Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g083320.3.1
CDS Infomation	calcium sensor calcineurin B
Sequence	ATGGGCTGCTTTCCCTCAAAAATCTGCCGATTCAGTACCCCTGGTTACGAGGATCCAACA CTGCTGGCTGCTGAGACCGCTTTCCAAAACAGCAAATTGAGCATTCTGTTCAACGATTTA TGTATTGCAGTTACGGTGAGTGAAGTTGAAGCATTATATGAGCTGTTCAAGAAAATAAGC AGCTCTATAATTGATGATGGACTAATTCACAAGGAAGAATTTCAGCTGGCAATTTTCAAG AACCAAAACAGGAGAGATCTTTTTGCAGACAGGATTTTTGATCTATTTGATTTCAAGCGC AACGGAGTGATTGGATTTGGAGAATTTGTCAGATCATTGAGTGTATTCCACCCAAATGCA CCAGTAGCAGATAAAATTGCATTTGCATTCCGATTATATGATCTAAGGCAGACTGGTTAT ATTGAGAGAGAAGAGCTGAAAGAGATGGTTTTGGCGCTGCTGAATGAGTCAGACTTGATT CTTTCGGATGATATAGTTGAAATGATTGTAGATAAGACATTTGATGAAGCAGATAAAAAG AGTGACGGGAAGATAGATGAAGAAGAATGGAAGGAGTTTGTTTCAATGAATCCCTCTCTT CTAAAGAATATGACCCTTCCATATCTCAAGGATATAACTTTAGCATTTCCTAGCTTTGTG ATGAACTCTGAGGTGGAAGATTCGGAAGTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g083320.3.1
PEP Infomation	calcium sensor calcineurin B
Sequence	MGCFPSKICRFSTPGYEDPTLLAAETAFQNSKLSILFNDLCIAVTVSEVEALYELFKKIS SSIIDDGLIHKEEFQLAIFKNQNRRDLFADRIFDLFDFKRNGVIGFGEFVRSLSVFHPNA PVADKIAFAFRLYDLRQTGYIEREELKEMVLALLNESDLILSDDIVEMIVDKTFDEADKK SDGKIDEEEWKEFVSMNPSLLKNMTLPYLKDITLAFPSFVMNSEVEDSEV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g083320.3.1
Transcript Infomation	calcium sensor calcineurin B
Sequence	ATATTGCTTTCCCATTGGTATATATGTATTTTTCGAAATCGTAATAATCTTTTTCTACCT ATGTTCCATCTGAATTTGTGACTTAAAAAATGGTCCTATGGTAATGACATTTGGACCCTT AAACTTGGTCTCTAACTGCAAAAAGCTTTCTATCTGTATGTTATTACTGTCCTTTTTATG TTTAGATCCATCCTCTTTTCTCTTTTTAATGTGTTGTAATATGTTTTCTTTCAGAGCTAT GGTATTTTAGGTCCATACATATTAGTAACTCCAGTTTATTTGTGAGGGAAAAAAATGTTT ATGTCATAACTATATCTCTTTGCATTGTCAAGGCTATAAGTAAATTAGTTGCGAAAACAG AATGGTATAGTGCTGCTGAAGATATAAGATGCAGATTTTGAAGTGAAGGGCAATTGCTAT ATAGAGCTAGAAGCTTTGATCCATTTGTTCTTCTATTCTTGTTTTTATCTTATTTTGAGT AAGCGATAACATTCGATGTCCTGGTGATTACCTTGAACCTGATAAAGTAGCACAAATCAG AGGCTGTTTGACGAAGCTTCACTAGAATATATCGTTAGTTAACCAACATTTTATTGAATT TGGTCTTTTGATGGGCTGCTTTCCCTCAAAAATCTGCCGATTCAGTACCCCTGGTTACGA GGATCCAACACTGCTGGCTGCTGAGACCGCTTTCCAAAACAGCAAATTGAGCATTCTGTT CAACGATTTATGTATTGCAGTTACGGTGAGTGAAGTTGAAGCATTATATGAGCTGTTCAA GAAAATAAGCAGCTCTATAATTGATGATGGACTAATTCACAAGGAAGAATTTCAGCTGGC AATTTTCAAGAACCAAAACAGGAGAGATCTTTTTGCAGACAGGATTTTTGATCTATTTGA TTTCAAGCGCAACGGAGTGATTGGATTTGGAGAATTTGTCAGATCATTGAGTGTATTCCA CCCAAATGCACCAGTAGCAGATAAAATTGCATTTGCATTCCGATTATATGATCTAAGGCA GACTGGTTATATTGAGAGAGAAGAGCTGAAAGAGATGGTTTTGGCGCTGCTGAATGAGTC AGACTTGATTCTTTCGGATGATATAGTTGAAATGATTGTAGATAAGACATTTGATGAAGC AGATAAAAAGAGTGACGGGAAGATAGATGAAGAAGAATGGAAGGAGTTTGTTTCAATGAA TCCCTCTCTTCTAAAGAATATGACCCTTCCATATCTCAAGGATATAACTTTAGCATTTCC TAGCTTTGTGATGAACTCTGAGGTGGAAGATTCGGAAGTCTAGACTCATGCTTTTAGCAT ATAACACGCGTAGTTGAAACTCCCACGTATCAGGTAATCTCTTCCGAACTAGTGATGCAA CAGAAATGCAAAAGAGTCGAGATTAATCGGATTTTGCATTGAAATTTTGGAAGTTGGCTA CACCAGATTGATGCAGAAAATCAGTTCTTTTGCCAGCTCCAATAGGCATTAGCAAGATGT ACTACTTTTAAAGTATCTAGCTAGTCTGTTGGAGTTAGATATCAAGGTAGTATTGAAAGT CGAAGTTTTGTTCAAATGTAATAAACAAACATGAATTTCAAATTTGAAATCCAAATTGCA ATGATCAAACGGACTCTGTAGTTCCTCAAAACCTTTTTCTCACTTCTCATCTACTTAGAA GCTCTTTGTATCGGAAGGACGGTTAAACTTTTGCATTGAGATGAAATAAATTCTATCCTG TTTGTATATTCGTAAGCGAAATAGACAAAATGCAGACTCCATACCAAACACTACTACCTA TAACGCAATTATCGAAATTAGTCTAACAATAATTGAATCAATGACATCTTTTGCCTCATA TGCCTTATTTACAAACATGTACCCAGAGATCTTTATAGAGTCGTTGCTCATTTACAACAT TTTGTCATAGATGGATTTACCCCAGAGCTAAAATAAGCTATAGATCTGTCAACATGCATC AACACAACGCCTATTCTACAAAAAATTCTTTAGTATAATCAGGAAGCTTTAATTTAGGTA GGATTAAAATCACCAACTTAGTATAATTTTATGATGACAATTTAAATTTGTTTGCTACTA ATCTCAAAGAATACGATGTAAAATATTTTTTAAAAAAAATAGTTTTATAGCCAAAATTAA TTTCATAACATAGTTGAGCTCTCGCCATTTATATTTTTTTAAAAAAATTCTTAATATTTA AAACATTTACAAAGGTAAAAATAATTTCTAAAATATATCCATATATTATCAAATGAGAAT TTA