Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g093380.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K5K9_CYNCS)
Sequence	ATGAGATCACCGGAACATGTTTTGAAGGTCGTCGGAGTATGTAGAACAACCAATTTTCTC ACTCAATTGCATTCTTTAACTATCAGAACTTACGACACTCACTTGGCTGCAAAAATAACA GACTTATATTTCGAGTTGTTGCCAGCTCAAACTGCGCGTAAGCTGTTTGATGAAATTCCT CACCCAAATATATACACCTGTAATCGCATTCTGCAACGCTTCTGTGGAAAGAACCGATAT GAGGAAGTATTATCTCTGTTTTCGTCCATGTTTTCATTCGAAAAGGTTGATCATTTTACT CTACTCTTTGCATTGAAGGCGTGTTCTGCATTAAAAGCTACAAATTTTGGCAAAATAATT CATGGGTTGGGGAAGAAATATGGTAAAATTCATTCAAACATGTTTCTTGGATCAGGCCTC ATTGACATGTACTCGAGATGTGGAGATATGGACGATGCTTTTCGCGCCTTTGAGGAATAT TTAAAACCGGATATTGTTTTATGGACTACTCTGGTTACTGGATATGAGAAGAACTTTAAG CCTGATAAAGCACTAGCTGTTTTTACTGGAATGGTGATGGCGCATTGCATTAGTCCAGAC CCAATAACTCTTGTCACTGTTGTCTCTGCTTGTACTCAGTTGTTGAATTTAAAAGCTGGA AAAAGTGTTCATGCACACGTGTTTCGAATGGGTTATGAAAGTTCCCTTTCTTTATCAAAC GCTCTGCTGAACTTATATGCGAAATCTGGGTCCATGTTTTATGCAGGAAATTGGTTTAGG GTGATGGAGGAGAAAGATGTTATCTCATGGAGTTGTATGATCTCATGTTGTGCTCATAAT GATGCTACTGATAGAGCTACAAGTCTTTTTGATGAGATGATATATAAAGGAATTGAACCC AACGTCGCATGTGTTATCAGTGCTTTGCAAGCATGTGAAGCTTGTTGTAACTTAGACAAA GGCAGGGAAATACATAAATTAGCTTTGCAGAAAGGTTTTGAACTTGATATATTGGTCTCC ACCACTTTGATTGATATGTACATGGGCTGTTGTTCACCTCAGGAAGCGATTTTCTTATTT GACAGGATGCCCAGCAAAGATCCTGTTTCTTGGTTTGCTCTGTTATGTGGTTGTGTTCAA AATGGAATGGCCAACAAGTCTATGCAAATATTTTGTGATATGATGGCCAGCGATATCCAA CCTGATGCTACTGTGATTATTAAACTTCTTGGAGCTTGTTCTGATTTGGGGGTTCTTCAA TTGACTTCTTGTCTTCATAGTTATGTAATTAGAGGTGGGTTCATCAGCAATTCGTTCATC GGATCTTCAGTTATTGATTGTTATGCAAAATGTGGTAGCTTGGAGGAGGCTATCAATGTT TTTGAGAGTTTAACAGATAAAGATGTTGTTATCTGGAGCTCCATGTTTGCTGGCTACGGA ATTCATGGGCAAGCTAGGGAATCAATTAAGTTATTTCATCGTATGGTTGCAGATACCACG GTGTGTCCTAACAAAGTTACCTTCCTTTCAATATTAGCAGCTTGTAGTCATGCAGGTTTT GTTGAGGAAGGAATTGAATTCTTCAATATGATGTTAAATGAATACGAACTGATGCCAGAA TCAAAGCATTATGCAATCATTGTTGACCTGCTTGGACGAATCGGAGAGCTGGACAAGGCT ATGTGCCTCATTAACCAAATGCAGTCACGGGTTGGAGCACACGTATGGGGGGCCTTGCTT GGTGCTTGCAGAATTCATCAGAATGCAGAAATTGGAGAAGTCGCTGCCAGGAATCTTCTC CAGTTAGATCCAGATCATGCTGGATATTACATCCTGTTATCAAATGTGTATGCTGTTGAT GGGAAGTGGGATGATGCAGCTGAACTTAGAGGTCCAATTAAAGAGAGAGAATTGAAAAAG ATAACTGGCCAAAGTGTTGTTAGACTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g093380.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K5K9_CYNCS)
Sequence	MRSPEHVLKVVGVCRTTNFLTQLHSLTIRTYDTHLAAKITDLYFELLPAQTARKLFDEIP HPNIYTCNRILQRFCGKNRYEEVLSLFSSMFSFEKVDHFTLLFALKACSALKATNFGKII HGLGKKYGKIHSNMFLGSGLIDMYSRCGDMDDAFRAFEEYLKPDIVLWTTLVTGYEKNFK PDKALAVFTGMVMAHCISPDPITLVTVVSACTQLLNLKAGKSVHAHVFRMGYESSLSLSN ALLNLYAKSGSMFYAGNWFRVMEEKDVISWSCMISCCAHNDATDRATSLFDEMIYKGIEP NVACVISALQACEACCNLDKGREIHKLALQKGFELDILVSTTLIDMYMGCCSPQEAIFLF DRMPSKDPVSWFALLCGCVQNGMANKSMQIFCDMMASDIQPDATVIIKLLGACSDLGVLQ LTSCLHSYVIRGGFISNSFIGSSVIDCYAKCGSLEEAINVFESLTDKDVVIWSSMFAGYG IHGQARESIKLFHRMVADTTVCPNKVTFLSILAACSHAGFVEEGIEFFNMMLNEYELMPE SKHYAIIVDLLGRIGELDKAMCLINQMQSRVGAHVWGALLGACRIHQNAEIGEVAARNLL QLDPDHAGYYILLSNVYAVDGKWDDAAELRGPIKERELKKITGQSVVRL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g093380.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K5K9_CYNCS)
Sequence	ATGAGATCACCGGAACATGTTTTGAAGGTCGTCGGAGTATGTAGAACAACCAATTTTCTC ACTCAATTGCATTCTTTAACTATCAGAACTTACGACACTCACTTGGCTGCAAAAATAACA GACTTATATTTCGAGTTGTTGCCAGCTCAAACTGCGCGTAAGCTGTTTGATGAAATTCCT CACCCAAATATATACACCTGTAATCGCATTCTGCAACGCTTCTGTGGAAAGAACCGATAT GAGGAAGTATTATCTCTGTTTTCGTCCATGTTTTCATTCGAAAAGGTTGATCATTTTACT CTACTCTTTGCATTGAAGGCGTGTTCTGCATTAAAAGCTACAAATTTTGGCAAAATAATT CATGGGTTGGGGAAGAAATATGGTAAAATTCATTCAAACATGTTTCTTGGATCAGGCCTC ATTGACATGTACTCGAGATGTGGAGATATGGACGATGCTTTTCGCGCCTTTGAGGAATAT TTAAAACCGGATATTGTTTTATGGACTACTCTGGTTACTGGATATGAGAAGAACTTTAAG CCTGATAAAGCACTAGCTGTTTTTACTGGAATGGTGATGGCGCATTGCATTAGTCCAGAC CCAATAACTCTTGTCACTGTTGTCTCTGCTTGTACTCAGTTGTTGAATTTAAAAGCTGGA AAAAGTGTTCATGCACACGTGTTTCGAATGGGTTATGAAAGTTCCCTTTCTTTATCAAAC GCTCTGCTGAACTTATATGCGAAATCTGGGTCCATGTTTTATGCAGGAAATTGGTTTAGG GTGATGGAGGAGAAAGATGTTATCTCATGGAGTTGTATGATCTCATGTTGTGCTCATAAT GATGCTACTGATAGAGCTACAAGTCTTTTTGATGAGATGATATATAAAGGAATTGAACCC AACGTCGCATGTGTTATCAGTGCTTTGCAAGCATGTGAAGCTTGTTGTAACTTAGACAAA GGCAGGGAAATACATAAATTAGCTTTGCAGAAAGGTTTTGAACTTGATATATTGGTCTCC ACCACTTTGATTGATATGTACATGGGCTGTTGTTCACCTCAGGAAGCGATTTTCTTATTT GACAGGATGCCCAGCAAAGATCCTGTTTCTTGGTTTGCTCTGTTATGTGGTTGTGTTCAA AATGGAATGGCCAACAAGTCTATGCAAATATTTTGTGATATGATGGCCAGCGATATCCAA CCTGATGCTACTGTGATTATTAAACTTCTTGGAGCTTGTTCTGATTTGGGGGTTCTTCAA TTGACTTCTTGTCTTCATAGTTATGTAATTAGAGGTGGGTTCATCAGCAATTCGTTCATC GGATCTTCAGTTATTGATTGTTATGCAAAATGTGGTAGCTTGGAGGAGGCTATCAATGTT TTTGAGAGTTTAACAGATAAAGATGTTGTTATCTGGAGCTCCATGTTTGCTGGCTACGGA ATTCATGGGCAAGCTAGGGAATCAATTAAGTTATTTCATCGTATGGTTGCAGATACCACG GTGTGTCCTAACAAAGTTACCTTCCTTTCAATATTAGCAGCTTGTAGTCATGCAGGTTTT GTTGAGGAAGGAATTGAATTCTTCAATATGATGTTAAATGAATACGAACTGATGCCAGAA TCAAAGCATTATGCAATCATTGTTGACCTGCTTGGACGAATCGGAGAGCTGGACAAGGCT ATGTGCCTCATTAACCAAATGCAGTCACGGGTTGGAGCACACGTATGGGGGGCCTTGCTT GGTGCTTGCAGAATTCATCAGAATGCAGAAATTGGAGAAGTCGCTGCCAGGAATCTTCTC CAGTTAGATCCAGATCATGCTGGATATTACATCCTGTTATCAAATGTGTATGCTGTTGAT GGGAAGTGGGATGATGCAGCTGAACTTAGAGGTCCAATTAAAGAGAGAGAATTGAAAAAG ATAACTGGCCAAAGTGTTGTTAGACTTTAG