Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g072010.2.1
CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JSM9_CYNCS)
Sequence

ATGGCGGCAACTTCCCCAACACCATCAACCCTCTCATCCTTCTTAGAGATGGCGAATTCC
ATCTCCGAACTCCACCAAGCTCACGCTGTCATGCTCAAAACTGGTCTCTTTCGTGACCCT
TTTGCTGCCAGTCGCCTCTTGACTAAAGCCACTGTTCTTCCCTTATCTTCCACTGAAACC
CTTTCATATGCACTCTCTGTTTTCACTCACATTGAAGAACCCAACTCATATATCTACAAC
ACTATCATCCGTGCTTATTCCACTAGCCCCTTTCCACAACTAGCACTTATTATCTTCCTC
AAAATGTTAAACTCTGTAAATAAAGTTTTCCCAGATAAGTACACTTTAACATTTATTGTA
AAAGCTTGTGCTACTATGGAAAATGCTAAACAAGGTGAACAAGTTCATGGGTTGGTGACA
AAAATTGGACTTGAGGAAGATGTGTATGTATACAACACTTTGGTTCATATGTATGCGAAA
TGTGGGTGTTTTGGAGTTTCGCGTGGTATGATTGATGGGTTGATTGAAGATGATGTTATA
GCATGGAATGCATTGTTGAGTGTGTATGCAGAAAGGGGGTTGTTTGAATTGGCGCGTGAG
TTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAAAATGTGGAGTCTTGGAATTTTATGGTTTCTGGGTAT
GTGAATGTTGGGTTGGTGGATGAAGCAAGGAAGGTGTTTGATGAAATGTTGGTGAAAGAT
GTTGTGTCTTGGAATGTAATGATTACTGGTTATACTAAGGCTGATAAGTTTAATGAAGTT
TTGACTTCTTTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g072010.2.1
PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JSM9_CYNCS)
Sequence

MAATSPTPSTLSSFLEMANSISELHQAHAVMLKTGLFRDPFAASRLLTKATVLPLSSTET
LSYALSVFTHIEEPNSYIYNTIIRAYSTSPFPQLALIIFLKMLNSVNKVFPDKYTLTFIV
KACATMENAKQGEQVHGLVTKIGLEEDVYVYNTLVHMYAKCGCFGVSRGMIDGLIEDDVI
AWNALLSVYAERGLFELARELFDEMPVKNVESWNFMVSGYVNVGLVDEARKVFDEMLVKD
VVSWNVMITGYTKADKFNEVLTSF*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g072010.2.1
Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JSM9_CYNCS)
Sequence

ATGGCGGCAACTTCCCCAACACCATCAACCCTCTCATCCTTCTTAGAGATGGCGAATTCC
ATCTCCGAACTCCACCAAGCTCACGCTGTCATGCTCAAAACTGGTCTCTTTCGTGACCCT
TTTGCTGCCAGTCGCCTCTTGACTAAAGCCACTGTTCTTCCCTTATCTTCCACTGAAACC
CTTTCATATGCACTCTCTGTTTTCACTCACATTGAAGAACCCAACTCATATATCTACAAC
ACTATCATCCGTGCTTATTCCACTAGCCCCTTTCCACAACTAGCACTTATTATCTTCCTC
AAAATGTTAAACTCTGTAAATAAAGTTTTCCCAGATAAGTACACTTTAACATTTATTGTA
AAAGCTTGTGCTACTATGGAAAATGCTAAACAAGGTGAACAAGTTCATGGGTTGGTGACA
AAAATTGGACTTGAGGAAGATGTGTATGTATACAACACTTTGGTTCATATGTATGCGAAA
TGTGGGTGTTTTGGAGTTTCGCGTGGTATGATTGATGGGTTGATTGAAGATGATGTTATA
GCATGGAATGCATTGTTGAGTGTGTATGCAGAAAGGGGGTTGTTTGAATTGGCGCGTGAG
TTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAAAATGTGGAGTCTTGGAATTTTATGGTTTCTGGGTAT
GTGAATGTTGGGTTGGTGGATGAAGCAAGGAAGGTGTTTGATGAAATGTTGGTGAAAGAT
GTTGTGTCTTGGAATGTAATGATTACTGGTTATACTAAGGCTGATAAGTTTAATGAAGTT
TTGACTTCTTTTTGA