Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g025890.2.1
CDS Infomation	DNA mismatch repair protein (AHRD V3.3 *** Q6DQL5_PETHY)
Sequence	ATGGGGAAACCAAAACAACAAGTAATTTCCCGCTTCTTTGCACCAAAACCGAAGAACGAA GAAGACCCTTCAACTTCAACGACCCCCTGTACTCCACCTCCCAAAATTGTTGCCACCGTC AGCTTTTCACCTGCAAAGCGCCTTAGAACTTCCCAACTCATTTCTCCTCAGAACAAACTT TCTTCTTCTTACGATGATTATCCTACAAAACCCACCAAAACCCCTAAGCTATCAACCCAC GTAGATAACCCATCCACTCCTCTTCCTAATCCCACTCTCCACCAGAAGTTCCTGGATAAA CTTCTAGAACCATCTTACCACCTTTTGGAACCTTCCAAGTGTCATGAAATTGCAAATCCC AAGTACACGCCGTTAGAGCAACAAGTTGTGGAGCTTAAGACTAAGTACCCAGATGTTCTA TTGATGATTGAAGTTGGTTACAGGTACAGATTTTTTGGTCAGGATGCCGAAAATGCTGCT AGAGTTTTGGGTATTTATGCACATATGGACCACAATTTCTTGACAGCTAGTGTACCCACG TTTCGGTTGAATATTCATGTGAGGAGGCTGGTGAGTGCAGGGTACAAAGTTGGTGTTGTT AAACAAACGGAAACTGCTGCAATTAAGGCTCATGGATCGAATAAATTGGGCCCTTTTGGC CGTGGGTTGTCAGCATTGTACACGAAAGCCACTTTGGAGGCTTCTGAAGATGTAGGGGGT GGAGATGAGGGGTTCGGGTCATGTAATAACTATTTGGTTTGTGTTGTTGAGAAGGTAATC GACCTTGAGGGTTGTGGGAATGATGTGAAACTCGGGGTTGTTGGAGTTGAGGTTTCAACT GGGGATGTTGTTTATGGGGAGTTCAATGACAATTTCATGAGGGCTGGGTTGGAGGCTATG ATCCTGAACTTGTTGCCAGCTGAATTGCTTGTTGGCAGGCCTATATCTAAGCAGACAGAG AAGCTGCTACTGGCTTATGCTGGACCTGCATCGAATGTTCGGGTGGAGGATGTATCATCA GATCGGTTCAGTGACGGTGGTGCTCTGGCTGAGGTGATGTCTCTCTATGAGGGCATGCAG GAAACTAATTTGTTAGATGTTCAAGAAAAGGAAGAGGCTGAAATGAAAATGCCCAAATGC AATCAAATTGCAATCCAGGGAATAATGGCAATGCCTCATTTGGCTGTACAAGCATTGGGC CTAATTGTTAGCCATCTAAAACAATTTGGTTTGGAAAGAGTTCTGTGCTTGGGAGCCTCA TTTCGTCCCTTCTCTAGCAACATGGAGATGACTCTTTCAGCCAATGCATTGCAGCAACTT GAGGTTTTGATGAATAACTTTGACGGATCAGAGTCTGGCTCCTTATTTCATTGTATGAAT CAGACCCTTACTTTATTTGGTTCAAGGCTTCTCAGGCATTGGGTGACTCATCCATTACGG GATAGAAACATGATAGGTGCTCGTCTTGATGCAGTTTCAGAGATTGCAGAATCTATGCAA ACTCATCGAACTTCTCATACTTCTGTCTTGGAGATGGAAGGTGCTGATGTCACCAGTTCG CAACCGGAGATACATCATATAATTGTTTCAGTTCTGTCCACTATAGGAAGGCCACCAGAT ATCCAGCGGGGGCTTACAAGAATCTTTCATAGAAAAGCTACTGCTGCTGAGTTTATTGCA GTCATTCAAGCTATCTTGATTGCTGCGAAACAACTTCAGCGGCTTTTCATTACGGAGGAC AGAAGTACTAATCTGCAAAGAGAGACCTTGCATTCTGTCCTGTTGAGAAAGCTGATATCA ATTGCCTCATCTTCTACTGTTATTAATGGTGCTGCTAAGCTTTTGTCTGCTTTAAACAAG GAAGCTGCTGACAGACAGGATCTTCACAACTTATTTATCATTTCTGATGGGAAGTTCCCA GAGGTTGCTGAAGGTACAAGGAGAGTTGAGTTGGCAAATGAGAAGTTAGACTCATTGATT GTTATGCATCGCAAGCAGCTTCACATCCACAAATTGGAGTATACTAGTGTAGCTGGTATC ACACATTTGATAGAGTTGCCTCTAAACACAAAGGTGCCTCGAGATTGGGTCAAAGTGAAC AGTACTAAGAAAGCAATACGTTATCATTCACCAGAAGTATTAGTGGCTTTAGATGAGTTA GCGTTGGCAAATGAGCAGCTCACTGTCGTTTGCCAAGCTGCATGGAGTAATTTTTTGACG GGTTTTGGTGGATACTTTGCCGAGTTCCAAGCTGTTGTGCAAGCCCTGGCTTCATTGGAT TGTCTAAATTCTCTCGCCATTCTTTCGAGGAATAAGAATTATGTCCGTCCGCTCTTTGTT GAAGATGATGAGGCTGTTCAGATACATATATGCTCTGGTCGTCATCCGGTTCTGGAGGCT GTTTTACAAGATAACTTTGTCCCAAATGATACAGATTTGCATGCAGAAAGAGAGTACTGT CAGATTGTCACTGGACCAAATATGGGGGGGAAAAGTTGCTATATTCGCCAAGTTGCTCTT ATTGCTCTCATGGCTCAGGTTGGATCCTTTGTACCAGCGATCTCTGCAAAACTACATGTA CTGGATGGGATATATACTCGCATGGGTGCATCAGACAGTATTCAGCAGGGAAGGAGTACA TTCTTAGAAGAACTCAGTGAGGCTTCTGATATACTGAGAAAATGCTCAGCCAATTCACTG GTTATACTTGATGAGCTTGGGAGAGGCACCAGCACACATGATGGCGTAGCAATTGCTTAT GCAACACTTCAATATCTCCTGGAGCACAAAAAATGCATGGTTCTATTTGTTACTCATTAC CCTGAAATTGTCAGTATCAAGAATAAGTTTCCAGGCTCTGTGGGACCATACCATGTGTCA TATTTGACATCCCAAAGAGATGTGAATGGGGATTTCAAGTCAAATGAGAAGATGGATCAC ATTAATGGTGAGGACATCACCTACCTATACAAACTTGCACCAGGTGTTTCTGGGAGAAGT TTTGGTTTTAAAGTTGCTCAGCTTGCACAACTGCCGGTCACATGTATTCAGCAAGCCATT GTAATAGCTGCAAAACTGGAAGCAGCAGTCTGTAACTACACTGAACAACAATTTCGAAGG AGCTGTTCTCTAAGCCATAGGCAAGATGGCTGTAAAAATGAACCCACAGAGGATGTCCTA GAATCAGATTCCTTGTCTGCTGGAATAGTTGAAGGCTTAGACGACATCAGTGAGCTTTAC AGGGAGTTGTTTATGAACCTTAACTATGCATATCTTGAAGAACATGGTAATGACAGGAGA CTCCAGTTTCTAATGCAAGCTAGAAGCCTTGCAGCTCAGTTAATAAGTAGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g025890.2.1
PEP Infomation	DNA mismatch repair protein (AHRD V3.3 *** Q6DQL5_PETHY)
Sequence	MGKPKQQVISRFFAPKPKNEEDPSTSTTPCTPPPKIVATVSFSPAKRLRTSQLISPQNKL SSSYDDYPTKPTKTPKLSTHVDNPSTPLPNPTLHQKFLDKLLEPSYHLLEPSKCHEIANP KYTPLEQQVVELKTKYPDVLLMIEVGYRYRFFGQDAENAARVLGIYAHMDHNFLTASVPT FRLNIHVRRLVSAGYKVGVVKQTETAAIKAHGSNKLGPFGRGLSALYTKATLEASEDVGG GDEGFGSCNNYLVCVVEKVIDLEGCGNDVKLGVVGVEVSTGDVVYGEFNDNFMRAGLEAM ILNLLPAELLVGRPISKQTEKLLLAYAGPASNVRVEDVSSDRFSDGGALAEVMSLYEGMQ ETNLLDVQEKEEAEMKMPKCNQIAIQGIMAMPHLAVQALGLIVSHLKQFGLERVLCLGAS FRPFSSNMEMTLSANALQQLEVLMNNFDGSESGSLFHCMNQTLTLFGSRLLRHWVTHPLR DRNMIGARLDAVSEIAESMQTHRTSHTSVLEMEGADVTSSQPEIHHIIVSVLSTIGRPPD IQRGLTRIFHRKATAAEFIAVIQAILIAAKQLQRLFITEDRSTNLQRETLHSVLLRKLIS IASSSTVINGAAKLLSALNKEAADRQDLHNLFIISDGKFPEVAEGTRRVELANEKLDSLI VMHRKQLHIHKLEYTSVAGITHLIELPLNTKVPRDWVKVNSTKKAIRYHSPEVLVALDEL ALANEQLTVVCQAAWSNFLTGFGGYFAEFQAVVQALASLDCLNSLAILSRNKNYVRPLFV EDDEAVQIHICSGRHPVLEAVLQDNFVPNDTDLHAEREYCQIVTGPNMGGKSCYIRQVAL IALMAQVGSFVPAISAKLHVLDGIYTRMGASDSIQQGRSTFLEELSEASDILRKCSANSL VILDELGRGTSTHDGVAIAYATLQYLLEHKKCMVLFVTHYPEIVSIKNKFPGSVGPYHVS YLTSQRDVNGDFKSNEKMDHINGEDITYLYKLAPGVSGRSFGFKVAQLAQLPVTCIQQAI VIAAKLEAAVCNYTEQQFRRSCSLSHRQDGCKNEPTEDVLESDSLSAGIVEGLDDISELY RELFMNLNYAYLEEHGNDRRLQFLMQARSLAAQLISR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g025890.2.1
Transcript Infomation	DNA mismatch repair protein (AHRD V3.3 *** Q6DQL5_PETHY)
Sequence	CGAGTAGCATTACAATCTACACTGCGAAACCGCCTTTGCTCTTCGTACTGTCAAAATCAC CCGTCGGAGCTCGGAACTACCACCACTACCACCAGTCACCACCCCGACGACCGCAGTCGT CTCCATTGGTATAATGGGGAAACCAAAACAACAAGTAATTTCCCGCTTCTTTGCACCAAA ACCGAAGAACGAAGAAGACCCTTCAACTTCAACGACCCCCTGTACTCCACCTCCCAAAAT TGTTGCCACCGTCAGCTTTTCACCTGCAAAGCGCCTTAGAACTTCCCAACTCATTTCTCC TCAGAACAAACTTTCTTCTTCTTACGATGATTATCCTACAAAACCCACCAAAACCCCTAA GCTATCAACCCACGTAGATAACCCATCCACTCCTCTTCCTAATCCCACTCTCCACCAGAA GTTCCTGGATAAACTTCTAGAACCATCTTACCACCTTTTGGAACCTTCCAAGTGTCATGA AATTGCAAATCCCAAGTACACGCCGTTAGAGCAACAAGTTGTGGAGCTTAAGACTAAGTA CCCAGATGTTCTATTGATGATTGAAGTTGGTTACAGGTACAGATTTTTTGGTCAGGATGC CGAAAATGCTGCTAGAGTTTTGGGTATTTATGCACATATGGACCACAATTTCTTGACAGC TAGTGTACCCACGTTTCGGTTGAATATTCATGTGAGGAGGCTGGTGAGTGCAGGGTACAA AGTTGGTGTTGTTAAACAAACGGAAACTGCTGCAATTAAGGCTCATGGATCGAATAAATT GGGCCCTTTTGGCCGTGGGTTGTCAGCATTGTACACGAAAGCCACTTTGGAGGCTTCTGA AGATGTAGGGGGTGGAGATGAGGGGTTCGGGTCATGTAATAACTATTTGGTTTGTGTTGT TGAGAAGGTAATCGACCTTGAGGGTTGTGGGAATGATGTGAAACTCGGGGTTGTTGGAGT TGAGGTTTCAACTGGGGATGTTGTTTATGGGGAGTTCAATGACAATTTCATGAGGGCTGG GTTGGAGGCTATGATCCTGAACTTGTTGCCAGCTGAATTGCTTGTTGGCAGGCCTATATC TAAGCAGACAGAGAAGCTGCTACTGGCTTATGCTGGACCTGCATCGAATGTTCGGGTGGA GGATGTATCATCAGATCGGTTCAGTGACGGTGGTGCTCTGGCTGAGGTGATGTCTCTCTA TGAGGGCATGCAGGAAACTAATTTGTTAGATGTTCAAGAAAAGGAAGAGGCTGAAATGAA AATGCCCAAATGCAATCAAATTGCAATCCAGGGAATAATGGCAATGCCTCATTTGGCTGT ACAAGCATTGGGCCTAATTGTTAGCCATCTAAAACAATTTGGTTTGGAAAGAGTTCTGTG CTTGGGAGCCTCATTTCGTCCCTTCTCTAGCAACATGGAGATGACTCTTTCAGCCAATGC ATTGCAGCAACTTGAGGTTTTGATGAATAACTTTGACGGATCAGAGTCTGGCTCCTTATT TCATTGTATGAATCAGACCCTTACTTTATTTGGTTCAAGGCTTCTCAGGCATTGGGTGAC TCATCCATTACGGGATAGAAACATGATAGGTGCTCGTCTTGATGCAGTTTCAGAGATTGC AGAATCTATGCAAACTCATCGAACTTCTCATACTTCTGTCTTGGAGATGGAAGGTGCTGA TGTCACCAGTTCGCAACCGGAGATACATCATATAATTGTTTCAGTTCTGTCCACTATAGG AAGGCCACCAGATATCCAGCGGGGGCTTACAAGAATCTTTCATAGAAAAGCTACTGCTGC TGAGTTTATTGCAGTCATTCAAGCTATCTTGATTGCTGCGAAACAACTTCAGCGGCTTTT CATTACGGAGGACAGAAGTACTAATCTGCAAAGAGAGACCTTGCATTCTGTCCTGTTGAG AAAGCTGATATCAATTGCCTCATCTTCTACTGTTATTAATGGTGCTGCTAAGCTTTTGTC TGCTTTAAACAAGGAAGCTGCTGACAGACAGGATCTTCACAACTTATTTATCATTTCTGA TGGGAAGTTCCCAGAGGTTGCTGAAGGTACAAGGAGAGTTGAGTTGGCAAATGAGAAGTT AGACTCATTGATTGTTATGCATCGCAAGCAGCTTCACATCCACAAATTGGAGTATACTAG TGTAGCTGGTATCACACATTTGATAGAGTTGCCTCTAAACACAAAGGTGCCTCGAGATTG GGTCAAAGTGAACAGTACTAAGAAAGCAATACGTTATCATTCACCAGAAGTATTAGTGGC TTTAGATGAGTTAGCGTTGGCAAATGAGCAGCTCACTGTCGTTTGCCAAGCTGCATGGAG TAATTTTTTGACGGGTTTTGGTGGATACTTTGCCGAGTTCCAAGCTGTTGTGCAAGCCCT GGCTTCATTGGATTGTCTAAATTCTCTCGCCATTCTTTCGAGGAATAAGAATTATGTCCG TCCGCTCTTTGTTGAAGATGATGAGGCTGTTCAGATACATATATGCTCTGGTCGTCATCC GGTTCTGGAGGCTGTTTTACAAGATAACTTTGTCCCAAATGATACAGATTTGCATGCAGA AAGAGAGTACTGTCAGATTGTCACTGGACCAAATATGGGGGGGAAAAGTTGCTATATTCG CCAAGTTGCTCTTATTGCTCTCATGGCTCAGGTTGGATCCTTTGTACCAGCGATCTCTGC AAAACTACATGTACTGGATGGGATATATACTCGCATGGGTGCATCAGACAGTATTCAGCA GGGAAGGAGTACATTCTTAGAAGAACTCAGTGAGGCTTCTGATATACTGAGAAAATGCTC AGCCAATTCACTGGTTATACTTGATGAGCTTGGGAGAGGCACCAGCACACATGATGGCGT AGCAATTGCTTATGCAACACTTCAATATCTCCTGGAGCACAAAAAATGCATGGTTCTATT TGTTACTCATTACCCTGAAATTGTCAGTATCAAGAATAAGTTTCCAGGCTCTGTGGGACC ATACCATGTGTCATATTTGACATCCCAAAGAGATGTGAATGGGGATTTCAAGTCAAATGA GAAGATGGATCACATTAATGGTGAGGACATCACCTACCTATACAAACTTGCACCAGGTGT TTCTGGGAGAAGTTTTGGTTTTAAAGTTGCTCAGCTTGCACAACTGCCGGTCACATGTAT TCAGCAAGCCATTGTAATAGCTGCAAAACTGGAAGCAGCAGTCTGTAACTACACTGAACA ACAATTTCGAAGGAGCTGTTCTCTAAGCCATAGGCAAGATGGCTGTAAAAATGAACCCAC AGAGGATGTCCTAGAATCAGATTCCTTGTCTGCTGGAATAGTTGAAGGCTTAGACGACAT CAGTGAGCTTTACAGGGAGTTGTTTATGAACCTTAACTATGCATATCTTGAAGAACATGG TAATGACAGGAGACTCCAGTTTCTAATGCAAGCTAGAAGCCTTGCAGCTCAGTTAATAAG TAGGTAA