Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g088650.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2RWF1_GLYSO)
Sequence	ATGAATGGCCCATCTTTGCCATTGTCCAAGAAATTGACGCACCTAAAACGAGTCGTTGAA ACAACAGCTACAGCAGCAGAGCAATGCAAGTCTCTCTTAGAACACTGCGCCAAAATCAAA TCTTTAAGAACCACCAAGGGAGTCCATGCTCATACCATTACACTCGGGCTCCTACAATCC ATCAACTCGACTCATTTGCGTTCTCTCCTGACAGCAGCATATGCACTCTGTGGTCACACT TCCTATGCTCCAAAAATGTTCGATGAATTGCCTCAACGAACTTTGCTGTCATACAGGTCC ATGATAAGAATGTACACTCAGAAGGGGTTCCCTAACATTGCCCTCAAACTCTTCGGGGAA ATGCTGCGATCGGATAAACACAAGCCTGATAGGCATACATTTCCTTATGTGATTAGGGCG TGCAGTGATTTGTTCTTACTCCAGCAGGGTGTTGTTATTCATGGGTTGACTGTTCTAAGT GGGCATATGTGGGATACTTTTGTGGGAAATTCACTTTTGTCTATGTATTTGAGTTGTGGA GATAAAGAGGGTGCTAGGAGGGTCTTTGATGCAATGCAGGTAAGAACTGTTGTGACCTGG AACACTATGATCAGTGGGTATTGCCGAAATGATAGTCCGAAGGAGGCCCTAATGATTTAC AGGAGAATGGAAGATGCTGGTGTTGACGCTGATTGTGCTACTGTGCTTTCCGTGTTGCCT GCGTGTGGGTGTCTAAAGGACTTTGAAATTGGCAGAGAGGTTCACTCACTGGTTGAACAA GTAGGTTTTTGGGACAATTTGTCAGTTCGGAATGCTGTCGTTGATATGTATGTCAAGTGT GGAAGAATGGATGAAGCAAGGTTGGTTTTTGAGAAGATGATCGATAGAGATGTGGTTACT TGGACTACAATGATCCACGGTTTCATTTCAGATGGTGACTTAAAAAATGCACTATGGTTT TCTCAGAGGATGCAGCTTGAAGGTGTAAGACCGAATGCGGTAACTCTAGCATCCCTTCTT GCTGCATGTGCCAGTTTGCCACATTTGAGGCTTGGTAAATGCCTGCATGGCTGGGCTATC AGGCAGGACCTTCAGGCTGATGTTAATGTAGAAACTGGCCTTATTGACATGTATGCTAAA TGCAATTGTTTTAGACTAGGCTATCAGGTGTTTACAAAGACTAGCAAGAAGAGGACTGTC CCGTGGAATGCAATTTTGTCTGGGTGCCTTCATAATGAGCTTGCGAGAGAAGCCATAGAG CTTTTCAAATTCATGTTGTCAGAGGCTGTCAAACCTAATGATGCAACCCTGAAAAGTGTA CTTCCTGCATTTGCCATTGAAGCTGATCTAAGGCAAGCGTTGAGCATGCACAGCTATCTT GTAAGATCTGGATTTGTTACAAGAACTGAGGTAGCTACTGCTTTAGTTGATATATACTCG AAATGTGGAAATTTAGATAATAGTCACAAGGTTTTTAGTGGGATACCCAAGAAAGAAAAG GACATAATCTTATGGAGTACGTTAATTGCTGGTTATGGGATGCATGGGCATGGCGAAACT TCTTTGTCATTGTTTAATGAGATGGTGCAATCTGGGGTCAAACCTAACGAAGTCACTTTC ACCTCGGTTTTGCATGCTTGTGGACATGCTGGTTTGGTGGATGACGGTCTTTGTTTGTTC AATTTTATGCTTAGAAATCACTCTGGTAGTCTTAGAACAGATCATTATACCTGTATGGTT GATCTTCTTGGTCGAGCTGGCCGACTTGAGGAGGCATATGAACTTATTCAAACTATGACT TTTGAACCAAGTCATGCCATCTGGGGTGCACTACTTGGTGCCTGTGTGATACATGAAAAT GTGGAACTGGGAGAATTGTCTGCAAGGTGGCTGTTTAAGCTGGAGCCGGAGAACACAGGA AACTATATACTGTTGGGAAAGATCTATTCTGCAGTTGGAAGATGGAAAGATGCAGAGAAC GTGAGACTTTTGATGAATGAAGTCGGACTGATAAAGGCGCCAGCTCAAAGTGTCATTGGG TGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g088650.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2RWF1_GLYSO)
Sequence	MNGPSLPLSKKLTHLKRVVETTATAAEQCKSLLEHCAKIKSLRTTKGVHAHTITLGLLQS INSTHLRSLLTAAYALCGHTSYAPKMFDELPQRTLLSYRSMIRMYTQKGFPNIALKLFGE MLRSDKHKPDRHTFPYVIRACSDLFLLQQGVVIHGLTVLSGHMWDTFVGNSLLSMYLSCG DKEGARRVFDAMQVRTVVTWNTMISGYCRNDSPKEALMIYRRMEDAGVDADCATVLSVLP ACGCLKDFEIGREVHSLVEQVGFWDNLSVRNAVVDMYVKCGRMDEARLVFEKMIDRDVVT WTTMIHGFISDGDLKNALWFSQRMQLEGVRPNAVTLASLLAACASLPHLRLGKCLHGWAI RQDLQADVNVETGLIDMYAKCNCFRLGYQVFTKTSKKRTVPWNAILSGCLHNELAREAIE LFKFMLSEAVKPNDATLKSVLPAFAIEADLRQALSMHSYLVRSGFVTRTEVATALVDIYS KCGNLDNSHKVFSGIPKKEKDIILWSTLIAGYGMHGHGETSLSLFNEMVQSGVKPNEVTF TSVLHACGHAGLVDDGLCLFNFMLRNHSGSLRTDHYTCMVDLLGRAGRLEEAYELIQTMT FEPSHAIWGALLGACVIHENVELGELSARWLFKLEPENTGNYILLGKIYSAVGRWKDAEN VRLLMNEVGLIKAPAQSVIG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g088650.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2RWF1_GLYSO)
Sequence	ATGAATGGCCCATCTTTGCCATTGTCCAAGAAATTGACGCACCTAAAACGAGTCGTTGAA ACAACAGCTACAGCAGCAGAGCAATGCAAGTCTCTCTTAGAACACTGCGCCAAAATCAAA TCTTTAAGAACCACCAAGGGAGTCCATGCTCATACCATTACACTCGGGCTCCTACAATCC ATCAACTCGACTCATTTGCGTTCTCTCCTGACAGCAGCATATGCACTCTGTGGTCACACT TCCTATGCTCCAAAAATGTTCGATGAATTGCCTCAACGAACTTTGCTGTCATACAGGTCC ATGATAAGAATGTACACTCAGAAGGGGTTCCCTAACATTGCCCTCAAACTCTTCGGGGAA ATGCTGCGATCGGATAAACACAAGCCTGATAGGCATACATTTCCTTATGTGATTAGGGCG TGCAGTGATTTGTTCTTACTCCAGCAGGGTGTTGTTATTCATGGGTTGACTGTTCTAAGT GGGCATATGTGGGATACTTTTGTGGGAAATTCACTTTTGTCTATGTATTTGAGTTGTGGA GATAAAGAGGGTGCTAGGAGGGTCTTTGATGCAATGCAGGTAAGAACTGTTGTGACCTGG AACACTATGATCAGTGGGTATTGCCGAAATGATAGTCCGAAGGAGGCCCTAATGATTTAC AGGAGAATGGAAGATGCTGGTGTTGACGCTGATTGTGCTACTGTGCTTTCCGTGTTGCCT GCGTGTGGGTGTCTAAAGGACTTTGAAATTGGCAGAGAGGTTCACTCACTGGTTGAACAA GTAGGTTTTTGGGACAATTTGTCAGTTCGGAATGCTGTCGTTGATATGTATGTCAAGTGT GGAAGAATGGATGAAGCAAGGTTGGTTTTTGAGAAGATGATCGATAGAGATGTGGTTACT TGGACTACAATGATCCACGGTTTCATTTCAGATGGTGACTTAAAAAATGCACTATGGTTT TCTCAGAGGATGCAGCTTGAAGGTGTAAGACCGAATGCGGTAACTCTAGCATCCCTTCTT GCTGCATGTGCCAGTTTGCCACATTTGAGGCTTGGTAAATGCCTGCATGGCTGGGCTATC AGGCAGGACCTTCAGGCTGATGTTAATGTAGAAACTGGCCTTATTGACATGTATGCTAAA TGCAATTGTTTTAGACTAGGCTATCAGGTGTTTACAAAGACTAGCAAGAAGAGGACTGTC CCGTGGAATGCAATTTTGTCTGGGTGCCTTCATAATGAGCTTGCGAGAGAAGCCATAGAG CTTTTCAAATTCATGTTGTCAGAGGCTGTCAAACCTAATGATGCAACCCTGAAAAGTGTA CTTCCTGCATTTGCCATTGAAGCTGATCTAAGGCAAGCGTTGAGCATGCACAGCTATCTT GTAAGATCTGGATTTGTTACAAGAACTGAGGTAGCTACTGCTTTAGTTGATATATACTCG AAATGTGGAAATTTAGATAATAGTCACAAGGTTTTTAGTGGGATACCCAAGAAAGAAAAG GACATAATCTTATGGAGTACGTTAATTGCTGGTTATGGGATGCATGGGCATGGCGAAACT TCTTTGTCATTGTTTAATGAGATGGTGCAATCTGGGGTCAAACCTAACGAAGTCACTTTC ACCTCGGTTTTGCATGCTTGTGGACATGCTGGTTTGGTGGATGACGGTCTTTGTTTGTTC AATTTTATGCTTAGAAATCACTCTGGTAGTCTTAGAACAGATCATTATACCTGTATGGTT GATCTTCTTGGTCGAGCTGGCCGACTTGAGGAGGCATATGAACTTATTCAAACTATGACT TTTGAACCAAGTCATGCCATCTGGGGTGCACTACTTGGTGCCTGTGTGATACATGAAAAT GTGGAACTGGGAGAATTGTCTGCAAGGTGGCTGTTTAAGCTGGAGCCGGAGAACACAGGA AACTATATACTGTTGGGAAAGATCTATTCTGCAGTTGGAAGATGGAAAGATGCAGAGAAC GTGAGACTTTTGATGAATGAAGTCGGACTGATAAAGGCGCCAGCTCAAAGTGTCATTGGG TGA