Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g026070.3.1
CDS Infomation	Homeobox leucine zipper protein (AHRD V3.3 *** A0A072TNH2_MEDTR)
Sequence	ATGAGTTTTGGAGGTTTTATTGGAAGTAGTAGTGGAGGAAACGGTGGTGGGGTTTCAAGA TTGGTGGGTGATACTTCATACGAAGCCATGCCTACTGCTACTATGGCTCAGTCACAGCTT ATCACATCATCTTTATCTCATTCAATGTTTAACTCTTCACCGTTATCTCTTGCTCTTAAA CCGAAAATGGAAGGTTCTGGTGATTTAAGCTTTGATGGAATGGGAAGGAACTCCAGAGAT GATGAGTACGAGAGCAGGTCTGGGACTGGGAGTGACAACTTTGATGGCGTTGGATCGGGT GATGAAATTGAAACTCACATTGGTAGCTCATCCAAATCGGCAAAGAAGTACCATAGGCAT ACTCCATACCAAATCCAAGAGCTGGAGGCTTTCTTTAAGGAGAGTCCACACCCGGATGAG AAAGCAAGGCTGGAACTTGGTAAGAGGTTGACATTGGAAAGCAGGCAGGTTAAGTTCTGG TTCCAGAACAGGAGAACCCAAATGAAGACTCAGATGGAGCGTCATGAAAATTCAATGTTG AAGCAAGAGAATGATAAGCTTCGCATTGAGAACATAGCGATGAAGGAAGCGATGAGAAGC CCAGCTTGCCCACATTGTGGTGGTCAGGCAATTCTTGGGGAGATACACATTGAAGAGCAT CATTTGAAGATTGAGAATGCTCGGCTGAGAGATGAATACAGTAGGATCTGTGTTGTTGCA AACAAGTTTCTGGGTAGGCAGGTGGAATCTGTCCATGGTCCAATGTCAGCTGGAATGGCT AATTCAGGTTTGGAACTTGCTGTGGGAAGAAACGGCTATGGTGCTATGAATTCTGTTGAC ACTGCATTGCCAATGGGTCTTAATTTTGGCAATAATTTCTCAAGTGCTCTACCAGCTATT TCACCTAGGCCCGCCCTGAGCATGGCCGGTGTAGATGTATCCTTTGATAGGAACATGCTA ATGGAGCTTGCTTTTGCTTCCATGAATGAGCTGATTAAGCTGGCTGATATCGGTGCTCCT CTGTGGCTTGGAAACTTTGATGGAACTGCTGAAGTATTGAACCTTGAGGAGTATGCCAGG TCTTTTCCTCCATGTATTGGCATTAAACCTGCCCATTTCACAGCAGAAGCAACCAAGGCA ACTGGTACTGTGATGATTAACAGTCTGACCTTGGTGGAGACTCTGATGGACACAAGTCGA TGGATGGATATATTTTCATGCATTGTTGGCAAAACCTCTACAATTAATGTGATCTCCAAC AGCTCAGGTGGAAGCAAGGATGGCAATATGCAATTGGTACGTTATTGTTATTTTGGTGGA AGTCGCCCATTCTATAATGTTTTGCAGATCCAAGCTGAGTTCCAAGTTCCTTCTGCTTTA GTTCCTGTCCGTCGAGTGAAGTTTCTACGCTTCTGCAAGCAGCATGCTGAAGGTGTCTGG GTGATGGTGGATGTGTCTATTGATGCTATCCAGGAAGGTCCAGTACCGCTTGATGGAAGT TGCAGGAGGCTTCCTTCGGGATGTATCGTGCAAGAGTTGCCCAATGGGTGCTCCAAGGTT ATTTGGATTGAGCACATGGAGTATGATGAGAGTGTCACCCACAATTACTACCACCCTTAC ATCAGGTCTGGGCTGGGGTTTGGTGCCCAACGGTGGATCGCCACCCTACAAAGGCAATGC GAGTTCATAACAGTCATGTCTTCTCCTGTGCCCAGTGGTGATAATTCAGTGCTTAGTTCC AGTGGACGGAGAAGTATTGCGATGCTTGCTCGACGCGTTACTCGCCACTTTTGCAATGGT GTTTGTGCAACCTATTACAAGTGGGAATCAATCCAACTGGGGACTGCAGAGGAGAGCAAG TTTATTATGAGGAAGGGCGTTGGTGAACCTGGCGACCTTAATGGTATGGTGTTGAGTGCC AGCAGGACCCTCTGGCTGCCGATAACACATGAACGTTTGTCTGACTTCCTGCGAAATGAA CAGACGAGAGGTCAATGGGATGTGTTGTCCCAGGGTGGTTCCGTGCACCGAATAGTCCAC ATTGCCAAGGGTCAGGATCCTGGCAATAGCATCACTCTGTTTCGTACTACTGTGGCTAAC AGCGATGGTAGCCAAAACGGTTTGCTGACCTTGCAAGAGTCGTGCACAGATGTATCTGGT TCGATCATAGCATATACATCACTTAATACCGGAGACATGAATGGTGTGATGAATGGTGGC GATTCCTCCTGCGTGACGTTCCTTCCATCTGGATTCGCCATGGTTCCAGATTGTTACGAG AATTCCAACGGGGTAGCTGGCATCGGAACACTGGAGAACGGTGGTAAGATGAATGGGTGT CTATTGACCATGGGATACCAGGTACTCATGAGTAACCCGCCTACAGGCAATCTCACTATG GATTCTGTCAACACTGTTGACTCTCTCATCACCCGTACAGTGCACAACATCAAGCTTGCT TTCCAGTGCAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g026070.3.1
PEP Infomation	Homeobox leucine zipper protein (AHRD V3.3 *** A0A072TNH2_MEDTR)
Sequence	MSFGGFIGSSSGGNGGGVSRLVGDTSYEAMPTATMAQSQLITSSLSHSMFNSSPLSLALK PKMEGSGDLSFDGMGRNSRDDEYESRSGTGSDNFDGVGSGDEIETHIGSSSKSAKKYHRH TPYQIQELEAFFKESPHPDEKARLELGKRLTLESRQVKFWFQNRRTQMKTQMERHENSML KQENDKLRIENIAMKEAMRSPACPHCGGQAILGEIHIEEHHLKIENARLRDEYSRICVVA NKFLGRQVESVHGPMSAGMANSGLELAVGRNGYGAMNSVDTALPMGLNFGNNFSSALPAI SPRPALSMAGVDVSFDRNMLMELAFASMNELIKLADIGAPLWLGNFDGTAEVLNLEEYAR SFPPCIGIKPAHFTAEATKATGTVMINSLTLVETLMDTSRWMDIFSCIVGKTSTINVISN SSGGSKDGNMQLVRYCYFGGSRPFYNVLQIQAEFQVPSALVPVRRVKFLRFCKQHAEGVW VMVDVSIDAIQEGPVPLDGSCRRLPSGCIVQELPNGCSKVIWIEHMEYDESVTHNYYHPY IRSGLGFGAQRWIATLQRQCEFITVMSSPVPSGDNSVLSSSGRRSIAMLARRVTRHFCNG VCATYYKWESIQLGTAEESKFIMRKGVGEPGDLNGMVLSASRTLWLPITHERLSDFLRNE QTRGQWDVLSQGGSVHRIVHIAKGQDPGNSITLFRTTVANSDGSQNGLLTLQESCTDVSG SIIAYTSLNTGDMNGVMNGGDSSCVTFLPSGFAMVPDCYENSNGVAGIGTLENGGKMNGC LLTMGYQVLMSNPPTGNLTMDSVNTVDSLITRTVHNIKLAFQCN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g026070.3.1
Transcript Infomation	Homeobox leucine zipper protein (AHRD V3.3 *** A0A072TNH2_MEDTR)
Sequence	AAGGTAATGAAAAGTCCACCTTTTTTTTATATATATATATGTGTGTGTACTGGTTTTATT TAGCCCCATTTATAAAACCTTTCATTTTCTTCTTTTATGGTAGCGATCCCACTGTTTTTA CAATGACAGCTATGAGCAGTGAAAACCCATATCTCTTTGATTGAATGAATGAAATAATCT TGTTAGGGTTTCCTTTTTATTGTTTTAGCCAACCCATTTTTTCTCATTTGTTTAAAAGAG TGGAGTTAGAGGGGAAGGTGCAATAAGGGTTCTTGGTTGTCTTATACCAACCCCCTTTGC TTCTTCTTTAATTTTTGTGGGTTTGGGTTGTTGAGTTTTGTGTTAATCACTAATCTTGGG CTAAATAAAAAAAAAAAAAATTTTGTGGGTGTATAAATATGAAAAGTGTGTTGGGAAAGT TGGGATCTTGAAAGTGATTGAAAAGGGTGTTTTTGAGATTAAAAGTTTTGATTTTTTGAT AGAGTGGGGTTGAGTTTTGATGAGTTTTGGAGGTTTTATTGGAAGTAGTAGTGGAGGAAA CGGTGGTGGGGTTTCAAGATTGGTGGGTGATACTTCATACGAAGCCATGCCTACTGCTAC TATGGCTCAGTCACAGCTTATCACATCATCTTTATCTCATTCAATGTTTAACTCTTCACC GTTATCTCTTGCTCTTAAACCGAAAATGGAAGGTTCTGGTGATTTAAGCTTTGATGGAAT GGGAAGGAACTCCAGAGATGATGAGTACGAGAGCAGGTCTGGGACTGGGAGTGACAACTT TGATGGCGTTGGATCGGGTGATGAAATTGAAACTCACATTGGTAGCTCATCCAAATCGGC AAAGAAGTACCATAGGCATACTCCATACCAAATCCAAGAGCTGGAGGCTTTCTTTAAGGA GAGTCCACACCCGGATGAGAAAGCAAGGCTGGAACTTGGTAAGAGGTTGACATTGGAAAG CAGGCAGGTTAAGTTCTGGTTCCAGAACAGGAGAACCCAAATGAAGACTCAGATGGAGCG TCATGAAAATTCAATGTTGAAGCAAGAGAATGATAAGCTTCGCATTGAGAACATAGCGAT GAAGGAAGCGATGAGAAGCCCAGCTTGCCCACATTGTGGTGGTCAGGCAATTCTTGGGGA GATACACATTGAAGAGCATCATTTGAAGATTGAGAATGCTCGGCTGAGAGATGAATACAG TAGGATCTGTGTTGTTGCAAACAAGTTTCTGGGTAGGCAGGTGGAATCTGTCCATGGTCC AATGTCAGCTGGAATGGCTAATTCAGGTTTGGAACTTGCTGTGGGAAGAAACGGCTATGG TGCTATGAATTCTGTTGACACTGCATTGCCAATGGGTCTTAATTTTGGCAATAATTTCTC AAGTGCTCTACCAGCTATTTCACCTAGGCCCGCCCTGAGCATGGCCGGTGTAGATGTATC CTTTGATAGGAACATGCTAATGGAGCTTGCTTTTGCTTCCATGAATGAGCTGATTAAGCT GGCTGATATCGGTGCTCCTCTGTGGCTTGGAAACTTTGATGGAACTGCTGAAGTATTGAA CCTTGAGGAGTATGCCAGGTCTTTTCCTCCATGTATTGGCATTAAACCTGCCCATTTCAC AGCAGAAGCAACCAAGGCAACTGGTACTGTGATGATTAACAGTCTGACCTTGGTGGAGAC TCTGATGGACACAAGTCGATGGATGGATATATTTTCATGCATTGTTGGCAAAACCTCTAC AATTAATGTGATCTCCAACAGCTCAGGTGGAAGCAAGGATGGCAATATGCAATTGGTACG TTATTGTTATTTTGGTGGAAGTCGCCCATTCTATAATGTTTTGCAGATCCAAGCTGAGTT CCAAGTTCCTTCTGCTTTAGTTCCTGTCCGTCGAGTGAAGTTTCTACGCTTCTGCAAGCA GCATGCTGAAGGTGTCTGGGTGATGGTGGATGTGTCTATTGATGCTATCCAGGAAGGTCC AGTACCGCTTGATGGAAGTTGCAGGAGGCTTCCTTCGGGATGTATCGTGCAAGAGTTGCC CAATGGGTGCTCCAAGGTTATTTGGATTGAGCACATGGAGTATGATGAGAGTGTCACCCA CAATTACTACCACCCTTACATCAGGTCTGGGCTGGGGTTTGGTGCCCAACGGTGGATCGC CACCCTACAAAGGCAATGCGAGTTCATAACAGTCATGTCTTCTCCTGTGCCCAGTGGTGA TAATTCAGTGCTTAGTTCCAGTGGACGGAGAAGTATTGCGATGCTTGCTCGACGCGTTAC TCGCCACTTTTGCAATGGTGTTTGTGCAACCTATTACAAGTGGGAATCAATCCAACTGGG GACTGCAGAGGAGAGCAAGTTTATTATGAGGAAGGGCGTTGGTGAACCTGGCGACCTTAA TGGTATGGTGTTGAGTGCCAGCAGGACCCTCTGGCTGCCGATAACACATGAACGTTTGTC TGACTTCCTGCGAAATGAACAGACGAGAGGTCAATGGGATGTGTTGTCCCAGGGTGGTTC CGTGCACCGAATAGTCCACATTGCCAAGGGTCAGGATCCTGGCAATAGCATCACTCTGTT TCGTACTACTGTGGCTAACAGCGATGGTAGCCAAAACGGTTTGCTGACCTTGCAAGAGTC GTGCACAGATGTATCTGGTTCGATCATAGCATATACATCACTTAATACCGGAGACATGAA TGGTGTGATGAATGGTGGCGATTCCTCCTGCGTGACGTTCCTTCCATCTGGATTCGCCAT GGTTCCAGATTGTTACGAGAATTCCAACGGGGTAGCTGGCATCGGAACACTGGAGAACGG TGGTAAGATGAATGGGTGTCTATTGACCATGGGATACCAGGTACTCATGAGTAACCCGCC TACAGGCAATCTCACTATGGATTCTGTCAACACTGTTGACTCTCTCATCACCCGTACAGT GCACAACATCAAGCTTGCTTTCCAGTGCAATTAAATCTCCAACTGGAGGTTTCGTTGAAC GCACTACCCTACAAGTTATAGAGTTGTTGCTTTTCTGTGTTGTGATGCAAGTAGTAGTAT ACAAAGAAGACGGGTTTGAGTCAATGAACGAACCGAGGTGGTTCCCTCGGGTTGACTAGT TAGTTAGTGTTTTGATGAGGCATGGAGGATATTGGTGTGGTTCGCGTATTGACTTTCGTT CGCCCTTTTAAGGTTACTGTGTGATATGATAGTCTCTACAGGTGGTTGTTTTTGTTATTA GTACTGTTGGTTTGTTCGTGTTTGAATCTTACTTGTGTTTTTGGCAAGTTGTTGAACTTA TTTGGATGGTTTTTTTAATATATTTGGATTTTGGTTTATCAATATCTCATTAT