Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g087610.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7LM18_ARALL)
Sequence	ATGAACTGTCTAAGCAACGCCCTTGTCGTAGTGAGAACCAACAACAGCTTCCAAATATGG AAGTGGTGTATGTCTATGGCAGAAAAGTGCAACAATATGCGTCAACTCAAAGCTATCCAC GCCATTTACATTACCCTCGGTCTTCAACGCAACACTTACGCCGTCAGCAAGCTCCTCGAT TTTTGTGCCCTTTCAAATTCCGGCGACCTTTCCTACGCCTCACGGATCTTTGCCCAGGTT CAGACTCCCAATGCGTTCCTCTACAACGCCCTTATACGAGCCTACTCTAGCAGCCCACAA CCCCAAGTTTCCCTCAATTACTTCAATCTCATGGTACAAACCAGTAACGCTGCGGCTCCT GATAGCTTCACATTTCCCTTCCTTCTCATCGCTTGCGCTAACGGTCCTTTGGAAGTGGAG GGTAAACAAATACACAGTTGGATAATCAAGAATTCCTTTTCTGCGTCAAATGCACATGTA CAGACTGCATTAATTCGGTTTTACACGAACTGCAAAGCATTGGATGATGCTCGTAAGGTG TTTGATGAAATTACTGATATTGATGTTATTCAATGTAATGTTCTTATGAGTGGACACCTT CAAAGCGGACTAGCAAAGGAGGCATTGAGTATTTTTCAAGATATGTTGGGGCGTGGAGTT GGTCCAGATGAGTACTGTGTGACCACAGCACTTGGGGCCTGTGCTCAGTTGGGTGCTCTT GAGCAAGGAAAATGGATTCATGAGCATGTTACAAAGAGTGAGTGGTTGGAATACGATGTT TTTATCGGCTCTGCTCTTGTTGATATGTATGCTAAGTGTGGGAGTATTAACCTGGCTTCT GAGGTATTTGAGAGCATGCCTACGAGGAATAAGCATTCGTGGGCGACAATGATTAGAGGA TTTGCTGTCCATGGTCGTCCTGAGCTAGCATTAAGCTGTTTGGAGAGGATGCAGGTGGCT GATGGGCTTAAGCCTGATGGTGTTGTCATTCTTGCAGTTTTAGCAGCATGTGCACATTCA GGGCTTCAGAAAGAAGGTCAAGGTTTGTTGGATGAGATGGAATCTTTATATGGCGTTACA CCGGAACATGAGCACTTCAGCTGTGTAGTGGACTTGTTATGCAGAGCTGGCCGATTGGAT GACGCACTTAAGCTTATTAGAAGGATGCCAATGAAACCACGGGCCTCTGTTTGGGGAGCA TTGTTAAGTGGTTGCCGAAATCACAACAACGTGAATCTTGCAGAACTTGCCGTCAAAGAG ATTTTGTTGGTAGAAGATGGCAATGAAGCTGAAGAAGATTCTGCTTATGTTCAACTATCA AATATATATTTAGCAGCTCGACAATGTGATGATGCACGTCGAATCAGGAGGAGAATTGGT GACCGAGGGCTCAGGAAGACACCTGGATACAGTGCAATTGAGATTGATGGGATGGTTAAT GAGTTTATATCTGGAGACGTTTCCCATATATGTCTAGCTGACATTCATAAGGTGCTTGAT CTAACATATCTAGATCCCCATTTCGACAACCTAATATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g087610.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7LM18_ARALL)
Sequence	MNCLSNALVVVRTNNSFQIWKWCMSMAEKCNNMRQLKAIHAIYITLGLQRNTYAVSKLLD FCALSNSGDLSYASRIFAQVQTPNAFLYNALIRAYSSSPQPQVSLNYFNLMVQTSNAAAP DSFTFPFLLIACANGPLEVEGKQIHSWIIKNSFSASNAHVQTALIRFYTNCKALDDARKV FDEITDIDVIQCNVLMSGHLQSGLAKEALSIFQDMLGRGVGPDEYCVTTALGACAQLGAL EQGKWIHEHVTKSEWLEYDVFIGSALVDMYAKCGSINLASEVFESMPTRNKHSWATMIRG FAVHGRPELALSCLERMQVADGLKPDGVVILAVLAACAHSGLQKEGQGLLDEMESLYGVT PEHEHFSCVVDLLCRAGRLDDALKLIRRMPMKPRASVWGALLSGCRNHNNVNLAELAVKE ILLVEDGNEAEEDSAYVQLSNIYLAARQCDDARRIRRRIGDRGLRKTPGYSAIEIDGMVN EFISGDVSHICLADIHKVLDLTYLDPHFDNLI*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g087610.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7LM18_ARALL)
Sequence	ATGAACTGTCTAAGCAACGCCCTTGTCGTAGTGAGAACCAACAACAGCTTCCAAATATGG AAGTGGTGTATGTCTATGGCAGAAAAGTGCAACAATATGCGTCAACTCAAAGCTATCCAC GCCATTTACATTACCCTCGGTCTTCAACGCAACACTTACGCCGTCAGCAAGCTCCTCGAT TTTTGTGCCCTTTCAAATTCCGGCGACCTTTCCTACGCCTCACGGATCTTTGCCCAGGTT CAGACTCCCAATGCGTTCCTCTACAACGCCCTTATACGAGCCTACTCTAGCAGCCCACAA CCCCAAGTTTCCCTCAATTACTTCAATCTCATGGTACAAACCAGTAACGCTGCGGCTCCT GATAGCTTCACATTTCCCTTCCTTCTCATCGCTTGCGCTAACGGTCCTTTGGAAGTGGAG GGTAAACAAATACACAGTTGGATAATCAAGAATTCCTTTTCTGCGTCAAATGCACATGTA CAGACTGCATTAATTCGGTTTTACACGAACTGCAAAGCATTGGATGATGCTCGTAAGGTG TTTGATGAAATTACTGATATTGATGTTATTCAATGTAATGTTCTTATGAGTGGACACCTT CAAAGCGGACTAGCAAAGGAGGCATTGAGTATTTTTCAAGATATGTTGGGGCGTGGAGTT GGTCCAGATGAGTACTGTGTGACCACAGCACTTGGGGCCTGTGCTCAGTTGGGTGCTCTT GAGCAAGGAAAATGGATTCATGAGCATGTTACAAAGAGTGAGTGGTTGGAATACGATGTT TTTATCGGCTCTGCTCTTGTTGATATGTATGCTAAGTGTGGGAGTATTAACCTGGCTTCT GAGGTATTTGAGAGCATGCCTACGAGGAATAAGCATTCGTGGGCGACAATGATTAGAGGA TTTGCTGTCCATGGTCGTCCTGAGCTAGCATTAAGCTGTTTGGAGAGGATGCAGGTGGCT GATGGGCTTAAGCCTGATGGTGTTGTCATTCTTGCAGTTTTAGCAGCATGTGCACATTCA GGGCTTCAGAAAGAAGGTCAAGGTTTGTTGGATGAGATGGAATCTTTATATGGCGTTACA CCGGAACATGAGCACTTCAGCTGTGTAGTGGACTTGTTATGCAGAGCTGGCCGATTGGAT GACGCACTTAAGCTTATTAGAAGGATGCCAATGAAACCACGGGCCTCTGTTTGGGGAGCA TTGTTAAGTGGTTGCCGAAATCACAACAACGTGAATCTTGCAGAACTTGCCGTCAAAGAG ATTTTGTTGGTAGAAGATGGCAATGAAGCTGAAGAAGATTCTGCTTATGTTCAACTATCA AATATATATTTAGCAGCTCGACAATGTGATGATGCACGTCGAATCAGGAGGAGAATTGGT GACCGAGGGCTCAGGAAGACACCTGGATACAGTGCAATTGAGATTGATGGGATGGTTAAT GAGTTTATATCTGGAGACGTTTCCCATATATGTCTAGCTGACATTCATAAGGTGCTTGAT CTAACATATCTAGATCCCCATTTCGACAACCTAATATAG