Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g088470.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YHC4_CYNCS)
Sequence	ATGCAGATGCCAACACCAATCCGAGCTCCTACATGGGTTTCAAGGCGAAGATACTTCGAG CAGAAACTATGGGACTTAGATAAATGCAGAGACATTAACCAGCTGAAGCAAATGCAGGCA TTGGTATACAAATCCAATCTTGAACAAGACCCTTTCATTGCTCCAAAGTTAATTGCTGCT TTCTCTAATTGTAGACAAATGGGTTCTGTTTTGAAGATTTTTGATCAAGTGCGTGACCCT AATGTGCATTTGTATAATGCGTTGATAAGAGCTCATATCTACAACTTTCAACCATCTCAA GCTTTTGATACTTTCTTTGATATGCAGTCTTCTGGTATTTTTCCTGATAATTTTACCTTT TCGTTTCTTCTAAAGGGTTGTTCGGGGAAGTGTTGGTTGAGTGTTGTGAGTATGATTCAT ACCCATGTTGTGAAATGGGGTTTCGAGGATGATATATATGTGCCCAATTCGTTGATTGAT GCTTATTCCAAGTGTGGGTTAGTTGGTGTACGAATTGCAGGTCAGTTGTTTTGGGGAATG AAGGAGAGAGATGTTGTTTCTTGGAATTCCATGATTAGTGCGTTGCTCAAAGTGGGGGAT TTGAGTGAAGCGCGGAAGCTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAGATAGGGTTAGTTGGAAT ACTATGTTAGATGGATATACCAAGGCTGAGCAAATGAGTGTGGCATTTGAGTTGTTTAAA ACTATGCCACAGAGGGATGTCGTCTCTTGGTCCACCATGGTCTCGGGTTATTGCAAAGCT GGGGATTTGGAGATGGCTCGGATGTTATTTGATAAGATGCCTTCCAAGAATTTGGTTTCT TGGACAATAATGATATCAGGGTATGCTGAAAAGGGTCTTATAAATGAGGCAATTCTGTTG TTCATGCAAATGGAGGAGACAGGTTTGAGACTTGATGTTGCGGCTTTTGTTAGCATTCTA GCTGCCTGTGCAGAGTCGGGAATGCTTAGTTTGGGTAAAAAAGTGCATGATTCCGTTGAA AGGAGTATGTACAAGTGTAATACTTTGGTTTGTAATGCGTTGATTGATATGTATGCCAAG TGTGGATGTTTGCATAAGGCTTATAAAGTCTTTAACGGGCTGAAAAAAAGAGACTTGGTA TCTTGGAATGCTATGATACATGGGTTGGCTATGCATGGACGTGGAAAGAAGGCACTTGAG CTCTTCATTAGGATGAAGCAAGAAGGATTTGTGCCTGATAAAGTGACATTAGTTGGTATA TTGTGTGCGTGCAATCATACTGGTTTGGTGGACGAGGGAATACTTTTTTTCTATTCCATG GAGAAAGATTATGGGGTAAAACCTGAAGTAGAACATTATGGCTGTCTTATTGATCTTTTA GGCCGTGGTGGCTATGTTAGAGAAGCTTTTGAACTTGCACGAAAGATGCCGCTTGAACCT AACATTAAAATTTGGGGCTCCCTTTTAGGGGCTTGCAGGATGCATAAAGATGTTGAACTT GCAGATGACGTGCGTAGCCTCCTAGTTAAATTAGAGCCTAAAAATGCTGGAAAACTTTCT GCATTGTCGAACATTTATGCTTCAGCAGGAGACTGGGATAATGTTGCCAACATAAGGTTG ATGATGAAGAACATTGGCAGGCCAAATCAATCTGGTGGTAGCTTGTTACTATTGAATGAT GAATACCGTGAATTCACCGTGATGGATAAATCTCACGTCAAATCAGACAAGATTTATCAG ATGATTGACAGATTAGGTCAGCATCTTAAATTGCTTTCTCCTGTTCCAGCAGGTCTTTGC GATGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g088470.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YHC4_CYNCS)
Sequence	MQMPTPIRAPTWVSRRRYFEQKLWDLDKCRDINQLKQMQALVYKSNLEQDPFIAPKLIAA FSNCRQMGSVLKIFDQVRDPNVHLYNALIRAHIYNFQPSQAFDTFFDMQSSGIFPDNFTF SFLLKGCSGKCWLSVVSMIHTHVVKWGFEDDIYVPNSLIDAYSKCGLVGVRIAGQLFWGM KERDVVSWNSMISALLKVGDLSEARKLFDEMPQRDRVSWNTMLDGYTKAEQMSVAFELFK TMPQRDVVSWSTMVSGYCKAGDLEMARMLFDKMPSKNLVSWTIMISGYAEKGLINEAILL FMQMEETGLRLDVAAFVSILAACAESGMLSLGKKVHDSVERSMYKCNTLVCNALIDMYAK CGCLHKAYKVFNGLKKRDLVSWNAMIHGLAMHGRGKKALELFIRMKQEGFVPDKVTLVGI LCACNHTGLVDEGILFFYSMEKDYGVKPEVEHYGCLIDLLGRGGYVREAFELARKMPLEP NIKIWGSLLGACRMHKDVELADDVRSLLVKLEPKNAGKLSALSNIYASAGDWDNVANIRL MMKNIGRPNQSGGSLLLLNDEYREFTVMDKSHVKSDKIYQMIDRLGQHLKLLSPVPAGLC DE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g088470.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YHC4_CYNCS)
Sequence	ATGCAGATGCCAACACCAATCCGAGCTCCTACATGGGTTTCAAGGCGAAGATACTTCGAG CAGAAACTATGGGACTTAGATAAATGCAGAGACATTAACCAGCTGAAGCAAATGCAGGCA TTGGTATACAAATCCAATCTTGAACAAGACCCTTTCATTGCTCCAAAGTTAATTGCTGCT TTCTCTAATTGTAGACAAATGGGTTCTGTTTTGAAGATTTTTGATCAAGTGCGTGACCCT AATGTGCATTTGTATAATGCGTTGATAAGAGCTCATATCTACAACTTTCAACCATCTCAA GCTTTTGATACTTTCTTTGATATGCAGTCTTCTGGTATTTTTCCTGATAATTTTACCTTT TCGTTTCTTCTAAAGGGTTGTTCGGGGAAGTGTTGGTTGAGTGTTGTGAGTATGATTCAT ACCCATGTTGTGAAATGGGGTTTCGAGGATGATATATATGTGCCCAATTCGTTGATTGAT GCTTATTCCAAGTGTGGGTTAGTTGGTGTACGAATTGCAGGTCAGTTGTTTTGGGGAATG AAGGAGAGAGATGTTGTTTCTTGGAATTCCATGATTAGTGCGTTGCTCAAAGTGGGGGAT TTGAGTGAAGCGCGGAAGCTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAGATAGGGTTAGTTGGAAT ACTATGTTAGATGGATATACCAAGGCTGAGCAAATGAGTGTGGCATTTGAGTTGTTTAAA ACTATGCCACAGAGGGATGTCGTCTCTTGGTCCACCATGGTCTCGGGTTATTGCAAAGCT GGGGATTTGGAGATGGCTCGGATGTTATTTGATAAGATGCCTTCCAAGAATTTGGTTTCT TGGACAATAATGATATCAGGGTATGCTGAAAAGGGTCTTATAAATGAGGCAATTCTGTTG TTCATGCAAATGGAGGAGACAGGTTTGAGACTTGATGTTGCGGCTTTTGTTAGCATTCTA GCTGCCTGTGCAGAGTCGGGAATGCTTAGTTTGGGTAAAAAAGTGCATGATTCCGTTGAA AGGAGTATGTACAAGTGTAATACTTTGGTTTGTAATGCGTTGATTGATATGTATGCCAAG TGTGGATGTTTGCATAAGGCTTATAAAGTCTTTAACGGGCTGAAAAAAAGAGACTTGGTA TCTTGGAATGCTATGATACATGGGTTGGCTATGCATGGACGTGGAAAGAAGGCACTTGAG CTCTTCATTAGGATGAAGCAAGAAGGATTTGTGCCTGATAAAGTGACATTAGTTGGTATA TTGTGTGCGTGCAATCATACTGGTTTGGTGGACGAGGGAATACTTTTTTTCTATTCCATG GAGAAAGATTATGGGGTAAAACCTGAAGTAGAACATTATGGCTGTCTTATTGATCTTTTA GGCCGTGGTGGCTATGTTAGAGAAGCTTTTGAACTTGCACGAAAGATGCCGCTTGAACCT AACATTAAAATTTGGGGCTCCCTTTTAGGGGCTTGCAGGATGCATAAAGATGTTGAACTT GCAGATGACGTGCGTAGCCTCCTAGTTAAATTAGAGCCTAAAAATGCTGGAAAACTTTCT GCATTGTCGAACATTTATGCTTCAGCAGGAGACTGGGATAATGTTGCCAACATAAGGTTG ATGATGAAGAACATTGGCAGGCCAAATCAATCTGGTGGTAGCTTGTTACTATTGAATGAT GAATACCGTGAATTCACCGTGATGGATAAATCTCACGTCAAATCAGACAAGATTTATCAG ATGATTGACAGATTAGGTCAGCATCTTAAATTGCTTTCTCCTGTTCCAGCAGGTCTTTGC GATGAATGA