Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g058450.3.1

CDS Infomation

Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SHH6_RICCO)

Sequence

ATGGAAAAGCTTTTGGTTAATGTTTTCATGGTGACGTTGTTGGTGTGTTTAGGGCATAAT
GTAGAAGGACTTGGGGTTAATTGGGGTGACATCTCCTCCCACAAGTTGCCTCCTAAAGAT
GTAGTCAAAATGTTGCAAGAAAATGGGATTAAGAAGGTGAAGCTTTTCAATAATGATGAG
ACCATTTTGAATGCCTTGGCTGGAACTGGCATTGAGGTCATGATTGGTATCTCAAATCAA
CTCCTCAAGGATTTGGTTAATCCTGATGTTGCCAAGAAATGGGTTAAAGAAAACGTCACA
CGTTATGAGCCTAAGTCTCCTAAAGGAGTTAATATCACACTTGTAGGTGTTGGTAATGAG
CCATTCTTGAGAGATTACAAGGATACATTGACAAATGTTACAGGGCCAGCATTAGAGAAT
ATCCAAAATGCACTGAATGATGCTGGACTTGGTGACACCACTAAGGCAACTGTACCTCTA
AATGCTGATGTTTACTTGTCACCAAGCTATAATCCTGTCCCTTCTGGGGGATTTTTTCGC
GCTGACATTGTTGATCCACTCAACTATATTCTTAAGGTGTTGAACAAGAATAAAGCTCCT
TTCATGGTCAATATTTATCCTTTTCTTAGTCTTTTCTATGGAAATGGTGCCTTCCCTTTT
GACTATGCCTTCTTTGATGGCGTGAGCAATCCTCTTAAGGACAAAGATGGTGTTGAATAC
ACCAACTGCTTTGATGCCAATCTTGACACTTGTGCAGCTGCTCTGGCTGGTGCTGGGTAT
GGCAACATGACCATTATGGTAGGAGAAATGGGATGGCCTACAGATGGAAACAATTATGCT
AATGTGACATTGGCTGAAAAGTTTTATAAAGGATTTGTATCATATCTTGCTAAAGGAAAA
GGTAGCCCACGTCGCCCTGGAAATGTTGAGGCGTACATATTTGCCTTATTTGATGAGGAT
AGGAAGAGCACACTCCCAGGAAACTTTGAGACACATTGGGGACTTTACTATGACGATGGA
ACGCCAAAGTTCCCTCTTGATCTACATGGAAATAAAAAGAATCTTGTGCCCGTGCCAAAT
GTAGAAAAACTCTCCAAAAAATGGTGTGTGATCAAGCCGGATGTTAAGAACTTTACAGAT
GTTATGACATATGCTTGTGACCGTGCAGATTGTACACCTCTTACTAATGGATCATCTTGC
CAAAACCTTAATGACGCTGCCAAGGCTTCATACGCCGTGAATGCCTATTTCCAAAACAGC
CAACAAAAAGATGATAGTTGTAATTTTGAAGGCAAGGCAACAGTAACCACAAAGGATCCA
TCACAAGGGACTTGCAATTTCACCATTGGCTTCAAGTCACTT

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g058450.3.1

PEP Infomation

Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SHH6_RICCO)

Sequence

MEKLLVNVFMVTLLVCLGHNVEGLGVNWGDISSHKLPPKDVVKMLQENGIKKVKLFNNDE
TILNALAGTGIEVMIGISNQLLKDLVNPDVAKKWVKENVTRYEPKSPKGVNITLVGVGNE
PFLRDYKDTLTNVTGPALENIQNALNDAGLGDTTKATVPLNADVYLSPSYNPVPSGGFFR
ADIVDPLNYILKVLNKNKAPFMVNIYPFLSLFYGNGAFPFDYAFFDGVSNPLKDKDGVEY
TNCFDANLDTCAAALAGAGYGNMTIMVGEMGWPTDGNNYANVTLAEKFYKGFVSYLAKGK
GSPRRPGNVEAYIFALFDEDRKSTLPGNFETHWGLYYDDGTPKFPLDLHGNKKNLVPVPN
VEKLSKKWCVIKPDVKNFTDVMTYACDRADCTPLTNGSSCQNLNDAAKASYAVNAYFQNS
QQKDDSCNFEGKATVTTKDPSQGTCNFTIGFKSL

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g058450.3.1

Transcript Infomation

Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SHH6_RICCO)

Sequence

GTAGGCACTTTATTTTCATCTATTAATTCATCTCCATTGTTTTTGTTTGCATTGGCAGGT
GTCTAAGAATTCATATCCCCTTTCCTTCCTGCCAGCTGGAAAAACCCAAAAAAATAAAAA
AATAAACCCCAAAAAAAGATAAAATGGAAAAGCTTTTGGTTAATGTTTTCATGGTGACGT
TGTTGGTGTGTTTAGGGCATAATGTAGAAGGACTTGGGGTTAATTGGGGTGACATCTCCT
CCCACAAGTTGCCTCCTAAAGATGTAGTCAAAATGTTGCAAGAAAATGGGATTAAGAAGG
TGAAGCTTTTCAATAATGATGAGACCATTTTGAATGCCTTGGCTGGAACTGGCATTGAGG
TCATGATTGGTATCTCAAATCAACTCCTCAAGGATTTGGTTAATCCTGATGTTGCCAAGA
AATGGGTTAAAGAAAACGTCACACGTTATGAGCCTAAGTCTCCTAAAGGAGTTAATATCA
CACTTGTAGGTGTTGGTAATGAGCCATTCTTGAGAGATTACAAGGATACATTGACAAATG
TTACAGGGCCAGCATTAGAGAATATCCAAAATGCACTGAATGATGCTGGACTTGGTGACA
CCACTAAGGCAACTGTACCTCTAAATGCTGATGTTTACTTGTCACCAAGCTATAATCCTG
TCCCTTCTGGGGGATTTTTTCGCGCTGACATTGTTGATCCACTCAACTATATTCTTAAGG
TGTTGAACAAGAATAAAGCTCCTTTCATGGTCAATATTTATCCTTTTCTTAGTCTTTTCT
ATGGAAATGGTGCCTTCCCTTTTGACTATGCCTTCTTTGATGGCGTGAGCAATCCTCTTA
AGGACAAAGATGGTGTTGAATACACCAACTGCTTTGATGCCAATCTTGACACTTGTGCAG
CTGCTCTGGCTGGTGCTGGGTATGGCAACATGACCATTATGGTAGGAGAAATGGGATGGC
CTACAGATGGAAACAATTATGCTAATGTGACATTGGCTGAAAAGTTTTATAAAGGATTTG
TATCATATCTTGCTAAAGGAAAAGGTAGCCCACGTCGCCCTGGAAATGTTGAGGCGTACA
TATTTGCCTTATTTGATGAGGATAGGAAGAGCACACTCCCAGGAAACTTTGAGACACATT
GGGGACTTTACTATGACGATGGAACGCCAAAGTTCCCTCTTGATCTACATGGAAATAAAA
AGAATCTTGTGCCCGTGCCAAATGTAGAAAAACTCTCCAAAAAATGGTGTGTGATCAAGC
CGGATGTTAAGAACTTTACAGATGTTATGACATATGCTTGTGACCGTGCAGATTGTACAC
CTCTTACTAATGGATCATCTTGCCAAAACCTTAATGACGCTGCCAAGGCTTCATACGCCG
TGAATGCCTATTTCCAAAACAGCCAACAAAAAGATGATAGTTGTAATTTTGAAGGCAAGG
CAACAGTAACCACAAAGGATCCATCACAAGGGACTTGCAATTTCACCATTGGCTTCAAGT
CACTT