Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g078300.2.1
CDS Infomation	Disease resistance protein (AHRD V3.3 *** A0A068EUA8_SOLLC)
Sequence	ATGGCTGTAAAATATAAATTAATTAACTTTATTATCATCACTTATTTGTCAAACACATCA ATAATATTTTTTTCAGCTTTAGCACTTTTATCTAAACTACTTTTTCTTAAAGTTGCTCCA AACTGGGTTAGACTCAAATCGGAAATGGATATCGGTTTAACAGTTGGAGGTGCGTTCCTC TCTTCAACTCTGCAAGTTCTGTTTGATCGACTCACCCCACAGTGTGATTTCCTTAATCTG TTCCGAGGACGGAGGCAAGATCAGCGTCTCTTAAAAAAGCTTCATACTAATTTACTTGCT CTTCGTGCTGTTGTCCATCACATCGAGATCCAGCAAATTTGTGACGAAGATATTCGGACT TGGCTGAACCAACTTCAGGATGCTGTGGACACTGCAGATAACTTATTAGATGAGATCAGT TATGAAGTTTTGAGAGTATCTGGTGAGGAAACAAGTCGTTTTTGCTACTTAGACTCCATG ATGCCCAAATTGGAAGAGACCATTGAAACGTTGCAAGACTTGGAAACACAAATTAATTGC CTCACGATCACCCTGAAAGCTCAACTGGTGACGGGTAAAAAGGATTCACCTAAACGTCTC CCATCGACTTCTTTGGTTGATGAATCAGGGGTATTTGGTAGACATCAGGAAGTTGAGGAA ATAATCAGCAAATTGTTATCATCTGATGATGATGCACATGGATCTGGTGATGTGGTTCCG ATAGTGGGATTGGGTGGAGTGGGCAAGACAACACTTGCTCGAGCTGTTTACAATGATAAG AGGATAAAACAACATTTCAATATTACAGCATGGGTTTGTGTTTCAGAAGAATATGACGCT TTCAGAATTACAACAACATTGCTTGGAGAGATAATTGGGTCATTGGATTCAAAAGTTAGT GCCAGCAATCTTAATCAGCTCCAAATTAAGCTAAGTCATAGGCTTAAAGGGAAAAGGTTT CTTTTTGTTCTAGATGATGTATGGAATGAAAATTACACTGATTGGGATGAGTTAAGGTGT CCTTTTGTTCATGGACGAAAGGGAAGCAGGATCATTTTAACAACAAGAAAACAAAGCGTT GCCATGATGATGGCAAGTGAGATGATTCAGTTGAAATCTCTTTCTGATGAAGATTGCTGG TCTTTGTTTAAAACACATTCATTTGAAAATAGAGATCCCAACAAATATCCAGAGCTTGAA GTGGTTGGCAGGCAAATTGTGGGGAAGTGCAAGGGGTTACCTTTAGCTGTGAAGACGTTG GCAGGTCTATTGCGCTCTAAATCAACTATTGAAGAGTGGGAACGTCTTCTGCAAAGTGAA ATATGGGAGCTACCAAGTGACATATTACCAGTGCTCAAACTAAGCTATAATGACCTTTCT CAGGTGCTAAAGCGTTGCTTTGCTTATTGTGCACTATTTCCTAAAGATCACCCCTTTGGT CGTGACGAGGTTGTTCAACTATGGATCGCTAATGGCCTTATAACACAGGGAGAAAGTGAT GAAACAATTGAAGATACAGGGAATCAATACTTTTTGGAGCTAAGATCAAGATCCTTGATA CAAAAGGCATCTGATCTCAATTTGTTGAAATGGGAAGCAAGGGATGTGTTCTTGATGCAT GACCTTGTCAATGATTTGGCTCAAGTTGTGTCTGCAAAACTCTGTCTCAGGCTTGAAGAT TATCCAAGGACTCACATATTGAAAAGAGTTCGACATTTGTCATATCTTAGAGATTGCTAT GGTGAGTTTGACAAGTTCAAATCTCTTTCTGGCCTTGAGTATTTGAGGACATTGATTCCC GTAAGGATTAATTTTTATTCATTTCTGAGCAAAAAAGTTGTGTATGACATACTGCCAACC CTCACCTCCTTGAGGGCATTATCCTTATCTGGATATCAAAACAATGAGTTTCCTGATGCC TTGTTCATCAATATGAAGCACCTACGCTATTTGGACTTTTCTCGTACAAAAATTACAAAA ATACCAGATTCAGTTTGTACTTTGTATAATCTACAAACATTGTTGCTGTTGAATTGTTGG GGTCTTGTTGAGTTGCCGCCAGAGATGGGGAGATTAATCAACTTGCGTCACCTTGATATT CGAGGAACTGGTATTTCATGGAACATTCCTCTACAGAAAAGCAAGTTACAGATTCTCCTA CTTTCTTATTCAACAAGATTTGTCGTGGGTGCATTTAGTGATTCAAGAATTGAAGAGTTG GGTGAACTTCAAAATCTCCATGGATCCTTATCAATTTCAGAATTGCAAAATGTTGTTAAT GGCAGGGAAGCTATTAAGGGAAACATGAAGGATAAAAAGCACCTTGAAGAGCTATCTTTG TCATGGAGTGGCATTAATGCCGATGATTCGCAAATTGAAAGGGAGATTCTGGATAAGTTG AAGCCAGATAAAAACATTAAGAAGCTGGAGATCAATGGGTATCGAGGGACAAAGTTTCCA GATTGGCTTGGAGATCATTCATTTAGTAAGCTCGTCTCATTGAATCTCCGGAAATGTAGG GATTGCGATTCCTTACCAGCACTTGGACAACTGCCATCTCTCAAACATCTTTCAGTCAGT GGAATGCATCGGATACTGCAATTGACTCAAGAATTTTATGGGAGTGTGTCTTCAGTTCCA CCATTTAGAGCTCTCACAAACCTTGTGTTTAAGCAAATGCCAGAATTGATAGAATGGCAC GTGTTAGAGAATGGAAGCTTTCCTCAACTCAAGCATCTTGACTTAATTAATTGTCCTAAA CTGATAGGGGAGCTACCAAAAAGTCTTCCATTTTTAGCTACATTAAGGATTTCTGGCTGC CCAAAGCTTGGAGTTCTTCCTGATGGTCAAGTGGCTATGTTTGGAATCCATTTGAGTTTG ATCCATCAAAACTTCACGTCTCTTCAAAAATTGAGAATTTCAGACATGCCAAACTTGGTG GAGTTGCCATCAGAAATATGTGGACTAACAAATCTTGGAGAATTGAGGATATCTAATTGT GCAAGCTTAAGAATAATCAGAATTCAGGAAATGCAACAGCTCATTGAATTGGTCATTCGA AATTGTCCAGATCTTATGTCCTTAACAATTCTGAGTCTACCAGTAACACTGGAAAAATTG CATATTTCACGATGCGGAAAATTGGAGTTGGAGTTTCCAGAAGATAGCATGACTGGAAGC TGCTGTAACATGTTCTTTGAAGAATTAAGACTTGAAAATTGTGAGTCTCTACGCCATCTC CCCTTTGGCTTTTCCCTTAGAGTACATACTCTCATAGTCTACAGTTGTAGGCATCTTCAA ACGCTATCATTTCCACATGGAATTGACACCCTTGAAGTAGAAAGATGTGGGAATCTTAAA GCACTTACAGTACCAAAGGGAATTCATCTGAAATTTCTGCATTCGATGAAAATCTCAGGC TGTGATAATCTGACTTCTTTTCCACAAAAACTTGTTGCTCCGAACTTGAAGTATCTTTGG GTTTATGACTGCCAGAAACTGAAAGCACTGCCAGACTGTATGCATGAACTCCTTCCATCT CTTAAAAATCTTTGGATTTCGAACTGTCCTGAACTTGAGTCCTTCCCTGATGGAGGATTG CCTTTCAATATAGAAATCCTAGACATCTCTAGTTGTCAAAATCTGATAACTGGCAGAGAG GAGTGGGGTCTACAGAGACTCCCTTATCTTAGATGTTTCAGAATTTATGGTTCTGATGAA ACTTCAATTCTAGACGTAAGTTGGAAGCTGCCGCAGAGCATCCAAACAATTACCATAGAG GGTCTTCCTCGTCTGAAAACACTAAGTGGGAAAGCTCTTGAGGGATTCAAGTATCTTCAA GTTTTGGAAATTAAGCACTGCCCTCAGCTTCAATCACTATCAGCGGAAGGTCTTCAAGGC CTCACCTCTCTTGCAACATTAGAGATTGAAGACTGTTGTCAGCTGAAATCACTTCCAGAA GTAGGGTTGCCTTCCTCACTTTCTGTTCTGAAGATCTCTTCCTGCCCACAGTTTCTATCA CTACCAAAAAAGGGTCTCCCCTCCTCTGTGTGTCGATTAGAGATCAATGACTGTCCATTG CTCACTCCTCGTTTACATAACAAGAAAGCGGAGGACTGGCTAAAGATTGCTGGAATCCAC ACTCTACTTATAGACTATGAATTGGTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g078300.2.1
PEP Infomation	Disease resistance protein (AHRD V3.3 *** A0A068EUA8_SOLLC)
Sequence	MAVKYKLINFIIITYLSNTSIIFFSALALLSKLLFLKVAPNWVRLKSEMDIGLTVGGAFL SSTLQVLFDRLTPQCDFLNLFRGRRQDQRLLKKLHTNLLALRAVVHHIEIQQICDEDIRT WLNQLQDAVDTADNLLDEISYEVLRVSGEETSRFCYLDSMMPKLEETIETLQDLETQINC LTITLKAQLVTGKKDSPKRLPSTSLVDESGVFGRHQEVEEIISKLLSSDDDAHGSGDVVP IVGLGGVGKTTLARAVYNDKRIKQHFNITAWVCVSEEYDAFRITTTLLGEIIGSLDSKVS ASNLNQLQIKLSHRLKGKRFLFVLDDVWNENYTDWDELRCPFVHGRKGSRIILTTRKQSV AMMMASEMIQLKSLSDEDCWSLFKTHSFENRDPNKYPELEVVGRQIVGKCKGLPLAVKTL AGLLRSKSTIEEWERLLQSEIWELPSDILPVLKLSYNDLSQVLKRCFAYCALFPKDHPFG RDEVVQLWIANGLITQGESDETIEDTGNQYFLELRSRSLIQKASDLNLLKWEARDVFLMH DLVNDLAQVVSAKLCLRLEDYPRTHILKRVRHLSYLRDCYGEFDKFKSLSGLEYLRTLIP VRINFYSFLSKKVVYDILPTLTSLRALSLSGYQNNEFPDALFINMKHLRYLDFSRTKITK IPDSVCTLYNLQTLLLLNCWGLVELPPEMGRLINLRHLDIRGTGISWNIPLQKSKLQILL LSYSTRFVVGAFSDSRIEELGELQNLHGSLSISELQNVVNGREAIKGNMKDKKHLEELSL SWSGINADDSQIEREILDKLKPDKNIKKLEINGYRGTKFPDWLGDHSFSKLVSLNLRKCR DCDSLPALGQLPSLKHLSVSGMHRILQLTQEFYGSVSSVPPFRALTNLVFKQMPELIEWH VLENGSFPQLKHLDLINCPKLIGELPKSLPFLATLRISGCPKLGVLPDGQVAMFGIHLSL IHQNFTSLQKLRISDMPNLVELPSEICGLTNLGELRISNCASLRIIRIQEMQQLIELVIR NCPDLMSLTILSLPVTLEKLHISRCGKLELEFPEDSMTGSCCNMFFEELRLENCESLRHL PFGFSLRVHTLIVYSCRHLQTLSFPHGIDTLEVERCGNLKALTVPKGIHLKFLHSMKISG CDNLTSFPQKLVAPNLKYLWVYDCQKLKALPDCMHELLPSLKNLWISNCPELESFPDGGL PFNIEILDISSCQNLITGREEWGLQRLPYLRCFRIYGSDETSILDVSWKLPQSIQTITIE GLPRLKTLSGKALEGFKYLQVLEIKHCPQLQSLSAEGLQGLTSLATLEIEDCCQLKSLPE VGLPSSLSVLKISSCPQFLSLPKKGLPSSVCRLEINDCPLLTPRLHNKKAEDWLKIAGIH TLLIDYELV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g078300.2.1
Transcript Infomation	Disease resistance protein (AHRD V3.3 *** A0A068EUA8_SOLLC)
Sequence	ATGGCTGTAAAATATAAATTAATTAACTTTATTATCATCACTTATTTGTCAAACACATCA ATAATATTTTTTTCAGCTTTAGCACTTTTATCTAAACTACTTTTTCTTAAAGTTGCTCCA AACTGGGTTAGACTCAAATCGGAAATGGATATCGGTTTAACAGTTGGAGGTGCGTTCCTC TCTTCAACTCTGCAAGTTCTGTTTGATCGACTCACCCCACAGTGTGATTTCCTTAATCTG TTCCGAGGACGGAGGCAAGATCAGCGTCTCTTAAAAAAGCTTCATACTAATTTACTTGCT CTTCGTGCTGTTGTCCATCACATCGAGATCCAGCAAATTTGTGACGAAGATATTCGGACT TGGCTGAACCAACTTCAGGATGCTGTGGACACTGCAGATAACTTATTAGATGAGATCAGT TATGAAGTTTTGAGAGTATCTGGTGAGGAAACAAGTCGTTTTTGCTACTTAGACTCCATG ATGCCCAAATTGGAAGAGACCATTGAAACGTTGCAAGACTTGGAAACACAAATTAATTGC CTCACGATCACCCTGAAAGCTCAACTGGTGACGGGTAAAAAGGATTCACCTAAACGTCTC CCATCGACTTCTTTGGTTGATGAATCAGGGGTATTTGGTAGACATCAGGAAGTTGAGGAA ATAATCAGCAAATTGTTATCATCTGATGATGATGCACATGGATCTGGTGATGTGGTTCCG ATAGTGGGATTGGGTGGAGTGGGCAAGACAACACTTGCTCGAGCTGTTTACAATGATAAG AGGATAAAACAACATTTCAATATTACAGCATGGGTTTGTGTTTCAGAAGAATATGACGCT TTCAGAATTACAACAACATTGCTTGGAGAGATAATTGGGTCATTGGATTCAAAAGTTAGT GCCAGCAATCTTAATCAGCTCCAAATTAAGCTAAGTCATAGGCTTAAAGGGAAAAGGTTT CTTTTTGTTCTAGATGATGTATGGAATGAAAATTACACTGATTGGGATGAGTTAAGGTGT CCTTTTGTTCATGGACGAAAGGGAAGCAGGATCATTTTAACAACAAGAAAACAAAGCGTT GCCATGATGATGGCAAGTGAGATGATTCAGTTGAAATCTCTTTCTGATGAAGATTGCTGG TCTTTGTTTAAAACACATTCATTTGAAAATAGAGATCCCAACAAATATCCAGAGCTTGAA GTGGTTGGCAGGCAAATTGTGGGGAAGTGCAAGGGGTTACCTTTAGCTGTGAAGACGTTG GCAGGTCTATTGCGCTCTAAATCAACTATTGAAGAGTGGGAACGTCTTCTGCAAAGTGAA ATATGGGAGCTACCAAGTGACATATTACCAGTGCTCAAACTAAGCTATAATGACCTTTCT CAGGTGCTAAAGCGTTGCTTTGCTTATTGTGCACTATTTCCTAAAGATCACCCCTTTGGT CGTGACGAGGTTGTTCAACTATGGATCGCTAATGGCCTTATAACACAGGGAGAAAGTGAT GAAACAATTGAAGATACAGGGAATCAATACTTTTTGGAGCTAAGATCAAGATCCTTGATA CAAAAGGCATCTGATCTCAATTTGTTGAAATGGGAAGCAAGGGATGTGTTCTTGATGCAT GACCTTGTCAATGATTTGGCTCAAGTTGTGTCTGCAAAACTCTGTCTCAGGCTTGAAGAT TATCCAAGGACTCACATATTGAAAAGAGTTCGACATTTGTCATATCTTAGAGATTGCTAT GGTGAGTTTGACAAGTTCAAATCTCTTTCTGGCCTTGAGTATTTGAGGACATTGATTCCC GTAAGGATTAATTTTTATTCATTTCTGAGCAAAAAAGTTGTGTATGACATACTGCCAACC CTCACCTCCTTGAGGGCATTATCCTTATCTGGATATCAAAACAATGAGTTTCCTGATGCC TTGTTCATCAATATGAAGCACCTACGCTATTTGGACTTTTCTCGTACAAAAATTACAAAA ATACCAGATTCAGTTTGTACTTTGTATAATCTACAAACATTGTTGCTGTTGAATTGTTGG GGTCTTGTTGAGTTGCCGCCAGAGATGGGGAGATTAATCAACTTGCGTCACCTTGATATT CGAGGAACTGGTATTTCATGGAACATTCCTCTACAGAAAAGCAAGTTACAGATTCTCCTA CTTTCTTATTCAACAAGATTTGTCGTGGGTGCATTTAGTGATTCAAGAATTGAAGAGTTG GGTGAACTTCAAAATCTCCATGGATCCTTATCAATTTCAGAATTGCAAAATGTTGTTAAT GGCAGGGAAGCTATTAAGGGAAACATGAAGGATAAAAAGCACCTTGAAGAGCTATCTTTG TCATGGAGTGGCATTAATGCCGATGATTCGCAAATTGAAAGGGAGATTCTGGATAAGTTG AAGCCAGATAAAAACATTAAGAAGCTGGAGATCAATGGGTATCGAGGGACAAAGTTTCCA GATTGGCTTGGAGATCATTCATTTAGTAAGCTCGTCTCATTGAATCTCCGGAAATGTAGG GATTGCGATTCCTTACCAGCACTTGGACAACTGCCATCTCTCAAACATCTTTCAGTCAGT GGAATGCATCGGATACTGCAATTGACTCAAGAATTTTATGGGAGTGTGTCTTCAGTTCCA CCATTTAGAGCTCTCACAAACCTTGTGTTTAAGCAAATGCCAGAATTGATAGAATGGCAC GTGTTAGAGAATGGAAGCTTTCCTCAACTCAAGCATCTTGACTTAATTAATTGTCCTAAA CTGATAGGGGAGCTACCAAAAAGTCTTCCATTTTTAGCTACATTAAGGATTTCTGGCTGC CCAAAGCTTGGAGTTCTTCCTGATGGTCAAGTGGCTATGTTTGGAATCCATTTGAGTTTG ATCCATCAAAACTTCACGTCTCTTCAAAAATTGAGAATTTCAGACATGCCAAACTTGGTG GAGTTGCCATCAGAAATATGTGGACTAACAAATCTTGGAGAATTGAGGATATCTAATTGT GCAAGCTTAAGAATAATCAGAATTCAGGAAATGCAACAGCTCATTGAATTGGTCATTCGA AATTGTCCAGATCTTATGTCCTTAACAATTCTGAGTCTACCAGTAACACTGGAAAAATTG CATATTTCACGATGCGGAAAATTGGAGTTGGAGTTTCCAGAAGATAGCATGACTGGAAGC TGCTGTAACATGTTCTTTGAAGAATTAAGACTTGAAAATTGTGAGTCTCTACGCCATCTC CCCTTTGGCTTTTCCCTTAGAGTACATACTCTCATAGTCTACAGTTGTAGGCATCTTCAA ACGCTATCATTTCCACATGGAATTGACACCCTTGAAGTAGAAAGATGTGGGAATCTTAAA GCACTTACAGTACCAAAGGGAATTCATCTGAAATTTCTGCATTCGATGAAAATCTCAGGC TGTGATAATCTGACTTCTTTTCCACAAAAACTTGTTGCTCCGAACTTGAAGTATCTTTGG GTTTATGACTGCCAGAAACTGAAAGCACTGCCAGACTGTATGCATGAACTCCTTCCATCT CTTAAAAATCTTTGGATTTCGAACTGTCCTGAACTTGAGTCCTTCCCTGATGGAGGATTG CCTTTCAATATAGAAATCCTAGACATCTCTAGTTGTCAAAATCTGATAACTGGCAGAGAG GAGTGGGGTCTACAGAGACTCCCTTATCTTAGATGTTTCAGAATTTATGGTTCTGATGAA ACTTCAATTCTAGACGTAAGTTGGAAGCTGCCGCAGAGCATCCAAACAATTACCATAGAG GGTCTTCCTCGTCTGAAAACACTAAGTGGGAAAGCTCTTGAGGGATTCAAGTATCTTCAA GTTTTGGAAATTAAGCACTGCCCTCAGCTTCAATCACTATCAGCGGAAGGTCTTCAAGGC CTCACCTCTCTTGCAACATTAGAGATTGAAGACTGTTGTCAGCTGAAATCACTTCCAGAA GTAGGGTTGCCTTCCTCACTTTCTGTTCTGAAGATCTCTTCCTGCCCACAGTTTCTATCA CTACCAAAAAAGGGTCTCCCCTCCTCTGTGTGTCGATTAGAGATCAATGACTGTCCATTG CTCACTCCTCGTTTACATAACAAGAAAGCGGAGGACTGGCTAAAGATTGCTGGAATCCAC ACTCTACTTATAGACTATGAATTGGTCTAGTAGTGAAGAAGAACCTGGTCCCTTATCTGC ATTCTTCCATTGTACTGGATCAGTATAATATGTGGGAAAAGTTATTCATATGCTGTGATA TCTGCCAAAACAGATGGATGGAGAGATTCGACTGGTATGACATGCATTTTAGAAGACCGG AGGAAGTAAATTATTCTTATGTTTGACTGATTGGTTGCATTCCTTCAGCAGTGATGGAGC TAGCTTTTGATTGCTTCTGCAGAAATATTCCGCAATTTCCATACCATATAACTTATAACC TGATCAGTTTTAGTTAAGGATGCCAGAGCTTAAATAGTTAATAAGTGTTGCAAGTTGGTG TCGTGAATCTTGTTTTAGTGATGAAGGCATTTGTTTGCCATGTAAAAGTATTGAATAAGC TAAACAAGGTCTTCATCTTAGATTTATGGGAGATGACAGCTTAATTCAAGGCTTCCCCAA TTGTATAAAGAAAGGTAATCCATCTAGTGTACAATATTCCTCTAGTGTGCCACTACCACC TACGCTGTTCTCTATAATAGTTCATCAGCTATATTGGTT