Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g092990.1.1
CDS Infomation

F-box protein (AHRD V3.3 *** W9R4Y4_9ROSA)
Sequence

ATGGGCCAATATTCATCCACACACTGCGGCGGCGGGACAAAACATCGCCACCGCAGTCTT
CATCCTACCCAACTGCCCAATTACAACCGTTCTGCCTCTGACAATTCCCAGTCCGATTTC
TTCTCCCTTATGAATTCAGATGAAGATGAGTCACCGATTCCGTTTGTTTTCGGCAACCGA
GATTATACGGATGATCTTCCTGATGAATGTTTGGCTTTGATTTTTCAGTGCTTGAGTTCC
GGTGACCGGAAAAAGTGTTCCCTTGTCTCCAGGAGATGGCTTTTGGTGGAGGGTCAAAGC
CGTCACCGACTTGCCCTCAACGCGAAAGTTGAGATTCTTCCGCATGTCCCTACCATCTTT
TCTCGTTTCGATTCTGTGACGAAACTTGCTCTCCGATGTGACCGGAAATCGGTAAGTATA
AACGATGAAGCTTTGAATCTTATCTCCCTTCGTTGTTCTAAACTTATTCGCCTTAAGCTT
CGCGGTTGCCGTGATGTTACCGATGTGGGTATGTCTGCTTTTGCTCGGAATTGTAAGAAT
TTGAAGAAATTCTCCTGTGGGTCTTGTATGTTTGGGGCCAAAGGTATGAATGCTTTGCTT
GATAACTGTTCTTCCCTTGAAGAATTATCTGTGAAACGTCTCCGGGGTATGAATGATGGG
TTTGCAGCGGACCCAATTGGGCCAGGAGCTGCTGCTTCATCGCTTAAATCTATATGTTTG
AAAGAGTTATATAATGGACAATGTTTTGCACCTTTGATTGCTGGGTCTAAAAATTTAAAG
ACTTTGAAGTTGTTGAGGTGTTTAGGTGATTGGGATAGGCTTTTTGAGACAATTGGAAGT
AGGGAAAATCATGTTTCTGAGATTCACTTGGAGAGGCTTCAAGTTGGTGATACTGGACTT
GCAGCAATATCTAATTGTCCAAAGTTGGAGATTCTGCATTTGGTGAAGACACCCGAATGC
ACTGATGCTGGAGTTGTAACAGTGGCTAGTAAGTGCAAGTTATTGAGGAAGCTTCACATT
GATGGATGGAGGACAAATAGGATAGGTGATGAGGGTTTAGTTGCAATTGCTGAGAATAGT
TCAAATCTCAAAGAATTAGTGCTTATCGGCCTGAATCCTACGTCGACTAGCCTGTTCGCA
ATAGCTTCTAATTGCAAAAAGTTAGAAAGATTGGCTCTTTGTGGTAGCGACACTATTGGA
GATCCTGAAGTTACTTGTATTGCCACAAAATGTATGGCCTTGAAGAAGCTGTGTATCAAG
GGATGTGAAGTAACCGATCAAGGGATTGAATCTTTCGCTTGGGGTTGCCCTAATTTGGTA
AAAATCAAGGTGAAGAAGTGCAAGCATGTGACGGGTGATGTTGCAGATAGGATACGAGCT
ATGAGGCAATCACTAGCAGTGAATCTTGATGGTGGGGAAATTGATATTGAACCTGTGGAT
AGTAGTGCAAGTGATGGTGGAGCAATAGAAGAAGCAACAGAGTTTCAACATACTGCAGCT
GCACTGCCCATAATTGGTGCTAGTGATATTCCATCGACGAGCAATGTAGGACGATCATCA
GCATCCAAGCCATGGTTTGGCTTTTTCGGAGGAAGGGGCCTCGTTGCCTGCACTCTCCGT
AGGTGGTCAAATGGTAATGGTGAGAGCTTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g092990.1.1
PEP Infomation

F-box protein (AHRD V3.3 *** W9R4Y4_9ROSA)
Sequence

MGQYSSTHCGGGTKHRHRSLHPTQLPNYNRSASDNSQSDFFSLMNSDEDESPIPFVFGNR
DYTDDLPDECLALIFQCLSSGDRKKCSLVSRRWLLVEGQSRHRLALNAKVEILPHVPTIF
SRFDSVTKLALRCDRKSVSINDEALNLISLRCSKLIRLKLRGCRDVTDVGMSAFARNCKN
LKKFSCGSCMFGAKGMNALLDNCSSLEELSVKRLRGMNDGFAADPIGPGAAASSLKSICL
KELYNGQCFAPLIAGSKNLKTLKLLRCLGDWDRLFETIGSRENHVSEIHLERLQVGDTGL
AAISNCPKLEILHLVKTPECTDAGVVTVASKCKLLRKLHIDGWRTNRIGDEGLVAIAENS
SNLKELVLIGLNPTSTSLFAIASNCKKLERLALCGSDTIGDPEVTCIATKCMALKKLCIK
GCEVTDQGIESFAWGCPNLVKIKVKKCKHVTGDVADRIRAMRQSLAVNLDGGEIDIEPVD
SSASDGGAIEEATEFQHTAAALPIIGASDIPSTSNVGRSSASKPWFGFFGGRGLVACTLR
RWSNGNGESL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g092990.1.1
Transcript Infomation

F-box protein (AHRD V3.3 *** W9R4Y4_9ROSA)
Sequence

ATGGGCCAATATTCATCCACACACTGCGGCGGCGGGACAAAACATCGCCACCGCAGTCTT
CATCCTACCCAACTGCCCAATTACAACCGTTCTGCCTCTGACAATTCCCAGTCCGATTTC
TTCTCCCTTATGAATTCAGATGAAGATGAGTCACCGATTCCGTTTGTTTTCGGCAACCGA
GATTATACGGATGATCTTCCTGATGAATGTTTGGCTTTGATTTTTCAGTGCTTGAGTTCC
GGTGACCGGAAAAAGTGTTCCCTTGTCTCCAGGAGATGGCTTTTGGTGGAGGGTCAAAGC
CGTCACCGACTTGCCCTCAACGCGAAAGTTGAGATTCTTCCGCATGTCCCTACCATCTTT
TCTCGTTTCGATTCTGTGACGAAACTTGCTCTCCGATGTGACCGGAAATCGGTAAGTATA
AACGATGAAGCTTTGAATCTTATCTCCCTTCGTTGTTCTAAACTTATTCGCCTTAAGCTT
CGCGGTTGCCGTGATGTTACCGATGTGGGTATGTCTGCTTTTGCTCGGAATTGTAAGAAT
TTGAAGAAATTCTCCTGTGGGTCTTGTATGTTTGGGGCCAAAGGTATGAATGCTTTGCTT
GATAACTGTTCTTCCCTTGAAGAATTATCTGTGAAACGTCTCCGGGGTATGAATGATGGG
TTTGCAGCGGACCCAATTGGGCCAGGAGCTGCTGCTTCATCGCTTAAATCTATATGTTTG
AAAGAGTTATATAATGGACAATGTTTTGCACCTTTGATTGCTGGGTCTAAAAATTTAAAG
ACTTTGAAGTTGTTGAGGTGTTTAGGTGATTGGGATAGGCTTTTTGAGACAATTGGAAGT
AGGGAAAATCATGTTTCTGAGATTCACTTGGAGAGGCTTCAAGTTGGTGATACTGGACTT
GCAGCAATATCTAATTGTCCAAAGTTGGAGATTCTGCATTTGGTGAAGACACCCGAATGC
ACTGATGCTGGAGTTGTAACAGTGGCTAGTAAGTGCAAGTTATTGAGGAAGCTTCACATT
GATGGATGGAGGACAAATAGGATAGGTGATGAGGGTTTAGTTGCAATTGCTGAGAATAGT
TCAAATCTCAAAGAATTAGTGCTTATCGGCCTGAATCCTACGTCGACTAGCCTGTTCGCA
ATAGCTTCTAATTGCAAAAAGTTAGAAAGATTGGCTCTTTGTGGTAGCGACACTATTGGA
GATCCTGAAGTTACTTGTATTGCCACAAAATGTATGGCCTTGAAGAAGCTGTGTATCAAG
GGATGTGAAGTAACCGATCAAGGGATTGAATCTTTCGCTTGGGGTTGCCCTAATTTGGTA
AAAATCAAGGTGAAGAAGTGCAAGCATGTGACGGGTGATGTTGCAGATAGGATACGAGCT
ATGAGGCAATCACTAGCAGTGAATCTTGATGGTGGGGAAATTGATATTGAACCTGTGGAT
AGTAGTGCAAGTGATGGTGGAGCAATAGAAGAAGCAACAGAGTTTCAACATACTGCAGCT
GCACTGCCCATAATTGGTGCTAGTGATATTCCATCGACGAGCAATGTAGGACGATCATCA
GCATCCAAGCCATGGTTTGGCTTTTTCGGAGGAAGGGGCCTCGTTGCCTGCACTCTCCGT
AGGTGGTCAAATGGTAATGGTGAGAGCTTATGA