Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g087280.3.1
CDS Infomation

Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G14940.1)
Sequence

ATGGCTGGAGGACAAAGTCCAAGAAATCTCAACAAACCATGTATTCTCCTCATAGTAATA
GCGGGAATGGAGAGGTTTTCATTCAAAGGGGTGGCATCAAATTTAGTGACATATCTAACA
GACGTGGCCAAAATGAGCAATTCAGCTGCAGCAAAGATGGTTAACAATTGGTGTGGTATT
ACTTCTATGTTGCCATTGCTGGTTGCTCCACTAGCTGATTCTTATTTGGACCGCTACACC
ACTGTATTGGCTTCTTCTTCTCTATATTTTGCCGGTCTTTTAGCTTTGACATCATTGGCA
TTACAATGGCCATGGACATCCTTGGACAAATCGGGCTTCTCTTCATCGTTATCATGGTCT
CTGCATTTAATTTCACTAGGCCAAGCGGGTTACAACCCGTCCTTACAAGCTTTTGCAGCG
GACCAATTGGATGACGAAGAAGAATTGCCCTGTACAAAGAATGACCAAAGCTCCAAGAAA
AAGAGCACATTTTTCCACTGGTGGTATTTTGGCATATGTTGTGGCAGTCTACTTGGAGTG
TCCATTATGTCGTACATACAGGACACGTTAGGATGGGGATTAGGTTTCGCCATTCCCTCG
ATTGCCATGATAGTGTCGATTGTAGTCTTCAGATTTGGCAACAGGTTTTATACACATAAC
ACGGATGGTGAAATTATTCATATCAAGTCCTTGGGAGGTCATATAGTTAAAGCTATTAGA
GCGGCTACCTCAAGATTGACCTGTGGTGAGATTGCGGTACCAGATACCAACAAGTCAAAA
GTTGTTGAGATCGAACTTGAAAATGCACCACTCTGCCAACAAGATTCAGGCAGCACGGAG
GGTACGGATAAAAAGCCGGAGAATGGGATAGTAGAAATTCTAAAAGTAGTACTACCTCTA
CTGCCAGTATGGACTATGCTTCTGATGTTTGCAGTGATTTTTCAACAACCTGCAACATTT
TTCACTAAACAAGGTATGACAATGAGGAGAAACATCGGAAGCAGCTTCCGAATTCCACCA
GCTGCACTTCAGAGTTCAATCACAATATCTATAATCCTGCTTATGCCTCTTTACGACACG
TGCTTTATCCCCTTCATTCGTGTTTTGACACGTAATGAGAAAGGCATCACTGTGATGCAG
AGAATGGGAATAGGGATGTTTCTTTCAGTGATAGCAATGATAATTGCTGCTGTTACCGAA
AGAAAAAGACTGGATATTGCCAGAAATGTAGGTACTTTAACTTCAGAATTCGAAGCTTTG
CCAATGAGCATATTTTGGTTGCTGCCTCAGTACATCTTATTGGGAATTTCAGATATATTC
ACAGTTGTTGGTATGCAAGAGTTCTTTTACTCTGAAGTTCCGATAAATATGAGAACTTTA
GGCATAGCTCTTTATACTAGTGTATTTGGTTGTGGTAGTTTCTTCAGCTCATTCCTTATA
ACAGTGATTGAACATTTGACAAGTTCAATAGGAGAAAAGCAGAACTGGTTCGCCGATGAC
ATGAGCAGAGCCCGTTTAGACAACTATTACTGGTTTCTGGCATTGTCAAGTGCAGCCAGT
TTTATGATGTTTATGGTTTTCTGTCGATTTTATAGAAGCAGGACAGTTAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g087280.3.1
PEP Infomation

Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G14940.1)
Sequence

MAGGQSPRNLNKPCILLIVIAGMERFSFKGVASNLVTYLTDVAKMSNSAAAKMVNNWCGI
TSMLPLLVAPLADSYLDRYTTVLASSSLYFAGLLALTSLALQWPWTSLDKSGFSSSLSWS
LHLISLGQAGYNPSLQAFAADQLDDEEELPCTKNDQSSKKKSTFFHWWYFGICCGSLLGV
SIMSYIQDTLGWGLGFAIPSIAMIVSIVVFRFGNRFYTHNTDGEIIHIKSLGGHIVKAIR
AATSRLTCGEIAVPDTNKSKVVEIELENAPLCQQDSGSTEGTDKKPENGIVEILKVVLPL
LPVWTMLLMFAVIFQQPATFFTKQGMTMRRNIGSSFRIPPAALQSSITISIILLMPLYDT
CFIPFIRVLTRNEKGITVMQRMGIGMFLSVIAMIIAAVTERKRLDIARNVGTLTSEFEAL
PMSIFWLLPQYILLGISDIFTVVGMQEFFYSEVPINMRTLGIALYTSVFGCGSFFSSFLI
TVIEHLTSSIGEKQNWFADDMSRARLDNYYWFLALSSAASFMMFMVFCRFYRSRTVN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g087280.3.1
Transcript Infomation

Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G14940.1)
Sequence

GTAAAGGAGCTTCTTTTAAAAATCATAACAATATTATCTGCGTTTGTGCATTTTTCTAGC
GCTAAACCACTGATATTTATATTTCTAATATATAGATCTCAACAATAATATAGGTACGGA
CTAATTTCTAGTTACTAAGACTTGAAGTTGATAATATTTGAGTTTAGTTTGTATGTATCT
AGAATATTACAGAGCTGCTTATAAATATCTGTTTATAAGCTATTTTTGAGTTAATGTAGA
GTTAGTTTACGTGTATCTAAAATATTACCGAGTTAATTATGAGTACCTGTTTATCGGCTG
CGACAAAATTGTCTGCGAAGACTAAAGTAAGAAATAATTTAGAAACACTTCTTTCGTATG
TTGGATCAATGGTCTGTTGATGAGTGCTTTTGGTGATTGTCTAGTGTTCCATTATACGTC
TCAATACAAAAGTTATGTTACTTATTGAAATAGACTTGACTTCTTTTTTTCCTTTTAGTC
ACTATATATATGCAAAATATTGTTAATTAAATTGCCTTGTTGGGTTGGAGCAAGCTTAGC
CAATATAAATATATATATATAAGATGTTCGAGTACGGCACAAAATAAATACTGTTTAATT
TGTTTGTGTAGTGACTGAAATAGTAAAAACCAGATGAAAGCAACAACAACAACATATAAT
TAACTAGCCAAGATTATTTCACCTTTTCAACATAATTTCTCATGGCTGGAGGACAAAGTC
CAAGAAATCTCAACAAACCATGTATTCTCCTCATAGTAATAGCGGGAATGGAGAGGTTTT
CATTCAAAGGGGTGGCATCAAATTTAGTGACATATCTAACAGACGTGGCCAAAATGAGCA
ATTCAGCTGCAGCAAAGATGGTTAACAATTGGTGTGGTATTACTTCTATGTTGCCATTGC
TGGTTGCTCCACTAGCTGATTCTTATTTGGACCGCTACACCACTGTATTGGCTTCTTCTT
CTCTATATTTTGCCGGTCTTTTAGCTTTGACATCATTGGCATTACAATGGCCATGGACAT
CCTTGGACAAATCGGGCTTCTCTTCATCGTTATCATGGTCTCTGCATTTAATTTCACTAG
GCCAAGCGGGTTACAACCCGTCCTTACAAGCTTTTGCAGCGGACCAATTGGATGACGAAG
AAGAATTGCCCTGTACAAAGAATGACCAAAGCTCCAAGAAAAAGAGCACATTTTTCCACT
GGTGGTATTTTGGCATATGTTGTGGCAGTCTACTTGGAGTGTCCATTATGTCGTACATAC
AGGACACGTTAGGATGGGGATTAGGTTTCGCCATTCCCTCGATTGCCATGATAGTGTCGA
TTGTAGTCTTCAGATTTGGCAACAGGTTTTATACACATAACACGGATGGTGAAATTATTC
ATATCAAGTCCTTGGGAGGTCATATAGTTAAAGCTATTAGAGCGGCTACCTCAAGATTGA
CCTGTGGTGAGATTGCGGTACCAGATACCAACAAGTCAAAAGTTGTTGAGATCGAACTTG
AAAATGCACCACTCTGCCAACAAGATTCAGGCAGCACGGAGGGTACGGATAAAAAGCCGG
AGAATGGGATAGTAGAAATTCTAAAAGTAGTACTACCTCTACTGCCAGTATGGACTATGC
TTCTGATGTTTGCAGTGATTTTTCAACAACCTGCAACATTTTTCACTAAACAAGGTATGA
CAATGAGGAGAAACATCGGAAGCAGCTTCCGAATTCCACCAGCTGCACTTCAGAGTTCAA
TCACAATATCTATAATCCTGCTTATGCCTCTTTACGACACGTGCTTTATCCCCTTCATTC
GTGTTTTGACACGTAATGAGAAAGGCATCACTGTGATGCAGAGAATGGGAATAGGGATGT
TTCTTTCAGTGATAGCAATGATAATTGCTGCTGTTACCGAAAGAAAAAGACTGGATATTG
CCAGAAATGTAGGTACTTTAACTTCAGAATTCGAAGCTTTGCCAATGAGCATATTTTGGT
TGCTGCCTCAGTACATCTTATTGGGAATTTCAGATATATTCACAGTTGTTGGTATGCAAG
AGTTCTTTTACTCTGAAGTTCCGATAAATATGAGAACTTTAGGCATAGCTCTTTATACTA
GTGTATTTGGTTGTGGTAGTTTCTTCAGCTCATTCCTTATAACAGTGATTGAACATTTGA
CAAGTTCAATAGGAGAAAAGCAGAACTGGTTCGCCGATGACATGAGCAGAGCCCGTTTAG
ACAACTATTACTGGTTTCTGGCATTGTCAAGTGCAGCCAGTTTTATGATGTTTATGGTTT
TCTGTCGATTTTATAGAAGCAGGACAGTTAATTAGAGTGTTGGTAGTGACTGATAATTTG
TTATTGTGGAATGTTGTGTTTTGCACATTCATTTTTCTAAGTAGAAAGTGAAGGTTCTGC
ACTTGTATATAAAGGAAGATATATCTAGTACATCACATCCTCTTTTAATGAGTAAATATC
GAAAAAATTATCCACTAAAGCCATTTAATTTTGATCTGTATCAATAAGGTTATTAAACTT
GGTGTTTTTCTCTTTAAAATTACTCTTAACAAAATTTGAAATTAGAAAAGTCCACTTAAT
ATTTTGGATGTGATAATACACTCTTCACATTTTGGATGGGATAAATATTCCTTTGATTTT
TAAATTAATGACTAGAAATAAGTTGAATTATAGATAATTGTATACTGAATCAGATGACAA
AAAAATGAAATA