Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g063690.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7MS71_ARALL)
Sequence	ATGAACTACCCACTTGTGCAAGAGCCCCTTCAAGAAACAACTTTCTCCCAAAGTTTCAAT CTCAATTACAGAGCCATATGCAACAATCTGTTGTCCCTAACCCAATCAAGGTCCTTACCA AAAGGGTTAGCTTTACATGCTCACATTATCAAATCAGGTATTCAAATAATCCCACTTGTT TCACATCACTTAATCAACTTCTACTCAAAACTTCAACGCCCAATTGATTCCACACTAGTT TTTGATGAAACCCTTTCCAAGTCTTCTACTACTTGGAGTTCAGTAATCTCTTCACTTTCC CAAAATGAACAACCAATTCTTGCTTTACAATTTTTTCGCCAAATGTTGCATAATGGGGTA ACCCCAGATGATCATATTTTCCCTTGTGCAACCAAAGCCTGTGGGATTCTTTGTGATTAT CGTATTGGCCAATCCATTCATTGCTTTGCTTTCAAGATTGGATTTGATTCCGATGTGTTT GTAGGGAGTTCTCTAGTCGATATGTATGCTAAATGCAGGAACATTGAGATTGCTCGCAAA GTGTTCGATCAAATGCCCGAAAGAAATGTGGTTTCTTGGAGTGGAATGATATATGGGTAT GCTCAAATCGCTGAGGATGAGGAAGCTTTGAGGCTTTTCAAGCTTGCTTTGGGTGAAGGT TTGGATGTCAATGACTTTACCTTTTCGAGTGTCATTAGGGTGTGTGCGAATTCTACCTTG CTTGAATTAGGGAAGCAAATACACGGTTTGTGCTTGAAAACTAGCTATGATTCGTCGAGC TTTATTGGGAGTGCCTTGATATCATTGTACTCCAAGTGTGGTCTTGTTGAAGGTGCTTAT CGTGTTTTTAATGAGGTTCCAGTTAGGAATTTAGGGATGTGGAATGCGATGTTGATTGCT TGTGCTCAGCACGGGCACACGGAAAAAGTATTTGGCTTGTTTAAAGAAATGGAGGGTATT GTAATGAAGCCAAATTTTATTACTTTTTTATGTGTGCTATATGCTTGTAGCCATGCTGGG CTGGTCCCAGAAGGGAAATTTTACTTTGATTTAATGAAGAAACATGGAGTTGAGCCAGGG GACCAACATTATGCTTCTCTTGTGGACTGTCTCGGCCGAGCTGGAAAATTACAAGAGGCA GTTCAAGTCATTGAGAAGATGCCAATGGAACCAACAGAATCTGTTTGGGGAGCTTTGTTG ACTGGCTGTAGAATCCACAAGAACACTGAATTGGCAGCTTATGTGGCCGACAGGGTCCTT GAGTTAGGTCCTGTAAGCTCAGGCTTACATGTGCTGCTGTCCAACGCATATGCTGCTGCT GGTAGATATGAAGAGGCTGCTAAAGCTAGGAAGATGCTCAGAGACAGAGGTGTGAAAAAG GAAACTGGTTTGAGTTGGGTTGAGGAGGGAAATAAAGTACACACATTTGCTGCTGGAGAT CGGTCTCACTCAAAGTCGAAGGAGATATATGAAAAGTTGGATGAATTAGGTGAACACATG GAGCAAGCTGGGTATGTTGCAGACACAAATTATGTGTTGCAACAGGTTGCTGGCCAGGAA AAGAGTGAGACTATCAGGTATCATAGCGAAAGACTAGCCATTGCTTTCGCCCTTATCACC TTTCCACCAGAAAGGCCTATTAGAATTATGAAAAACTTGCGTGTATGTGGCGACTGTCAC AATGCAATAAAGATTATTTCAAAGTGCACCAAAAGAGTAATTATAGTAAGGGACAACAAT CGATTTCATCGCTTTGAGGATGGGAAATGCTCCTGTGGTGACTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g063690.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7MS71_ARALL)
Sequence	MNYPLVQEPLQETTFSQSFNLNYRAICNNLLSLTQSRSLPKGLALHAHIIKSGIQIIPLV SHHLINFYSKLQRPIDSTLVFDETLSKSSTTWSSVISSLSQNEQPILALQFFRQMLHNGV TPDDHIFPCATKACGILCDYRIGQSIHCFAFKIGFDSDVFVGSSLVDMYAKCRNIEIARK VFDQMPERNVVSWSGMIYGYAQIAEDEEALRLFKLALGEGLDVNDFTFSSVIRVCANSTL LELGKQIHGLCLKTSYDSSSFIGSALISLYSKCGLVEGAYRVFNEVPVRNLGMWNAMLIA CAQHGHTEKVFGLFKEMEGIVMKPNFITFLCVLYACSHAGLVPEGKFYFDLMKKHGVEPG DQHYASLVDCLGRAGKLQEAVQVIEKMPMEPTESVWGALLTGCRIHKNTELAAYVADRVL ELGPVSSGLHVLLSNAYAAAGRYEEAAKARKMLRDRGVKKETGLSWVEEGNKVHTFAAGD RSHSKSKEIYEKLDELGEHMEQAGYVADTNYVLQQVAGQEKSETIRYHSERLAIAFALIT FPPERPIRIMKNLRVCGDCHNAIKIISKCTKRVIIVRDNNRFHRFEDGKCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g063690.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7MS71_ARALL)
Sequence	ATGAACTACCCACTTGTGCAAGAGCCCCTTCAAGAAACAACTTTCTCCCAAAGTTTCAAT CTCAATTACAGAGCCATATGCAACAATCTGTTGTCCCTAACCCAATCAAGGTCCTTACCA AAAGGGTTAGCTTTACATGCTCACATTATCAAATCAGGTATTCAAATAATCCCACTTGTT TCACATCACTTAATCAACTTCTACTCAAAACTTCAACGCCCAATTGATTCCACACTAGTT TTTGATGAAACCCTTTCCAAGTCTTCTACTACTTGGAGTTCAGTAATCTCTTCACTTTCC CAAAATGAACAACCAATTCTTGCTTTACAATTTTTTCGCCAAATGTTGCATAATGGGGTA ACCCCAGATGATCATATTTTCCCTTGTGCAACCAAAGCCTGTGGGATTCTTTGTGATTAT CGTATTGGCCAATCCATTCATTGCTTTGCTTTCAAGATTGGATTTGATTCCGATGTGTTT GTAGGGAGTTCTCTAGTCGATATGTATGCTAAATGCAGGAACATTGAGATTGCTCGCAAA GTGTTCGATCAAATGCCCGAAAGAAATGTGGTTTCTTGGAGTGGAATGATATATGGGTAT GCTCAAATCGCTGAGGATGAGGAAGCTTTGAGGCTTTTCAAGCTTGCTTTGGGTGAAGGT TTGGATGTCAATGACTTTACCTTTTCGAGTGTCATTAGGGTGTGTGCGAATTCTACCTTG CTTGAATTAGGGAAGCAAATACACGGTTTGTGCTTGAAAACTAGCTATGATTCGTCGAGC TTTATTGGGAGTGCCTTGATATCATTGTACTCCAAGTGTGGTCTTGTTGAAGGTGCTTAT CGTGTTTTTAATGAGGTTCCAGTTAGGAATTTAGGGATGTGGAATGCGATGTTGATTGCT TGTGCTCAGCACGGGCACACGGAAAAAGTATTTGGCTTGTTTAAAGAAATGGAGGGTATT GTAATGAAGCCAAATTTTATTACTTTTTTATGTGTGCTATATGCTTGTAGCCATGCTGGG CTGGTCCCAGAAGGGAAATTTTACTTTGATTTAATGAAGAAACATGGAGTTGAGCCAGGG GACCAACATTATGCTTCTCTTGTGGACTGTCTCGGCCGAGCTGGAAAATTACAAGAGGCA GTTCAAGTCATTGAGAAGATGCCAATGGAACCAACAGAATCTGTTTGGGGAGCTTTGTTG ACTGGCTGTAGAATCCACAAGAACACTGAATTGGCAGCTTATGTGGCCGACAGGGTCCTT GAGTTAGGTCCTGTAAGCTCAGGCTTACATGTGCTGCTGTCCAACGCATATGCTGCTGCT GGTAGATATGAAGAGGCTGCTAAAGCTAGGAAGATGCTCAGAGACAGAGGTGTGAAAAAG GAAACTGGTTTGAGTTGGGTTGAGGAGGGAAATAAAGTACACACATTTGCTGCTGGAGAT CGGTCTCACTCAAAGTCGAAGGAGATATATGAAAAGTTGGATGAATTAGGTGAACACATG GAGCAAGCTGGGTATGTTGCAGACACAAATTATGTGTTGCAACAGGTTGCTGGCCAGGAA AAGAGTGAGACTATCAGGTATCATAGCGAAAGACTAGCCATTGCTTTCGCCCTTATCACC TTTCCACCAGAAAGGCCTATTAGAATTATGAAAAACTTGCGTGTATGTGGCGACTGTCAC AATGCAATAAAGATTATTTCAAAGTGCACCAAAAGAGTAATTATAGTAAGGGACAACAAT CGATTTCATCGCTTTGAGGATGGGAAATGCTCCTGTGGTGACTACTGGTGA