Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g090910.3.1
CDS Infomation	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein (AHRD V3.3 *** AT4G36960.2)
Sequence	ATGTCGGAGAAGAAGCTTGTGGTTTTAGGCATCCCATGGGACGTGGATACAGAAGGTCTA AGGGAATATATGATCAAATATGGAGATTTAGAGGATTGTATTGTGATGAAGGAACGTGCT ACTGGTCGTTCTCGTGGATTCGGCTATGTCACATTTGCTACAGTTGAGGATGCTAAGAAT GCATTGTCTAAGGAGCACTTTCTTGGAAACAGAATGCTAGAAGTGAAAGTGGCGACACCG AAGGAGGAGATGAGGGCTCCTGCAAAGAAAGTGACCAGGATTTTCGTTGCTAGGATTCCT CCGTCTGTGTCTGAAGCTACTTTCAGAGGTTATTTTGAGAAGTACGGTGAAATAACAGAT CTGTACATGCCAAAGGATCCATCTACCAAGGGACATCGTGGAATTGGGTTTATTACTTTT GCAAATGCTGAATCAGTTGATGATCTGATGAGTGACACCCATGAACTGGGAGGTTCCACA ATTGTGGTGGACCGAGCAACACCCAAGGAAGAAGATTTCAGACCTGTTAGTCGGATGTCT CAGAGTGGAGGAGGATATGGTGCATATAATGCATATATGAGTGCAACTACTAGATATGGT GCGCTTGGTGCTCCTACCTTATATGATCATCCTAGTTCTATGTATGGAAGAGGTGGAGGT GGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGATTTCCATCTCGTGGTGGCTTGGGCCAGAAGATCTTT GTTGGTCGACTACCTCAAGAGGCAACAACTGAAGATCTTCGCCAGTATTTTGGTAGATTT GGCCGTGTTTTAGATGTGTATGTCCCAAAGGATCCAAGAAGACCAGGGCATAGAGGGTTT GGTTTTGTTACATTTGCTGATGATGGTGTTGCAGATCGTGTTTCTCGAAGGCCTCATGAG ATATGTGGACATCAGGTTGCAATTGATTCTGCTACTCCTCTTGATGATGCTGGTCCAAGT AACAATTACATGATGGATCCTCCTCCTCCTGCTCCTGAAGCATATGGGGGATATGGTGGT CCTATGCGTACTTATGGAAGGATGTATGGGGGCCTAGATTATGATGATTGGGGTTACGGC CTGGGTGGTGGGAGACCTTCAAGATCAGATATGAGATACAGGCCCTACTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g090910.3.1
PEP Infomation	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein (AHRD V3.3 *** AT4G36960.2)
Sequence	MSEKKLVVLGIPWDVDTEGLREYMIKYGDLEDCIVMKERATGRSRGFGYVTFATVEDAKN ALSKEHFLGNRMLEVKVATPKEEMRAPAKKVTRIFVARIPPSVSEATFRGYFEKYGEITD LYMPKDPSTKGHRGIGFITFANAESVDDLMSDTHELGGSTIVVDRATPKEEDFRPVSRMS QSGGGYGAYNAYMSATTRYGALGAPTLYDHPSSMYGRGGGGGGGGGGGFPSRGGLGQKIF VGRLPQEATTEDLRQYFGRFGRVLDVYVPKDPRRPGHRGFGFVTFADDGVADRVSRRPHE ICGHQVAIDSATPLDDAGPSNNYMMDPPPPAPEAYGGYGGPMRTYGRMYGGLDYDDWGYG LGGGRPSRSDMRYRPY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g090910.3.1
Transcript Infomation	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein (AHRD V3.3 *** AT4G36960.2)
Sequence	TATATACTAATATAAAAAAGACGGGACGGATAAGAGCAGTGGCTTGGGGTTTGAAGGAGC TGAGCGGCGCGAGGAAGAGCGAGCGGAGCGGAGTGAGAGAGCGAATTAGGGTTTTGATAA TCGGAATCAAGAAGGAAGAATCGTCTTGTGTGAGCGATTCGTTTATAGAGAGAGGTGTGG TGAGATCGCGAGAGCGAGTTGAGTGTATATCCTACGATTTCCACTCTCCGCTAATCAATT TGTCAGACAAGTTTTCGTTACCATGTCGGAGAAGAAGCTTGTGGTTTTAGGCATCCCATG GGACGTGGATACAGAAGGTCTAAGGGAATATATGATCAAATATGGAGATTTAGAGGATTG TATTGTGATGAAGGAACGTGCTACTGGTCGTTCTCGTGGATTCGGCTATGTCACATTTGC TACAGTTGAGGATGCTAAGAATGCATTGTCTAAGGAGCACTTTCTTGGAAACAGAATGCT AGAAGTGAAAGTGGCGACACCGAAGGAGGAGATGAGGGCTCCTGCAAAGAAAGTGACCAG GATTTTCGTTGCTAGGATTCCTCCGTCTGTGTCTGAAGCTACTTTCAGAGGTTATTTTGA GAAGTACGGTGAAATAACAGATCTGTACATGCCAAAGGATCCATCTACCAAGGGACATCG TGGAATTGGGTTTATTACTTTTGCAAATGCTGAATCAGTTGATGATCTGATGAGTGACAC CCATGAACTGGGAGGTTCCACAATTGTGGTGGACCGAGCAACACCCAAGGAAGAAGATTT CAGACCTGTTAGTCGGATGTCTCAGAGTGGAGGAGGATATGGTGCATATAATGCATATAT GAGTGCAACTACTAGATATGGTGCGCTTGGTGCTCCTACCTTATATGATCATCCTAGTTC TATGTATGGAAGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGATTTCCATCTCGTGG TGGCTTGGGCCAGAAGATCTTTGTTGGTCGACTACCTCAAGAGGCAACAACTGAAGATCT TCGCCAGTATTTTGGTAGATTTGGCCGTGTTTTAGATGTGTATGTCCCAAAGGATCCAAG AAGACCAGGGCATAGAGGGTTTGGTTTTGTTACATTTGCTGATGATGGTGTTGCAGATCG TGTTTCTCGAAGGCCTCATGAGATATGTGGACATCAGGTTGCAATTGATTCTGCTACTCC TCTTGATGATGCTGGTCCAAGTAACAATTACATGATGGATCCTCCTCCTCCTGCTCCTGA AGCATATGGGGGATATGGTGGTCCTATGCGTACTTATGGAAGGATGTATGGGGGCCTAGA TTATGATGATTGGGGTTACGGCCTGGGTGGTGGGAGACCTTCAAGATCAGATATGAGATA CAGGCCCTACTAGCTGGCCTGGTTGGATAGGAGGCGGTCAAGATCAGATATGAGATTCAG GCCCTAGTAGCTTTGTGTTGCAGGAGGTCAGAGGCTGTCTGAATTTCCAATGGGTGACAA CAATAGATATGTCATATTTATATCAGTTTATTATTAGGTGGACATCATAATACATGTGCT ACTAATACTTAAGTAATTGAAAAAGCAGTGCTGATGGATTGTGCAATTCACTTCATACTT GATCCTTTGTATTAAATGTATTGAAGAAACAAAGAATGGGTGCTAATTCCATATCCAGGA GTAGAAACATAGTTGGTAGTGAAGCAATATAGCAAATTATGTTTTATACCTAAAGTGAGT TTTCCTGGAAATCCGTTCTGAGAGATGAGTGGTTTCCTGTATTTATGTTTTTGTGGAAAT CGGAAATTTAAATGCTTCTACTCGCTCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAT GAGATACCGCATCGGGATCAGAAGTTGCGTCGAATAATAGATTTCCAGCTTGTCTCAATT ATATGTAGGTTGGACTAGTGAAATATATATTATGTTGGTGTTCTAGTAAGGGACATGACT AGAAAATGCTGCATTTTTATGAGGTGTGTACTACAACCAGTCTGTCTTGGCATGTGTATT CTTTCTGGGTATTGTGGAGATATCAGATGGTATGGAATTCCACGAGACAGTGATAAGGCC TGAATACATAGCCAAAAGTAGGTGGATTACTGAATAAAGCAGTCAGCAACGAGTTGTCTG TTCCTTTAGATTACCATTAACAACTGAGGCTCTAGATTTGACAAGAACCACCTACAATGA CTTGAATTTTACTTCAGAAAGCCTCATGCCTGTACACAAAATCAAGGGATACGGCAAACA AAGCAACTGCTAAATGATGTAATCTTGAAATACTCCCGAAATGGAATGATTCTGTGGGAA TCCCTTCTAGGCTGACTCTCCGAAGTTGCACGTCTCATATTTTGGGCCTTCACCTGAGCG TGT