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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g077650.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9N3J7_POPTR)

Sequence

ATGGGTAGCAAGATACCAATCAAATGGCCAAGAGAAGTCACAGCGGCTTTTGTTGAACAG
TTGATTCGAGCAGAAAAAGATGTACAAAAAGCGGTTCTTATATTTGATGCAGCAACAGCA
GAGTACTCGAATGGCTTTCGACACGATCGTAGCACATTTGGTCTTATAATCTCGAGATTG
CTTTCTGCAAATCATTTTAATTTAGCAGAGGAAATGCTTGTCAGAATGAAGGATGAGAGC
TGTAAGATTACTGAGGATATATTCCTCTCAGTCTATCGAGCCTATGGGCGGGTTCACAAG
CCACTTGAGGTGATCAGGGTTTTCCAAAAGATGAAGGAGTTTGATTGTGAGCCAACCCAG
AAATCGTATATTACAGTGTTCTCTGTACTTGTTGAGGAAAACCGGTTAAAAACTGCTTTT
AGGTTTTATCGTCACATGAGGGGGGTGGGCATTCCACCTTGTGTTGCTTCCCTTAATATT
TTGATTAAAGCTCTCAGCAAGAACAGTGGAACAATGGATTCTGCTTTTCGTATTTTTCAT
GAGATGCCCAAGCGCGGATTTTCACCGGATTCCTATACGTATGGGACTCTCATTAATGGG
CTTTGCAAATTGGGCAAGGCCACTGAAGCAAAAAAACTTCTGATGGAGATGGAAGCAAAT
GGTTGCTCGCCTACTGTAGTGACCTATACTTGTTTGATTCGTGGCTTTTGCCAGTCAAAT
AACTTGGATGAAGCCATGACATTCCTTGAGGACATGAGAAGCCAAGGTATTGACCCCAAT
GTGTTCACTTATAGTTCTTTGATGGACGGCCTTTGTAAGGGTGGACGTTCCTCTGAAGCA
ATGGAGCTATTACAGATAATGATTCATGAACATAAGGTTCCCAATATGATAACTTACAGT
ACCTTAATTCACGGACTTTGTGGAGAAGGTAAAATTGGAGAAGCCTTAGAGATTTTCGAC
AGAATGAAACTTCAGGGATGTAAACCTGATGCAGGGTTATACTGGAAAATCATCAATGGC
TTTTGTGAGAATAACAAGTTTCATGAAGCAGCCAACTATCTTGATGAAATGATTCTCAGT
GGAATATCTCCAAACCGGTTAACTTGGAGCTTGCATGTGAAGATCCATAATGCAGTAGTC
CGAGGCCTGTGTGCTGTGAATGATCCAAAGCGAGCTTTTCAATTATATCTAAGCATGCGC
ACCAGAGCCATCTCAGTTGAAGCTAAATCTTTTGAGACTTTGGTCAACCATTTCTGCAAA
AAAGGAGATGTGCACAAGGTTGCTCGTATTGTCGAGGAAATGTTGACTGATGGATGCATT
CCAGATGAAAAAACATGGGCTGTTGTGGTGGGTGGATTTTGGGATAGAAGGAAAGTAAGA
GAAGCAGCTGATTCGGTACAGGCTGACCTAATGCCTAAACACATGAATTTTGAGACTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g077650.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9N3J7_POPTR)

Sequence

MGSKIPIKWPREVTAAFVEQLIRAEKDVQKAVLIFDAATAEYSNGFRHDRSTFGLIISRL
LSANHFNLAEEMLVRMKDESCKITEDIFLSVYRAYGRVHKPLEVIRVFQKMKEFDCEPTQ
KSYITVFSVLVEENRLKTAFRFYRHMRGVGIPPCVASLNILIKALSKNSGTMDSAFRIFH
EMPKRGFSPDSYTYGTLINGLCKLGKATEAKKLLMEMEANGCSPTVVTYTCLIRGFCQSN
NLDEAMTFLEDMRSQGIDPNVFTYSSLMDGLCKGGRSSEAMELLQIMIHEHKVPNMITYS
TLIHGLCGEGKIGEALEIFDRMKLQGCKPDAGLYWKIINGFCENNKFHEAANYLDEMILS
GISPNRLTWSLHVKIHNAVVRGLCAVNDPKRAFQLYLSMRTRAISVEAKSFETLVNHFCK
KGDVHKVARIVEEMLTDGCIPDEKTWAVVVGGFWDRRKVREAADSVQADLMPKHMNFET*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g077650.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9N3J7_POPTR)

Sequence

ATGGGTAGCAAGATACCAATCAAATGGCCAAGAGAAGTCACAGCGGCTTTTGTTGAACAG
TTGATTCGAGCAGAAAAAGATGTACAAAAAGCGGTTCTTATATTTGATGCAGCAACAGCA
GAGTACTCGAATGGCTTTCGACACGATCGTAGCACATTTGGTCTTATAATCTCGAGATTG
CTTTCTGCAAATCATTTTAATTTAGCAGAGGAAATGCTTGTCAGAATGAAGGATGAGAGC
TGTAAGATTACTGAGGATATATTCCTCTCAGTCTATCGAGCCTATGGGCGGGTTCACAAG
CCACTTGAGGTGATCAGGGTTTTCCAAAAGATGAAGGAGTTTGATTGTGAGCCAACCCAG
AAATCGTATATTACAGTGTTCTCTGTACTTGTTGAGGAAAACCGGTTAAAAACTGCTTTT
AGGTTTTATCGTCACATGAGGGGGGTGGGCATTCCACCTTGTGTTGCTTCCCTTAATATT
TTGATTAAAGCTCTCAGCAAGAACAGTGGAACAATGGATTCTGCTTTTCGTATTTTTCAT
GAGATGCCCAAGCGCGGATTTTCACCGGATTCCTATACGTATGGGACTCTCATTAATGGG
CTTTGCAAATTGGGCAAGGCCACTGAAGCAAAAAAACTTCTGATGGAGATGGAAGCAAAT
GGTTGCTCGCCTACTGTAGTGACCTATACTTGTTTGATTCGTGGCTTTTGCCAGTCAAAT
AACTTGGATGAAGCCATGACATTCCTTGAGGACATGAGAAGCCAAGGTATTGACCCCAAT
GTGTTCACTTATAGTTCTTTGATGGACGGCCTTTGTAAGGGTGGACGTTCCTCTGAAGCA
ATGGAGCTATTACAGATAATGATTCATGAACATAAGGTTCCCAATATGATAACTTACAGT
ACCTTAATTCACGGACTTTGTGGAGAAGGTAAAATTGGAGAAGCCTTAGAGATTTTCGAC
AGAATGAAACTTCAGGGATGTAAACCTGATGCAGGGTTATACTGGAAAATCATCAATGGC
TTTTGTGAGAATAACAAGTTTCATGAAGCAGCCAACTATCTTGATGAAATGATTCTCAGT
GGAATATCTCCAAACCGGTTAACTTGGAGCTTGCATGTGAAGATCCATAATGCAGTAGTC
CGAGGCCTGTGTGCTGTGAATGATCCAAAGCGAGCTTTTCAATTATATCTAAGCATGCGC
ACCAGAGCCATCTCAGTTGAAGCTAAATCTTTTGAGACTTTGGTCAACCATTTCTGCAAA
AAAGGAGATGTGCACAAGGTTGCTCGTATTGTCGAGGAAATGTTGACTGATGGATGCATT
CCAGATGAAAAAACATGGGCTGTTGTGGTGGGTGGATTTTGGGATAGAAGGAAAGTAAGA
GAAGCAGCTGATTCGGTACAGGCTGACCTAATGCCTAAACACATGAATTTTGAGACTTGA
TGTCTTGTTCAAGTTACTATTATGACCGCAATGCCGTTGTTAATCCATATGAATGTCAAA
CCAAAAAAATCTGGTTTTATGCATTTGCTTCACCTTCTAAGAAGATTTTTGGTAAATCAA
AACATAGTGGGCGTCTGTTGTATTTACTCTTTTTATCATGGATATTTGGTGCAAAGCGAA
GATTATTCCATGGCAACCTGGAACTCAAGGGTTTAAGTTGCAGATCAATCTTCACAGTGC
ATAGTGATTATCTTCAAATTCCATGAAGGAGTTCAGTATACACTAGCATTCTTATTTGTA
CATTCGCTTGTTAATCATTTACAGCTTCATCTGGCAAGTTAAGTGAAGAGGCAATGGAAA
TGGTTACATTGTTACATGAATGAAAAGACCAACGAAACTGTATCTCACTCTGAATGTAAA
AGAAGATGAGGATACACATGCGACAAATCTTTGGGATCAAGCATATTAGTTAGCAAGTGA
GGGGGAAGCCAATACCATGACGTTGAGTAGGAAACACCACAAACAACATACTGCAGATGA
CCCCAATTGCAACTGGCAGAGCTGTAAGCAGTTCCTGTGTTTCATATGAAGGTGTCGGAT
AGAAACAACTTACCACATTCTGATCAAACAACGCAACAGCTGCAAAAACCAATATTGACA
TGATGGCATGCATGAAATCTATAAATTTCAGCTTGTACTTTGCTGCGACTTCCAACGGGG
GTGTTGCTGATCCATCAATTATCCACAAGCCGCGTGTTGTGGCAAACCCATAGCAAATAT
TTCCTTTCTGATCCTTGAAACTATCTGTGAAGTTCAATAGGAAACATGACAGTCCACAAA
GTGCTACAAGACCAGCAGTTAAGGATCGACCAACCACATCACACTGTCCCTGATTTGTGA
ATATGGGTGATAAAAATTGAAAAGCAAGAACAGATCCAGTAGGCAGAAGATTGGCAAGAT
GGGCAGTGCTTTTAAATGTGTGGCTTATTGCTTGTTGTATCAGGTTTTTCTCCACTTCAG
GCAGTTCTGAGCTTTCAAGCAGAGGAACTTTCTCGTCATCAAGATTCCGGGGTATCTGAT
TATCTACCTTAATCTCCATAGCCTTGAAGTCTTTAGTTGGTAAGTATTAATTTGATTATC
AACTCAAATTTGTGTTTGAATTTATTGCTTGAGGATATAAATATATACCTGAAGGAATAC
AAAATAGAGTGCACTTTGGTTAATGATGCCTTACAAGAAAGAAAAACAGAAGCATCTTTT
CCGTGGTATTCTAGATTTTTTAGAATTTCAGTTACCATTTGGCTTTTGGTGCTAGATAGT
TAGAAAAGTATTTTAAAAGTTGTTTGCAGTTTCCTTTACAGTTATAGAACTCAGATTTTA
GAAATCGACGTTTTTTCAGGTATCGATTTTCAACTGAATTATGCCCCTTTTACTTGATTT
TCTGTCATAAAAGAATAAATTACTTTACCTGAAATTTGAAACTTTTAGAAAAAGCAAGTT
TGAACATTTGTTGTGTTCATCACAAGCAGCCTTTAATTGCTTTCTTGGAGGATGACGCAT
GTTTTTCTTGCTTATTTTTGTGGTAACAACTTAAGCATGATTTTACTTAAAAGTCATCTT
TTTGATTAGGTAGATTATTTAACGTAAGATGGTTCAACAAATTTGTTTTTCTTTTTTCCT
TTAGGTTGTGCTAGTTTAGTGTATAACTGTCTTTGGGCGTCAGTTTCCACGGATTCAATA
AATATACTATAGGGTAAATTAGACATCATGTGAAAATTTACCTAAAAATTAGTCTACTTA
AAAAGAAGATAAGTTTATGTCATTCTTACTAAAAAATAGATTTGCTTAGCTCTTTATC