Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g082340.3.1
CDS Infomation	RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 protein (AHRD V3.3 *** AT2G34750.1)
Sequence	ATGGGAATGGAATTACATGCTGAAAGTGCGGGTTGTGCTGAGATGGAGATTGCTGAGATT ACGGATTCAGATTTGTTCAAACTTGTTAGACATGCCCTTAAATCTGTTATCCAGGGTGAT CCAGACCAATATGAGCAGCTTCTTCGTGTTATGCACCCTGATGAAGGCGTTTTACCTGAT GTGGCCCTACTGGTGACATGTTTAAAAGCTCTGTCAGGATCAGTTTCTTGTCTAGACATT GTTCACCATAAATCTCTTATTGCATCTATTTTACAAATGAGCATGTGGAACTATGGAACT GATGTAATGGATGCTTTGATGGAATTTAATATATCCTTGGCTACATCCAGTGGGCAGTAT GTAGATCTGTGCTTGGAAATGCTTGTGAGCAATTTTATGCCTCCTGATTCCTTCATATCA TTGTTGAATCAGCCACGTGGCATTCTACGGAAGGGCCAAGTCATTGACCGTGTCCATTCA ACATTAACATACATTGCAAAGTTAGTTCCTCTCTCGCCCTTGAGACTTGAGAGAATGATA ACGGAGAGGATGCCACACATTTTCACAAAGGAACCATTGATTTTGATATATGTGGAGAAC ATGTTAAAACTAGAGAGTGGAGCAATTGGTGATCTTGTTGGGAGAACAATGCTTGTGGCA ATTATGGATAAGCTAATAGATTTGGATGTAGATATAGCATGGGATGATATCTTACAAGAA GATTTCACCAAAGGCATCTTCGATATGGAGCTGGGAGATCTCGAATGGCCAATGGATGAT GGCCAGCAAAATGGTGACGAGCTCCAAATATCTTGGATGGAACGGTATTTTAGTGGAAAT CTAAATGCTCAGAAATTGGATAGTTTAATCGTCCTTACCTTTGAACACCTTAACATTTGC AAAGAGAGTGGACGCCTGAGTCAGGTTTTTCATACTCTTCTCCAGTCTTTTCAGCAAACT GTTTTGATGGCATACAAGTCTAAATTTGCTCAGTTTGTGTTGTTTTACGCCTGTTCACTG GATCCTGAAAACTGCGGTAGGAGATTTGCCGATACGCTATTTCATAAATTTAAGTCAAGT AAATATCCAGAATGGAGAATGAGTGCTGTTGCCTATCTTGCTAGTTATTTGGCTCGTGCG AAGTTTTTGCCCATCTCATTTGTTGCTGAATATGTAGAAAGTTTGCTGGAATGGTGTTCT TCTTATTGCTTCAACCAGGGTGGCAGCATCAATCCAAAAGCTCACAAGGAATTCTATGCT GGGTGCCAGGCCTTGATGTATGTACTTTGCTTTCGCATGAGATCAATGCTTGCTATTCCT CGCATCAGATCACGTATATCAAAGCATATAGAGGATATCCTGAGGCATCCTTTGAGCCCA TTAATGGTATGCTTGCCATCAATAGTGGAAGAATTTCTTCGGTTGGCAAAAGTGACTCAT CTTGATGTGCCGGATAATGTTGTATCAAGTAACCTGCTTGAGTCGGAACTTTCAATGGCT TTTGGTGGTAGGGAGAGGCTTGACACATTTTTCCCGTTTGATCCCTGTCTTCTAATGAAA TCTGACAGATTCATCCGGCCAAATTTTGTGTACTGGTCAATGGTTCGGAACTCTTATGAC AATGATGATGATGATGAGGGTACTAGTGATGAAGACGATATTGAAATCTGTACAGCAGGG AACGGGATAAATATACCTAATGATGGAGCTGCCCGAAGTTATGATCAGGATCTCGATGAA TTTGGTAATAAAATGAGCAAAATGTCCATAACACCTAAAGTTGCTCAATGGGGGGAATTA CAATCCGGCAGGCAGATGCCTTCAAGTTTGCTACCTTGCCCTGATTCCTTGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g082340.3.1
PEP Infomation	RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 protein (AHRD V3.3 *** AT2G34750.1)
Sequence	MGMELHAESAGCAEMEIAEITDSDLFKLVRHALKSVIQGDPDQYEQLLRVMHPDEGVLPD VALLVTCLKALSGSVSCLDIVHHKSLIASILQMSMWNYGTDVMDALMEFNISLATSSGQY VDLCLEMLVSNFMPPDSFISLLNQPRGILRKGQVIDRVHSTLTYIAKLVPLSPLRLERMI TERMPHIFTKEPLILIYVENMLKLESGAIGDLVGRTMLVAIMDKLIDLDVDIAWDDILQE DFTKGIFDMELGDLEWPMDDGQQNGDELQISWMERYFSGNLNAQKLDSLIVLTFEHLNIC KESGRLSQVFHTLLQSFQQTVLMAYKSKFAQFVLFYACSLDPENCGRRFADTLFHKFKSS KYPEWRMSAVAYLASYLARAKFLPISFVAEYVESLLEWCSSYCFNQGGSINPKAHKEFYA GCQALMYVLCFRMRSMLAIPRIRSRISKHIEDILRHPLSPLMVCLPSIVEEFLRLAKVTH LDVPDNVVSSNLLESELSMAFGGRERLDTFFPFDPCLLMKSDRFIRPNFVYWSMVRNSYD NDDDDEGTSDEDDIEICTAGNGINIPNDGAARSYDQDLDEFGNKMSKMSITPKVAQWGEL QSGRQMPSSLLPCPDSL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g082340.3.1
Transcript Infomation	RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 protein (AHRD V3.3 *** AT2G34750.1)
Sequence	TTTTCTCAGCCCTCAAATTGTTGCCACTGCCTGGCGCCGCTTTGGCTCATCTCCAGCTCT ACCGGCAACTCACTTTCTCCTTCCCCGACGAAATCAAAGTAAAATTTGCGCAATATTTCA ACCCTAGTCAACATAATGGGAATGGAATTACATGCTGAAAGTGCGGGTTGTGCTGAGATG GAGATTGCTGAGATTACGGATTCAGATTTGTTCAAACTTGTTAGACATGCCCTTAAATCT GTTATCCAGGGTGATCCAGACCAATATGAGCAGCTTCTTCGTGTTATGCACCCTGATGAA GGCGTTTTACCTGATGTGGCCCTACTGGTGACATGTTTAAAAGCTCTGTCAGGATCAGTT TCTTGTCTAGACATTGTTCACCATAAATCTCTTATTGCATCTATTTTACAAATGAGCATG TGGAACTATGGAACTGATGTAATGGATGCTTTGATGGAATTTAATATATCCTTGGCTACA TCCAGTGGGCAGTATGTAGATCTGTGCTTGGAAATGCTTGTGAGCAATTTTATGCCTCCT GATTCCTTCATATCATTGTTGAATCAGCCACGTGGCATTCTACGGAAGGGCCAAGTCATT GACCGTGTCCATTCAACATTAACATACATTGCAAAGTTAGTTCCTCTCTCGCCCTTGAGA CTTGAGAGAATGATAACGGAGAGGATGCCACACATTTTCACAAAGGAACCATTGATTTTG ATATATGTGGAGAACATGTTAAAACTAGAGAGTGGAGCAATTGGTGATCTTGTTGGGAGA ACAATGCTTGTGGCAATTATGGATAAGCTAATAGATTTGGATGTAGATATAGCATGGGAT GATATCTTACAAGAAGATTTCACCAAAGGCATCTTCGATATGGAGCTGGGAGATCTCGAA TGGCCAATGGATGATGGCCAGCAAAATGGTGACGAGCTCCAAATATCTTGGATGGAACGG TATTTTAGTGGAAATCTAAATGCTCAGAAATTGGATAGTTTAATCGTCCTTACCTTTGAA CACCTTAACATTTGCAAAGAGAGTGGACGCCTGAGTCAGGTTTTTCATACTCTTCTCCAG TCTTTTCAGCAAACTGTTTTGATGGCATACAAGTCTAAATTTGCTCAGTTTGTGTTGTTT TACGCCTGTTCACTGGATCCTGAAAACTGCGGTAGGAGATTTGCCGATACGCTATTTCAT AAATTTAAGTCAAGTAAATATCCAGAATGGAGAATGAGTGCTGTTGCCTATCTTGCTAGT TATTTGGCTCGTGCGAAGTTTTTGCCCATCTCATTTGTTGCTGAATATGTAGAAAGTTTG CTGGAATGGTGTTCTTCTTATTGCTTCAACCAGGGTGGCAGCATCAATCCAAAAGCTCAC AAGGAATTCTATGCTGGGTGCCAGGCCTTGATGTATGTACTTTGCTTTCGCATGAGATCA ATGCTTGCTATTCCTCGCATCAGATCACGTATATCAAAGCATATAGAGGATATCCTGAGG CATCCTTTGAGCCCATTAATGGTATGCTTGCCATCAATAGTGGAAGAATTTCTTCGGTTG GCAAAAGTGACTCATCTTGATGTGCCGGATAATGTTGTATCAAGTAACCTGCTTGAGTCG GAACTTTCAATGGCTTTTGGTGGTAGGGAGAGGCTTGACACATTTTTCCCGTTTGATCCC TGTCTTCTAATGAAATCTGACAGATTCATCCGGCCAAATTTTGTGTACTGGTCAATGGTT CGGAACTCTTATGACAATGATGATGATGATGAGGGTACTAGTGATGAAGACGATATTGAA ATCTGTACAGCAGGGAACGGGATAAATATACCTAATGATGGAGCTGCCCGAAGTTATGAT CAGGATCTCGATGAATTTGGTAATAAAATGAGCAAAATGTCCATAACACCTAAAGTTGCT CAATGGGGGGAATTACAATCCGGCAGGCAGATGCCTTCAAGTTTGCTACCTTGCCCTGAT TCCTTGTAGAGATTGATCTGCACCGTTTGATGACCTTGAAAGAGGAAATGCTTGCCCTTC CATGGCAAAGAAGCGTCGTATCAAAATGCCTGTCCTGGTCCGTGGTTGGTTATGGCAAGA CACTGAGATTATGTGATATCCATTATATCCTAGATTCATGAGAGGCCTTCACCCTGCCTG CCTGCCTGAATACATCCCGCGAGATGTTAAGAGGTCAAGTTTTGTGTTCACAGCTAATGT TATTTGTAATATTTAGCAATAGTTGGTTTGATGATGAGAACTAAATGTGTAAACACTCAA ATTCTCTTGTATTTTTCTTGTTGGTGTTAATATATTATGGTAAGAGTATATTTTAAATGT TTCGAAGG