Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g031450.3.1
CDS Infomation

basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein (AHRD V3.3 *-* AT1G61660.7)
Sequence

ATGGCTGATGAATATTTTCAAGATGGAGTCTATGGAGAAAGCTTGTGGATTAATTCAACA
AAAAATATTTTTAGTTTATCATCATCAACTAATTCAATTCTTGATCCAATTATTGGACGA
TATAATTTTGCATGGCCAAATGATGATCAATTTTTGGACATGAAAAATATGTCAAATAAT
AATGATGATTATTATTCTAGTTCTGATGATTCTATAGTTTTTCAAGAATTTCCCAAAAAT
CATAACTTGGGGATTAATGAAAATTCTTCTTCACCAGATTGGAATCACTCAATCAATGAT
TCCATGTTACAAGAAAAACTCAACTCAAGAGAGAATTATCCTAATCATAATGAATTGAAG
AGGAACTTTTCCAGCATAATTAGTGAAGATAATTCCTTAATTAAACCAATTATGAATCAA
GATTTCACTAATTACTATTCAGATTTGCTTCAAACATTGTTTGCTAATACTGATCTTCAT
GAAGAGCAACCTCAACAACAATCTTTCAATTATCCATCATCATCAATAAATCATAGACAA
AAATTGAAGGATTTTGTACCTTCTTTGCCTAAGTTTGATATTGAAGAAATTGGAGAGTCT
AAATTAAGCTCAATTACCAAGAATAACACAAATGAACAAACAAACAAACGGCAGAGAATT
GAGACACCATCATCATTGCCAACTTTTAAGGTGAGAAAAGAGAAACTGGGTGACAGGATA
ACTGCCCTCCAGCAATTGGTTTCACCTTTTGGAAAGACTGATACAGCTTCAGTTCTCCAA
GAAGCAATCGAATACATCAATTTTCTTCATGATCAAGTCAATGTATTTAGCAATCGATAT
ATGAAAAATGGACCACCCACACAACATCAACAGGTTAAGGAATTACAAGAAGGATTAAAA
CAAGGGTTAAGGAGCAAAGGACTATGTTTAGTACCAATATCAAGTACATTCCCATTAGCA
GCTGAGACTACTATGGAATTTTGGACACCAACATTAATGGGAACTACAGTCAGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g031450.3.1
PEP Infomation

basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein (AHRD V3.3 *-* AT1G61660.7)
Sequence

MADEYFQDGVYGESLWINSTKNIFSLSSSTNSILDPIIGRYNFAWPNDDQFLDMKNMSNN
NDDYYSSSDDSIVFQEFPKNHNLGINENSSSPDWNHSINDSMLQEKLNSRENYPNHNELK
RNFSSIISEDNSLIKPIMNQDFTNYYSDLLQTLFANTDLHEEQPQQQSFNYPSSSINHRQ
KLKDFVPSLPKFDIEEIGESKLSSITKNNTNEQTNKRQRIETPSSLPTFKVRKEKLGDRI
TALQQLVSPFGKTDTASVLQEAIEYINFLHDQVNVFSNRYMKNGPPTQHQQVKELQEGLK
QGLRSKGLCLVPISSTFPLAAETTMEFWTPTLMGTTVR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g031450.3.1
Transcript Infomation

basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein (AHRD V3.3 *-* AT1G61660.7)
Sequence

ATGTGTGTATAAATACAACTATGACTTGAGAATTTCATGTAAAACCAAATCAAACAAAAA
AAGTATCTTTGAAATTATCAAGAAGAATAGAGAAGGTATTAATAGCAACTATATTATAAA
GTTGATTAATTATGGCTGATGAATATTTTCAAGATGGAGTCTATGGAGAAAGCTTGTGGA
TTAATTCAACAAAAAATATTTTTAGTTTATCATCATCAACTAATTCAATTCTTGATCCAA
TTATTGGACGATATAATTTTGCATGGCCAAATGATGATCAATTTTTGGACATGAAAAATA
TGTCAAATAATAATGATGATTATTATTCTAGTTCTGATGATTCTATAGTTTTTCAAGAAT
TTCCCAAAAATCATAACTTGGGGATTAATGAAAATTCTTCTTCACCAGATTGGAATCACT
CAATCAATGATTCCATGTTACAAGAAAAACTCAACTCAAGAGAGAATTATCCTAATCATA
ATGAATTGAAGAGGAACTTTTCCAGCATAATTAGTGAAGATAATTCCTTAATTAAACCAA
TTATGAATCAAGATTTCACTAATTACTATTCAGATTTGCTTCAAACATTGTTTGCTAATA
CTGATCTTCATGAAGAGCAACCTCAACAACAATCTTTCAATTATCCATCATCATCAATAA
ATCATAGACAAAAATTGAAGGATTTTGTACCTTCTTTGCCTAAGTTTGATATTGAAGAAA
TTGGAGAGTCTAAATTAAGCTCAATTACCAAGAATAACACAAATGAACAAACAAACAAAC
GGCAGAGAATTGAGACACCATCATCATTGCCAACTTTTAAGGTGAGAAAAGAGAAACTGG
GTGACAGGATAACTGCCCTCCAGCAATTGGTTTCACCTTTTGGAAAGACTGATACAGCTT
CAGTTCTCCAAGAAGCAATCGAATACATCAATTTTCTTCATGATCAAGTCAATGTATTTA
GCAATCGATATATGAAAAATGGACCACCCACACAACATCAACAGGTTAAGGAATTACAAG
AAGGATTAAAACAAGGGTTAAGGAGCAAAGGACTATGTTTAGTACCAATATCAAGTACAT
TCCCATTAGCAGCTGAGACTACTATGGAATTTTGGACACCAACATTAATGGGAACTACAG
TCAGATAGATTTCGAGGCGGATTCAGATTTTAAAATTAATGAATTCTGAACTGTGTACAT
ATTAAATGAACATCTTAATTAAGTCAAATACAAAGTTTAGATTGACGTTATAATTGAATT
CTGCTGAACTTGTACCTCATACGCACCCTACTCCATCTTGATCATACAAACATCAACCAA
AAAGAGGAGAAGCTTAAGAAATTATGTATAATTAATTGATCAAAACAAGGTTATTTTAAT
TAATTAAGTGATGTTGTGGAGAAGAATAAGGAATAAACAT