Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g080080.3.1
CDS Infomation	Receptor-like protein kinase (AHRD V3.3 *** C6ZRS0_SOYBN)
Sequence	ATGGTTATTCAAAAGTGGTTACTCTTTCTGTTTCTGCATTTACATGTTCTCAATATTGTA GCCCAGCTGCCTCAGTTACAATTTGGTTCATGTGGTGAGAATGGTAACTATACTGAGAAT AGTACCTACAAGAACAATCTAAACACACTCCTCACTTCCCTTCCCTCAAAAATAGATGGC TATGGTTTCTACTATGATTCTATTGGTGAGGTCAGTGGTATTGTGCTATGTAGAGGAGAT GTGAAGCTAGACGATTGCCGCGTTTGTGTCTATAACGCTGCTCAAAAACTTGTACAGCTA TGTCCTACCCAAAAAGAAGTTCTTGGTGGCTATGGTGAATGTTTGTTGCTTTACTCGAAT AATCAATCCATTATAGAAACTCCATCATTCTCTGTTCGATATTTCTTTTGGAATGCTGCG AATGCCTCAAAACCCGAGGAATTTAACCAGGAACTGCATAAATTACTGGAAAATTTACGA GGCCGTGCTATAAATGGTGGTCCCTTTCGAAAATATGCTAGTGGTAATGTGACAGGTCCA GATGATCAGACTATATATGCACTTGTGCAGTGTACTCCTGATTTAACTCCTCGTAATTGC TTCAATTGCTTAACTGATATTTATAATAACATGCCTCAATGTCCTTGCCTGGGGAAGATC GGTGGAAGAATAATTGGGCCTAGGTGCAACTTCCGTTATGAAATTTCCCGTTTCTTCGCT GATGTGTCGGTGGAAGCTCCGCCACCTACAGGAAATGATGATAAAACAGCTCCAATGGGG AATGGTAATGAAACGGCTCCAACAGGGAATGATAATACAGCTCCAATAGTGCAGGATAAA AAAAAAGCTCGACTCGTCATTATTATCATTGTGCCAACTGTTATAGTTGTTATTCTTACT GTATGTATTTCTGTCATCTTAATGAAGAAGCGAAAGAGGAAGCTGGTGGACATAATTCTA GGTACACTTGGGGATGATACTAGCGATGTAGAATCGTTGCAGTATGATTTTTCTATAATT AGAGAAGCAACAGAAAACTTCTCAAATGCTAATAAATTGGGACAGGGAGGATTTGGTCCT GTGTATAAGGGTAAGCTTCAAAATGGACAAGAAGTAGCAGTGAAAAGATTGTCAGCAGAT TCAGGCCAAGGTGATCTAGAGTTCAAAAACGAGGTCTTGTTGGTTGCCAGGCTTCAACAC AGGAATTTGGTTAGATTACTCGGATTTTGCCTTGATGGAACAGAGAGACTTCTTGTCTAT GAATTTGTTCCCAATGCAAGCCTTGACCAATTTTTATTTGATCAAGTTAAACGTAGCCAA CTGGATTGGGAAAGGCGATCCAAAATCATAGGAGGCATAGCTAGGGGAATTGTTTACCTT CATGAGGATTCTAGACTTCGCATCATTCATCGTGATCTCAAAGCTGGTAATGTTCTACTT GATGCAGAGATGAATCCTAAAATTGCCGACTTTGGCATGGCAAGACTATTTACATTGGAT GAAACTCAAGGCAACACAAACAGAATTGTTGGGACTTATGGGTATATGGCTCCAGAATAT GCAATGCAGGGGCAATTTTCAGTGAAATCAGATGTTTATAGCTTTGGAGTACTAGTCCTG GAAATTATAAGCGGTCAACGAAACATTTGTTCCAGAAAAGGAGATTCAGTGGAAGACCTT CTGAGCGTTGCTTGGTTGAACTGGTGCGAAGAAACAGTTTCAAATTTGATTGACCCTATT CTGAGGGGAAGCTCAGGCCTTGTTGGTGACATAGTGAGATACATCCACATTGCTTTATTG TGCGTTCAAGAAAATGTTGCTGATAGACCAAACATGGGTGAAGTACTTCTCATGCTCAGC AGTCGCTCTTTGAGTCTTCCAGTTCCACACAACCCACAGATTTTACACTTTGGAGATGTC TATACAACAATTTCTGAGTCCAGCAAAATAACGGAAAGTAAATCAATATGTTCTTCAGGA AATCAGGATTTGATAACTGAGTTGCATCCTCGATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g080080.3.1
PEP Infomation	Receptor-like protein kinase (AHRD V3.3 *** C6ZRS0_SOYBN)
Sequence	MVIQKWLLFLFLHLHVLNIVAQLPQLQFGSCGENGNYTENSTYKNNLNTLLTSLPSKIDG YGFYYDSIGEVSGIVLCRGDVKLDDCRVCVYNAAQKLVQLCPTQKEVLGGYGECLLLYSN NQSIIETPSFSVRYFFWNAANASKPEEFNQELHKLLENLRGRAINGGPFRKYASGNVTGP DDQTIYALVQCTPDLTPRNCFNCLTDIYNNMPQCPCLGKIGGRIIGPRCNFRYEISRFFA DVSVEAPPPTGNDDKTAPMGNGNETAPTGNDNTAPIVQDKKKARLVIIIIVPTVIVVILT VCISVILMKKRKRKLVDIILGTLGDDTSDVESLQYDFSIIREATENFSNANKLGQGGFGP VYKGKLQNGQEVAVKRLSADSGQGDLEFKNEVLLVARLQHRNLVRLLGFCLDGTERLLVY EFVPNASLDQFLFDQVKRSQLDWERRSKIIGGIARGIVYLHEDSRLRIIHRDLKAGNVLL DAEMNPKIADFGMARLFTLDETQGNTNRIVGTYGYMAPEYAMQGQFSVKSDVYSFGVLVL EIISGQRNICSRKGDSVEDLLSVAWLNWCEETVSNLIDPILRGSSGLVGDIVRYIHIALL CVQENVADRPNMGEVLLMLSSRSLSLPVPHNPQILHFGDVYTTISESSKITESKSICSSG NQDLITELHPR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g080080.3.1
Transcript Infomation	Receptor-like protein kinase (AHRD V3.3 *** C6ZRS0_SOYBN)
Sequence	AGGTCACTGCACCTAGTCCATACGTTTTCTCTCTAACTCTATTTCTAGGTTACTAATATC AAAATTTGCTTGTAACATAAACAGACATAGCCATGGTTATTCAAAAGTGGTTACTCTTTC TGTTTCTGCATTTACATGTTCTCAATATTGTAGCCCAGCTGCCTCAGTTACAATTTGGTT CATGTGGTGAGAATGGTAACTATACTGAGAATAGTACCTACAAGAACAATCTAAACACAC TCCTCACTTCCCTTCCCTCAAAAATAGATGGCTATGGTTTCTACTATGATTCTATTGGTG AGGTCAGTGGTATTGTGCTATGTAGAGGAGATGTGAAGCTAGACGATTGCCGCGTTTGTG TCTATAACGCTGCTCAAAAACTTGTACAGCTATGTCCTACCCAAAAAGAAGTTCTTGGTG GCTATGGTGAATGTTTGTTGCTTTACTCGAATAATCAATCCATTATAGAAACTCCATCAT TCTCTGTTCGATATTTCTTTTGGAATGCTGCGAATGCCTCAAAACCCGAGGAATTTAACC AGGAACTGCATAAATTACTGGAAAATTTACGAGGCCGTGCTATAAATGGTGGTCCCTTTC GAAAATATGCTAGTGGTAATGTGACAGGTCCAGATGATCAGACTATATATGCACTTGTGC AGTGTACTCCTGATTTAACTCCTCGTAATTGCTTCAATTGCTTAACTGATATTTATAATA ACATGCCTCAATGTCCTTGCCTGGGGAAGATCGGTGGAAGAATAATTGGGCCTAGGTGCA ACTTCCGTTATGAAATTTCCCGTTTCTTCGCTGATGTGTCGGTGGAAGCTCCGCCACCTA CAGGAAATGATGATAAAACAGCTCCAATGGGGAATGGTAATGAAACGGCTCCAACAGGGA ATGATAATACAGCTCCAATAGTGCAGGATAAAAAAAAAGCTCGACTCGTCATTATTATCA TTGTGCCAACTGTTATAGTTGTTATTCTTACTGTATGTATTTCTGTCATCTTAATGAAGA AGCGAAAGAGGAAGCTGGTGGACATAATTCTAGGTACACTTGGGGATGATACTAGCGATG TAGAATCGTTGCAGTATGATTTTTCTATAATTAGAGAAGCAACAGAAAACTTCTCAAATG CTAATAAATTGGGACAGGGAGGATTTGGTCCTGTGTATAAGGGTAAGCTTCAAAATGGAC AAGAAGTAGCAGTGAAAAGATTGTCAGCAGATTCAGGCCAAGGTGATCTAGAGTTCAAAA ACGAGGTCTTGTTGGTTGCCAGGCTTCAACACAGGAATTTGGTTAGATTACTCGGATTTT GCCTTGATGGAACAGAGAGACTTCTTGTCTATGAATTTGTTCCCAATGCAAGCCTTGACC AATTTTTATTTGATCAAGTTAAACGTAGCCAACTGGATTGGGAAAGGCGATCCAAAATCA TAGGAGGCATAGCTAGGGGAATTGTTTACCTTCATGAGGATTCTAGACTTCGCATCATTC ATCGTGATCTCAAAGCTGGTAATGTTCTACTTGATGCAGAGATGAATCCTAAAATTGCCG ACTTTGGCATGGCAAGACTATTTACATTGGATGAAACTCAAGGCAACACAAACAGAATTG TTGGGACTTATGGGTATATGGCTCCAGAATATGCAATGCAGGGGCAATTTTCAGTGAAAT CAGATGTTTATAGCTTTGGAGTACTAGTCCTGGAAATTATAAGCGGTCAACGAAACATTT GTTCCAGAAAAGGAGATTCAGTGGAAGACCTTCTGAGCGTTGCTTGGTTGAACTGGTGCG AAGAAACAGTTTCAAATTTGATTGACCCTATTCTGAGGGGAAGCTCAGGCCTTGTTGGTG ACATAGTGAGATACATCCACATTGCTTTATTGTGCGTTCAAGAAAATGTTGCTGATAGAC CAAACATGGGTGAAGTACTTCTCATGCTCAGCAGTCGCTCTTTGAGTCTTCCAGTTCCAC ACAACCCACAGATTTTACACTTTGGAGATGTCTATACAACAATTTCTGAGTCCAGCAAAA TAACGGAAAGTAAATCAATATGTTCTTCAGGAAATCAGGATTTGATAACTGAGTTGCATC CTCGATAAAACATCCATACATACATCTCTCTATGTATATGCACAAGTATATCATTCATTT TTAGGCGTGGTGTATATGTGTAGTGCACTCTCTCTTTATTTTGTGTTAGATATGCATGTA CATATATTTTT