Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g082480.3.1
CDS Infomation	glutamate receptor-like 3.5
Sequence	ATGAAATATGGCTCATTTCAAACTCTAGTGTCAAGATTGCACATTTTTGTACCCAAGTTC ACTATGAGACTATTTTGGACAATAATTTTAGTAGTTCTCTACAATGGGTGTTCTTCAGAG GGGGTTAATTCAACTCTTTCTGCAAGGCCTAAAGTTGTGAACATTGGGTGTATGGTGTCT TTCAATACACTTGTTGGGAAAGTTACTAAAGTTGCTGCGGAAGCTGCTGTTGAGGATATA AATTCCAATCCAGATGTTCTTGGAGGAACTAAACTGAATATGATAACATTGGACAGTAAT GCCAGTGGATTTCTTGGAATAGTTGAGGCTATCCGTTTCATGGAGACGGATACTATGGCA ATTGTTGGCCCCCAATCTTCTGTTATAGCCCATGTGGTATCAAACATTGCGAATGAGCTG CAGGTCCCTCTATTATCATTTGCAGCCACAGATCCCTCTCTTTCTTCGCTTCAGTACCCG TTTTTTGTTAGAACTTCACCAAGTGATAAGTATCAGATGGAAGCTATAGCTGAAATGGTT GAGTACTATGAATGGAGGGAGGTGATTGCTATATATATTGATGATGATTTTGGAAGAAAT GGTATAGCTGCATTAGCAGATCAGCTGGCCAAGAGGCGATGTTCGATCTCTTACAAAGCA GCAATGAGACCTGGAGCAACATTGGATGATGCCCGGGATGCTTTGGTTCAGGTTGCTTTG AGAGAGTCACGAATAATGGTTGTTCATACTTATCCTACAAAGGGTCTGGAGATATTCTCT ATGGCACGGTATTTGGGGATGATAGATAAAGGATATGTGTGGATTGCTACAAATTGGCTC TCAACTATCCTTGACGCTGGTAGTCCCCTTCCTTCGGATGAAAAAGAGAACCTTGAAGGG GCTATTACCTTGCGTATACACACTCCAGGTTCAGAATTGAAACAGAAGTTTGTCTCACGG TGGAGCAATTTGACAAGGAAGGCAGGACTTGCTGGATCTTCAAGGATGTCCACTTATGCA CTCTATGCTTATGACACTGTGTGGCTACTTGCTCGTGCCATCAATGAATTCTTTAACCAG GGTGGAAAAGTTTCATTTTCTAAGGATCCAAGGCTAACTGAACTGAATAGTGGAAGTATG AATCTTGATTCTATGAGCATCTTTAATGGAGGGAAGTTATTGCGAGACAACATTTTTAAG GTTAATATGACAGGTGTAACAGGACCATTTAGTTTCACTTCTGAAAAGGAACTCTTCCGC CCTACTTTTGAAGTCATTAATGTGGTTGGTACAGGTTTTAGGAAAGTTGGTTATTGGTCT GAATACTCTGGTTTATCAATTGTGCCTCCTGAAACACTGTACTCTAAGCCGCCAAATCGT TCCTCTTCGAATCAACAGCTACAAAGTATAATCTGGCCTGGACAAATAACGGAAAAACCT CGTGGATGGGTTTTTCCAAACAATGGGAGACAACTGAAAATTGGAGTTCCTAACAGAGCT AGCTTTCGTGAATTTGTTGGAAAGGTACCAGGCGTCGACTCATTCAGAGGATACTGTATA GAGGTCTTCACTACTGCCATAGACTTATTGCCTTATGCTCTCCCTTACAAGCTAGTTGCC TTTGGGGATGGTCATAACAATCCAGATGATACAGAGCTAATACGCCTAATCACAGCAGGA GTTTATGATGCAGCCATAGGTGACATAGCAATTACAACTAATCGAACAAAAATGGTTGAC TTCACTCAACCATACATTGAATCTGGGTTAGTTGTAGTGGCACCAGTTAAGGAGCAGAAT TCTAATGCTTGGGCTTTTCTCAGTCCATTTACTCCTAAGATGTGGTGTGTCACTGGTGTT TTTTTCTTAATTGTGGGCACTGTAATTTGGATTTTGGAACACAGATTGAATGATGAATTT CGTGGACCTCCGAGTAAACAGATTGTCACTGTTTTATGGTTCAGCTTTTCAACTCTCTTT ACTGCCCAGAGAGAAAACACTGTCAGCACCTTTGGCCGTATTGTCCTTCTTATATGGCTA TTTGTGGTTTTGATAATAAACTCAAGCTATACTGCCAGTCTCACCTCAATTCTTACAGTG CAGAAACTTTCTTCCCCAATTACCGGAATTGAAAGTTTAGTAAATACAAAGGAACCCATT GGTTATCAGTGGGGTTCATTTGCCCGTAACTATCTGATTCAAGAACTTCGCATTGATGAA TCTAGACTTGTTCCTCTTAACCTCCCTGAAGATTATGCTAAAGCTTTAAAAGATGGTCCT AGCCGTGGTGGTGTTGCAGCAGTGGTAGATGAGCGTGCTTATATGGAGCTTTTCCTCTCA TCGCGTTGCCAATTCAGTATTCTGGGTCAAGAATTCACAAAAAATGGATGGGGGTTTGCT TTCCCTAGGGATTCTCCTCTAGCAGTAGACATGTCAACAGCAATTTTGAAACTATCAGAG AATGGGGAACTTCAAAGGATCCATGATAAATGGCTTTCTGGAATAGCTTGCACTTCACAG AGTACAAAGCTTGAAGTGGACAGACTTCAGCTGAAAAGCTTCTCAGGTCTATTCTTTCTA TGTGGGTTGGCATGTTTTCTGGCTCTGCTCATTTATTTTGTGATGCTAGCATGTCAATAT TGCCAATACTATCCCAATTCTGAGGTAGCTAGTGAAAGTTCACGATCAGGACGACTGCAG ACATTCCTTTCTTTTGCTGATGAAAAGGAAGAGTCAGTGAGGTCTCGATCCAAACGAAGG CAACTAGAGGTGACTTCAGTAAGAAGTATTGATCAAGATGCATCAGTAAATGGTTCAAGA ACTGACCGTTCTGAGATATACTCGAACAGGGTTGTAAGTTTTGGAGAATCTGTATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g082480.3.1
PEP Infomation	glutamate receptor-like 3.5
Sequence	MKYGSFQTLVSRLHIFVPKFTMRLFWTIILVVLYNGCSSEGVNSTLSARPKVVNIGCMVS FNTLVGKVTKVAAEAAVEDINSNPDVLGGTKLNMITLDSNASGFLGIVEAIRFMETDTMA IVGPQSSVIAHVVSNIANELQVPLLSFAATDPSLSSLQYPFFVRTSPSDKYQMEAIAEMV EYYEWREVIAIYIDDDFGRNGIAALADQLAKRRCSISYKAAMRPGATLDDARDALVQVAL RESRIMVVHTYPTKGLEIFSMARYLGMIDKGYVWIATNWLSTILDAGSPLPSDEKENLEG AITLRIHTPGSELKQKFVSRWSNLTRKAGLAGSSRMSTYALYAYDTVWLLARAINEFFNQ GGKVSFSKDPRLTELNSGSMNLDSMSIFNGGKLLRDNIFKVNMTGVTGPFSFTSEKELFR PTFEVINVVGTGFRKVGYWSEYSGLSIVPPETLYSKPPNRSSSNQQLQSIIWPGQITEKP RGWVFPNNGRQLKIGVPNRASFREFVGKVPGVDSFRGYCIEVFTTAIDLLPYALPYKLVA FGDGHNNPDDTELIRLITAGVYDAAIGDIAITTNRTKMVDFTQPYIESGLVVVAPVKEQN SNAWAFLSPFTPKMWCVTGVFFLIVGTVIWILEHRLNDEFRGPPSKQIVTVLWFSFSTLF TAQRENTVSTFGRIVLLIWLFVVLIINSSYTASLTSILTVQKLSSPITGIESLVNTKEPI GYQWGSFARNYLIQELRIDESRLVPLNLPEDYAKALKDGPSRGGVAAVVDERAYMELFLS SRCQFSILGQEFTKNGWGFAFPRDSPLAVDMSTAILKLSENGELQRIHDKWLSGIACTSQ STKLEVDRLQLKSFSGLFFLCGLACFLALLIYFVMLACQYCQYYPNSEVASESSRSGRLQ TFLSFADEKEESVRSRSKRRQLEVTSVRSIDQDASVNGSRTDRSEIYSNRVVSFGESV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g082480.3.1
Transcript Infomation	glutamate receptor-like 3.5
Sequence	TTATATATATTTAACACACTTTTTTGTCCTATTTTCTTGGCAATGATACCTGAGTGAGTT CACTGTTTAATCATCTTTTTGTTCAAACCAAAAATACCAAATTCAGAATTTTGTAAGCCA TACATGAACTAGGTGAGAAAATTGAGTAGTTGGGTTAATGATTATAGGAATATTAGTTCT TAGTTTTATAAAAGTAGAAAAGTTCATATTTTTTTCTTGCTGAAACCTCAAGATTTCAAT AGTTGCACTTATTTGCTTTGCCCTTTATGCTTTATTAGTGGGGAAGAGCAGAAGCAGATA CCCCACTAAAGAAAACTACACCTTTTTTTCCCTTTTCCTTCTACTTCTTGTTCTTTATTT TCCCCCTTTTGTTATGGCGGTTTAATGTTCTGTAAGTAAATTTCTTGTCCCTATCCAATA CTCAAACCATATTTTCTCAAGATTTTGTTCTGCTCTTTTCAGAGTTTCAATATTCTTTTT GTCTGCTCCATTATCTCCTTATGAAATATGGCTCATTTCAAACTCTAGTGTCAAGATTGC ACATTTTTGTACCCAAGTTCACTATGAGACTATTTTGGACAATAATTTTAGTAGTTCTCT ACAATGGGTGTTCTTCAGAGGGGGTTAATTCAACTCTTTCTGCAAGGCCTAAAGTTGTGA ACATTGGGTGTATGGTGTCTTTCAATACACTTGTTGGGAAAGTTACTAAAGTTGCTGCGG AAGCTGCTGTTGAGGATATAAATTCCAATCCAGATGTTCTTGGAGGAACTAAACTGAATA TGATAACATTGGACAGTAATGCCAGTGGATTTCTTGGAATAGTTGAGGCTATCCGTTTCA TGGAGACGGATACTATGGCAATTGTTGGCCCCCAATCTTCTGTTATAGCCCATGTGGTAT CAAACATTGCGAATGAGCTGCAGGTCCCTCTATTATCATTTGCAGCCACAGATCCCTCTC TTTCTTCGCTTCAGTACCCGTTTTTTGTTAGAACTTCACCAAGTGATAAGTATCAGATGG AAGCTATAGCTGAAATGGTTGAGTACTATGAATGGAGGGAGGTGATTGCTATATATATTG ATGATGATTTTGGAAGAAATGGTATAGCTGCATTAGCAGATCAGCTGGCCAAGAGGCGAT GTTCGATCTCTTACAAAGCAGCAATGAGACCTGGAGCAACATTGGATGATGCCCGGGATG CTTTGGTTCAGGTTGCTTTGAGAGAGTCACGAATAATGGTTGTTCATACTTATCCTACAA AGGGTCTGGAGATATTCTCTATGGCACGGTATTTGGGGATGATAGATAAAGGATATGTGT GGATTGCTACAAATTGGCTCTCAACTATCCTTGACGCTGGTAGTCCCCTTCCTTCGGATG AAAAAGAGAACCTTGAAGGGGCTATTACCTTGCGTATACACACTCCAGGTTCAGAATTGA AACAGAAGTTTGTCTCACGGTGGAGCAATTTGACAAGGAAGGCAGGACTTGCTGGATCTT CAAGGATGTCCACTTATGCACTCTATGCTTATGACACTGTGTGGCTACTTGCTCGTGCCA TCAATGAATTCTTTAACCAGGGTGGAAAAGTTTCATTTTCTAAGGATCCAAGGCTAACTG AACTGAATAGTGGAAGTATGAATCTTGATTCTATGAGCATCTTTAATGGAGGGAAGTTAT TGCGAGACAACATTTTTAAGGTTAATATGACAGGTGTAACAGGACCATTTAGTTTCACTT CTGAAAAGGAACTCTTCCGCCCTACTTTTGAAGTCATTAATGTGGTTGGTACAGGTTTTA GGAAAGTTGGTTATTGGTCTGAATACTCTGGTTTATCAATTGTGCCTCCTGAAACACTGT ACTCTAAGCCGCCAAATCGTTCCTCTTCGAATCAACAGCTACAAAGTATAATCTGGCCTG GACAAATAACGGAAAAACCTCGTGGATGGGTTTTTCCAAACAATGGGAGACAACTGAAAA TTGGAGTTCCTAACAGAGCTAGCTTTCGTGAATTTGTTGGAAAGGTACCAGGCGTCGACT CATTCAGAGGATACTGTATAGAGGTCTTCACTACTGCCATAGACTTATTGCCTTATGCTC TCCCTTACAAGCTAGTTGCCTTTGGGGATGGTCATAACAATCCAGATGATACAGAGCTAA TACGCCTAATCACAGCAGGAGTTTATGATGCAGCCATAGGTGACATAGCAATTACAACTA ATCGAACAAAAATGGTTGACTTCACTCAACCATACATTGAATCTGGGTTAGTTGTAGTGG CACCAGTTAAGGAGCAGAATTCTAATGCTTGGGCTTTTCTCAGTCCATTTACTCCTAAGA TGTGGTGTGTCACTGGTGTTTTTTTCTTAATTGTGGGCACTGTAATTTGGATTTTGGAAC ACAGATTGAATGATGAATTTCGTGGACCTCCGAGTAAACAGATTGTCACTGTTTTATGGT TCAGCTTTTCAACTCTCTTTACTGCCCAGAGAGAAAACACTGTCAGCACCTTTGGCCGTA TTGTCCTTCTTATATGGCTATTTGTGGTTTTGATAATAAACTCAAGCTATACTGCCAGTC TCACCTCAATTCTTACAGTGCAGAAACTTTCTTCCCCAATTACCGGAATTGAAAGTTTAG TAAATACAAAGGAACCCATTGGTTATCAGTGGGGTTCATTTGCCCGTAACTATCTGATTC AAGAACTTCGCATTGATGAATCTAGACTTGTTCCTCTTAACCTCCCTGAAGATTATGCTA AAGCTTTAAAAGATGGTCCTAGCCGTGGTGGTGTTGCAGCAGTGGTAGATGAGCGTGCTT ATATGGAGCTTTTCCTCTCATCGCGTTGCCAATTCAGTATTCTGGGTCAAGAATTCACAA AAAATGGATGGGGGTTTGCTTTCCCTAGGGATTCTCCTCTAGCAGTAGACATGTCAACAG CAATTTTGAAACTATCAGAGAATGGGGAACTTCAAAGGATCCATGATAAATGGCTTTCTG GAATAGCTTGCACTTCACAGAGTACAAAGCTTGAAGTGGACAGACTTCAGCTGAAAAGCT TCTCAGGTCTATTCTTTCTATGTGGGTTGGCATGTTTTCTGGCTCTGCTCATTTATTTTG TGATGCTAGCATGTCAATATTGCCAATACTATCCCAATTCTGAGGTAGCTAGTGAAAGTT CACGATCAGGACGACTGCAGACATTCCTTTCTTTTGCTGATGAAAAGGAAGAGTCAGTGA GGTCTCGATCCAAACGAAGGCAACTAGAGGTGACTTCAGTAAGAAGTATTGATCAAGATG CATCAGTAAATGGTTCAAGAACTGACCGTTCTGAGATATACTCGAACAGGGTTGTAAGTT TTGGAGAATCTGTATAGTTCATAAACAAAAATCTACTACTCTTCCTCAAATGTAAGTATT AAGGTTGACTGCGTATTTGTGTAGACAATGCTGTAACTGTATCAAATTTTACAAAGTTCT GATGCCATTGACATATTATGTCAAATAATCGATGAACC