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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g007350.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061EH92_THECC)

Sequence

ATGGTTAAGAGAATCGACATTGACAAAACATCAATGAAACTTTATCGAATGAAGATGATT
ATAAGGCATTCATTAACAGGGACCTGGAGGCATCAACGCTGGAAATGGAGTTTCAGATTT
TGCTCCAACATGTGTTGTAATAGTAATAATACGCATCTATCAATTGTCTCCACTAACATT
GCAATTACAGAGTTAGCGAAAAAGGGTTTACTGGAACAAGCACGAAACCTGTTTGACAAA
ATGCCTCAAAGATCAATTGTCTCATGGAACACCATGATTTCTGGTTATTCCGAATGGGAC
AAGTTCAGTGAAGGGTTAAGTTTAGTTTCATTAATGCGTAGCAGCTGTATAAAGCTGAAC
GAGTCTACTTTGTCCTCAGTGCTGAGTGTTTGTGCTCGATCACAGTCGCTCAATCGTGGT
AAGGAAGTTCACGGGCTAGTTTTGAAATCTGGATATCAAAGTTTTCAGCTTGTGGGTAGT
GCTTTATTGTATCTTTATTCAACGTGTCATGAAATCGAAGATGCAAGGATGGTGTTTGAT
GTATTGCATAGGGAGAATGAGTTGTTATGGAGCTTGATGCTTGTGGGATATGTTAAATGT
AACTTGTTAACTGATGCTTTGGAGATTTTTAGGAAAATGCCGACCCGTGATGTTGTTGCT
TGGACCACTTTGATTTCTGGATACTCAAAGGTTGAAGGTGGATGCCAGAAAGCTTTAGAG
TTGTTTCGGTCTATTAGAGAGGATACTGAGCTTGTCCCAAATGAATTTACTCTGGATTGT
GTTTTGAGGGTGTCTGGTCGATTGGGATCTTTATATGGGGGAAGAGCAGTTCATGGGTTG
GTAGTGAAATTTGGGTTTGAGTGGGATCATTCTGTTTCTGGTGCACTGATTGATTTTTAT
TGTAGTTGTGAGGTTCTTGATGATGCTATGTTAGTTTATAGTGCACTAGTTAATCCTTCC
TTGAATAATTCAAACTCACTAATTGGAGGGCTAATCTTGGCGGGCAGGATTGAGGAGGCT
CGATATTTGTTTAACGGATTGATCAAGCAGGATCATGTTTACAATTTGATGATTAAAGGA
TATGCCATGGCTGGTCAAGTAGAGGAGTCTAAACAGTTGTTTCTGGAGATGTCAGAAAGA
AATTTAACTTCCATCAATACTATGATTTCTGTGTACTCGAGGAATGGTGAAATTGACAAA
GCTGTAGAGCTTTTTGAAGAAGTGAAAGTACAGGGAAATTCTGTCACCTGGAATTCTATG
ATTTCAGGATATACCCAAAATTATGAACATGAGAGTGCGTTAAAGTTGTATACAACCATG
AGAAGATTAACAATTAGCCAAACTAGGTCAACATTTTCTGCCCTGTTTCACGCATGCTCC
TGCCTTGGTTCACTTCAACAAGGTCAATTGATTCACGCAGATTTGATTAAGACTCCATTT
GAATCCAATAACTATGTCGGGACAGCTGTTGTTGATATGTATTCCAAATGTGGGAGCCTT
AATGATGCTCAAACATCCTTTCATAGCATTGCATATCCTAATGTAGCAGCATGGACAGCT
CTGATTAATGGGTATGCGCATCATGGGCTTGGCTCTGAGGCACTTGTACTTTTTCACCAA
ATGTTAGATGAAGGGATTAATCCTAATGCAGCAACCTTTGTCGGTGTCTTATTGGCTTGT
ACTTGTGTGGGTTTGGTTGGAGACGGCACAAGACTTTTCCACGTAATGCAAGAATACTAT
GGTATAGCACCTACTCTGGAACACTACACGTGCATGGTAGATCTTCTTGGTAGATCAGGC
CATTTACATGAAGCTGAGAAGCTTGTTAACAGAATGACTATTGAACCAGACAGCATTATC
TTTGTTGCACTGCTTAATGCTTGTTGGTTCTGGATGGACGTGGAAGTTGGAGAGAGGGTG
GCAGAAAAACTGTTGTCATTGGATCCCAACTCTACATCCAGCTGCGTTATCATGGCCAAT
ATGTATGCAGGAATTGGCAGGTGGTGGGAGAAGATGAGAGTGAGGAAAGCAATGAAGAAA
CTGCAGTATAGAAAGGATCCTGGATATAGTTGGATTGAACTAAACAACAAGGTTCAATTT
TTCTCCGTTGATAATAGAACTCATCCTTTTTGTGATACAATTTACTCAACTTTGGCAAAC
CTAACAGCAAATGTGGACTCCGAAATTAATTTTGATTGTACTTCAAAATTATTTGGTGAA
AGTGAGTTACTCTCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g007350.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061EH92_THECC)

Sequence

MVKRIDIDKTSMKLYRMKMIIRHSLTGTWRHQRWKWSFRFCSNMCCNSNNTHLSIVSTNI
AITELAKKGLLEQARNLFDKMPQRSIVSWNTMISGYSEWDKFSEGLSLVSLMRSSCIKLN
ESTLSSVLSVCARSQSLNRGKEVHGLVLKSGYQSFQLVGSALLYLYSTCHEIEDARMVFD
VLHRENELLWSLMLVGYVKCNLLTDALEIFRKMPTRDVVAWTTLISGYSKVEGGCQKALE
LFRSIREDTELVPNEFTLDCVLRVSGRLGSLYGGRAVHGLVVKFGFEWDHSVSGALIDFY
CSCEVLDDAMLVYSALVNPSLNNSNSLIGGLILAGRIEEARYLFNGLIKQDHVYNLMIKG
YAMAGQVEESKQLFLEMSERNLTSINTMISVYSRNGEIDKAVELFEEVKVQGNSVTWNSM
ISGYTQNYEHESALKLYTTMRRLTISQTRSTFSALFHACSCLGSLQQGQLIHADLIKTPF
ESNNYVGTAVVDMYSKCGSLNDAQTSFHSIAYPNVAAWTALINGYAHHGLGSEALVLFHQ
MLDEGINPNAATFVGVLLACTCVGLVGDGTRLFHVMQEYYGIAPTLEHYTCMVDLLGRSG
HLHEAEKLVNRMTIEPDSIIFVALLNACWFWMDVEVGERVAEKLLSLDPNSTSSCVIMAN
MYAGIGRWWEKMRVRKAMKKLQYRKDPGYSWIELNNKVQFFSVDNRTHPFCDTIYSTLAN
LTANVDSEINFDCTSKLFGESELLS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g007350.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061EH92_THECC)

Sequence

ATGGTTAAGAGAATCGACATTGACAAAACATCAATGAAACTTTATCGAATGAAGATGATT
ATAAGGCATTCATTAACAGGGACCTGGAGGCATCAACGCTGGAAATGGAGTTTCAGATTT
TGCTCCAACATGTGTTGTAATAGTAATAATACGCATCTATCAATTGTCTCCACTAACATT
GCAATTACAGAGTTAGCGAAAAAGGGTTTACTGGAACAAGCACGAAACCTGTTTGACAAA
ATGCCTCAAAGATCAATTGTCTCATGGAACACCATGATTTCTGGTTATTCCGAATGGGAC
AAGTTCAGTGAAGGGTTAAGTTTAGTTTCATTAATGCGTAGCAGCTGTATAAAGCTGAAC
GAGTCTACTTTGTCCTCAGTGCTGAGTGTTTGTGCTCGATCACAGTCGCTCAATCGTGGT
AAGGAAGTTCACGGGCTAGTTTTGAAATCTGGATATCAAAGTTTTCAGCTTGTGGGTAGT
GCTTTATTGTATCTTTATTCAACGTGTCATGAAATCGAAGATGCAAGGATGGTGTTTGAT
GTATTGCATAGGGAGAATGAGTTGTTATGGAGCTTGATGCTTGTGGGATATGTTAAATGT
AACTTGTTAACTGATGCTTTGGAGATTTTTAGGAAAATGCCGACCCGTGATGTTGTTGCT
TGGACCACTTTGATTTCTGGATACTCAAAGGTTGAAGGTGGATGCCAGAAAGCTTTAGAG
TTGTTTCGGTCTATTAGAGAGGATACTGAGCTTGTCCCAAATGAATTTACTCTGGATTGT
GTTTTGAGGGTGTCTGGTCGATTGGGATCTTTATATGGGGGAAGAGCAGTTCATGGGTTG
GTAGTGAAATTTGGGTTTGAGTGGGATCATTCTGTTTCTGGTGCACTGATTGATTTTTAT
TGTAGTTGTGAGGTTCTTGATGATGCTATGTTAGTTTATAGTGCACTAGTTAATCCTTCC
TTGAATAATTCAAACTCACTAATTGGAGGGCTAATCTTGGCGGGCAGGATTGAGGAGGCT
CGATATTTGTTTAACGGATTGATCAAGCAGGATCATGTTTACAATTTGATGATTAAAGGA
TATGCCATGGCTGGTCAAGTAGAGGAGTCTAAACAGTTGTTTCTGGAGATGTCAGAAAGA
AATTTAACTTCCATCAATACTATGATTTCTGTGTACTCGAGGAATGGTGAAATTGACAAA
GCTGTAGAGCTTTTTGAAGAAGTGAAAGTACAGGGAAATTCTGTCACCTGGAATTCTATG
ATTTCAGGATATACCCAAAATTATGAACATGAGAGTGCGTTAAAGTTGTATACAACCATG
AGAAGATTAACAATTAGCCAAACTAGGTCAACATTTTCTGCCCTGTTTCACGCATGCTCC
TGCCTTGGTTCACTTCAACAAGGTCAATTGATTCACGCAGATTTGATTAAGACTCCATTT
GAATCCAATAACTATGTCGGGACAGCTGTTGTTGATATGTATTCCAAATGTGGGAGCCTT
AATGATGCTCAAACATCCTTTCATAGCATTGCATATCCTAATGTAGCAGCATGGACAGCT
CTGATTAATGGGTATGCGCATCATGGGCTTGGCTCTGAGGCACTTGTACTTTTTCACCAA
ATGTTAGATGAAGGGATTAATCCTAATGCAGCAACCTTTGTCGGTGTCTTATTGGCTTGT
ACTTGTGTGGGTTTGGTTGGAGACGGCACAAGACTTTTCCACGTAATGCAAGAATACTAT
GGTATAGCACCTACTCTGGAACACTACACGTGCATGGTAGATCTTCTTGGTAGATCAGGC
CATTTACATGAAGCTGAGAAGCTTGTTAACAGAATGACTATTGAACCAGACAGCATTATC
TTTGTTGCACTGCTTAATGCTTGTTGGTTCTGGATGGACGTGGAAGTTGGAGAGAGGGTG
GCAGAAAAACTGTTGTCATTGGATCCCAACTCTACATCCAGCTGCGTTATCATGGCCAAT
ATGTATGCAGGAATTGGCAGGTGGTGGGAGAAGATGAGAGTGAGGAAAGCAATGAAGAAA
CTGCAGTATAGAAAGGATCCTGGATATAGTTGGATTGAACTAAACAACAAGGTTCAATTT
TTCTCCGTTGATAATAGAACTCATCCTTTTTGTGATACAATTTACTCAACTTTGGCAAAC
CTAACAGCAAATGTGGACTCCGAAATTAATTTTGATTGTACTTCAAAATTATTTGGTGAA
AGTGAGTTACTCTCTTAG