Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g071300.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GEI5_THECC)
Sequence	ATGCCTAATTATGTTGTTCCCCGTTGCTATATCTCAAGATCTATAATTGGTTTAGCAAGA TTCTACAGAGTAGCTAGCCCCACTTGCTATTCAATTCTATCTGAGCACCTAAAGAACCAA CGAATTGATGAAGCTAAAGAGCTTTTTGAAAGAATCCCATCTCCAAATATCTATTTATGC ACCAAAATGATAGCTGGGTATGCCGAAAATCTAAGGTTGAATGAGGCACTGCAGCTGTTT GACAAAATGCCTGTCAAAGATACGGTTATGTGGAACTTGATGATTAAAGGGTGTGTAGAG TGTGGGAATACGGAGATGGGTTTGAAGCTATTTGAAGAAATGACCCAAAGAAATGTAGTT TCGTACACAACGATGATTAGCGGGTATTTGAAGTTTGGAAAGGTTGAAGAGGCTGAGAGT TTGTTTTCGGAGATGCCACAAAGGGATGTGGCAGCTTGGAATGCTATGCTTTATGGGTAT TTTGAGAATGGAAGAGTTGAAGAGGCTGTTAAGTTGTTTGAGCTAATGCCTTATAGGAAT GTGATTTCGTGGACGTCGGTTATTAGTGGGCTTGATCAGCATGGGAGGAGTGATGAGGCT CTATTGATTTTCAAGAAGATGGTAAATTTCTTTATTGAACCTACTTCTAGTACTTTTGCT TCTGTTATTACAGCTTGTGCTAATGCAAGGGATTTAGGTCTAGGTAGTGAAATTCATGCC TGTGTTGTGAAGCTTGGTTATCAGTATGATACTTATGTCACTGCTTCACTAATCACATTG TATGCTAATTGCATGCGCATGAATGATTCTTCTAAGGTATTCAGCGAGAGGTTGCATATA AATATAGTTGTATGGACGTCTCTTTTGACAGGGTATGGTTTGAATTATAAGCACAAAGAA GCATTGAAAGTGTTTGGGGACATGATTAGGATTGGTCTACTTCCCAATCAATCTTCCTTC ACTAGTGCCCTAAATTCATCCTGTGAAATGGAGTCTATTGATCTTGGCAAAGAGATTCAT GGTGTAGCAGTCAAACTGGGATTGAACACTGATGCCTTTGTTGGCAATTCACTAGTTGTA TTGTATTCAAAATGTGGAAATATAAACGATGGACTCATTGCATTCAAGGAGATCCCTGAA AAAAACACAGTTTCGTGGAACTCAACCATCGTTGGATGTGCACAACATGGATTTGGTAAT TGGGCACTCACATTATTCGCCCAGATGGTTCGTTCAAGGGCTGATATGGATGATATTACA TTTACTGGGTTACTTGCTGCTTGTAGCCATTCTGGCATGCTAGAGAAAGGAAGACGCTTA TTTCAATATATCCCCCAAAGCTCATCCATTGAAGTGACACTTGAGCATTATAGTTGTATG GTAGATATCCTTTGCAGAAGTGGGAAGTTAAATGAAGCAGAGGATTTGGTGAAAAGCATG CCCATGAGACCAAATTTGTCAATATGGTTAGCTTTGCTTAGTGGTTGTAAGAAGCATTTA AACTTAGAACTGGCCGAAAGAGCTGCAGATAACATTTTTCATCTTGACCCAAACTGTAGT GCTGCTTATGTTTTGTTATCTAACATTTATGCCTTTTCTGGTAGATGGAATGATGTAGCA AGAGTTAGAGGAAATATGAGAAGAAGAGGAAACACCAAACAACCAGGATGCAGTTGGGTT AATCAGATGGGAATCCGGCATACATTTCTTTCTGGTGATACTTCACATCCTCTAAGTCGT AGGATATATGAAAAGCTGGAAATGTTGACGGAAAAGTTGAAGGAATATGGTTATGTCCCT GATCAAAGATATGCATTGCATGACGTAGAGGATGAACAGAAGGAAGTTCTACTGTCATAT CATAGTGAGAGGCTTGCTATTTGCTTTGCATTAATTACAACACATGGTAGTGCTATTACA GTAATGAAGAACCTGCGCGTCTGTGGGGACTGTCACTCTGCCATCAAGCTCATAGCGAAA ATTGTTGATCGTGAAATCATAGTAAGAGACTCTAGCCGCTTTCATCACTTCAGGGATGGC TTTTGTTCTTGTTCAGATTATTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g071300.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GEI5_THECC)
Sequence	MPNYVVPRCYISRSIIGLARFYRVASPTCYSILSEHLKNQRIDEAKELFERIPSPNIYLC TKMIAGYAENLRLNEALQLFDKMPVKDTVMWNLMIKGCVECGNTEMGLKLFEEMTQRNVV SYTTMISGYLKFGKVEEAESLFSEMPQRDVAAWNAMLYGYFENGRVEEAVKLFELMPYRN VISWTSVISGLDQHGRSDEALLIFKKMVNFFIEPTSSTFASVITACANARDLGLGSEIHA CVVKLGYQYDTYVTASLITLYANCMRMNDSSKVFSERLHINIVVWTSLLTGYGLNYKHKE ALKVFGDMIRIGLLPNQSSFTSALNSSCEMESIDLGKEIHGVAVKLGLNTDAFVGNSLVV LYSKCGNINDGLIAFKEIPEKNTVSWNSTIVGCAQHGFGNWALTLFAQMVRSRADMDDIT FTGLLAACSHSGMLEKGRRLFQYIPQSSSIEVTLEHYSCMVDILCRSGKLNEAEDLVKSM PMRPNLSIWLALLSGCKKHLNLELAERAADNIFHLDPNCSAAYVLLSNIYAFSGRWNDVA RVRGNMRRRGNTKQPGCSWVNQMGIRHTFLSGDTSHPLSRRIYEKLEMLTEKLKEYGYVP DQRYALHDVEDEQKEVLLSYHSERLAICFALITTHGSAITVMKNLRVCGDCHSAIKLIAK IVDREIIVRDSSRFHHFRDGFCSCSDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g071300.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GEI5_THECC)
Sequence	ATGCCTAATTATGTTGTTCCCCGTTGCTATATCTCAAGATCTATAATTGGTTTAGCAAGA TTCTACAGAGTAGCTAGCCCCACTTGCTATTCAATTCTATCTGAGCACCTAAAGAACCAA CGAATTGATGAAGCTAAAGAGCTTTTTGAAAGAATCCCATCTCCAAATATCTATTTATGC ACCAAAATGATAGCTGGGTATGCCGAAAATCTAAGGTTGAATGAGGCACTGCAGCTGTTT GACAAAATGCCTGTCAAAGATACGGTTATGTGGAACTTGATGATTAAAGGGTGTGTAGAG TGTGGGAATACGGAGATGGGTTTGAAGCTATTTGAAGAAATGACCCAAAGAAATGTAGTT TCGTACACAACGATGATTAGCGGGTATTTGAAGTTTGGAAAGGTTGAAGAGGCTGAGAGT TTGTTTTCGGAGATGCCACAAAGGGATGTGGCAGCTTGGAATGCTATGCTTTATGGGTAT TTTGAGAATGGAAGAGTTGAAGAGGCTGTTAAGTTGTTTGAGCTAATGCCTTATAGGAAT GTGATTTCGTGGACGTCGGTTATTAGTGGGCTTGATCAGCATGGGAGGAGTGATGAGGCT CTATTGATTTTCAAGAAGATGGTAAATTTCTTTATTGAACCTACTTCTAGTACTTTTGCT TCTGTTATTACAGCTTGTGCTAATGCAAGGGATTTAGGTCTAGGTAGTGAAATTCATGCC TGTGTTGTGAAGCTTGGTTATCAGTATGATACTTATGTCACTGCTTCACTAATCACATTG TATGCTAATTGCATGCGCATGAATGATTCTTCTAAGGTATTCAGCGAGAGGTTGCATATA AATATAGTTGTATGGACGTCTCTTTTGACAGGGTATGGTTTGAATTATAAGCACAAAGAA GCATTGAAAGTGTTTGGGGACATGATTAGGATTGGTCTACTTCCCAATCAATCTTCCTTC ACTAGTGCCCTAAATTCATCCTGTGAAATGGAGTCTATTGATCTTGGCAAAGAGATTCAT GGTGTAGCAGTCAAACTGGGATTGAACACTGATGCCTTTGTTGGCAATTCACTAGTTGTA TTGTATTCAAAATGTGGAAATATAAACGATGGACTCATTGCATTCAAGGAGATCCCTGAA AAAAACACAGTTTCGTGGAACTCAACCATCGTTGGATGTGCACAACATGGATTTGGTAAT TGGGCACTCACATTATTCGCCCAGATGGTTCGTTCAAGGGCTGATATGGATGATATTACA TTTACTGGGTTACTTGCTGCTTGTAGCCATTCTGGCATGCTAGAGAAAGGAAGACGCTTA TTTCAATATATCCCCCAAAGCTCATCCATTGAAGTGACACTTGAGCATTATAGTTGTATG GTAGATATCCTTTGCAGAAGTGGGAAGTTAAATGAAGCAGAGGATTTGGTGAAAAGCATG CCCATGAGACCAAATTTGTCAATATGGTTAGCTTTGCTTAGTGGTTGTAAGAAGCATTTA AACTTAGAACTGGCCGAAAGAGCTGCAGATAACATTTTTCATCTTGACCCAAACTGTAGT GCTGCTTATGTTTTGTTATCTAACATTTATGCCTTTTCTGGTAGATGGAATGATGTAGCA AGAGTTAGAGGAAATATGAGAAGAAGAGGAAACACCAAACAACCAGGATGCAGTTGGGTT AATCAGATGGGAATCCGGCATACATTTCTTTCTGGTGATACTTCACATCCTCTAAGTCGT AGGATATATGAAAAGCTGGAAATGTTGACGGAAAAGTTGAAGGAATATGGTTATGTCCCT GATCAAAGATATGCATTGCATGACGTAGAGGATGAACAGAAGGAAGTTCTACTGTCATAT CATAGTGAGAGGCTTGCTATTTGCTTTGCATTAATTACAACACATGGTAGTGCTATTACA GTAATGAAGAACCTGCGCGTCTGTGGGGACTGTCACTCTGCCATCAAGCTCATAGCGAAA ATTGTTGATCGTGAAATCATAGTAAGAGACTCTAGCCGCTTTCATCACTTCAGGGATGGC TTTTGTTCTTGTTCAGATTATTGGTAG