Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g078050.3.1

CDS Infomation

120 kDa pistil extensin-like protein (AHRD V3.3 *-* Q49I27_9SOLA)

Sequence

ATGGCGTTTAGGTCATCAAAGGCCATGGTGCTCATACAAGTTTTATCATTAGTAGTTGCC
TCTTTCTCAGAGCTCAGCTTTGGTGAAGTCGCTGAAAATTCATCATTAGACAATGATCGT
GAGGACAATGAAATCATCTCAACCAAAGGGTTAGGGATTGGACGCGTTCCTAAGAAAAGT
CCTTCGACCCCTGCACCTGCTAAACGACCATCACCACCAGCTAAGTCATCACCACCACCA
TCACCGCCAGCTAAGTCACCACCACCACCGCCACCAACACCAACTAAGTCACCTTCACCC
TCGCCACCGCCACCAACTAAGTCACCATCACAATCATCGCCGCCACCACCAACTAAGTCA
CCGCCACCACCAACTAAGTCACCATCACCACCTACCCAGCCACCAATAAACAGACCGCCG
CAGCCATCACCACCAGCTACTCAGGTACCAATAAGGAGAACACCACCGCCATCACCACCA
ACTAGTAAACCACCTATCAGGTCATCACCACCACCACCAACTGATTATGATGAACCGCCA
GACATCGAGCCACCCGTTGATCAGGAGCCACCACCCGTTTCTCATGAGCCACCACCAATT
AATGAACCACCTATTATACCATTTCCACCAACTCTAAGTCCACCAGTTAAGCTTCCACCA
CCAACAATTCATCCCACCGGAAAGCCTCTAATCGTCGTCGGCCGTGTGAATTGCAAATCT
TGCAGTAACAGAGGCCTTCCTTCTCTCTTTAAAGCCTTCCCACTCCACGGAGCTTCAGTG
AAGCTAGTTTGTCACAATAATGGAAGAAAGGCACATGTTCAAACAGCATTGACAGACAAG
AATGGTGATTTCTCTATCACACCCATATCTTTAACCAGAGCAGATGTACACAAATGCAGA
GTATACTTAGTGAAATCACCCAAATCAATTTGCAATGTGCCAACAAATTTCAACAATGGA
AAATCGGGTGCTCAATTGAAACCTATCCTGCCACCGGGTAATCATGGCCCAGGCCATGGC
CTAATGTTTGATTTCTTTGGTGTTGGGCCTTTTATATTCGAAGCCCCAAACAAATTCCCA
TGCAGAAAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g078050.3.1

PEP Infomation

120 kDa pistil extensin-like protein (AHRD V3.3 *-* Q49I27_9SOLA)

Sequence

MAFRSSKAMVLIQVLSLVVASFSELSFGEVAENSSLDNDREDNEIISTKGLGIGRVPKKS
PSTPAPAKRPSPPAKSSPPPSPPAKSPPPPPPTPTKSPSPSPPPPTKSPSQSSPPPPTKS
PPPPTKSPSPPTQPPINRPPQPSPPATQVPIRRTPPPSPPTSKPPIRSSPPPPTDYDEPP
DIEPPVDQEPPPVSHEPPPINEPPIIPFPPTLSPPVKLPPPTIHPTGKPLIVVGRVNCKS
CSNRGLPSLFKAFPLHGASVKLVCHNNGRKAHVQTALTDKNGDFSITPISLTRADVHKCR
VYLVKSPKSICNVPTNFNNGKSGAQLKPILPPGNHGPGHGLMFDFFGVGPFIFEAPNKFP
CRK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g078050.3.1

Transcript Infomation

120 kDa pistil extensin-like protein (AHRD V3.3 *-* Q49I27_9SOLA)

Sequence

ACATGAGGTAACAAATTAAGTATGGCGTTTAGGTCATCAAAGGCCATGGTGCTCATACAA
GTTTTATCATTAGTAGTTGCCTCTTTCTCAGAGCTCAGCTTTGGTGAAGTCGCTGAAAAT
TCATCATTAGACAATGATCGTGAGGACAATGAAATCATCTCAACCAAAGGGTTAGGGATT
GGACGCGTTCCTAAGAAAAGTCCTTCGACCCCTGCACCTGCTAAACGACCATCACCACCA
GCTAAGTCATCACCACCACCATCACCGCCAGCTAAGTCACCACCACCACCGCCACCAACA
CCAACTAAGTCACCTTCACCCTCGCCACCGCCACCAACTAAGTCACCATCACAATCATCG
CCGCCACCACCAACTAAGTCACCGCCACCACCAACTAAGTCACCATCACCACCTACCCAG
CCACCAATAAACAGACCGCCGCAGCCATCACCACCAGCTACTCAGGTACCAATAAGGAGA
ACACCACCGCCATCACCACCAACTAGTAAACCACCTATCAGGTCATCACCACCACCACCA
ACTGATTATGATGAACCGCCAGACATCGAGCCACCCGTTGATCAGGAGCCACCACCCGTT
TCTCATGAGCCACCACCAATTAATGAACCACCTATTATACCATTTCCACCAACTCTAAGT
CCACCAGTTAAGCTTCCACCACCAACAATTCATCCCACCGGAAAGCCTCTAATCGTCGTC
GGCCGTGTGAATTGCAAATCTTGCAGTAACAGAGGCCTTCCTTCTCTCTTTAAAGCCTTC
CCACTCCACGGAGCTTCAGTGAAGCTAGTTTGTCACAATAATGGAAGAAAGGCACATGTT
CAAACAGCATTGACAGACAAGAATGGTGATTTCTCTATCACACCCATATCTTTAACCAGA
GCAGATGTACACAAATGCAGAGTATACTTAGTGAAATCACCCAAATCAATTTGCAATGTG
CCAACAAATTTCAACAATGGAAAATCGGGTGCTCAATTGAAACCTATCCTGCCACCGGGT
AATCATGGCCCAGGCCATGGCCTAATGTTTGATTTCTTTGGTGTTGGGCCTTTTATATTC
GAAGCCCCAAACAAATTCCCATGCAGAAAGTAAAAATTGAGCCCTTCAATATTAATGGAG
TACTTAGCTAGGAAAATAAAAGTATGGAGTTTATCAAGGAAAATACTTTTATCTTTTCCT
TTCTCTAGTTTCACATGAACGATACATCTTTGTACTTGCGCTAGAAATCAACTTCAATTA
AAAAAAAGTTAAAAGTTTATAATATTGCCTTGTCCTGACTTTCATTTTATGAATTTTGTT
TCCCTCTGTCTTGCAACTTTAGACCTGAAACCTGAAAAAAAATTATATTGTAATTTGATC
TAAAAAATTGTACTAATTTTCTTGATAAAACGAAGTAAATTATATTAGTGACCATGTTAT
ATTAAATACGAATTTATCATAGTATCTTTAGAATCTTATAGTCTAAATATGAGATTACTA
CGATAAACGAGTTGCTATATATAAAAAATGTCTAAATCCTTTCTTAATTGAATAGGAAAA
AGAGGTCTCATATAAATTTTTTCTTTAAAAAAAAGGAAAGGTAAAAATGTGATAATGAGA
GTACTTTAAGTTTAGGATTGAAATTTAATCGACATTTATATCAAACTAATTAATATAGCA
TCATATATGTCTTTTATACACATGTTTATCCTTGTGTATAATTAAATTATAAGGTGACCC
GAGTGTACTATAATAATGAGTTTAAAAAATTTATTACAGTAGCTATTTGCAAAGTTCCTC
AAATCTAAACTCTTGTAATATTTAGATGAGGCCTCGAGCACAATAAACTGAGAAAAAAAA
GTATCTTTTTTTTTAGTTACCTTTACTGAGAAAATTTGTGAAATCTGCATTTATCTATTG
ATTTCAATTAATCAAAAGTGATACATGTATGCTTACTCTCATATTCCGTTGATACACATT
ATCAATTTTATGTGGTAAGATAATAAATAGAGTATTTTCAGTTTTGAAGTTAAAAAGTAT
GTTTTGAGGGATCATTTGATATGAGAGATTGAAAA