Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g093630.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9PNP9_ZOSMR)
Sequence	ATGGATAGTAATAGTAATAGCATAGTGAGGCTATCATCAATTACTACAAGTTGGTTGCAT CAACACTTAAACTCAACTCAACATTATGCTTCTCTTCTCCAATCTTGCATTGCTCGAAAA GCAGTTCAGCCTGGAAAGCAGCTCCATGCGCATCTATGCCTCACGGGTTTAGGCTACAAT ATCAATTTAGCAACAAAGCTTGTTAATCTTTATTGTGTTTGTGACAAATTGCCGAATGCC CATCACCTGTTTGATAGAATTCCTAAAGGAAATATTTTTCTTTGGAATGTTTTGATTCGT GGGTATGCTTGGAATGGACCATATGAGGCTGCAATTTCTCTGTATCATCAAATGATTGAT TATGGTCATGTGCCTGATAATTTTACTTTTCCGTTTGTACTTAAAGCGTGTTCGGCCTTG TCTGCGATTGAAGTGGGGAAGGATATACATGATTATGCGAAGAGAACGAAGTGGGATAAG GATGTTTTTGTGGGTGCTGCTCTTATTGACATGTATGCTAAATGTGGTTGTGTTGGTAGG TCGAGGGAGGTGTTTGAGAATGTCGTTGAGAGGGATGTAGTTGTTTGGAATTCAATGCTT GCTGCTTACTCACAAAATGGTCACCCTGAGGATTGTTTGGCTTTATGTGGTGAAATGGCT TGCGGAGGTATTAGACCCACGGAGGCGACCTTAGTGACTGCGATTTCTGCTTCTGCTGAT GTTGCAGCTCTTCGACAGGGGAGGGAGCTTCATGGGTATAGTTGGAGACAGGGTTTTGAC TCTCTTGACAAAGTGAAGACAGCACTTGTGGATATGTATGCCAAGAGTGGGTCTGTGAAG GTTGCTAGGATCTTGTTCGAAGGACTCCAGGAGAAAAGAGTAGTTTCTTGGAATGCTATG ATCACTGGATATGCAATGCATGGTCATGCTAATGCAGCACTTTGCCTGTTTAATGAGATG GTTGGCAAAGCTAAGCCGGATCATATAACTTTTGTAGGTGTTTTATCAGCTTGTAATCAT GGAGGTCTGTTGAGTGAAGGGAGGATGTATTTTGATTCAATGGCAAAAGATTATGGAATT GAACCGACTATTCAGCACACTACATGCATGGTTGATCTGCTAGGTCATTCTGGTCGCTTA GATGAGGCTTATGGACTTATAACGCAGATGAAAGTTATGCCGGATGCTGGTGTCTGGGGT GCATTTCTTAATTCATGTAAAATCCATGGTTATGTGGAATTTGCAGAATTGGCATTAGAG AGGTTGATTGAGCTTGAGCCTGATGATGCAGGCAATTATGTGATCCTATCTAATATTTAT GCCCAAGCAGGTAGATGGGAAGGTGTTGCAAAGCTTAGAGAACTAATGAACGAAAGAGGT GTAAAGAAAACCACCGCGTACAGTTGGATTGAAGTTAAAAACAAAGTACATGCATTTCTC TCTGGGGATACATCTCATCCTATGTCTGACGAGATTTATGCAGAGCTACAGAGCTTAGGA GCACGAATGGTACAAGCTGGCTATGTCCCAAACATTACGCCAGTTTTCCATGATGTGGAA GATGATGAGAAGAGCAGAATGGTGTGCAGCCACAGTGAAAGGCTAGCAATTGCTTTTGGA CTAATTAGTACACCCCCAGGGACAAAGTTGTTGATCACCAAGAATCTCCGAGTTTGCGAG GACTGTCATGTTGCGATCAAGTTTATCTCAAAGTTAACAGAGAGAGAAATCACTATCAGA GATGTCAATCGCTATCATCATTTCAAAGATGGCATCTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g093630.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9PNP9_ZOSMR)
Sequence	MDSNSNSIVRLSSITTSWLHQHLNSTQHYASLLQSCIARKAVQPGKQLHAHLCLTGLGYN INLATKLVNLYCVCDKLPNAHHLFDRIPKGNIFLWNVLIRGYAWNGPYEAAISLYHQMID YGHVPDNFTFPFVLKACSALSAIEVGKDIHDYAKRTKWDKDVFVGAALIDMYAKCGCVGR SREVFENVVERDVVVWNSMLAAYSQNGHPEDCLALCGEMACGGIRPTEATLVTAISASAD VAALRQGRELHGYSWRQGFDSLDKVKTALVDMYAKSGSVKVARILFEGLQEKRVVSWNAM ITGYAMHGHANAALCLFNEMVGKAKPDHITFVGVLSACNHGGLLSEGRMYFDSMAKDYGI EPTIQHTTCMVDLLGHSGRLDEAYGLITQMKVMPDAGVWGAFLNSCKIHGYVEFAELALE RLIELEPDDAGNYVILSNIYAQAGRWEGVAKLRELMNERGVKKTTAYSWIEVKNKVHAFL SGDTSHPMSDEIYAELQSLGARMVQAGYVPNITPVFHDVEDDEKSRMVCSHSERLAIAFG LISTPPGTKLLITKNLRVCEDCHVAIKFISKLTEREITIRDVNRYHHFKDGICSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g093630.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9PNP9_ZOSMR)
Sequence	ATGGATAGTAATAGTAATAGCATAGTGAGGCTATCATCAATTACTACAAGTTGGTTGCAT CAACACTTAAACTCAACTCAACATTATGCTTCTCTTCTCCAATCTTGCATTGCTCGAAAA GCAGTTCAGCCTGGAAAGCAGCTCCATGCGCATCTATGCCTCACGGGTTTAGGCTACAAT ATCAATTTAGCAACAAAGCTTGTTAATCTTTATTGTGTTTGTGACAAATTGCCGAATGCC CATCACCTGTTTGATAGAATTCCTAAAGGAAATATTTTTCTTTGGAATGTTTTGATTCGT GGGTATGCTTGGAATGGACCATATGAGGCTGCAATTTCTCTGTATCATCAAATGATTGAT TATGGTCATGTGCCTGATAATTTTACTTTTCCGTTTGTACTTAAAGCGTGTTCGGCCTTG TCTGCGATTGAAGTGGGGAAGGATATACATGATTATGCGAAGAGAACGAAGTGGGATAAG GATGTTTTTGTGGGTGCTGCTCTTATTGACATGTATGCTAAATGTGGTTGTGTTGGTAGG TCGAGGGAGGTGTTTGAGAATGTCGTTGAGAGGGATGTAGTTGTTTGGAATTCAATGCTT GCTGCTTACTCACAAAATGGTCACCCTGAGGATTGTTTGGCTTTATGTGGTGAAATGGCT TGCGGAGGTATTAGACCCACGGAGGCGACCTTAGTGACTGCGATTTCTGCTTCTGCTGAT GTTGCAGCTCTTCGACAGGGGAGGGAGCTTCATGGGTATAGTTGGAGACAGGGTTTTGAC TCTCTTGACAAAGTGAAGACAGCACTTGTGGATATGTATGCCAAGAGTGGGTCTGTGAAG GTTGCTAGGATCTTGTTCGAAGGACTCCAGGAGAAAAGAGTAGTTTCTTGGAATGCTATG ATCACTGGATATGCAATGCATGGTCATGCTAATGCAGCACTTTGCCTGTTTAATGAGATG GTTGGCAAAGCTAAGCCGGATCATATAACTTTTGTAGGTGTTTTATCAGCTTGTAATCAT GGAGGTCTGTTGAGTGAAGGGAGGATGTATTTTGATTCAATGGCAAAAGATTATGGAATT GAACCGACTATTCAGCACACTACATGCATGGTTGATCTGCTAGGTCATTCTGGTCGCTTA GATGAGGCTTATGGACTTATAACGCAGATGAAAGTTATGCCGGATGCTGGTGTCTGGGGT GCATTTCTTAATTCATGTAAAATCCATGGTTATGTGGAATTTGCAGAATTGGCATTAGAG AGGTTGATTGAGCTTGAGCCTGATGATGCAGGCAATTATGTGATCCTATCTAATATTTAT GCCCAAGCAGGTAGATGGGAAGGTGTTGCAAAGCTTAGAGAACTAATGAACGAAAGAGGT GTAAAGAAAACCACCGCGTACAGTTGGATTGAAGTTAAAAACAAAGTACATGCATTTCTC TCTGGGGATACATCTCATCCTATGTCTGACGAGATTTATGCAGAGCTACAGAGCTTAGGA GCACGAATGGTACAAGCTGGCTATGTCCCAAACATTACGCCAGTTTTCCATGATGTGGAA GATGATGAGAAGAGCAGAATGGTGTGCAGCCACAGTGAAAGGCTAGCAATTGCTTTTGGA CTAATTAGTACACCCCCAGGGACAAAGTTGTTGATCACCAAGAATCTCCGAGTTTGCGAG GACTGTCATGTTGCGATCAAGTTTATCTCAAAGTTAACAGAGAGAGAAATCACTATCAGA GATGTCAATCGCTATCATCATTTCAAAGATGGCATCTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTGA