTTCGGAAGCAGACAGCTTTAAAGGGAGAGAGAAAAATAGATGTCCTTGTTGG
TTATTTTGTGGTTTTTGTGATACATGTTACTGGAATCTACTGGTGGTATCACAATGATGA
ACTTTTCTATCCATTACTAATGGTTCCTCCGAAGGTTATCCCACCTTTCTGGCATGCTAT
TTTCATCATCCTGGTAAATGATACCATGGTGCGGCAGGCAGCAATGGCTTTGAAGTTGGT
GCTGCTTATGTATTACAAGAATGGCAGGGGCCACAACTTTCGTAGACAGGGTCAAATCCT
GACTCTGGTGGAGTACATGCTGTTGTTATACCGTGCTTTGTTACCAACTCCTGTGTGGTA
TAGATTCTTTCTCAATAAAGAATACGGAAGCCTTTTCTCATCACTGACAACGGGATTGTA
CTTAACGTTTAAGCTTACCTCAATTGTTGAGAAGGTAAAATCATTCTATACTGCTTTGAA
GGCATTGTCAAAAAAGGAAGTCCATTATGGGTCTCATGCCACACCTGAGCAGGTGAATGC
GGCTGGTGATTTGTGCGCTATTTGCCAGGAGAAGATGCATGCACCAATTTTGTTACGTTG
CAAACACCTCTTCTGTGAAGACTGTGTCTCAGAATGGTTCGAAAGAGAAAGAACATGCCC
TCTGTGCAGAGCGTTGGTCAGACCGGCTGATCTAAGATCGTTTGGTGATGGATCCACTAG
CCTTTTCTTCCAGTTATTCTAGACTACATATTAATTATCCTACGCCAAAGTAAATATCTG
TCCACATCTTTGTCCACCTGATATTACTGGATTCTGGGGGTTGCCCCGTTAAGGTTTCTG
CTGGAATGCAGCATTAAAGTAAAAACAGGCAGATTCTTTGAGGAAGATATACACATCTAC
TCCCATATCGTACATAATTTTTTCCCCCCATGAGATATGTGCATGTAATACTTTCCAAAA
AGA