Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g007240.3.1
CDS Infomation

spermine synthase
Sequence

ATGGATGGGAAGGAGAATAATGGTGTTAATGGTTCAAACAAAGTTGGTATTCCTAAATGT
TGCTTGAAGGCTAGGGTATTTGATCCTGAACTTGAAGCCAATTGTCACTCTACTGTTGTT
TCTGGATGGTTCTCTCAACCTCCTACATCATTTGATGGTAAAGAGAAGGTACTGTACTTC
AACAATCCAATGTGGCCAGGAGAAGCACATTCCCTGAAAGTAGAAAAGGTTTTGTTCAAG
GGAAAGTCAGAATTCCAGGAGGTTTTGGTTTTTGAGTCTGCATCCTATGGAAAAGTTCTA
GTGCTAGATGGCATTGTTCAGTTGACTGAGAAAGATGAATGTGCCTATCAGGAGATGATA
GCCCATCTTCCTCTTTGTTCAATCAAATCTCCTAAGAAGGTTCTGGTTGTTGGGGGTGGT
GATGGTGGAGTTCTAAGGGAAATTTCTCGACATAGCTCTGTGGAGCTGATTGATATTTGT
GAGATTGATAAAATGGTTATAGATGTCAGTAAAAAGTATTTTCCAGATTTGGCTATTGGC
TTTGAGGATCCTCGTGTCAATCTTCATGTTGGTGATGCTGTTGAATTTCTGAAGAACACA
CCTGAAGGGAAGTATGATGCTATCATAGTTGATTCATCAGATCCTGTAGGTCCTGCAATA
GAGCTTGTTGAAGGACCATTCTTTGCAAAGATAGCCAGGGCATTAAGGCCTGGCGGTGTA
CTTTGCAACATGGCAGAGAGCATGTGGCTTCATACTCATCTTATTCAAGATATGATCTCA
ATTTGCCGTGAAACATTTAGTTCTGTTCATTATGCATGGGCCAGTGTTCCTACATATCCT
AGTGGCGTTATTGGGTTTCTTCTGTGCTCAACTGAGGGACCATTTGTTGATTTTAAGCAC
CCTGTTAATCCTATTGAGAAGTTAGAGGGCGCTCTCCAGCATCAGCGGGAACTCAAGTTT
TACAATTCTGAGATGCATGAAGCTGCTTTTGCATTGCCATGCTTTTTAAGGAGGGAGGTG
AGCGGTCTCCGCGATAGCCCACGTTCCGCAGGGAGTGGAGTCAAGATTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g007240.3.1
PEP Infomation

spermine synthase
Sequence

MDGKENNGVNGSNKVGIPKCCLKARVFDPELEANCHSTVVSGWFSQPPTSFDGKEKVLYF
NNPMWPGEAHSLKVEKVLFKGKSEFQEVLVFESASYGKVLVLDGIVQLTEKDECAYQEMI
AHLPLCSIKSPKKVLVVGGGDGGVLREISRHSSVELIDICEIDKMVIDVSKKYFPDLAIG
FEDPRVNLHVGDAVEFLKNTPEGKYDAIIVDSSDPVGPAIELVEGPFFAKIARALRPGGV
LCNMAESMWLHTHLIQDMISICRETFSSVHYAWASVPTYPSGVIGFLLCSTEGPFVDFKH
PVNPIEKLEGALQHQRELKFYNSEMHEAAFALPCFLRREVSGLRDSPRSAGSGVKI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g007240.3.1
Transcript Infomation

spermine synthase
Sequence

AACAAACTTGGTGGGCTACTACTGAGAATAATATGATTAAAATAATTATATTATCACGAA
ATATAAAGACCTAATTTGGAAGCGGTAACGCATTGATTCGTCCAAACCAAAGCTTTTTGC
CTGTAACGTTTTTTTTTCCCTTCTCTTTCTCTCTCGGATTCCTTCTTCTTTTTGAATTTT
TTTTTGCTAAGTGTTGGTTCTGCGTTAATTCAACGCTGCTTTTATTGTATTTTGGTGAAG
TAAGAGTGGAGTTCCCAGTTGGAAAGTGTTTGATTTGGGTTCCATTTGCTTATTAATACT
TGGTTTAGTTCTCTAATCTTCCTGTGGAGTTTCAATTTTTGCCTGAAGATATCGTGAGGT
TGTTGGAGGCTGGATTCCAATAAGATTATAATTTACGGAGCTCGAAGAAGGAAGAGGTTT
GGACAGCCGGAGGACTATGGATGGGAAGGAGAATAATGGTGTTAATGGTTCAAACAAAGT
TGGTATTCCTAAATGTTGCTTGAAGGCTAGGGTATTTGATCCTGAACTTGAAGCCAATTG
TCACTCTACTGTTGTTTCTGGATGGTTCTCTCAACCTCCTACATCATTTGATGGTAAAGA
GAAGGTACTGTACTTCAACAATCCAATGTGGCCAGGAGAAGCACATTCCCTGAAAGTAGA
AAAGGTTTTGTTCAAGGGAAAGTCAGAATTCCAGGAGGTTTTGGTTTTTGAGTCTGCATC
CTATGGAAAAGTTCTAGTGCTAGATGGCATTGTTCAGTTGACTGAGAAAGATGAATGTGC
CTATCAGGAGATGATAGCCCATCTTCCTCTTTGTTCAATCAAATCTCCTAAGAAGGTTCT
GGTTGTTGGGGGTGGTGATGGTGGAGTTCTAAGGGAAATTTCTCGACATAGCTCTGTGGA
GCTGATTGATATTTGTGAGATTGATAAAATGGTTATAGATGTCAGTAAAAAGTATTTTCC
AGATTTGGCTATTGGCTTTGAGGATCCTCGTGTCAATCTTCATGTTGGTGATGCTGTTGA
ATTTCTGAAGAACACACCTGAAGGGAAGTATGATGCTATCATAGTTGATTCATCAGATCC
TGTAGGTCCTGCAATAGAGCTTGTTGAAGGACCATTCTTTGCAAAGATAGCCAGGGCATT
AAGGCCTGGCGGTGTACTTTGCAACATGGCAGAGAGCATGTGGCTTCATACTCATCTTAT
TCAAGATATGATCTCAATTTGCCGTGAAACATTTAGTTCTGTTCATTATGCATGGGCCAG
TGTTCCTACATATCCTAGTGGCGTTATTGGGTTTCTTCTGTGCTCAACTGAGGGACCATT
TGTTGATTTTAAGCACCCTGTTAATCCTATTGAGAAGTTAGAGGGCGCTCTCCAGCATCA
GCGGGAACTCAAGTTTTACAATTCTGAGATGCATGAAGCTGCTTTTGCATTGCCATGCTT
TTTAAGGAGGGAGGTGAGCGGTCTCCGCGATAGCCCACGTTCCGCAGGGAGTGGAGTCAA
GATTTAAGAAGGTGCATTTTCTATGAAATTAATTACCCATTTCTTTTCCTTGCTGCTGGA
GTAAGCTCAACCATATCCTTCCCACTTGTCACACGCATAGCAGCAGGAAATGTAGATGTG
GCTATTTATCTATGTGGTTTGTATTTGGTATTAAACATTGAAGACATTAACATGTAATAT
GCAGGTTTCACTACTGCTATATCTATTGTATGGTACTCTTCTCTTAGTTTATATTGAGAC
TCGAATAAACTATGTCATGACACGCATTGGCCTATATATTACTCTTTCTGATAAATGCTT
GGTAACTTCAGTGAATTACGATAAACTGTAAATGTAGGTTGCTTGTTATCATGTCTCATT
AAGGAATCTGGAAGTTGAAACAGTACAAATACGAAACAAAAAAATTATGAATTCGTCAAT
CTTGTTAGTAAAAAAATGTATGGTTGAGGTTGGTAACTTCAAAGACTTCCATTACAGCAA
CTAACCTGTCAGTTAAAAATCATTCAAATGTGAATAACCAAGGCCAATAACAGTCTAAAT
GGAAAAAAAAAGAAAAAGAAAACAAGCAAGCAAGGCAGTAATGGTATTGCTGCAGACAAT
CAAAAGGAAAGATCCATCCGTAAAATTGTTCATTTGTATGGGAAGCTTAACTATCAATGG
ATGAACGTACAGATCTATTCAAATTGACGACAATTACGCTGATGTTATCCCTACTACCCC
GAGCAATTGCTAACTCTGCAAGGAAGGAAGCTGCCCGTGCTGCGAGACTTTCTTTGACGC
CTTCATCTCTCTTATAGGATTTGGTTTGTTGATCGCACCTTCTGAACGTTTGACCATTCA
AGCATCTTCTTGTAACGTCACACGCAACATCATTTGGAATGACATCCCATAGACCATCAC
TTGCAAGTATTAAGAACTCATCTTCATCGCTTCTTTTGCTAACTATCACTTCAGGATCTG
GTATCACGTACGGTTTGAGGTACATATCACCTGGCATCATCAATCAATAAGGTATCATAA
GAAGCATGATTTACTACGATCAGCTCTGCCACGAACAAGTAAGATAATTAGTAATGTTTC
AATTGGAGGTTTGTAACGGACTGGTCAGGGGCTACATAATAATGTTGCACAATATCATTC
CAATTTCCAGCAGCTAGTTTATCAATAATGATCTGATTTGTCATATCCATTTCTGTTGGT
TGCCTCGACAAAGATGAGAATGAATTAGGGAAAGACCTACAAGTGCAGTAAGCTGAGTCT
TCGACGTACCTATGGATCTTGAAGTAGCAAGAACTCCTAAGACTCTTTGTCCATTCCAAT
TTATGACTTTCCCACCTGAATTTTCAATTCTATCCAGCTCATCAGGTCTGTCAGGCTGCG
CCCATACAGGAACTCCGTCAACAGAAAGCATTCCATTTCAAAAATCAAAGACAATCTACT
TGGCACTATCAAATGTCGAGAGAAGTTTTTATAACCAAGTTAATTCATCCCTATCATATC
TACACGCAAATTCAGGATTTCAATTTGATGGTCTTAAGCATTGATCACCCGCAGCGCTAA
AGGCTAACATCAATCACTGAATACTGATCATATCATTACTCGTTGTCAGTTTAATTATAT
GTTGAACGACCCATACAACATTAGACCTTCGGCGAGTTAAGATCACTGCAATAACAGTGT
TAAATAAAAGGCATACCAAAGTTGCCAGGCCCCGTGGTTATATAGGAGGATTTACAACGA
AAAAAATATAAAGTAAAATTATAACGACACGTCTTTGTTCGTGTTTGAGTAGGGCTAATC
CTTTGACATTATTCACAGCCATATCTTTTAGAAAAGTGTACGTTTTGATTTTTACTGGAC
ACAAAATGAAAAAATAAATAAATTCGGTCTTACGATTTTATACTAAAAATATTATATAAA
TTATAACA