Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g076830.1.1
CDS Infomation	Serine/threonine-protein kinase (AHRD V3.3 - A0A199VI10_ANACO)
Sequence	ATGTCTTCATATTCTTCTTTGCTTGTAATAACATTTTGTTCGTTATTCATAGTAACATTA GCTAATGTTCCTCCTTCCAAAACCTTCAAGTACACAAATGAAGGCTCATTCGGCGAATAC TCCGTTGAATACTTTGCAGATTATCGTGTATTGGACATTGTCAACTTCCCTTTCACCCTT TGTTTCTTTAATTCTACTCCAAACACCTTCATACTGGGGCTACGAATGGGTCATCGTAGA TCTGAGTCCATAATGCGATGGGTCTGGGAGGCTAATCGTGGCAACCCTGTCCGCGAAAAC GCCACTCTAACGTTTGGTATTGATGGGAATTTGGTACTAACTGATGTCGATGGCACGGTA GCTTGGCATACAAACACTGCCAACAAAGGTGTAACTGGGCTAAAACTTTTGCCCAATGGG AACTTGGTTTTACATGACAAAAATGATTTATTTGTTTGGCAAAGTTTTGATCACCCAACG GATACACTATTGGTGGGCCAAAGTTTAAGGGCTACAGGCCCATATAAGCTTGTTAGTAGA ATGTCCAGTAAAGAACCTGTTGATGGGCCTTATAGTTTTGTCCTAGAAGGGAGACATTGG GCCATGTATTATACAAGTGTAAATTCACAAAAGCCTTTACCGTATTTCAAATCAGATGAT TTTGGTAATGGGAAAGGCTCTTTAGCCAATTTTGATTTCTATTGTGAGCCAGAGTATGGT GAAAATTATGCTTTTGAGCTAGGATTTAGGATCAACATGACCAATTCTTCTAGCTCTGGT ACATCTATATTTACTAGGCCTAAATACAATAGTACATACACTATGTTTAGAGTTGATATG GATGGTAATTTAAGAATGTACACTTATGAACCAAATGTTGATTGGGGAGCATGGGAAGTA ACATATCGACTTCTCGATAGGGATAACGATGGAAATAGTGAATGCAAGCTACCGATGAGG TGTGGATCATTAGGCGTTTGCGAGGACAGCCAATGTGTGGCGTGTCCGAGCCCTCGAGGC TTGATTGGGTGGAGTAAAGGATGTGCACCACCAAAGTTGCCAGTATGTAAAGGAGGATCA AATGTGGACTATTATAAGGTGGAAGGAGTTGAACATTTTACTAGTGATTATAATGAAGGA GTTGGACCTATAAAAATAAGTGAATGCAAAAACAGGTGCAACAAAGATTGCAAATGTGTG GGCTTTTTCTACAAACAAGAGTCATCAAAGTGCTTGGTTGTACCTGAGCTTGGAGCTTTG GTTAAAGTGAACAATTCCTCCCATGTTGGCTACATCAAGATCTCAAAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g076830.1.1
PEP Infomation	Serine/threonine-protein kinase (AHRD V3.3 - A0A199VI10_ANACO)
Sequence	MSSYSSLLVITFCSLFIVTLANVPPSKTFKYTNEGSFGEYSVEYFADYRVLDIVNFPFTL CFFNSTPNTFILGLRMGHRRSESIMRWVWEANRGNPVRENATLTFGIDGNLVLTDVDGTV AWHTNTANKGVTGLKLLPNGNLVLHDKNDLFVWQSFDHPTDTLLVGQSLRATGPYKLVSR MSSKEPVDGPYSFVLEGRHWAMYYTSVNSQKPLPYFKSDDFGNGKGSLANFDFYCEPEYG ENYAFELGFRINMTNSSSSGTSIFTRPKYNSTYTMFRVDMDGNLRMYTYEPNVDWGAWEV TYRLLDRDNDGNSECKLPMRCGSLGVCEDSQCVACPSPRGLIGWSKGCAPPKLPVCKGGS NVDYYKVEGVEHFTSDYNEGVGPIKISECKNRCNKDCKCVGFFYKQESSKCLVVPELGAL VKVNNSSHVGYIKISK*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g076830.1.1
Transcript Infomation	Serine/threonine-protein kinase (AHRD V3.3 - A0A199VI10_ANACO)
Sequence	ATGTCTTCATATTCTTCTTTGCTTGTAATAACATTTTGTTCGTTATTCATAGTAACATTA GCTAATGTTCCTCCTTCCAAAACCTTCAAGTACACAAATGAAGGCTCATTCGGCGAATAC TCCGTTGAATACTTTGCAGATTATCGTGTATTGGACATTGTCAACTTCCCTTTCACCCTT TGTTTCTTTAATTCTACTCCAAACACCTTCATACTGGGGCTACGAATGGGTCATCGTAGA TCTGAGTCCATAATGCGATGGGTCTGGGAGGCTAATCGTGGCAACCCTGTCCGCGAAAAC GCCACTCTAACGTTTGGTATTGATGGGAATTTGGTACTAACTGATGTCGATGGCACGGTA GCTTGGCATACAAACACTGCCAACAAAGGTGTAACTGGGCTAAAACTTTTGCCCAATGGG AACTTGGTTTTACATGACAAAAATGATTTATTTGTTTGGCAAAGTTTTGATCACCCAACG GATACACTATTGGTGGGCCAAAGTTTAAGGGCTACAGGCCCATATAAGCTTGTTAGTAGA ATGTCCAGTAAAGAACCTGTTGATGGGCCTTATAGTTTTGTCCTAGAAGGGAGACATTGG GCCATGTATTATACAAGTGTAAATTCACAAAAGCCTTTACCGTATTTCAAATCAGATGAT TTTGGTAATGGGAAAGGCTCTTTAGCCAATTTTGATTTCTATTGTGAGCCAGAGTATGGT GAAAATTATGCTTTTGAGCTAGGATTTAGGATCAACATGACCAATTCTTCTAGCTCTGGT ACATCTATATTTACTAGGCCTAAATACAATAGTACATACACTATGTTTAGAGTTGATATG GATGGTAATTTAAGAATGTACACTTATGAACCAAATGTTGATTGGGGAGCATGGGAAGTA ACATATCGACTTCTCGATAGGGATAACGATGGAAATAGTGAATGCAAGCTACCGATGAGG TGTGGATCATTAGGCGTTTGCGAGGACAGCCAATGTGTGGCGTGTCCGAGCCCTCGAGGC TTGATTGGGTGGAGTAAAGGATGTGCACCACCAAAGTTGCCAGTATGTAAAGGAGGATCA AATGTGGACTATTATAAGGTGGAAGGAGTTGAACATTTTACTAGTGATTATAATGAAGGA GTTGGACCTATAAAAATAAGTGAATGCAAAAACAGGTGCAACAAAGATTGCAAATGTGTG GGCTTTTTCTACAAACAAGAGTCATCAAAGTGCTTGGTTGTACCTGAGCTTGGAGCTTTG GTTAAAGTGAACAATTCCTCCCATGTTGGCTACATCAAGATCTCAAAGTAG