Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g005680.3.1
CDS Infomation

RNA-binding protein-like (AHRD V3.3 *** Q9FJ56_ARATH)
Sequence

ATGGATTCAGATCAAGGAAAACTATTTATTGGTGGGGTATCATGGGAAACATCAGAGGAG
AAGATGAAGGAGTATTTTCAAGGGTATGGTGATGTTGTACAGACTGTAGTAATGAGGGAT
AAGATTACAGGGAAGCCTAGAGGATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTATT
GATAGGGTTCTTCAGGATACCCATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCC
TTGTCCAGAGAGGAACAACAGGGTCCAAAATCTGGAAATATGGGTGGTGGTAGAAGTTTT
GGAGGCAGTGGAAATACCAGGACTAAGAAAATATTTGTTGGGGGATTGCCTCCCACTCTG
ACTGAGGATGACTTTAGAATTTACTTTGAAACTTATGGTAATGTCACTGATGTAGCAATT
ATGTATGATCAACAGACCAACCGACCTCGTGGGTTTGGCTTCATTTCATTTGATTCCGAA
GATGCAGTAGATAGGGTTTTACACAAGGCATATCATGATCTCAGTGGGAAACAAGTAGAA
GTAAAACGTGCTCTTCCTAAAGATAGTAATTCTGGTTTTGGTGGTCGTTCCACGGGCAAT
GGTGGTAGTGGTATGGGTGGTGGAAGTTACCAGGGGTATGGTGACAATCCCAGTTCTTAT
GACAGAATGGATACCAACAGATACATGCAATCACAAAACACTGGAGGTGGTTATCCATCT
TATGGTTCCTCTGGATATGGTACCGCAGGTTATGGTTATGGATCGTCCAACAATGGCATG
GGTTATGGTGCTTATGGAAGTTACGGTGGAGCCAATCCTGGCTATGGGGGTGTCAATCCT
GGATATGGTGGTGCTGCAGGTGCTGCCTTTGGAAATCCAAATGTGCCTGGTACCGGTTAT
GGTAGTGGTCAAGCTGGTGGACCAAGAAGCTCGTGGGGCTCTCAGGTTTCTTCTGGATAT
GGTAATATGGGCTATGGTAATGTATCCTGGGGTGCTTCAAGTGCTGGTGGTGGAGGTGGG
CCTGCTAACGGTGGATCTGCTGCTGGCCAGTCTCCAACTGGAGCCACAGGATATGGAAAT
CAAGGTTATGGCTATGGTGGATATGGCGGAAATGATGGGTCTTATGGAGGTGGTGCATCG
GGAGATATGCAATCAGGTGGAGGTTACATGGGCAGTGGCTATGGCGATGCTAGTGGAAAT
TCACAAGGTTCTGGTAATTATGGTGCTCAGCAAAATGGACCTTATGGTGGTGGTGCCCCA
AGTCGGCAGGCTCAACAACACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g005680.3.1
PEP Infomation

RNA-binding protein-like (AHRD V3.3 *** Q9FJ56_ARATH)
Sequence

MDSDQGKLFIGGVSWETSEEKMKEYFQGYGDVVQTVVMRDKITGKPRGFGFVVFADPSVI
DRVLQDTHVIDGRTVEAKRALSREEQQGPKSGNMGGGRSFGGSGNTRTKKIFVGGLPPTL
TEDDFRIYFETYGNVTDVAIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKAYHDLSGKQVE
VKRALPKDSNSGFGGRSTGNGGSGMGGGSYQGYGDNPSSYDRMDTNRYMQSQNTGGGYPS
YGSSGYGTAGYGYGSSNNGMGYGAYGSYGGANPGYGGVNPGYGGAAGAAFGNPNVPGTGY
GSGQAGGPRSSWGSQVSSGYGNMGYGNVSWGASSAGGGGGPANGGSAAGQSPTGATGYGN
QGYGYGGYGGNDGSYGGGASGDMQSGGGYMGSGYGDASGNSQGSGNYGAQQNGPYGGGAP
SRQAQQH*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g005680.3.1
Transcript Infomation

RNA-binding protein-like (AHRD V3.3 *** Q9FJ56_ARATH)
Sequence

AACCGTTCATTCTTTGTCCCCAAAATTCATAATCCTTCACTACTATTCGCTTCCCTAGTC
TGCGCCTCTTTTCCAGATTTTCTCTTACACAAACCCTCACTCTCTCTTCTCCCTCACACA
CACACTCAAAAATCTACATTTTTTCGTTATACATACATATACATCTTAAATATATATAGA
TAGAGAGAGAAAAAGTATAGGGGGAGAGAGAAAAAAGTATGGATTCAGATCAAGGAAAAC
TATTTATTGGTGGGGTATCATGGGAAACATCAGAGGAGAAGATGAAGGAGTATTTTCAAG
GGTATGGTGATGTTGTACAGACTGTAGTAATGAGGGATAAGATTACAGGGAAGCCTAGAG
GATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTATTGATAGGGTTCTTCAGGATACCC
ATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCCTTGTCCAGAGAGGAACAACAGG
GTCCAAAATCTGGAAATATGGGTGGTGGTAGAAGTTTTGGAGGCAGTGGAAATACCAGGA
CTAAGAAAATATTTGTTGGGGGATTGCCTCCCACTCTGACTGAGGATGACTTTAGAATTT
ACTTTGAAACTTATGGTAATGTCACTGATGTAGCAATTATGTATGATCAACAGACCAACC
GACCTCGTGGGTTTGGCTTCATTTCATTTGATTCCGAAGATGCAGTAGATAGGGTTTTAC
ACAAGGCATATCATGATCTCAGTGGGAAACAAGTAGAAGTAAAACGTGCTCTTCCTAAAG
ATAGTAATTCTGGTTTTGGTGGTCGTTCCACGGGCAATGGTGGTAGTGGTATGGGTGGTG
GAAGTTACCAGGGGTATGGTGACAATCCCAGTTCTTATGACAGAATGGATACCAACAGAT
ACATGCAATCACAAAACACTGGAGGTGGTTATCCATCTTATGGTTCCTCTGGATATGGTA
CCGCAGGTTATGGTTATGGATCGTCCAACAATGGCATGGGTTATGGTGCTTATGGAAGTT
ACGGTGGAGCCAATCCTGGCTATGGGGGTGTCAATCCTGGATATGGTGGTGCTGCAGGTG
CTGCCTTTGGAAATCCAAATGTGCCTGGTACCGGTTATGGTAGTGGTCAAGCTGGTGGAC
CAAGAAGCTCGTGGGGCTCTCAGGTTTCTTCTGGATATGGTAATATGGGCTATGGTAATG
TATCCTGGGGTGCTTCAAGTGCTGGTGGTGGAGGTGGGCCTGCTAACGGTGGATCTGCTG
CTGGCCAGTCTCCAACTGGAGCCACAGGATATGGAAATCAAGGTTATGGCTATGGTGGAT
ATGGCGGAAATGATGGGTCTTATGGAGGTGGTGCATCGGGAGATATGCAATCAGGTGGAG
GTTACATGGGCAGTGGCTATGGCGATGCTAGTGGAAATTCACAAGGTTCTGGTAATTATG
GTGCTCAGCAAAATGGACCTTATGGTGGTGGTGCCCCAAGTCGGCAGGCTCAACAACACT
GATCATAGTGGTCAATTTCATCCGAGAAGTCACCTAGTAACGTAGCAGAGGATTTCACGC
AACTGATTTCGTTCCACAGACAGTTTCCTCTTGCTGTTCTTGCAAGCGTAAAGCGCTTAA
TGGGATTGCTTTAATTTTTGTAGTTTGCAGTTCTTATTTCTAGTTTACAACAAGTAATTG
TCAGTCTTATTTCCCTGTTTTGTCATATTTTATGTTTTACTGTAGTTTTAATTTGGCTTG
CTTATGGTTGAGGTTCGTTTAATAGTTAGTTTTACCCTTGGTGATACTATCTCATCGCCA
TTACTAAACTTCCTTAGTTGGATGGAAAACTCCAAATAGGATAATGAAAGTGGAAAATAC
AACTCCGAGTGTTATTCAAATCTCAA