Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g071900.3.1
CDS Infomation

Seipin (AHRD V3.3 *** A0A151RDH9_CAJCA)
Sequence

ATGGAAGATACAAAACCAAAAAAGCAAGCCAACAACGGAGACTTATTTGATGATGCGGCG
GACGAATTCCCCTTCGACGATTGCAGCGACATATTTTCCGACGCCGAAACCGGCGGATCG
GAGGATGACGTAAACCTTAATCAATCCGTGGAAAATGACAATTTACCGTTGTCTTCTCTC
CGGCATCGGCGACCTTTTTCTTTCAATGATTCTGGTAACGAGTCGACTAATTTTCGACCT
TTCATAAGTTCCGAGAGTTATTCGAATTCGAGAGAGCGAAAGATAAATTTCTCAAGGAAA
TTTATGGCAGAAGATAAGGATAAGAATGGAAGTTTGGACAATATAGAAAGTTCGAACTCA
ATGCAGCTTGACTTGAGCACAAAAAGTCAAAAAGGTATAGGTGATGAACAAAATAAGGAG
ATTCCAACAGGTATGAATGCAAATAGTGTAATAATAGATAATTCGAATGAGGATTCTTCA
CTGCTGAAAGAGGATTCTGTAATTACTCATGTAAACAATGACGAAACCGATAATTCGGAG
GAAGTTAATTCACATTTCAGAGAAATTGATGATTCAAGTTCGAATATTTTGTTTGATTTA
GCGAATTTAGTCATAAAATCTGTTGGATATCAAGTGAATATGTTGATAACTATTGTGAGT
TTGATGATAAAGTTGTTTACATTTCCTGTATGGATAATATATTGCTCTTATATGTTTGTG
ATGGATCCATTTCAAATAATGAGGCGTGTGAAACGATATGTACTACACAGGTTTATGAGG
AGTTTTGGGTTTGTGTTTGAGAATACGTTGAAATTTGTTTCTAGATGGTTGAAGGAGCAG
AGTTCAGTATGGAGGTTGGGGCTACAACTTGGATGGGGATGCTTGTGGTCTGTGTATGTT
TGTTTTGTGTTGGTTGGATTGCTGGTATCGGCTTTTATAATGGGTGGCATCTTGATAAGA
ATTATGGTGGAAGAGCCTATCAGGATGAACGAGCCTTTGAATTTTGATTATACAGCAAAG
AGCCCAGTTGCATATGTGCCGATAATAAGGAGTCCAGGTGTGACCTGTGGTGTAGATAGT
CAAGTGGAGGTTGGAATGGTTGATGGGGTGCGAGTTATCCCACCTAATCATAAGTTGCAG
GTTACTGTTTCCCTAATGTTGCCCGAGTCAGATTACAACAGAAATTTGGGCATTTTTCAG
GTTCGGGTTGATTTCCTCACTTCTAATGGTAAAGTGCTATCTAGCGCCAGGCGACCTTGT
ATGTTGCAATTCAAAAGCAATCCTATACGCCTTTTTTCTACTTTTCTTAAAGCTGCCCCT
CTTGTCACTGGATATACATCAGAATCCCAAAAGTTAAAGGTAGACTTAAAGGGCTTCACT
GAAGGTTTCATTCCAACTGCATGCTTGAGGGTGATCATTGAGCAACGAGCTGAATTCCAC
CCTGGAGGTGGAGTTCCCGAAATATATACTGCCTCTTTAACACTGGAGTCTGAACTTCCT
TTTATTAAAAGAATGCTATGGTATTGGAAGACAACATTATTTGTGTGGGTTAGCATGACA
TTGTTTACAATGGAATTCCTTTTCGCTCTTCTTTGCTGCAAACCTCTTATCATTCCAAGT
TTACGATTGCGGCATCACTCAAACAGTCGTACAGGTTCACCGAACAATGCACCTATTGGA
AGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g071900.3.1
PEP Infomation

Seipin (AHRD V3.3 *** A0A151RDH9_CAJCA)
Sequence

MEDTKPKKQANNGDLFDDAADEFPFDDCSDIFSDAETGGSEDDVNLNQSVENDNLPLSSL
RHRRPFSFNDSGNESTNFRPFISSESYSNSRERKINFSRKFMAEDKDKNGSLDNIESSNS
MQLDLSTKSQKGIGDEQNKEIPTGMNANSVIIDNSNEDSSLLKEDSVITHVNNDETDNSE
EVNSHFREIDDSSSNILFDLANLVIKSVGYQVNMLITIVSLMIKLFTFPVWIIYCSYMFV
MDPFQIMRRVKRYVLHRFMRSFGFVFENTLKFVSRWLKEQSSVWRLGLQLGWGCLWSVYV
CFVLVGLLVSAFIMGGILIRIMVEEPIRMNEPLNFDYTAKSPVAYVPIIRSPGVTCGVDS
QVEVGMVDGVRVIPPNHKLQVTVSLMLPESDYNRNLGIFQVRVDFLTSNGKVLSSARRPC
MLQFKSNPIRLFSTFLKAAPLVTGYTSESQKLKVDLKGFTEGFIPTACLRVIIEQRAEFH
PGGGVPEIYTASLTLESELPFIKRMLWYWKTTLFVWVSMTLFTMEFLFALLCCKPLIIPS
LRLRHHSNSRTGSPNNAPIGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g071900.3.1
Transcript Infomation

Seipin (AHRD V3.3 *** A0A151RDH9_CAJCA)
Sequence

AACCCCATACTCCAAAACAATAGAGTCCAGAATTGTTGATTTTCGTTTGTTATGGAAGAT
ACAAAACCAAAAAAGCAAGCCAACAACGGAGACTTATTTGATGATGCGGCGGACGAATTC
CCCTTCGACGATTGCAGCGACATATTTTCCGACGCCGAAACCGGCGGATCGGAGGATGAC
GTAAACCTTAATCAATCCGTGGAAAATGACAATTTACCGTTGTCTTCTCTCCGGCATCGG
CGACCTTTTTCTTTCAATGATTCTGGTAACGAGTCGACTAATTTTCGACCTTTCATAAGT
TCCGAGAGTTATTCGAATTCGAGAGAGCGAAAGATAAATTTCTCAAGGAAATTTATGGCA
GAAGATAAGGATAAGAATGGAAGTTTGGACAATATAGAAAGTTCGAACTCAATGCAGCTT
GACTTGAGCACAAAAAGTCAAAAAGGTATAGGTGATGAACAAAATAAGGAGATTCCAACA
GGTATGAATGCAAATAGTGTAATAATAGATAATTCGAATGAGGATTCTTCACTGCTGAAA
GAGGATTCTGTAATTACTCATGTAAACAATGACGAAACCGATAATTCGGAGGAAGTTAAT
TCACATTTCAGAGAAATTGATGATTCAAGTTCGAATATTTTGTTTGATTTAGCGAATTTA
GTCATAAAATCTGTTGGATATCAAGTGAATATGTTGATAACTATTGTGAGTTTGATGATA
AAGTTGTTTACATTTCCTGTATGGATAATATATTGCTCTTATATGTTTGTGATGGATCCA
TTTCAAATAATGAGGCGTGTGAAACGATATGTACTACACAGGTTTATGAGGAGTTTTGGG
TTTGTGTTTGAGAATACGTTGAAATTTGTTTCTAGATGGTTGAAGGAGCAGAGTTCAGTA
TGGAGGTTGGGGCTACAACTTGGATGGGGATGCTTGTGGTCTGTGTATGTTTGTTTTGTG
TTGGTTGGATTGCTGGTATCGGCTTTTATAATGGGTGGCATCTTGATAAGAATTATGGTG
GAAGAGCCTATCAGGATGAACGAGCCTTTGAATTTTGATTATACAGCAAAGAGCCCAGTT
GCATATGTGCCGATAATAAGGAGTCCAGGTGTGACCTGTGGTGTAGATAGTCAAGTGGAG
GTTGGAATGGTTGATGGGGTGCGAGTTATCCCACCTAATCATAAGTTGCAGGTTACTGTT
TCCCTAATGTTGCCCGAGTCAGATTACAACAGAAATTTGGGCATTTTTCAGGTTCGGGTT
GATTTCCTCACTTCTAATGGTAAAGTGCTATCTAGCGCCAGGCGACCTTGTATGTTGCAA
TTCAAAAGCAATCCTATACGCCTTTTTTCTACTTTTCTTAAAGCTGCCCCTCTTGTCACT
GGATATACATCAGAATCCCAAAAGTTAAAGGTAGACTTAAAGGGCTTCACTGAAGGTTTC
ATTCCAACTGCATGCTTGAGGGTGATCATTGAGCAACGAGCTGAATTCCACCCTGGAGGT
GGAGTTCCCGAAATATATACTGCCTCTTTAACACTGGAGTCTGAACTTCCTTTTATTAAA
AGAATGCTATGGTATTGGAAGACAACATTATTTGTGTGGGTTAGCATGACATTGTTTACA
ATGGAATTCCTTTTCGCTCTTCTTTGCTGCAAACCTCTTATCATTCCAAGTTTACGATTG
CGGCATCACTCAAACAGTCGTACAGGTTCACCGAACAATGCACCTATTGGAAGGTAGTAA
AAGCTTATGGTTTGATCTCTTGAATCATGCTGCCATTTCTTTTTTGTTTGTACATAACAG
GTAATTGTCGGTTTATTCTTTTTCCCCAAGTGTAACTCATTTTAACATGTATGCATAGTC
AATGGTTTTTATTTTTTCTCTGGAAATGTACACCCTCTCATGAGCTTTCAGTTTCTTTGA