Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g091240.1.1
CDS Infomation	Auxin efflux carrier (AHRD V3.3 *** A0A103XKJ3_CYNCS)
Sequence	ATGGAACCCCCATTTTCTGAAACTGATGTCAATCTGTATTATGGTGGTCATTACCTTGTA TATGCTGTTTTGCCATTGTTGAAGCTCCTATGTTTAACTGTTATTGGTCTGATTCTTGCA CATCCAAGAACCCAATTAGTTCCTAAAGCTACCTTTAAGCTTCTTAGTAAGCTTGTCTTT GCGCTTTTCTTGCCTTGTACTATCTTTATTCACCTTGGTGAGACTATTACTGTCAAGAAC TTTATGCGCTGGTGGTTTATACCAGCTAATGTGCTTCTTAGTACTGCAATTGGTTGTCTG TTGGGGTATTTGGTGGCGAAAATTTGTAAGCCACCTCCACAGTATTTTAGGTTCACTATT ATTGCGACTGCGTTTGGGAATACGGGAAATTTGCCTCTTGCTATTGTTGGATCAGTGTGT CATAGTAATGACAATCCTTTTGGTCCAGATTGCTACACGACTGGTGTGTCTTATGTGTCG TTTGCTCAATGGGTGGCGGTCCTGCTTGTTTACACTCTTGTTTACCATATGATGGAACCC CCAATTGAGTACTTTGATGTTGTTGATGGGGGTGGTGAGATTCAGGAGCAATTACCTAGT AATGATTTAAGTAGGCCACTTCTAGTGGAAGCTGAATGGCCTGGTATGGAAGATAGAGAA ACTGTGCATTGCAAGACACCCTTTATTGCGCGAGTTTTTACAAGTGTCTCAACCCTCTCG TGTACTTCTATTCCAGACCCTGATAGTTTGGAGGAAGCGCCAGCTCCAACGAGTCCAAAA TCTATTAGATGTTTAGCGGAGCCTCGGGTGGTTAGAAAATTAAGAATTGTTGCTGAACAA ACTCCAGTTCGACATGTTCTCCAGCCTCCAATGTTTGCTATATTGTTGGCTTTTATTGTT GGAATGGTTCCACCCATTAAATCTGTTGTTTATGGTACAGAAGCTCCTCTCGAGTTCCTC ACGGACAGTTTAAATATACTAGCTCAAGCTATGGTGCCTTCAGTTATGCTGATTCTGGGA GGAATGCTTGCTGAGGGTCCAAATGAATCTGAACTTGGGGTTCGAACCACTGTTGGCATC AGCGTTGCTAGGCTTTTCGTCCTTCCTTTGCTGGGAACAGGGGTGGTCTATTTGGCAGAT GAACTGAACTTTTTAATTCCTGATGATAAGATGTACCAATTCGTTCTTTTGCTGCAATAC ACCACACCAAGTGCCATTTTGTTGGGAGCAGTTGCTAGCTTGAGAGGTTATGCAGTCAGA GAAGCTTCAGCATTGCTCTTCTGGCAACATGTGTTTGCTCTCTTCTCTATTTCTATGTAC ATTATTGTCTACTTCAAGCTTCTGCTTTCTTATGTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g091240.1.1
PEP Infomation	Auxin efflux carrier (AHRD V3.3 *** A0A103XKJ3_CYNCS)
Sequence	MEPPFSETDVNLYYGGHYLVYAVLPLLKLLCLTVIGLILAHPRTQLVPKATFKLLSKLVF ALFLPCTIFIHLGETITVKNFMRWWFIPANVLLSTAIGCLLGYLVAKICKPPPQYFRFTI IATAFGNTGNLPLAIVGSVCHSNDNPFGPDCYTTGVSYVSFAQWVAVLLVYTLVYHMMEP PIEYFDVVDGGGEIQEQLPSNDLSRPLLVEAEWPGMEDRETVHCKTPFIARVFTSVSTLS CTSIPDPDSLEEAPAPTSPKSIRCLAEPRVVRKLRIVAEQTPVRHVLQPPMFAILLAFIV GMVPPIKSVVYGTEAPLEFLTDSLNILAQAMVPSVMLILGGMLAEGPNESELGVRTTVGI SVARLFVLPLLGTGVVYLADELNFLIPDDKMYQFVLLLQYTTPSAILLGAVASLRGYAVR EASALLFWQHVFALFSISMYIIVYFKLLLSYV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g091240.1.1
Transcript Infomation	Auxin efflux carrier (AHRD V3.3 *** A0A103XKJ3_CYNCS)
Sequence	ATGGAACCCCCATTTTCTGAAACTGATGTCAATCTGTATTATGGTGGTCATTACCTTGTA TATGCTGTTTTGCCATTGTTGAAGCTCCTATGTTTAACTGTTATTGGTCTGATTCTTGCA CATCCAAGAACCCAATTAGTTCCTAAAGCTACCTTTAAGCTTCTTAGTAAGCTTGTCTTT GCGCTTTTCTTGCCTTGTACTATCTTTATTCACCTTGGTGAGACTATTACTGTCAAGAAC TTTATGCGCTGGTGGTTTATACCAGCTAATGTGCTTCTTAGTACTGCAATTGGTTGTCTG TTGGGGTATTTGGTGGCGAAAATTTGTAAGCCACCTCCACAGTATTTTAGGTTCACTATT ATTGCGACTGCGTTTGGGAATACGGGAAATTTGCCTCTTGCTATTGTTGGATCAGTGTGT CATAGTAATGACAATCCTTTTGGTCCAGATTGCTACACGACTGGTGTGTCTTATGTGTCG TTTGCTCAATGGGTGGCGGTCCTGCTTGTTTACACTCTTGTTTACCATATGATGGAACCC CCAATTGAGTACTTTGATGTTGTTGATGGGGGTGGTGAGATTCAGGAGCAATTACCTAGT AATGATTTAAGTAGGCCACTTCTAGTGGAAGCTGAATGGCCTGGTATGGAAGATAGAGAA ACTGTGCATTGCAAGACACCCTTTATTGCGCGAGTTTTTACAAGTGTCTCAACCCTCTCG TGTACTTCTATTCCAGACCCTGATAGTTTGGAGGAAGCGCCAGCTCCAACGAGTCCAAAA TCTATTAGATGTTTAGCGGAGCCTCGGGTGGTTAGAAAATTAAGAATTGTTGCTGAACAA ACTCCAGTTCGACATGTTCTCCAGCCTCCAATGTTTGCTATATTGTTGGCTTTTATTGTT GGAATGGTTCCACCCATTAAATCTGTTGTTTATGGTACAGAAGCTCCTCTCGAGTTCCTC ACGGACAGTTTAAATATACTAGCTCAAGCTATGGTGCCTTCAGTTATGCTGATTCTGGGA GGAATGCTTGCTGAGGGTCCAAATGAATCTGAACTTGGGGTTCGAACCACTGTTGGCATC AGCGTTGCTAGGCTTTTCGTCCTTCCTTTGCTGGGAACAGGGGTGGTCTATTTGGCAGAT GAACTGAACTTTTTAATTCCTGATGATAAGATGTACCAATTCGTTCTTTTGCTGCAATAC ACCACACCAAGTGCCATTTTGTTGGGAGCAGTTGCTAGCTTGAGAGGTTATGCAGTCAGA GAAGCTTCAGCATTGCTCTTCTGGCAACATGTGTTTGCTCTCTTCTCTATTTCTATGTAC ATTATTGTCTACTTCAAGCTTCTGCTTTCTTATGTCTGA