Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g080420.3.1

CDS Infomation

RNA-binding family protein (AHRD V3.3 *** A0A061FD24_THECC)

Sequence

ATGCAACCAGCGAATTCCATGGTTCCACCACCACAGTACCAGCAGACACAGCAGTGGATG
GCTCAGCCGCCGCCGCAGTATCAGGTTGCGCCTCCGCAGCAATCGGGATATTACTACCAG
CAACCTCAGCAACAGGGCGGAGTTCCTCCACCCCAACAACAACAACTTCAGTACAACGCC
TCTGGTTTGGCTGCTACTGCCGGTTCTGTTCAGCCGACTAGTGCTGATGAGATCCGAAGC
CTTTGGATCGGAGATCTACAGTTTTGGATGGATGAGCAATACCTTCTCAACTGTTTCGCA
CAAACTGGAGAGGTGACCTCTGCTAAAGTTATCCGTAACAAGCAAAGTGGACAATCAGAG
GGTTATGGCTTTATTGAGTTTATTAGTCATGCTGCTGCAGAAAGGAATCTGCAAGCATAT
AATGGTACCTTGATGCCTAATATTGAGCAAAATTTCAGACTCAACTGGGCTTCACTCGGT
TCTGGTGAAAAACGTTCTGATAATGGTCCTGAATATACAATATTTGTTGGTGACTTGGCA
GCCGATGTTTCTGATTATATGCTTCAGGAGACATTTAGGGCTAACTATCCTTCTGTGAAG
GGCGCTAAGGTTGTAACAGATAAGGCCACGGGGCGCACCAAGGGTTATGGTTTTGTTAAG
TTTGGGGATGAAAGTGAGCAGTTGCGCGCTATGACTGAGATGAATGGACAGTTTTGCTCC
ACTAGGCCCATGCGGATTGGTCCCGCAGCTAACAAGAAGAGTATGGGTGGTCAAAGTCAA
GCTTCGTATCAAAGTTCACCTGGAACTCAAAATGAGGACGACCCATCTAATACCACTATT
TTTGTTGGGAACTTGGATTCCAATATAACGGATGAACATTTAAGGCAGATTTTTGGACAC
TATGGGCAGTTGCTTCATGTAAAAATACCAGTAGGCAAGCGGTGTGGCTTTATTCAGTTT
GCTGACAGAAGTTGTGCTGAGGAAGCTCTACGGGTATTAAATGGAACTCAGCTGGGTGGA
CAAAGCATCCGTCTTTCATGGGGTCGAAGTCCTGCAAACAAGCAGCAGCCTCAGCTTGAT
CCAAACCAATATGCTGGTTATTATGGGTATACTGCTGGATATGAAGGTTATGGTTATGCC
CCCCCTGCTCAGGATCCAAATCAGTATTATGCGGGCTATGCTGGATATGGAAATTACGCA
CAACCTCAACAGCAGCAGCAAGTTTTGCAGCATCCTCAGGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g080420.3.1

PEP Infomation

RNA-binding family protein (AHRD V3.3 *** A0A061FD24_THECC)

Sequence

MQPANSMVPPPQYQQTQQWMAQPPPQYQVAPPQQSGYYYQQPQQQGGVPPPQQQQLQYNA
SGLAATAGSVQPTSADEIRSLWIGDLQFWMDEQYLLNCFAQTGEVTSAKVIRNKQSGQSE
GYGFIEFISHAAAERNLQAYNGTLMPNIEQNFRLNWASLGSGEKRSDNGPEYTIFVGDLA
ADVSDYMLQETFRANYPSVKGAKVVTDKATGRTKGYGFVKFGDESEQLRAMTEMNGQFCS
TRPMRIGPAANKKSMGGQSQASYQSSPGTQNEDDPSNTTIFVGNLDSNITDEHLRQIFGH
YGQLLHVKIPVGKRCGFIQFADRSCAEEALRVLNGTQLGGQSIRLSWGRSPANKQQPQLD
PNQYAGYYGYTAGYEGYGYAPPAQDPNQYYAGYAGYGNYAQPQQQQQVLQHPQV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g080420.3.1

Transcript Infomation

RNA-binding family protein (AHRD V3.3 *** A0A061FD24_THECC)

Sequence

CCCCATATATATAATTCTCCTTGTCTTAAAAAAGGAAAAACCCCAAAAGGGCAGAAAATA
TCTCATCAGCTGATTTTGGAATAAATAGAAGGCACGGGTGCATACAATACATTTCTCCGT
GTTTCTCCATACATTCTTATAGGGTTCCACCGTTCCCCCCCTCTCTGAACCCCATTTCAT
CACGATGCAACCAGCGAATTCCATGGTTCCACCACCACAGTACCAGCAGACACAGCAGTG
GATGGCTCAGCCGCCGCCGCAGTATCAGGTTGCGCCTCCGCAGCAATCGGGATATTACTA
CCAGCAACCTCAGCAACAGGGCGGAGTTCCTCCACCCCAACAACAACAACTTCAGTACAA
CGCCTCTGGTTTGGCTGCTACTGCCGGTTCTGTTCAGCCGACTAGTGCTGATGAGATCCG
AAGCCTTTGGATCGGAGATCTACAGTTTTGGATGGATGAGCAATACCTTCTCAACTGTTT
CGCACAAACTGGAGAGGTGACCTCTGCTAAAGTTATCCGTAACAAGCAAAGTGGACAATC
AGAGGGTTATGGCTTTATTGAGTTTATTAGTCATGCTGCTGCAGAAAGGAATCTGCAAGC
ATATAATGGTACCTTGATGCCTAATATTGAGCAAAATTTCAGACTCAACTGGGCTTCACT
CGGTTCTGGTGAAAAACGTTCTGATAATGGTCCTGAATATACAATATTTGTTGGTGACTT
GGCAGCCGATGTTTCTGATTATATGCTTCAGGAGACATTTAGGGCTAACTATCCTTCTGT
GAAGGGCGCTAAGGTTGTAACAGATAAGGCCACGGGGCGCACCAAGGGTTATGGTTTTGT
TAAGTTTGGGGATGAAAGTGAGCAGTTGCGCGCTATGACTGAGATGAATGGACAGTTTTG
CTCCACTAGGCCCATGCGGATTGGTCCCGCAGCTAACAAGAAGAGTATGGGTGGTCAAAG
TCAAGCTTCGTATCAAAGTTCACCTGGAACTCAAAATGAGGACGACCCATCTAATACCAC
TATTTTTGTTGGGAACTTGGATTCCAATATAACGGATGAACATTTAAGGCAGATTTTTGG
ACACTATGGGCAGTTGCTTCATGTAAAAATACCAGTAGGCAAGCGGTGTGGCTTTATTCA
GTTTGCTGACAGAAGTTGTGCTGAGGAAGCTCTACGGGTATTAAATGGAACTCAGCTGGG
TGGACAAAGCATCCGTCTTTCATGGGGTCGAAGTCCTGCAAACAAGCAGCAGCCTCAGCT
TGATCCAAACCAATATGCTGGTTATTATGGGTATACTGCTGGATATGAAGGTTATGGTTA
TGCCCCCCCTGCTCAGGATCCAAATCAGTATTATGCGGGCTATGCTGGATATGGAAATTA
CGCACAACCTCAACAGCAGCAGCAAGTTTTGCAGCATCCTCAGGTTTGATTAACCCGTTG
AGCTTATTTATTAACTAAAGCTACTTTATACCGACATCTCCATTTTGGAATAGAAATGAC
TGAAATTTTATGAGATAATATCTTTTTACTTGTATGGCCAAATGGGTTCTTAAACTGATA
ATAGTTTTTTCATAAAAAATAATGAGTTGTTTGAATACTTATCTCACTTCCTCCTTGCAG
TGATATATGCTGGTGAAAGGATTTACTGAGTGCTTCCCGGCGTGATTTGTGTATTGATTT
CAAAAGCGGGACATGAGGTTATCAGTTGGGATCCAGATGTGTATTTCACAATCTTAGGGT
GTTGGAAACCTTTGTAGGCTATTTCATTGAGGATACAATTTATGGTTTCGATCAACTGAT
TGTATGCTGTTTGTTTTTTTATTTTTGCGTTGCCCTTTTATTACTTAGATATGAGATCTA
GATATACTTGAAGGTCTTTGGAGAAGTGTAGGCATGTAACTGTATACTTGTGCTTTTTGG
CTATCCTGGCAATGCTGAACACCCTATTTTGCTCGTTGCTC