Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g087120.3.1
CDS Infomation	Trichome birefringence-like 22, putative (AHRD V3.3 *** A0A061EBK7_THECC)
Sequence	ATGAAGATGAATTTTCACAATTATAATCTATTTAAAGAGGATAAGTTTCGTAGCCCAGGT TTCTTATTGATCTATTCACTCTTTCTAACCGTGATTTTCAGCTGCTACATGCTTCATTTT TCCTTCAGCCCAAACGTTAACTTCATAACCAAACAAGATTCAGCTCCTCCTACTAAATCC TCACACGTTACAAATCACTCTCAACCTGCAGTTCACAACAACATTACATCCGATTGTGAC TTGTTGAATGGTAATTGGGTTTTAGAGGAGAAGGGTAATTATTCTCTGTATTATACAAAC TTTAGCTGTCCAACAATTCCGCATTCAAAAAACTGTTTGTTGAACGGAAGGGCAGATGAA GGATTTATGCAGTGGAGATGGAAACCAGAAGAATGTACGCTTCCGCGATTCAATGCTAAA ACGTTTTTAACATTTGTTAAAGGGAAGACGATGGCGTTTATAGGCGATTCCCTCGCAAGG AATCATATGGAGTCCCTACTCTGTATATTATCTTCGGAAGAAAGTCCAAGAGACATGTAC AAGGATGTTGAAGACAAATTCAGAACATGGTTATTTCCTCGTCATAACTTCACTCTCATG GTCCTCCGCACAGAGTTTCTTGTCTTTGCTACTGAGAGAAGTATCAATGGTTCGTTCACA GGCGGATTTGACTTGCATTTAGACAAATTAAATGGGAATTGGACTCAACATTTACCCAAC ATAGATTATGCTATTTTCTCAGATGGACATTGGTTTCTTCGGCCTAATTACCTTTACGAA AATGGCAACCTTATTGGATGTGTTTATTGTGGGGAAGCAGGGGTTCAAGATCTTGGCCCT GGTTATGCCATTCGAAGAGCATTTGAAGCTGCTTTCAACTACATAAACCAATGCGTGGAA TGCTCAGGTATTGTTGTGCTTTTGAGGACATTCTCCGCCGGTCAATTCGAGCAAGGAGCA TGGAATGAAGGAGGATTTTGCAACAGAACAAGACCGTTTACTAGAGATGAAGTTAAAATT GGTGATCAAGATTGGGAATTTCGGAACATTCAAATAGAAGAAATTGAAAGAGCAAGAAAA GATGGAGAAAAATTTGGTAACATGTTTGAACTTATGGACGTGACAAGAGCCATGTTAATG AGACCAGATGGACATCCAGGAGCCTATTGGGGCAATAAATGGATGAAGGGCTACAGTGAT TGTATACATTGGTGTTTGCCAGGGCCGATTGATACATGGAATGAATTTTTACAGGAAATT CTTAGAAGAAAATTCCCCAATTTTCATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g087120.3.1
PEP Infomation	Trichome birefringence-like 22, putative (AHRD V3.3 *** A0A061EBK7_THECC)
Sequence	MKMNFHNYNLFKEDKFRSPGFLLIYSLFLTVIFSCYMLHFSFSPNVNFITKQDSAPPTKS SHVTNHSQPAVHNNITSDCDLLNGNWVLEEKGNYSLYYTNFSCPTIPHSKNCLLNGRADE GFMQWRWKPEECTLPRFNAKTFLTFVKGKTMAFIGDSLARNHMESLLCILSSEESPRDMY KDVEDKFRTWLFPRHNFTLMVLRTEFLVFATERSINGSFTGGFDLHLDKLNGNWTQHLPN IDYAIFSDGHWFLRPNYLYENGNLIGCVYCGEAGVQDLGPGYAIRRAFEAAFNYINQCVE CSGIVVLLRTFSAGQFEQGAWNEGGFCNRTRPFTRDEVKIGDQDWEFRNIQIEEIERARK DGEKFGNMFELMDVTRAMLMRPDGHPGAYWGNKWMKGYSDCIHWCLPGPIDTWNEFLQEI LRRKFPNFH*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g087120.3.1
Transcript Infomation	Trichome birefringence-like 22, putative (AHRD V3.3 *** A0A061EBK7_THECC)
Sequence	ATTAATAATATATAAAATTAAATTCACGTGGCGAAGATTAATGATAAATTGCTAAATATG TGTATCAGCTAGGATTATGCAGCTATATATATGTTTGGTCTGAAGTGGTCATGTGTGTAT AAGATGGATTATGACCTGTCGTGCAGATGGGTTCAGTGAGGAGTGTACCTAACCATCACC TACTCTAGAAAAATTAACCCATTCTTCACTTAAAGTAGAACAAGCACCACATTTCTCTCT GTTTCTCTCTTCTCCTTGTTGTTAATGTATATCAAATGAAGATGAATTTTCACAATTATA ATCTATTTAAAGAGGATAAGTTTCGTAGCCCAGGTTTCTTATTGATCTATTCACTCTTTC TAACCGTGATTTTCAGCTGCTACATGCTTCATTTTTCCTTCAGCCCAAACGTTAACTTCA TAACCAAACAAGATTCAGCTCCTCCTACTAAATCCTCACACGTTACAAATCACTCTCAAC CTGCAGTTCACAACAACATTACATCCGATTGTGACTTGTTGAATGGTAATTGGGTTTTAG AGGAGAAGGGTAATTATTCTCTGTATTATACAAACTTTAGCTGTCCAACAATTCCGCATT CAAAAAACTGTTTGTTGAACGGAAGGGCAGATGAAGGATTTATGCAGTGGAGATGGAAAC CAGAAGAATGTACGCTTCCGCGATTCAATGCTAAAACGTTTTTAACATTTGTTAAAGGGA AGACGATGGCGTTTATAGGCGATTCCCTCGCAAGGAATCATATGGAGTCCCTACTCTGTA TATTATCTTCGGAAGAAAGTCCAAGAGACATGTACAAGGATGTTGAAGACAAATTCAGAA CATGGTTATTTCCTCGTCATAACTTCACTCTCATGGTCCTCCGCACAGAGTTTCTTGTCT TTGCTACTGAGAGAAGTATCAATGGTTCGTTCACAGGCGGATTTGACTTGCATTTAGACA AATTAAATGGGAATTGGACTCAACATTTACCCAACATAGATTATGCTATTTTCTCAGATG GACATTGGTTTCTTCGGCCTAATTACCTTTACGAAAATGGCAACCTTATTGGATGTGTTT ATTGTGGGGAAGCAGGGGTTCAAGATCTTGGCCCTGGTTATGCCATTCGAAGAGCATTTG AAGCTGCTTTCAACTACATAAACCAATGCGTGGAATGCTCAGGTATTGTTGTGCTTTTGA GGACATTCTCCGCCGGTCAATTCGAGCAAGGAGCATGGAATGAAGGAGGATTTTGCAACA GAACAAGACCGTTTACTAGAGATGAAGTTAAAATTGGTGATCAAGATTGGGAATTTCGGA ACATTCAAATAGAAGAAATTGAAAGAGCAAGAAAAGATGGAGAAAAATTTGGTAACATGT TTGAACTTATGGACGTGACAAGAGCCATGTTAATGAGACCAGATGGACATCCAGGAGCCT ATTGGGGCAATAAATGGATGAAGGGCTACAGTGATTGTATACATTGGTGTTTGCCAGGGC CGATTGATACATGGAATGAATTTTTACAGGAAATTCTTAGAAGAAAATTCCCCAATTTTC ATTGATTTTAGTGAAAGAATAACATCCTCATTTTATTCAATTCAAAATTTTCTTCTGAGT TATGGGGAAGTGGCCTTCGGCCTAAATGGATTAATAATTGTAAATGATGTTAAATTAATG TTGTATAATACAAGAATAATGCGAATTGTTCAATTAAGCCAATTATACAAGTTTGTAGGT TAAAAAGTATGTGTTTGAAACAATAAAAATGTAGAAAAATATGCAACAAAACCACATGTT TCTCTTCTTTTATTGGACAAAAATATCATATAATACACTCTGAAATAGTTTCATAAAACG GCTCACTGAATGAAACAGGTAGTGAGGATAGTACATGGAATCTTATTACACATTTGCAGG TAAAAACTAATCAACACACGTATTACTTCTTTTTATTTTGATTTTGAGCCTATGTCCGAG GAACGCGAAAGTAGACTGGAATTGGATTGTGTGGTTCTGGAGGCGAGTTCCAAACAGAAA AGGCGCTGTTGGAGTTCATCCATTTCTCAGTCATCTCTGGATAATGTCGATCTAGTACAT CTTTTAAGCTTTCAGTTGTATTCACCCATTCAAGTCCTTTTTTCGTATATGTCTCCTCAT TGTAATAGCTCGTGAAAAATTTATCTGCCTCTAACCTTCTGTAAATTTATAAATCAACTT TCAATATTAGTCAATCTACAAAGGCATAATATTGTTATGCATAAATGATAATTGCTTCTT TTTTTCAGTTCTAGTACGAACCTTGATGCCATGATTAGAAATATGAAAAAAGCAGTCTCA GAGATAGCAAACCCCTTAATTTTTTTCTCCGCGGACATTCCAACTAACAGATCCAATTGT TCTACATCATCACCATATACTTCATTAAGTGTTTTAATAACTTCCATATCATCACTCAAA TCTTCCCATTTAGTGATGGGAATTTGCAACATTCTCCTTCGAAATTCATTGTACCTAGCA ACACTCCTTTCTCTGTCTCTATAAACTGCCATCCAAACAACAATATCAATTATATATACT CTGTTTTATTTATTTATTTTGAAGTAGTTTTAGTCCTGAGAAATAAACTGTACTTTCAAG AGCTGCAAGGTCAATAGGATCTGGCCTGTCTGTTCCATCGACGTCTTGGGCAATAAGATC CCTCATCCATATCGGATAATTCCAAAGTTCAAGAGCTCCACTAGCTTGATGTCCCATTGA AACCATTTGCTTAGTAAACCCAATTCTTGATAGATTCTCATTAGTCAAAGGAAGAGATTT GTTTAGTCCAGGCGTGGCATCGATATTTCTTAGCTCAAGTGTATCAGGCAGGAGTTGATG CATTCGATAGACACTCGTAAATTCCTCAGTTAAGGAATAAGGCACTCCATGATCCTCAGG TTTCTTCATTCCCACAAAACCACTTAAAATGGAACCTCCAACATGACCAAATGTATCCTT GAATTTCTTTCCTAACAATCCATACCTGCGAACATAAAATTAATTCATTTGAGTCATGCT CAGTACTACGTAGTTGACAAAATGAAAATAACTTGTGTTAATTTGAGATTATTGACCAAT TGGCGCGCATTCCTGCTAGAAGGGTGTCTGTATTGAGAAGTTCAACTGTCCAATCTATGG TGTGAATTTTAGCAATTACAGCAGCAGTGACACGTTTTGCATGACGATACAACTCCTCAT CTTTCAATTCTGGATATTCTTTCTGGAAAAATTTGAAAATCAATTCAGGTTGTAAAAATA CTCGAAAAAAATAAAATAATCCAAGATCACTAAGATTAGTACCTTCAAGGTGTCACAAAC AAGATTATGCTCTTGTACAAAGAGCGCTTGCAGAGTTACAAGTCCAGCCCAAGCATTGCG AACATCACCAGATATAATTTTTCCATTTTCATCTTGTTCAAGGAGCCCATTTTCTGATAG TTTCAATTTTCCGTCTTTAAATGTCCTCACTTTCTTTGAAACTTCAGATCTGCTCCCATA AATAGCACTTCCATCCCTTCATTTACAAGTACAAATTTCAATTCCAAATCGACCGTTAAA ATTTTAGTAATGAAATCTTACCACTGTGGAGTACGTATGTTCAAGTGACCCGTCTTGATA TCACATAAACCCGTAGGTGTTTGCTTGGTCTTGAAAAAC