Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g062660.3.1
CDS Infomation	Protein kinase (AHRD V3.3 *** C6FF71_SOYBN)
Sequence	ATGACAGTACAGTGTATTGTATACACATTTTGTTGGTATTGGCTTTTTGTAGCTGTCTCC TTCACTAAAAACCCTGAGCTTGTTTGTCCTTCTCCAATGGCGACTATCTGCAAATCCTCC ATCTCTCTGTATTTTTCATTGTCATTGTTTGTTCTGAGTTGTGCTATGGATGAAGGTGAT ATTCTTCTAAGATTTAAAGACTCTGTTAATGACCCTTTAAACCTTCTTTCAAGCTGGTCT AAACACTCGACAAGTGAATGTAACTGGAGTGGTATCACTTGTACATCTTCGTCTTCTTCC GTATCTTCTATTAACCTCGTAAGTTTCAATCTTTCAGGTTCAATTTCATCTTCTATCTGT GAACTTCCTAATCTTGTCCATCTCAATCTTGCAAATAACCTCTTTAATCAGCCTATACCT CTGCATCTTTCACAGTGTGCTACTTTACAGAGTCTTAATCTCAGTAATAATCTCATTTGG GGCACTATTCCAGATCAAATTTATCTGTTTCAGTCGCTCAAAATTCTTGATTTCAGTAGA AACCATCTACAAGGAAGGATCCCACAAGGCATAGGCTCGTTGAAACACCTTCAAATTCTC AACTTAGGAAGCAACTTGCTTTCAGGTCCTTTTCCTCTCGTTCTTTCTAACTTAACTCAA CTTATCATTCTTGATCTATCTCAAAATCCATTGTTCCTCACTCGCATTCCTCGTGATATT GCTAAACTAACTAAGCTTCAGATGCTTTTCTTGCAAAGCTCTGGTTTTTATGGTGAATTA GTACCAAACTTGTTCCAGGGTTTAAAAAGTTTGGTCATTTTGGATTTATCACACAATAAT ATCACTGCTACTTTACCAATAGTTGGTTTTTCTCTACCAAACATGGTTTCTTTTGATGTT TCAAGAAACAAGCTTTCTGGATCATTCCCATGTGGCATATGTGAAGCCAAAGGTCTTGTT CATCTTGGTTTACATAGAAACTTCTTCAATGGTTCAATACCTAATGACTCCATTAACAAG TGCATGAATCTTGAAACTTTTCAAGTTCACGATAACTTGTTCTTGGGGAATTTTCCTTCA AGGTTATGGTCGTTGCCCCGGATAAAGCTCATCAGAGCTGAAAACAACAACTTCTCTGGA GAAATTCCTGATTCCATATCAAAGGCTGCTCAGTTGGAGCAAGTTCAGATTGATAATAAT AGTTTTACTAGTAAAATTCCGCATGGTCTTGGGTTGATTAGAAGCTTGTACAGGTTTTCT GCATCTGTCAATGGTTTGTATGGTGAGCTTCCTACAAACTTGTGTGATTCACCAGTAATG AGCATTTTAAATCTGTCACATAATTATCTTTCTGGAACAATTCCTGAATTGATGAATTGC AAAAAGATAGTCTCGTTATCACTAGCTCATAACAATTTCATTGGTGAAATACCCAAATCA CTCGGTATACTGCCTGTTTTAACATATCTTGATCTTTCCCACAATAATCTCAGTGGTCAA ATTCCACAAGAGCTTCAGAACTTGAAGCTTGCTTTATTTAATGTCTCCTTCAATAGACTA TCCGGTAGAGTTCCAGCTTCATTGATTTCTGGCCTTCCTGCTTCATTTTTACAAGGAAAT CCTGACCTTTGTGGTCCAGGATTCTCCAGTTCTTGCTCACATGAAAAAACAATGCCTAAA GATGTTAATCTTTCAAAATTAACATCTGTCTTAATTTCAGCTGTTGCAATTTCTTCCATA ATTGCTGCTGCTGTTGGATTTTACATAACAAGGCTGTGTAGGAAACAAAGATCCAAAATG AATGGGGGGAGATCAGTTTTTTTCTACCCTTTGAGAGTTACAGAGAATGATGTGATGATG GAAATGTGTGATAAGAATGCTAGAGGAAATGGGGGAACCTTTGGAAGAGTTTATATCGTA AATTTACCAAGTGGGGAGTTGATAGCTGTGAAGAAGTTAATGAATTTCGGAACTCATTCT GAGATAAAAACTTTAGCAAAGACGAGGCATAAGAACATCACAAAGATTCTTGGATTTTGT TACTCTAATGATGCGATATTATTGATATATGAATATGTAGCAAGAGGAAGCCTAGGGGAT CTGATAGGGAAACCTGATTTTGAATTACCATGGAGTGTTCGGTTGCGCATTGCCATTGGA GTAGCTCAAGGACTCGAATATCTCCATAAAGATTGCCTCCCTCATTTACTTCATCGAAAC CTGAAATCAACTAATATTCTTCTTGATGCTGATTATGAACCAAAGATGACCGATTTTGCT CTAGACCTGATAATTGGAGAAGCTTCTTTTAAGTCATCTTTGGGTTCAGATGCTTGCTGT TACTTGGCACCAGAATATGGATACACGAAAAGGGCTAGTGAGGAAATGGACACATATAGC TTTGGTGTAATCCTACTTGAGCTTATAACAGGGCAGCGAACAGACAAAGCAGAATGCGGT GATGTGGTGAAGTGGGTAAGAAGGAAAATAAACATTAGAAATGGAGCACTTGAAATTATT GATCCCAAAATTTCAAGTGCTTCACAACATGAGATGCTTGGAGCTCTAGACATTGCTCTG CGCTGCACATCTGTAATGCCAGAGAAACGACCTTCGATGGTCCAAGTTCTTACGATACTG CGTTCTCTCCATTCAACATTCAACCTTCCATATATCCATCAACCATCCACTTCCACTTCC ACCCATACTCATTCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g062660.3.1
PEP Infomation	Protein kinase (AHRD V3.3 *** C6FF71_SOYBN)
Sequence	MTVQCIVYTFCWYWLFVAVSFTKNPELVCPSPMATICKSSISLYFSLSLFVLSCAMDEGD ILLRFKDSVNDPLNLLSSWSKHSTSECNWSGITCTSSSSSVSSINLVSFNLSGSISSSIC ELPNLVHLNLANNLFNQPIPLHLSQCATLQSLNLSNNLIWGTIPDQIYLFQSLKILDFSR NHLQGRIPQGIGSLKHLQILNLGSNLLSGPFPLVLSNLTQLIILDLSQNPLFLTRIPRDI AKLTKLQMLFLQSSGFYGELVPNLFQGLKSLVILDLSHNNITATLPIVGFSLPNMVSFDV SRNKLSGSFPCGICEAKGLVHLGLHRNFFNGSIPNDSINKCMNLETFQVHDNLFLGNFPS RLWSLPRIKLIRAENNNFSGEIPDSISKAAQLEQVQIDNNSFTSKIPHGLGLIRSLYRFS ASVNGLYGELPTNLCDSPVMSILNLSHNYLSGTIPELMNCKKIVSLSLAHNNFIGEIPKS LGILPVLTYLDLSHNNLSGQIPQELQNLKLALFNVSFNRLSGRVPASLISGLPASFLQGN PDLCGPGFSSSCSHEKTMPKDVNLSKLTSVLISAVAISSIIAAAVGFYITRLCRKQRSKM NGGRSVFFYPLRVTENDVMMEMCDKNARGNGGTFGRVYIVNLPSGELIAVKKLMNFGTHS EIKTLAKTRHKNITKILGFCYSNDAILLIYEYVARGSLGDLIGKPDFELPWSVRLRIAIG VAQGLEYLHKDCLPHLLHRNLKSTNILLDADYEPKMTDFALDLIIGEASFKSSLGSDACC YLAPEYGYTKRASEEMDTYSFGVILLELITGQRTDKAECGDVVKWVRRKINIRNGALEII DPKISSASQHEMLGALDIALRCTSVMPEKRPSMVQVLTILRSLHSTFNLPYIHQPSTSTS THTHS*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g062660.3.1
Transcript Infomation	Protein kinase (AHRD V3.3 *** C6FF71_SOYBN)
Sequence	ATAAAAAATTTATGATAAAAAATAAATTTATTTAAATCTCAAAATTATAAACATGTCACT AAATTAGGATTACGATTAGCATGGATGGAGCATTATTTTTACTTTTGATTTGTGGAATAT GACAGTACAGTGTATTGTATACACATTTTGTTGGTATTGGCTTTTTGTAGCTGTCTCCTT CACTAAAAACCCTGAGCTTGTTTGTCCTTCTCCAATGGCGACTATCTGCAAATCCTCCAT CTCTCTGTATTTTTCATTGTCATTGTTTGTTCTGAGTTGTGCTATGGATGAAGGTGATAT TCTTCTAAGATTTAAAGACTCTGTTAATGACCCTTTAAACCTTCTTTCAAGCTGGTCTAA ACACTCGACAAGTGAATGTAACTGGAGTGGTATCACTTGTACATCTTCGTCTTCTTCCGT ATCTTCTATTAACCTCGTAAGTTTCAATCTTTCAGGTTCAATTTCATCTTCTATCTGTGA ACTTCCTAATCTTGTCCATCTCAATCTTGCAAATAACCTCTTTAATCAGCCTATACCTCT GCATCTTTCACAGTGTGCTACTTTACAGAGTCTTAATCTCAGTAATAATCTCATTTGGGG CACTATTCCAGATCAAATTTATCTGTTTCAGTCGCTCAAAATTCTTGATTTCAGTAGAAA CCATCTACAAGGAAGGATCCCACAAGGCATAGGCTCGTTGAAACACCTTCAAATTCTCAA CTTAGGAAGCAACTTGCTTTCAGGTCCTTTTCCTCTCGTTCTTTCTAACTTAACTCAACT TATCATTCTTGATCTATCTCAAAATCCATTGTTCCTCACTCGCATTCCTCGTGATATTGC TAAACTAACTAAGCTTCAGATGCTTTTCTTGCAAAGCTCTGGTTTTTATGGTGAATTAGT ACCAAACTTGTTCCAGGGTTTAAAAAGTTTGGTCATTTTGGATTTATCACACAATAATAT CACTGCTACTTTACCAATAGTTGGTTTTTCTCTACCAAACATGGTTTCTTTTGATGTTTC AAGAAACAAGCTTTCTGGATCATTCCCATGTGGCATATGTGAAGCCAAAGGTCTTGTTCA TCTTGGTTTACATAGAAACTTCTTCAATGGTTCAATACCTAATGACTCCATTAACAAGTG CATGAATCTTGAAACTTTTCAAGTTCACGATAACTTGTTCTTGGGGAATTTTCCTTCAAG GTTATGGTCGTTGCCCCGGATAAAGCTCATCAGAGCTGAAAACAACAACTTCTCTGGAGA AATTCCTGATTCCATATCAAAGGCTGCTCAGTTGGAGCAAGTTCAGATTGATAATAATAG TTTTACTAGTAAAATTCCGCATGGTCTTGGGTTGATTAGAAGCTTGTACAGGTTTTCTGC ATCTGTCAATGGTTTGTATGGTGAGCTTCCTACAAACTTGTGTGATTCACCAGTAATGAG CATTTTAAATCTGTCACATAATTATCTTTCTGGAACAATTCCTGAATTGATGAATTGCAA AAAGATAGTCTCGTTATCACTAGCTCATAACAATTTCATTGGTGAAATACCCAAATCACT CGGTATACTGCCTGTTTTAACATATCTTGATCTTTCCCACAATAATCTCAGTGGTCAAAT TCCACAAGAGCTTCAGAACTTGAAGCTTGCTTTATTTAATGTCTCCTTCAATAGACTATC CGGTAGAGTTCCAGCTTCATTGATTTCTGGCCTTCCTGCTTCATTTTTACAAGGAAATCC TGACCTTTGTGGTCCAGGATTCTCCAGTTCTTGCTCACATGAAAAAACAATGCCTAAAGA TGTTAATCTTTCAAAATTAACATCTGTCTTAATTTCAGCTGTTGCAATTTCTTCCATAAT TGCTGCTGCTGTTGGATTTTACATAACAAGGCTGTGTAGGAAACAAAGATCCAAAATGAA TGGGGGGAGATCAGTTTTTTTCTACCCTTTGAGAGTTACAGAGAATGATGTGATGATGGA AATGTGTGATAAGAATGCTAGAGGAAATGGGGGAACCTTTGGAAGAGTTTATATCGTAAA TTTACCAAGTGGGGAGTTGATAGCTGTGAAGAAGTTAATGAATTTCGGAACTCATTCTGA GATAAAAACTTTAGCAAAGACGAGGCATAAGAACATCACAAAGATTCTTGGATTTTGTTA CTCTAATGATGCGATATTATTGATATATGAATATGTAGCAAGAGGAAGCCTAGGGGATCT GATAGGGAAACCTGATTTTGAATTACCATGGAGTGTTCGGTTGCGCATTGCCATTGGAGT AGCTCAAGGACTCGAATATCTCCATAAAGATTGCCTCCCTCATTTACTTCATCGAAACCT GAAATCAACTAATATTCTTCTTGATGCTGATTATGAACCAAAGATGACCGATTTTGCTCT AGACCTGATAATTGGAGAAGCTTCTTTTAAGTCATCTTTGGGTTCAGATGCTTGCTGTTA CTTGGCACCAGAATATGGATACACGAAAAGGGCTAGTGAGGAAATGGACACATATAGCTT TGGTGTAATCCTACTTGAGCTTATAACAGGGCAGCGAACAGACAAAGCAGAATGCGGTGA TGTGGTGAAGTGGGTAAGAAGGAAAATAAACATTAGAAATGGAGCACTTGAAATTATTGA TCCCAAAATTTCAAGTGCTTCACAACATGAGATGCTTGGAGCTCTAGACATTGCTCTGCG CTGCACATCTGTAATGCCAGAGAAACGACCTTCGATGGTCCAAGTTCTTACGATACTGCG TTCTCTCCATTCAACATTCAACCTTCCATATATCCATCAACCATCCACTTCCACTTCCAC CCATACTCATTCTTAATTCTGCTCAAATTCCCCATATATTTTACTATTTTTTAAATGCAT TTTAACTATCCAAATTCCCCATATATTATATTTGGTTCTAAATACAAAAAAAAAGAGAGG TGGGTGCCTGGGTGGATAAAGGAACATGGTGGGGTTGGTGAATAGGAGGTAAAATAGT