Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g072393.1.1
CDS Infomation	Receptor-kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9RVA8_RICCO)
Sequence	ATGGAGAAATATCCCTCTTTTCAGCTTCTAACAATTTTGTTCCTTCTTCTTCATGTTCTA GCAACTTGCTTAGCCATGAATATTACAACTGATCAAACTTCTCTTCTCGCGTTGAAATAC CAAATCACTTCAGACCCTTATCAAATTATTTCAACAAACTGGTCTTCTTCTGTCTCTGTT TGTAACTGGATTGGCGTCACTTGTGGCTCTCGTCATCAACGAGTTACTGTACTTAATATT TCAGACATGGGATTTTCGGGTACCATCCCGTCACAACTTGGTGAACTCTCTTTTCTCGTT TCACTTGATCTAAGCTACAACAGTTTCCATGGTGAACTTCCACCTGAGTTTTCTCGTTTG CGAAAATTGAGAGCTATTAATCTTAGTTTCAACAACTTCACTGGAAATATTCCTAGATTT CTCGGTGATTTTCAAGACCTTCAGATTTTCAACATTGAAAACAATAGTTTCAGTGGGTTC ATTCCTTCTTCTATCTCAAACATGACGAATCTTGGATTCCTGAATCTGAGGTACAACAAT TTGGAAGGAAATATTCCAGCTGGAATAGCCGTTCTTCGGAGTTTGAAATGGTTGAGTTTT GGATTTAGTAAACTCAATGGTTCCAATGTGCTCACTATGTTCAACATCTCGATACTAGAA TATTTAGATCTCAGAAATGCAGGATTAACTGGTGATTTTCCATCTGATTTGTGTCGTCGC CTTCCAAGATTGCAAAAACTTGGACTTAATTTCAATAGGTTAAGTGGAGAGATCCCAAGA CGTATATCAGAATGCTCGCAGCTTCAAGTCTTACTGTTGATGGAAAATAATTTGATTGGA ACAATTCCAGGAGAACTTGGGAACTTACAACTGCTGCAACAATTAGCTCTCGGAAATAAT AAGTTAGAAGGTACAATTCCGAATGAGATTGGTCATCTTTATAACTTGAAGCAATTGGGA TTGGAACAAAATGCATTAACAGGCTCGATCCCAGTAAGCATATTCAGTATTTCATCACTT CAAGTTTTATCAATGTGGGACAACAAGCTTGAAGGGCCTCTACCAAGAGAGGTTGGAAAT TTGACTATGGTTAACGTACTTGATCTTGGAATGAATAGCCTGATGGGCGTACTTCCAGAT GAAATCGGTAACCTTCAAGAGTTGTTGATGCTGAAGTTGGATTTCAATGACTTTAGTGGG TCGATCCCTGTTGGTATATTTAATGGCTCAACTCTTGTATCTATTACACTCACACAAAAC CGCATTTCAGGTAATCTTCCCAACACTATAGGCAGGGGGTCACCCAATCTTGAACGAATT TTTCTAGGTGCAAATAACATTGATGGTCTTTTACCTAGTTCCATTTCAAATTTGTCTAAG CTTACTGTACTCGAACTTAGTGCAAATGCACTCACAGGTTCAATTCCTGACTTTCTAGGA AACTTAGGACTTATTGAAATTCTCAACTTGCAAGGTAACTTCTTCACTAGTGACTCTTCA ATGTTGAGTTTTATTACTCCTTTGGCCAATTGTAAACACTTAAGAGAACTGATATTGTCT ATCAATCCCCTAAATGCAATACTTCCAAAATCCATAGGGAATCTTTCTTCTCTTCAGACG TTTGAGGCAATAGGTTGTAATCTCAAAGGCCATATTCCAAATGAAATTGGAAATTTGAGA AATTTATCTTATTTGAAGCTGGATAAAAATGACTTTACTGGAATTGTCCCGACGACAATA AGTTCTTTGGAAAAACTTCAACAGTTTTCACTTGGTACAAACAGAATAAGTGGTCCTTTC CCAATTGTTGTATGTGAGCTACCCAACTTGGGCTTGCTAAACCTTTCACAAAACCAAATG TGGGGAAATATTCCTAGTTGTTTAGGGAATGTGACTTCTCTAAGGGAGATTTATCTTGAT TCCAATAAATTCACTGCCAGCATACCTTCAAGTCTATGGAACCTCAAAGACATTTTGAAG CTGAACTTGTCTTCTAATTTCTTCAATGGCTCTCTACCACTAGAAGTTGGAAATCTCAAG GCAGCAATAATTCTGGATCTTTCCAGGAACCAAATTTCAGGGAACATTCCTAGTACATTG GGAGGTTTGCAGAAATTGATTCAGCTATCTTTGGCTCAAAACAGAATTGAAGGATTTATT CCTGAAACATTCGGGGAACTCATAAGTTTGGAAGCATTGGATCTTTCAAATAACAATATT TCCGGTGTGATTCCAAAGTCATTAGAGGCACTCAAGCAACTACACTCCTTTAATGTCTCA TTCAACAGGTTACACGGGGAAATCCCGAGTGGTGGACCTTTTCTTAATCTCCCTTACCAG TCTTTCTTGTCGAATGAAGGATTGTGTGGTAATCCTCAAAAGCATGTCCCAGCTTGTCGT TCAAATTCAAAGAATCATTCCAATTCAAAGAAACGAAGAATAATATGGATTGTAGTTGTC TCTTCAGTTATCTCTATTATAGGGCTTGCTTCAGCAATAATTTTCGTGTTAATGCGACGT CAGGGTAAAGTAATCAAAGCTGAAGATGAGTGGTCTCCTGAGGTAGCACCACAGAGATTT TCTTACTATGAACTTCAAAGAGCAACTCAGGGGTTTGATGAAAATAACTTGCTAGGTAGT GGAGGTTTTGGTTCTGTTTTTAAAGGGACGTTGGCAGATGGGATGATACTAGCTGTCAAA GTTTTTAATGTGCAGATGGAAGGTACATTTCAAACCTTTGATAGAGAATGTGAAATCTTG AGGAATCTTCGTCACAGAAATCTCACAAAGATCATTAGCAGCTGTTGTAACTTGGATTTT AAAGCATTGGTACTTGAGTACATGCCAAATGGGAGCTTAGACAAGTTGCTATATTCTCGA GAGTATTCTCTAAATATAATGCAGCGATTGAATATCTTGGTCGATGTTGCATCCGCTCTG GAATATCTCCATCATGGTTACTCTGTACCTGTTATTCATTGTGATCTGAAGCCTAGCAAC GTCTTACTTGACAAAGACATGGTAGGACACCTAACTGACTTTGGCATTGCAAAACTTCTA ACAAAAGAGGAATCTATTGCTCACACTACAACCTTTGCCACAATTGGCTACATTGCTCCA GAATATGGGTTGGAAGGCCTTATATCCAAGAGGTCTGATGTTTTTAGTTATGGTATCATG TTGCTGGAAACTTTTACAAAGAAGAAACCTAATGATGAAATGTTCACGGGCGATTTGGAT TTGAAAAGCTGGGTACATAGTTCACTTCCTAATAAACTGGATGAAATCATAGATGCCGAC TTACTAACAGTAGATGAACAAAAGCTTAATGAGAACTTGGCCATGAATATTAGCACTGAT CAATCTTCTCTTCTTGCCTCGAAATCCCACATCAGTTCAGACCCTTTTCACATTCTTTCG ACGAACTGGTCTTCATCTACCTCTGTTTGTGATTGGATTGGAATCACTTGTAGCTCTCGT CATCAACGAGTGATTGCACTGAATATTTCAAACATGGGTTTTTCGGGTACTATCCCGCCA CAACTTGGCAACCTCTCCTTTCTTGTTTCACTTGATCTAAGCAAAAACAATTTCCGTACT GTAACTGGTATTCTTCGTGAACTTCCATCAGAATTTTCTCATTTACGGAGATTGAGAGTC ATTAATCTTAGTTACACCAACTTCCGGAGAAATTCAATAGGAATAGCCACTCTTCCGAGT TTGATACGGTTTTCCATGGGATACAATAAATTACTCAATGGCTCCAATGTGCTTTCTAAA TTCAGCATCTCAACACTTGAATATTTGGATCTCAGGAATTCTGGTTTAACTGGTGATTTC CCTTCTGATTTATGTCACCGTCTTCCTAGATTGCGAAATCTTGCACTCGGCAACAACATG TTAAGCGGAGAGGTACCAAGAAACATATCTGAATGCCAGAGCTTCAACTCCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g072393.1.1
PEP Infomation	Receptor-kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9RVA8_RICCO)
Sequence	MEKYPSFQLLTILFLLLHVLATCLAMNITTDQTSLLALKYQITSDPYQIISTNWSSSVSV CNWIGVTCGSRHQRVTVLNISDMGFSGTIPSQLGELSFLVSLDLSYNSFHGELPPEFSRL RKLRAINLSFNNFTGNIPRFLGDFQDLQIFNIENNSFSGFIPSSISNMTNLGFLNLRYNN LEGNIPAGIAVLRSLKWLSFGFSKLNGSNVLTMFNISILEYLDLRNAGLTGDFPSDLCRR LPRLQKLGLNFNRLSGEIPRRISECSQLQVLLLMENNLIGTIPGELGNLQLLQQLALGNN KLEGTIPNEIGHLYNLKQLGLEQNALTGSIPVSIFSISSLQVLSMWDNKLEGPLPREVGN LTMVNVLDLGMNSLMGVLPDEIGNLQELLMLKLDFNDFSGSIPVGIFNGSTLVSITLTQN RISGNLPNTIGRGSPNLERIFLGANNIDGLLPSSISNLSKLTVLELSANALTGSIPDFLG NLGLIEILNLQGNFFTSDSSMLSFITPLANCKHLRELILSINPLNAILPKSIGNLSSLQT FEAIGCNLKGHIPNEIGNLRNLSYLKLDKNDFTGIVPTTISSLEKLQQFSLGTNRISGPF PIVVCELPNLGLLNLSQNQMWGNIPSCLGNVTSLREIYLDSNKFTASIPSSLWNLKDILK LNLSSNFFNGSLPLEVGNLKAAIILDLSRNQISGNIPSTLGGLQKLIQLSLAQNRIEGFI PETFGELISLEALDLSNNNISGVIPKSLEALKQLHSFNVSFNRLHGEIPSGGPFLNLPYQ SFLSNEGLCGNPQKHVPACRSNSKNHSNSKKRRIIWIVVVSSVISIIGLASAIIFVLMRR QGKVIKAEDEWSPEVAPQRFSYYELQRATQGFDENNLLGSGGFGSVFKGTLADGMILAVK VFNVQMEGTFQTFDRECEILRNLRHRNLTKIISSCCNLDFKALVLEYMPNGSLDKLLYSR EYSLNIMQRLNILVDVASALEYLHHGYSVPVIHCDLKPSNVLLDKDMVGHLTDFGIAKLL TKEESIAHTTTFATIGYIAPEYGLEGLISKRSDVFSYGIMLLETFTKKKPNDEMFTGDLD LKSWVHSSLPNKLDEIIDADLLTVDEQKLNENLAMNISTDQSSLLASKSHISSDPFHILS TNWSSSTSVCDWIGITCSSRHQRVIALNISNMGFSGTIPPQLGNLSFLVSLDLSKNNFRT VTGILRELPSEFSHLRRLRVINLSYTNFRRNSIGIATLPSLIRFSMGYNKLLNGSNVLSK FSISTLEYLDLRNSGLTGDFPSDLCHRLPRLRNLALGNNMLSGEVPRNISECQSFNS*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g072393.1.1
Transcript Infomation	Receptor-kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9RVA8_RICCO)
Sequence	ATGGAGAAATATCCCTCTTTTCAGCTTCTAACAATTTTGTTCCTTCTTCTTCATGTTCTA GCAACTTGCTTAGCCATGAATATTACAACTGATCAAACTTCTCTTCTCGCGTTGAAATAC CAAATCACTTCAGACCCTTATCAAATTATTTCAACAAACTGGTCTTCTTCTGTCTCTGTT TGTAACTGGATTGGCGTCACTTGTGGCTCTCGTCATCAACGAGTTACTGTACTTAATATT TCAGACATGGGATTTTCGGGTACCATCCCGTCACAACTTGGTGAACTCTCTTTTCTCGTT TCACTTGATCTAAGCTACAACAGTTTCCATGGTGAACTTCCACCTGAGTTTTCTCGTTTG CGAAAATTGAGAGCTATTAATCTTAGTTTCAACAACTTCACTGGAAATATTCCTAGATTT CTCGGTGATTTTCAAGACCTTCAGATTTTCAACATTGAAAACAATAGTTTCAGTGGGTTC ATTCCTTCTTCTATCTCAAACATGACGAATCTTGGATTCCTGAATCTGAGGTACAACAAT TTGGAAGGAAATATTCCAGCTGGAATAGCCGTTCTTCGGAGTTTGAAATGGTTGAGTTTT GGATTTAGTAAACTCAATGGTTCCAATGTGCTCACTATGTTCAACATCTCGATACTAGAA TATTTAGATCTCAGAAATGCAGGATTAACTGGTGATTTTCCATCTGATTTGTGTCGTCGC CTTCCAAGATTGCAAAAACTTGGACTTAATTTCAATAGGTTAAGTGGAGAGATCCCAAGA CGTATATCAGAATGCTCGCAGCTTCAAGTCTTACTGTTGATGGAAAATAATTTGATTGGA ACAATTCCAGGAGAACTTGGGAACTTACAACTGCTGCAACAATTAGCTCTCGGAAATAAT AAGTTAGAAGGTACAATTCCGAATGAGATTGGTCATCTTTATAACTTGAAGCAATTGGGA TTGGAACAAAATGCATTAACAGGCTCGATCCCAGTAAGCATATTCAGTATTTCATCACTT CAAGTTTTATCAATGTGGGACAACAAGCTTGAAGGGCCTCTACCAAGAGAGGTTGGAAAT TTGACTATGGTTAACGTACTTGATCTTGGAATGAATAGCCTGATGGGCGTACTTCCAGAT GAAATCGGTAACCTTCAAGAGTTGTTGATGCTGAAGTTGGATTTCAATGACTTTAGTGGG TCGATCCCTGTTGGTATATTTAATGGCTCAACTCTTGTATCTATTACACTCACACAAAAC CGCATTTCAGGTAATCTTCCCAACACTATAGGCAGGGGGTCACCCAATCTTGAACGAATT TTTCTAGGTGCAAATAACATTGATGGTCTTTTACCTAGTTCCATTTCAAATTTGTCTAAG CTTACTGTACTCGAACTTAGTGCAAATGCACTCACAGGTTCAATTCCTGACTTTCTAGGA AACTTAGGACTTATTGAAATTCTCAACTTGCAAGGTAACTTCTTCACTAGTGACTCTTCA ATGTTGAGTTTTATTACTCCTTTGGCCAATTGTAAACACTTAAGAGAACTGATATTGTCT ATCAATCCCCTAAATGCAATACTTCCAAAATCCATAGGGAATCTTTCTTCTCTTCAGACG TTTGAGGCAATAGGTTGTAATCTCAAAGGCCATATTCCAAATGAAATTGGAAATTTGAGA AATTTATCTTATTTGAAGCTGGATAAAAATGACTTTACTGGAATTGTCCCGACGACAATA AGTTCTTTGGAAAAACTTCAACAGTTTTCACTTGGTACAAACAGAATAAGTGGTCCTTTC CCAATTGTTGTATGTGAGCTACCCAACTTGGGCTTGCTAAACCTTTCACAAAACCAAATG TGGGGAAATATTCCTAGTTGTTTAGGGAATGTGACTTCTCTAAGGGAGATTTATCTTGAT TCCAATAAATTCACTGCCAGCATACCTTCAAGTCTATGGAACCTCAAAGACATTTTGAAG CTGAACTTGTCTTCTAATTTCTTCAATGGCTCTCTACCACTAGAAGTTGGAAATCTCAAG GCAGCAATAATTCTGGATCTTTCCAGGAACCAAATTTCAGGGAACATTCCTAGTACATTG GGAGGTTTGCAGAAATTGATTCAGCTATCTTTGGCTCAAAACAGAATTGAAGGATTTATT CCTGAAACATTCGGGGAACTCATAAGTTTGGAAGCATTGGATCTTTCAAATAACAATATT TCCGGTGTGATTCCAAAGTCATTAGAGGCACTCAAGCAACTACACTCCTTTAATGTCTCA TTCAACAGGTTACACGGGGAAATCCCGAGTGGTGGACCTTTTCTTAATCTCCCTTACCAG TCTTTCTTGTCGAATGAAGGATTGTGTGGTAATCCTCAAAAGCATGTCCCAGCTTGTCGT TCAAATTCAAAGAATCATTCCAATTCAAAGAAACGAAGAATAATATGGATTGTAGTTGTC TCTTCAGTTATCTCTATTATAGGGCTTGCTTCAGCAATAATTTTCGTGTTAATGCGACGT CAGGGTAAAGTAATCAAAGCTGAAGATGAGTGGTCTCCTGAGGTAGCACCACAGAGATTT TCTTACTATGAACTTCAAAGAGCAACTCAGGGGTTTGATGAAAATAACTTGCTAGGTAGT GGAGGTTTTGGTTCTGTTTTTAAAGGGACGTTGGCAGATGGGATGATACTAGCTGTCAAA GTTTTTAATGTGCAGATGGAAGGTACATTTCAAACCTTTGATAGAGAATGTGAAATCTTG AGGAATCTTCGTCACAGAAATCTCACAAAGATCATTAGCAGCTGTTGTAACTTGGATTTT AAAGCATTGGTACTTGAGTACATGCCAAATGGGAGCTTAGACAAGTTGCTATATTCTCGA GAGTATTCTCTAAATATAATGCAGCGATTGAATATCTTGGTCGATGTTGCATCCGCTCTG GAATATCTCCATCATGGTTACTCTGTACCTGTTATTCATTGTGATCTGAAGCCTAGCAAC GTCTTACTTGACAAAGACATGGTAGGACACCTAACTGACTTTGGCATTGCAAAACTTCTA ACAAAAGAGGAATCTATTGCTCACACTACAACCTTTGCCACAATTGGCTACATTGCTCCA GAATATGGGTTGGAAGGCCTTATATCCAAGAGGTCTGATGTTTTTAGTTATGGTATCATG TTGCTGGAAACTTTTACAAAGAAGAAACCTAATGATGAAATGTTCACGGGCGATTTGGAT TTGAAAAGCTGGGTACATAGTTCACTTCCTAATAAACTGGATGAAATCATAGATGCCGAC TTACTAACAGTAGATGAACAAAAGCTTAATGAGAACTTGGCCATGAATATTAGCACTGAT CAATCTTCTCTTCTTGCCTCGAAATCCCACATCAGTTCAGACCCTTTTCACATTCTTTCG ACGAACTGGTCTTCATCTACCTCTGTTTGTGATTGGATTGGAATCACTTGTAGCTCTCGT CATCAACGAGTGATTGCACTGAATATTTCAAACATGGGTTTTTCGGGTACTATCCCGCCA CAACTTGGCAACCTCTCCTTTCTTGTTTCACTTGATCTAAGCAAAAACAATTTCCGTACT GTAACTGGTATTCTTCGTGAACTTCCATCAGAATTTTCTCATTTACGGAGATTGAGAGTC ATTAATCTTAGTTACACCAACTTCCGGAGAAATTCAATAGGAATAGCCACTCTTCCGAGT TTGATACGGTTTTCCATGGGATACAATAAATTACTCAATGGCTCCAATGTGCTTTCTAAA TTCAGCATCTCAACACTTGAATATTTGGATCTCAGGAATTCTGGTTTAACTGGTGATTTC CCTTCTGATTTATGTCACCGTCTTCCTAGATTGCGAAATCTTGCACTCGGCAACAACATG TTAAGCGGAGAGGTACCAAGAAACATATCTGAATGCCAGAGCTTCAACTCCTAA