Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g093380.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K5K9_CYNCS)

Sequence

ATGAGATCACCGGAACATGTTTTGAAGGTCGTCGGAGTATGTAGAACAACCAATTTTCTC
ACTCAATTGCATTCTTTAACTATCAGAACTTACGACACTCACTTGGCTGCAAAAATAACA
GACTTATATTTCGAGTTGTTGCCAGCTCAAACTGCGCGTAAGCTGTTTGATGAAATTCCT
CACCCAAATATATACACCTGTAATCGCATTCTGCAACGCTTCTGTGGAAAGAACCGATAT
GAGGAAGTATTATCTCTGTTTTCGTCCATGTTTTCATTCGAAAAGGTTGATCATTTTACT
CTACTCTTTGCATTGAAGGCGTGTTCTGCATTAAAAGCTACAAATTTTGGCAAAATAATT
CATGGGTTGGGGAAGAAATATGGTAAAATTCATTCAAACATGTTTCTTGGATCAGGCCTC
ATTGACATGTACTCGAGATGTGGAGATATGGACGATGCTTTTCGCGCCTTTGAGGAATAT
TTAAAACCGGATATTGTTTTATGGACTACTCTGGTTACTGGATATGAGAAGAACTTTAAG
CCTGATAAAGCACTAGCTGTTTTTACTGGAATGGTGATGGCGCATTGCATTAGTCCAGAC
CCAATAACTCTTGTCACTGTTGTCTCTGCTTGTACTCAGTTGTTGAATTTAAAAGCTGGA
AAAAGTGTTCATGCACACGTGTTTCGAATGGGTTATGAAAGTTCCCTTTCTTTATCAAAC
GCTCTGCTGAACTTATATGCGAAATCTGGGTCCATGTTTTATGCAGGAAATTGGTTTAGG
GTGATGGAGGAGAAAGATGTTATCTCATGGAGTTGTATGATCTCATGTTGTGCTCATAAT
GATGCTACTGATAGAGCTACAAGTCTTTTTGATGAGATGATATATAAAGGAATTGAACCC
AACGTCGCATGTGTTATCAGTGCTTTGCAAGCATGTGAAGCTTGTTGTAACTTAGACAAA
GGCAGGGAAATACATAAATTAGCTTTGCAGAAAGGTTTTGAACTTGATATATTGGTCTCC
ACCACTTTGATTGATATGTACATGGGCTGTTGTTCACCTCAGGAAGCGATTTTCTTATTT
GACAGGATGCCCAGCAAAGATCCTGTTTCTTGGTTTGCTCTGTTATGTGGTTGTGTTCAA
AATGGAATGGCCAACAAGTCTATGCAAATATTTTGTGATATGATGGCCAGCGATATCCAA
CCTGATGCTACTGTGATTATTAAACTTCTTGGAGCTTGTTCTGATTTGGGGGTTCTTCAA
TTGACTTCTTGTCTTCATAGTTATGTAATTAGAGGTGGGTTCATCAGCAATTCGTTCATC
GGATCTTCAGTTATTGATTGTTATGCAAAATGTGGTAGCTTGGAGGAGGCTATCAATGTT
TTTGAGAGTTTAACAGATAAAGATGTTGTTATCTGGAGCTCCATGTTTGCTGGCTACGGA
ATTCATGGGCAAGCTAGGGAATCAATTAAGTTATTTCATCGTATGGTTGCAGATACCACG
GTGTGTCCTAACAAAGTTACCTTCCTTTCAATATTAGCAGCTTGTAGTCATGCAGGTTTT
GTTGAGGAAGGAATTGAATTCTTCAATATGATGTTAAATGAATACGAACTGATGCCAGAA
TCAAAGCATTATGCAATCATTGTTGACCTGCTTGGACGAATCGGAGAGCTGGACAAGGCT
ATGTGCCTCATTAACCAAATGCAGTCACGGGTTGGAGCACACGTATGGGGGGCCTTGCTT
GGTGCTTGCAGAATTCATCAGAATGCAGAAATTGGAGAAGTCGCTGCCAGGAATCTTCTC
CAGTTAGATCCAGATCATGCTGGATATTACATCCTGTTATCAAATGTGTATGCTGTTGAT
GGGAAGTGGGATGATGCAGCTGAACTTAGAGGTCCAATTAAAGAGAGAGAATTGAAAAAG
ATAACTGGCCAAAGTGTTGTTAGACTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g093380.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K5K9_CYNCS)

Sequence

MRSPEHVLKVVGVCRTTNFLTQLHSLTIRTYDTHLAAKITDLYFELLPAQTARKLFDEIP
HPNIYTCNRILQRFCGKNRYEEVLSLFSSMFSFEKVDHFTLLFALKACSALKATNFGKII
HGLGKKYGKIHSNMFLGSGLIDMYSRCGDMDDAFRAFEEYLKPDIVLWTTLVTGYEKNFK
PDKALAVFTGMVMAHCISPDPITLVTVVSACTQLLNLKAGKSVHAHVFRMGYESSLSLSN
ALLNLYAKSGSMFYAGNWFRVMEEKDVISWSCMISCCAHNDATDRATSLFDEMIYKGIEP
NVACVISALQACEACCNLDKGREIHKLALQKGFELDILVSTTLIDMYMGCCSPQEAIFLF
DRMPSKDPVSWFALLCGCVQNGMANKSMQIFCDMMASDIQPDATVIIKLLGACSDLGVLQ
LTSCLHSYVIRGGFISNSFIGSSVIDCYAKCGSLEEAINVFESLTDKDVVIWSSMFAGYG
IHGQARESIKLFHRMVADTTVCPNKVTFLSILAACSHAGFVEEGIEFFNMMLNEYELMPE
SKHYAIIVDLLGRIGELDKAMCLINQMQSRVGAHVWGALLGACRIHQNAEIGEVAARNLL
QLDPDHAGYYILLSNVYAVDGKWDDAAELRGPIKERELKKITGQSVVRL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g093380.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K5K9_CYNCS)

Sequence

ATGAGATCACCGGAACATGTTTTGAAGGTCGTCGGAGTATGTAGAACAACCAATTTTCTC
ACTCAATTGCATTCTTTAACTATCAGAACTTACGACACTCACTTGGCTGCAAAAATAACA
GACTTATATTTCGAGTTGTTGCCAGCTCAAACTGCGCGTAAGCTGTTTGATGAAATTCCT
CACCCAAATATATACACCTGTAATCGCATTCTGCAACGCTTCTGTGGAAAGAACCGATAT
GAGGAAGTATTATCTCTGTTTTCGTCCATGTTTTCATTCGAAAAGGTTGATCATTTTACT
CTACTCTTTGCATTGAAGGCGTGTTCTGCATTAAAAGCTACAAATTTTGGCAAAATAATT
CATGGGTTGGGGAAGAAATATGGTAAAATTCATTCAAACATGTTTCTTGGATCAGGCCTC
ATTGACATGTACTCGAGATGTGGAGATATGGACGATGCTTTTCGCGCCTTTGAGGAATAT
TTAAAACCGGATATTGTTTTATGGACTACTCTGGTTACTGGATATGAGAAGAACTTTAAG
CCTGATAAAGCACTAGCTGTTTTTACTGGAATGGTGATGGCGCATTGCATTAGTCCAGAC
CCAATAACTCTTGTCACTGTTGTCTCTGCTTGTACTCAGTTGTTGAATTTAAAAGCTGGA
AAAAGTGTTCATGCACACGTGTTTCGAATGGGTTATGAAAGTTCCCTTTCTTTATCAAAC
GCTCTGCTGAACTTATATGCGAAATCTGGGTCCATGTTTTATGCAGGAAATTGGTTTAGG
GTGATGGAGGAGAAAGATGTTATCTCATGGAGTTGTATGATCTCATGTTGTGCTCATAAT
GATGCTACTGATAGAGCTACAAGTCTTTTTGATGAGATGATATATAAAGGAATTGAACCC
AACGTCGCATGTGTTATCAGTGCTTTGCAAGCATGTGAAGCTTGTTGTAACTTAGACAAA
GGCAGGGAAATACATAAATTAGCTTTGCAGAAAGGTTTTGAACTTGATATATTGGTCTCC
ACCACTTTGATTGATATGTACATGGGCTGTTGTTCACCTCAGGAAGCGATTTTCTTATTT
GACAGGATGCCCAGCAAAGATCCTGTTTCTTGGTTTGCTCTGTTATGTGGTTGTGTTCAA
AATGGAATGGCCAACAAGTCTATGCAAATATTTTGTGATATGATGGCCAGCGATATCCAA
CCTGATGCTACTGTGATTATTAAACTTCTTGGAGCTTGTTCTGATTTGGGGGTTCTTCAA
TTGACTTCTTGTCTTCATAGTTATGTAATTAGAGGTGGGTTCATCAGCAATTCGTTCATC
GGATCTTCAGTTATTGATTGTTATGCAAAATGTGGTAGCTTGGAGGAGGCTATCAATGTT
TTTGAGAGTTTAACAGATAAAGATGTTGTTATCTGGAGCTCCATGTTTGCTGGCTACGGA
ATTCATGGGCAAGCTAGGGAATCAATTAAGTTATTTCATCGTATGGTTGCAGATACCACG
GTGTGTCCTAACAAAGTTACCTTCCTTTCAATATTAGCAGCTTGTAGTCATGCAGGTTTT
GTTGAGGAAGGAATTGAATTCTTCAATATGATGTTAAATGAATACGAACTGATGCCAGAA
TCAAAGCATTATGCAATCATTGTTGACCTGCTTGGACGAATCGGAGAGCTGGACAAGGCT
ATGTGCCTCATTAACCAAATGCAGTCACGGGTTGGAGCACACGTATGGGGGGCCTTGCTT
GGTGCTTGCAGAATTCATCAGAATGCAGAAATTGGAGAAGTCGCTGCCAGGAATCTTCTC
CAGTTAGATCCAGATCATGCTGGATATTACATCCTGTTATCAAATGTGTATGCTGTTGAT
GGGAAGTGGGATGATGCAGCTGAACTTAGAGGTCCAATTAAAGAGAGAGAATTGAAAAAG
ATAACTGGCCAAAGTGTTGTTAGACTTTAG