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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g086230.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T3G5_RICCO)

Sequence

ATGCGGAGAATCAAAGATAAATTATCAACAAGGTTAATGAATGTTTGTGTGGCATCTCTT
TGTAAAGCCAAACAATTAGAGAAAGCTGAAATTGTTATAGTTGATGGCATACGAATTGGA
TTGCAACCAGATGTTGTCACTTACAATACATTGATTGCTGCATATTGCCGCTTTGTTGGC
ATAGATGCTGGTTATTCCATCCTTAATAGGATGAAGGATGCTGGAATTAACCCTGATGTT
ATTACCTATAACGCTTTGATCGCCGGAGCTACTAGAAATTCTCTGTTATCTAAATGTCTC
GACCTGTTTGATGAAATGCTTGAGATGAGAATTCTTCCTGATATCTGGAGTTACAACACA
TTAATGAATTGTTTCTTTAAATTCGGAAAGCCAGATGAAGCTTACAGGGTTTTTCAAGAT
ATTCTTTTGAAAGATATATCTGTTCATTCTGCAACATTTAGTATTTTAATTAATGGGCTG
TGTATGAATGGATATACTGAGAATGCCCTTATGCTATTTAGGAGTTTAAAGCGTCATGGA
TTTACTCCTCAGTTAGTAACTTACAACATTCTTATTCATGGGTTGTGCAAGTCAGGACGA
GGAAACGTTGCAAGAGAGTTCCTCAACGAATTGGTAGAATCAGGTCATATCCCGAATGCC
ATCACTTATACAACAGTAATGAAATGTTGCTTCAGATATAGACAATTTGAAGAAGGCCTT
AAAATCTTTGCAGAGATGAGAAACAAAGGATATACATATGATGCCTTTGCTTACTGTACA
GTTACAAGTATGTTACTTAAAACTGGGAGGATAACTGAGGCCAATGAGTACCTGGGATAT
ATCATTACAAGTGGCTTTACCCTTGACATTGTGTCTTTCAATACCATTTTTAATGTATAT
TGTAAGGAAGGTCAGCTGGATAATGCTTATAAGTTGTTATATGAGGCAGAAAATGGAGGC
TTGGAATCTGACAAGTTCACCCATGCTATCTGGATTGATGGCTTGTGCAGAACTGGTAAT
TTCCAAGAGGCCCAGCAACAATTGAACCGTATGAGTGTGACGGGTTTTGATTCTAACTTG
GTTGCGTGGAATTCTTTTATCAATGGGTTGTGTAAAACTGGTCAATTGGATTATGCTACA
CATATATTTGAGTCAATGGATACAAAAGATTCTGTTACTTACTCTACCATAGTTCGTGGT
CTTTGCCAAGCTAGGAGGTTTCGCGCAGCATCTAAGTTACTACTATCGTGTATTAGAGGT
GGCATGAGAATTCTTAAATCAGATAAACGAATTGTTATTGATGGTCTTCGTAGTTGTGGA
CTTACGCATGAAGCAAGGAAGGTCCAGTCTAAAATCCAAATGGCTAAGCTTCTGCATTAT
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g086230.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T3G5_RICCO)

Sequence

MRRIKDKLSTRLMNVCVASLCKAKQLEKAEIVIVDGIRIGLQPDVVTYNTLIAAYCRFVG
IDAGYSILNRMKDAGINPDVITYNALIAGATRNSLLSKCLDLFDEMLEMRILPDIWSYNT
LMNCFFKFGKPDEAYRVFQDILLKDISVHSATFSILINGLCMNGYTENALMLFRSLKRHG
FTPQLVTYNILIHGLCKSGRGNVAREFLNELVESGHIPNAITYTTVMKCCFRYRQFEEGL
KIFAEMRNKGYTYDAFAYCTVTSMLLKTGRITEANEYLGYIITSGFTLDIVSFNTIFNVY
CKEGQLDNAYKLLYEAENGGLESDKFTHAIWIDGLCRTGNFQEAQQQLNRMSVTGFDSNL
VAWNSFINGLCKTGQLDYATHIFESMDTKDSVTYSTIVRGLCQARRFRAASKLLLSCIRG
GMRILKSDKRIVIDGLRSCGLTHEARKVQSKIQMAKLLHY*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g086230.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T3G5_RICCO)

Sequence

ATTTTAGTTGGGGAAAAGATGTATTAGAAAAACAGGGATATTTTGATTTCTAATTTACAA
ACATGATTTCTAATTTACAAACATTGTGATAATTTAGATAATTATTAAATGTAGGGGAAA
ATTTTTGAAATCTATTTTATCACATAAATATAATAAATTTAGCTTTAAAATATACAAATA
ACTTTTTAGAGGTTTCTTTAAATATTAGTTCATGCCTATATCAAGAATAATATGTTGATC
TAAGCTACCATTTTAATTCACGCCCTTTATCAAAAACAAATAAGTTGTCCATAAAATGAG
GCACGTGCAATTCACATGCTTGGTTCACCGTTACTTTTAGACGGACATAGTAACTTTGGA
TCAAACTTGTTCACCTTTTGATACTTTTACCATAAGTCCTCTTAATTACAATACATTAAG
GATGTACTTGACATTTGATATACTTTATGGGCTTTCTTCGTAAAACTCAGCCAAAAGTCT
TTTGAAATTTCCCGGTGGTCTTTCTACCGGCGGCAACTGTTGGCTCAGCGGAAGTCCAGA
AACTGGCAAAGAGAGCTTTTTGAAATTTTCTTTCTCATTCTCTTGCTAGATAGCGGGTCA
AAGGCTATTGATTTCGTTCGTTGTTTTTAGTTGTTCAGATTTCAGGTGTGAACTGTTTTG
AGTAGATGCGGAGAATCAAAGATAAATTATCAACAAGGTTAATGAATGTTTGTGTGGCAT
CTCTTTGTAAAGCCAAACAATTAGAGAAAGCTGAAATTGTTATAGTTGATGGCATACGAA
TTGGATTGCAACCAGATGTTGTCACTTACAATACATTGATTGCTGCATATTGCCGCTTTG
TTGGCATAGATGCTGGTTATTCCATCCTTAATAGGATGAAGGATGCTGGAATTAACCCTG
ATGTTATTACCTATAACGCTTTGATCGCCGGAGCTACTAGAAATTCTCTGTTATCTAAAT
GTCTCGACCTGTTTGATGAAATGCTTGAGATGAGAATTCTTCCTGATATCTGGAGTTACA
ACACATTAATGAATTGTTTCTTTAAATTCGGAAAGCCAGATGAAGCTTACAGGGTTTTTC
AAGATATTCTTTTGAAAGATATATCTGTTCATTCTGCAACATTTAGTATTTTAATTAATG
GGCTGTGTATGAATGGATATACTGAGAATGCCCTTATGCTATTTAGGAGTTTAAAGCGTC
ATGGATTTACTCCTCAGTTAGTAACTTACAACATTCTTATTCATGGGTTGTGCAAGTCAG
GACGAGGAAACGTTGCAAGAGAGTTCCTCAACGAATTGGTAGAATCAGGTCATATCCCGA
ATGCCATCACTTATACAACAGTAATGAAATGTTGCTTCAGATATAGACAATTTGAAGAAG
GCCTTAAAATCTTTGCAGAGATGAGAAACAAAGGATATACATATGATGCCTTTGCTTACT
GTACAGTTACAAGTATGTTACTTAAAACTGGGAGGATAACTGAGGCCAATGAGTACCTGG
GATATATCATTACAAGTGGCTTTACCCTTGACATTGTGTCTTTCAATACCATTTTTAATG
TATATTGTAAGGAAGGTCAGCTGGATAATGCTTATAAGTTGTTATATGAGGCAGAAAATG
GAGGCTTGGAATCTGACAAGTTCACCCATGCTATCTGGATTGATGGCTTGTGCAGAACTG
GTAATTTCCAAGAGGCCCAGCAACAATTGAACCGTATGAGTGTGACGGGTTTTGATTCTA
ACTTGGTTGCGTGGAATTCTTTTATCAATGGGTTGTGTAAAACTGGTCAATTGGATTATG
CTACACATATATTTGAGTCAATGGATACAAAAGATTCTGTTACTTACTCTACCATAGTTC
GTGGTCTTTGCCAAGCTAGGAGGTTTCGCGCAGCATCTAAGTTACTACTATCGTGTATTA
GAGGTGGCATGAGAATTCTTAAATCAGATAAACGAATTGTTATTGATGGTCTTCGTAGTT
GTGGACTTACGCATGAAGCAAGGAAGGTCCAGTCTAAAATCCAAATGGCTAAGCTTCTGC
ATTATTGA