Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g031880.3.1
CDS Infomation

Amine oxidase family protein (AHRD V3.3 *** B9H3J5_POPTR)
Sequence

ATGGAGCTCAAAGGGAATGATTCTGGGAGGCGACATGGTTCATCTCCGTCGGTCATTGTA
ATTGGTGGAGGTATCTCAGGGGTAGCTGCTGCATGTTTCCTTCACAATGCTTATTTCAAG
GTGCTCTTACTGGAGTCACGAGATAGACTTGGTGGTCGCATACACACTGACAACTCGTTT
GGTTGTCCAGTTGATATGGGAGCTTCATGGCTCCATGGAGTGTGCAATGAAAATCCTTTA
GCTCCATTGATACGTCGGCTGGGGCTCACACTGTATCGAACTAGTGGTGATGACTCAGTT
CTGTATGACCATGATTTGGAAAGCTGCATGCTGTTTGACATGGATGGCCATCAAGTTCCT
CATAAAATAGTTGCTGAAGTAGGAGATGTATTCAAGAAAATCCTCGATGAGACTGAGAAA
GTGAGAAATGAGAATAGTAATGACATATCGGTTCTTCAAGCAATATCTATTGTACTGGAC
AGGCATCCTGAGCTGAGGCAAGAAGGAGTCTCTCATGAAGTACTGCAGTGGTACATATGC
AGAATGGAGGCATGGTTTTCTGCCGATGCAGACACGATCTCCTTGAAAACTTGGGATCAG
GAGCAAGTTCTTACGGGTGGCCATGGACTAATGGTGCAGGGTTATCACCCGGTGATTGAG
GCATTGTCAAAAGATATTGATATTCGTTTGAATCACAGAGTGAAGGCGATTACGGATGGG
TATAACAAAGTGATGGTTACACTTGAGGATGGGAGGAATTTTGTTGCGGATGCTGCTATA
ATAACTGTACCTATTGGGGTCCTCAAAGCCAACTTAATTGAGTTCAAACCCGAATTGCCA
GATTGGAAGCTTTCTGCAATAGCAGATCTTGGTGTGGGCAACGAAAACAAGATTGCATTA
CGATTTGATACTGTATTTTGGCCAAACGTTGAATTGTTAGGCATTGTTGCACCTACCTCT
TATGCTTGTGGGTATTTTCTTAACCTCCACAAGGCAACAGGGCATCAAGTCCTTGTCTAT
ATGGCTGCCGGAAGACTTGCTTATGACGTAGAGAAATTATCAGACAAAGAGGCGGCTAAT
TTTGTTATGCGTCAGCTGAAAAAAATGTTTCCTGATGCACCTGAACCTGTTCAGTATCTC
GTATCACGCTGGGGAACAGATCCGGATTCCCTAGGATGCTATTCATATGATCTGGTTGGA
AAGCCAACAGATATATATGATAAGCTTCGAGCACCTTTAGGTAATCTATTCTTTGGTGGC
GAAGCTGTGTGTATGGATGACCATCAAGGGTCTGTGCACGGTGCATATTCAGCTGGAATC
ATAGCTGCTGAAGATTGCTGCCAGCATCTCATTAAGAGACTTGGAAGTGTTCAACTTGTT
TCCTCCAGGGAAGAAATTCTCAAATCCATTGTTCCTCTCAAGATTTCCAGGATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g031880.3.1
PEP Infomation

Amine oxidase family protein (AHRD V3.3 *** B9H3J5_POPTR)
Sequence

MELKGNDSGRRHGSSPSVIVIGGGISGVAAACFLHNAYFKVLLLESRDRLGGRIHTDNSF
GCPVDMGASWLHGVCNENPLAPLIRRLGLTLYRTSGDDSVLYDHDLESCMLFDMDGHQVP
HKIVAEVGDVFKKILDETEKVRNENSNDISVLQAISIVLDRHPELRQEGVSHEVLQWYIC
RMEAWFSADADTISLKTWDQEQVLTGGHGLMVQGYHPVIEALSKDIDIRLNHRVKAITDG
YNKVMVTLEDGRNFVADAAIITVPIGVLKANLIEFKPELPDWKLSAIADLGVGNENKIAL
RFDTVFWPNVELLGIVAPTSYACGYFLNLHKATGHQVLVYMAAGRLAYDVEKLSDKEAAN
FVMRQLKKMFPDAPEPVQYLVSRWGTDPDSLGCYSYDLVGKPTDIYDKLRAPLGNLFFGG
EAVCMDDHQGSVHGAYSAGIIAAEDCCQHLIKRLGSVQLVSSREEILKSIVPLKISRM*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g031880.3.1
Transcript Infomation

Amine oxidase family protein (AHRD V3.3 *** B9H3J5_POPTR)
Sequence

AAAAATAATGAACAACTAATATGAATTGGAGAATATAAAATATGAGATGGTACCACCAAA
AATAAAAAAAAATGACAAAAATAACCCTGACCAAACACAATATCATGAAAAAACGGTTGG
CTTTAGCTTCTTGTTAAAACTGTTATTATTCTTCATTCATTATATATGAAAACACTCATT
TGCCGTTGCCTAACAACTGTTCGACGAATTGCCTCAAAGAAAAGAAAAAACGAAATTTGT
GATCGAACGATTTGTTTATTAGAGGATTTTATGATTATGAGTGGATTTGATCAGTTACAG
TGTTGTTACAATTTAAGCCGCATCATTGCTGGCCTTCTTCTCTTCATGCTTTATCATTCT
TTCCAATTTCTTGCTTCCTATACACCCTTAACAACATTCTCCACACACCCTTTTCTATTC
TTGATTGATTTCTTACGAACCATTGTTGAATCATGGAGCTCAAAGGGAATGATTCTGGGA
GGCGACATGGTTCATCTCCGTCGGTCATTGTAATTGGTGGAGGTATCTCAGGGGTAGCTG
CTGCATGTTTCCTTCACAATGCTTATTTCAAGGTGCTCTTACTGGAGTCACGAGATAGAC
TTGGTGGTCGCATACACACTGACAACTCGTTTGGTTGTCCAGTTGATATGGGAGCTTCAT
GGCTCCATGGAGTGTGCAATGAAAATCCTTTAGCTCCATTGATACGTCGGCTGGGGCTCA
CACTGTATCGAACTAGTGGTGATGACTCAGTTCTGTATGACCATGATTTGGAAAGCTGCA
TGCTGTTTGACATGGATGGCCATCAAGTTCCTCATAAAATAGTTGCTGAAGTAGGAGATG
TATTCAAGAAAATCCTCGATGAGACTGAGAAAGTGAGAAATGAGAATAGTAATGACATAT
CGGTTCTTCAAGCAATATCTATTGTACTGGACAGGCATCCTGAGCTGAGGCAAGAAGGAG
TCTCTCATGAAGTACTGCAGTGGTACATATGCAGAATGGAGGCATGGTTTTCTGCCGATG
CAGACACGATCTCCTTGAAAACTTGGGATCAGGAGCAAGTTCTTACGGGTGGCCATGGAC
TAATGGTGCAGGGTTATCACCCGGTGATTGAGGCATTGTCAAAAGATATTGATATTCGTT
TGAATCACAGAGTGAAGGCGATTACGGATGGGTATAACAAAGTGATGGTTACACTTGAGG
ATGGGAGGAATTTTGTTGCGGATGCTGCTATAATAACTGTACCTATTGGGGTCCTCAAAG
CCAACTTAATTGAGTTCAAACCCGAATTGCCAGATTGGAAGCTTTCTGCAATAGCAGATC
TTGGTGTGGGCAACGAAAACAAGATTGCATTACGATTTGATACTGTATTTTGGCCAAACG
TTGAATTGTTAGGCATTGTTGCACCTACCTCTTATGCTTGTGGGTATTTTCTTAACCTCC
ACAAGGCAACAGGGCATCAAGTCCTTGTCTATATGGCTGCCGGAAGACTTGCTTATGACG
TAGAGAAATTATCAGACAAAGAGGCGGCTAATTTTGTTATGCGTCAGCTGAAAAAAATGT
TTCCTGATGCACCTGAACCTGTTCAGTATCTCGTATCACGCTGGGGAACAGATCCGGATT
CCCTAGGATGCTATTCATATGATCTGGTTGGAAAGCCAACAGATATATATGATAAGCTTC
GAGCACCTTTAGGTAATCTATTCTTTGGTGGCGAAGCTGTGTGTATGGATGACCATCAAG
GGTCTGTGCACGGTGCATATTCAGCTGGAATCATAGCTGCTGAAGATTGCTGCCAGCATC
TCATTAAGAGACTTGGAAGTGTTCAACTTGTTTCCTCCAGGGAAGAAATTCTCAAATCCA
TTGTTCCTCTCAAGATTTCCAGGATGTGATCGATCATCTTCCAACAAAATCATAACTAGG
TTTAGTTTCCCTTTTTTTCCCCTCTGCTTAACAGGTAATGTGCTCCGATTCATCTTGAAC
GTTGTTTAGTTTCCCTTTTTTCCCCTTGCTTAACAAGTAATGTGCTCTGATTCATCGTCA
TTCGATTGAATTTCTGTAATGATATGAATGAAGTTGTAGCATCAGGCTGCCATTGTTGAT
TTCAATGAGAAGTATGTTTGTTTGTTTGGATTATTTCCTTGGAAGTCTTTTACTGTTACA
CAATTAATGTCTGTCCAATGCTGCTAATTTCTTTCAAAGTGTATATTTTACAGATTCATC
TGAAGTAGTAACTTTAGTCCAGCTTATTATGTATTTTCATTAAGAAATTCATTGAACATG
TTTTGGTAATTCTTTAATTTAATTTTTTCAATTGAGGAGATAGTTATGCATTTTTCACAT
TATTAAGCCATTAATCTATGAAGAAGTCAACGAAAGTAGTCGATCTTATGTAAACAAAAT
GTTTTTCTGTATCAGAAAATGAACTACTTTACTCAATTAGGACAAGGGGATTAATTTAAT
ATTATATGTTAAAAATTGAGACAAAGAGAGAGGTGTTACTAAGGAGAAATCCAATTATAG
AATAATCTTTGTTCATGGCTCCAAAGATATTGATTTTCTTGCACCCCAGGTTGCTATATC
TCCTCCATACTATACTTTATAGCGTGTAGTGCGCAGAGCGAAAAATATTTTTTTGACAAC
AGCCTTATAACATCA