Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g078150.3.1
CDS Infomation	Amino acid transporter family protein (AHRD V3.3 *** D7LGK0_ARALL)
Sequence	ATGTCAAAGAAGGATGAAGAATTTCTAGATTACTTAACGGACAATGACTCAGATGATGTC GAAGCTAATAGTGTCAATATGAGTGACGATGATGATGATGAGGAGGAGGAGGAGAATGCT CCATTTGCTTCACAGCAATGGCCCCAAAGTTTCAGAGAGTCAATTAACTCATATACAATT GCCGCATCACCTAATTTCGGATTCATACGACGTGGATCTAGTATTATACCTGAATCCGAT ACTAAAGGATTCTTGGACTCAGATTTGAAGACACATTTGCTCCCTGAAAAGGAAAAAATT CAGGAGCAAAATGTTGCAGATGGAATCTCAGTAACAAAAGCATCTTTGTTAGAGAAGGCT TCTTCTTTGCATGAGCAATTGACTGGGGAGCTTCCAATTCCGTATGGATGCAGCTTAACT CAGACTGTATTCAATGGTGTAAATGTCATGGCTGGAGTTGGACTGCTTTCTGTTCCTTGT ACAGTGAAAGAAGCTGGCTGGGCTAGTTTGTTAGTGTTGGTGATTTTTGCAGTCATATGT TGGTATACAGCTTCTCTTATGAAACATTGCTTCGAGAGCAGGGAAGGAATCTTAACTTAT CCCGATATTGGAGAAGCTGCATTTGGAAAATTTGGACGCATTATTATATCTATTATCTTG TACGTGGAGCTATATTCATATTGTGTAGAATTTATAATTTTGGAAGGAGATAACCTTACT AGCCTTTTTCCTGGATCTTCACTGAACTGGGGAGGCCTTAAACTTGATTCAATTCACATC TTTGGGATTCTGGCTGCCCTAATTATTCTGCCAACTGTTTGGTTGAGGGACCTTCATGTA ATATCATACCTCTCAGCCTGTGGGGTCTTTGCAACCATGATAATTGTTCTGTGTGTGATT TTCCTTGGTACGGTGGATGGAGTTGGATTTCACAATACCAGTCAGGTTGTGAACTGGAGT GGCATTCCTTTTTCTATCGGAGTGTATGGTTTTTGTTACTCTGGGCACTCAGTGTTTCCA AACATCTACCAATCTATGGCTGACAAGTCAAAATTCAATGTTGCACTTATAATATGCTTT ATTCTGTGCATTCTCATATATGGAGGTGTTGCAATAATGGGGTATCTCATGTTTGGTCAA AGTACATTATCTCAGATAACTTTAAATATGCCGAACAATTCAATTGCTTCAAAAGTTGCA GTATGGACCACTGTTATTAGCCCATTCACAAAATATGCGTTGCTGATGAATCCCTTGGGA AGATGCATAGAGGAATTGCTGCCCGAGAGAATCTCTAGTAGTCTCTGGTGTTTTCTTCTC TTAAGGACAGCGCTTGTCTTTTCTACAGTATGTGTAGCATTTCTTCTCCCCTTTTTTGGT CTTGTGATGGCTCTGATTGGTTCTCTTTTCAGTATACTGGTGTCTATAATAATACCAGCT TTATGTTACCTAAAGATCATCGGAAAGAAAGCAACACGGACGCAGAGGGTGTCTAGCATC AGCGTTATTGCACTTGGGATTGTATGTGCTGCTCTTGGAACTTACTCCTCACTGTCAGGA ATCGCGAACAAGTATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g078150.3.1
PEP Infomation	Amino acid transporter family protein (AHRD V3.3 *** D7LGK0_ARALL)
Sequence	MSKKDEEFLDYLTDNDSDDVEANSVNMSDDDDDEEEEENAPFASQQWPQSFRESINSYTI AASPNFGFIRRGSSIIPESDTKGFLDSDLKTHLLPEKEKIQEQNVADGISVTKASLLEKA SSLHEQLTGELPIPYGCSLTQTVFNGVNVMAGVGLLSVPCTVKEAGWASLLVLVIFAVIC WYTASLMKHCFESREGILTYPDIGEAAFGKFGRIIISIILYVELYSYCVEFIILEGDNLT SLFPGSSLNWGGLKLDSIHIFGILAALIILPTVWLRDLHVISYLSACGVFATMIIVLCVI FLGTVDGVGFHNTSQVVNWSGIPFSIGVYGFCYSGHSVFPNIYQSMADKSKFNVALIICF ILCILIYGGVAIMGYLMFGQSTLSQITLNMPNNSIASKVAVWTTVISPFTKYALLMNPLG RCIEELLPERISSSLWCFLLLRTALVFSTVCVAFLLPFFGLVMALIGSLFSILVSIIIPA LCYLKIIGKKATRTQRVSSISVIALGIVCAALGTYSSLSGIANKY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g078150.3.1
Transcript Infomation	Amino acid transporter family protein (AHRD V3.3 *** D7LGK0_ARALL)
Sequence	TTATTTAAAAATATGAAATTTGTGGTCTTAATTATTTCTTACTAATATTTATACTGTTAT AATTTTTATTAATAATAATAAAAGACAAAATAGATTTGCCATTAATAAAATTAGAGGGAA AAAAAAAGGAGTAAGATCTGTTGGTGCTGTCGTGTGTGTGTGTTTGTTATTTGTTTATGT TGTTGAGTCATAATAATAATTTTCTCCGTTGATTCTCATTCGTCCATTACACCAATGACT CATCATACCATATGCAGACAAACGTGCCCACTCCAGTGATTCTGGAAATCTCGAAAACGT ATTCAAAATGCCTCAATCAATCAATGAATACAGCTCCTTCTCCACATGCATCGTAGTATA TATATATATAGTTGTGACTATCAGTCTGGTGTAGCTTTTTATTTGATTGGAAATAGCCAT GTCAAAGAAGGATGAAGAATTTCTAGATTACTTAACGGACAATGACTCAGATGATGTCGA AGCTAATAGTGTCAATATGAGTGACGATGATGATGATGAGGAGGAGGAGGAGAATGCTCC ATTTGCTTCACAGCAATGGCCCCAAAGTTTCAGAGAGTCAATTAACTCATATACAATTGC CGCATCACCTAATTTCGGATTCATACGACGTGGATCTAGTATTATACCTGAATCCGATAC TAAAGGATTCTTGGACTCAGATTTGAAGACACATTTGCTCCCTGAAAAGGAAAAAATTCA GGAGCAAAATGTTGCAGATGGAATCTCAGTAACAAAAGCATCTTTGTTAGAGAAGGCTTC TTCTTTGCATGAGCAATTGACTGGGGAGCTTCCAATTCCGTATGGATGCAGCTTAACTCA GACTGTATTCAATGGTGTAAATGTCATGGCTGGAGTTGGACTGCTTTCTGTTCCTTGTAC AGTGAAAGAAGCTGGCTGGGCTAGTTTGTTAGTGTTGGTGATTTTTGCAGTCATATGTTG GTATACAGCTTCTCTTATGAAACATTGCTTCGAGAGCAGGGAAGGAATCTTAACTTATCC CGATATTGGAGAAGCTGCATTTGGAAAATTTGGACGCATTATTATATCTATTATCTTGTA CGTGGAGCTATATTCATATTGTGTAGAATTTATAATTTTGGAAGGAGATAACCTTACTAG CCTTTTTCCTGGATCTTCACTGAACTGGGGAGGCCTTAAACTTGATTCAATTCACATCTT TGGGATTCTGGCTGCCCTAATTATTCTGCCAACTGTTTGGTTGAGGGACCTTCATGTAAT ATCATACCTCTCAGCCTGTGGGGTCTTTGCAACCATGATAATTGTTCTGTGTGTGATTTT CCTTGGTACGGTGGATGGAGTTGGATTTCACAATACCAGTCAGGTTGTGAACTGGAGTGG CATTCCTTTTTCTATCGGAGTGTATGGTTTTTGTTACTCTGGGCACTCAGTGTTTCCAAA CATCTACCAATCTATGGCTGACAAGTCAAAATTCAATGTTGCACTTATAATATGCTTTAT TCTGTGCATTCTCATATATGGAGGTGTTGCAATAATGGGGTATCTCATGTTTGGTCAAAG TACATTATCTCAGATAACTTTAAATATGCCGAACAATTCAATTGCTTCAAAAGTTGCAGT ATGGACCACTGTTATTAGCCCATTCACAAAATATGCGTTGCTGATGAATCCCTTGGGAAG ATGCATAGAGGAATTGCTGCCCGAGAGAATCTCTAGTAGTCTCTGGTGTTTTCTTCTCTT AAGGACAGCGCTTGTCTTTTCTACAGTATGTGTAGCATTTCTTCTCCCCTTTTTTGGTCT TGTGATGGCTCTGATTGGTTCTCTTTTCAGTATACTGGTGTCTATAATAATACCAGCTTT ATGTTACCTAAAGATCATCGGAAAGAAAGCAACACGGACGCAGAGGGTGTCTAGCATCAG CGTTATTGCACTTGGGATTGTATGTGCTGCTCTTGGAACTTACTCCTCACTGTCAGGAAT CGCGAACAAGTATTGAAGTAAAGCTAACTACACACACCCCAGACACCCTTTTGTTTAGGG TGGGGGTGGACATGTTTGCCGTAAAGCATTCTTATTTACTGTCCTCTACTTTTGATCTCT TTCCCAAATATTATCCATCTTCTTCTCAGTTAAAACTTTATAGCAACTTTACGACCCCCT ATTGCTTTATAATTATGGGGTATCGTTCTCAGTGTGTATTAGTTGCTAGTGTTTCAAGTA GTAAGTATATGTTGGTTGCACTATAGAGTAAACCAACGTAAACTAGGATGTTGAGTTGAT TATAATGGATATATATCTTTTATTCCC