Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g070080.3.1
CDS Infomation	2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G10500.1)
Sequence	ATGGAAAATAAACTTGTGTCAAGTTGGTGGAAAAATGTGCAATCTTTGCCTGAGAATTAC AAGTTCCCATTAGATCAAAGACCTGGAGAACCTATTGATCCTTTAAAACATAGCACTCCA ATTATAGATTTAACTACTCATGAAGATGGAGGATATGCCCAACCTGCAATACTCGAGCAA ATAATTAAAGCCAGTCAGGATTTCGGCTATTTTCAGGTGATCAACCATGGGATTTCAGAA AAATTATTGGAAGAGACCATAGGTGTATTAAAAGAATTTTTTAACATGCCAGCTGAAGAG AAAGCAAAGTACTACTACACAGGTGACCCAAATAGCAAATGCAAACTCTACACAAGCAGT TATAATTATCAAAATGAAGATAAACATTGTTGGAGGGATACGTTAGCACATCATTGTCAT CCTCTCCAAGATAACTTGCCTTTTTGGCCAGAAAAACCTACTCATTATCGAGAAGTTATT AGTGCATATTCAATTGAAACAAGGAAACTAATCACAAAGATTTTAGATGTGATTAGTGAA GGATTAGGACTTGAAAAGGGGTATTTTGGAGGTGAATTAAGCAAAGTTCAAATGCTATCA GCTAATTATTATCCTCCATGTCCTGACCCAAATTTGGCACTTGGAATGCATAGCCATTGT GACCCAAATTTGCTCACAATTTTGCTTCAAGACAGTCATGTTTATGGCTTACAAATCTTC AAGAATGGAAAATGGATTGCTGTTGAACCTATTCCTAATGCATTTGTGGTCATCATTGGT TGCCAATTACAGATTATCAGTAACGATAGGCTAAAAAGTGTGATTCATCGAGCAGTGACA AATTCAAAAGAAACTAGAATTTGTGTGGGTAATTTTGTGATTCCTTCTTCAGATTGTCAC ATTGAACCTGCAAGTGAATTGGTTAAAAAAACAACAAATATTGCAGCATACAAATCTTAT CAGTACAAAGAGTTCTTGCACGCCTATGAAATAAAACATGGAGATTTTGAAGCTCTACTT CAATCTTATAAGCTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g070080.3.1
PEP Infomation	2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G10500.1)
Sequence	MENKLVSSWWKNVQSLPENYKFPLDQRPGEPIDPLKHSTPIIDLTTHEDGGYAQPAILEQ IIKASQDFGYFQVINHGISEKLLEETIGVLKEFFNMPAEEKAKYYYTGDPNSKCKLYTSS YNYQNEDKHCWRDTLAHHCHPLQDNLPFWPEKPTHYREVISAYSIETRKLITKILDVISE GLGLEKGYFGGELSKVQMLSANYYPPCPDPNLALGMHSHCDPNLLTILLQDSHVYGLQIF KNGKWIAVEPIPNAFVVIIGCQLQIISNDRLKSVIHRAVTNSKETRICVGNFVIPSSDCH IEPASELVKKTTNIAAYKSYQYKEFLHAYEIKHGDFEALLQSYKL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g070080.3.1
Transcript Infomation	2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G10500.1)
Sequence	AGATATTTTTTCTTAAATATAATTAATTTAGTTTTCGAAACATACAACTTTTCCTAGCCT ATAAATTTTGTCATAGAGTTTATGTGAATTTTCATAACATTTTTAATATGGAAAATAAAC TTGTGTCAAGTTGGTGGAAAAATGTGCAATCTTTGCCTGAGAATTACAAGTTCCCATTAG ATCAAAGACCTGGAGAACCTATTGATCCTTTAAAACATAGCACTCCAATTATAGATTTAA CTACTCATGAAGATGGAGGATATGCCCAACCTGCAATACTCGAGCAAATAATTAAAGCCA GTCAGGATTTCGGCTATTTTCAGGTGATCAACCATGGGATTTCAGAAAAATTATTGGAAG AGACCATAGGTGTATTAAAAGAATTTTTTAACATGCCAGCTGAAGAGAAAGCAAAGTACT ACTACACAGGTGACCCAAATAGCAAATGCAAACTCTACACAAGCAGTTATAATTATCAAA ATGAAGATAAACATTGTTGGAGGGATACGTTAGCACATCATTGTCATCCTCTCCAAGATA ACTTGCCTTTTTGGCCAGAAAAACCTACTCATTATCGAGAAGTTATTAGTGCATATTCAA TTGAAACAAGGAAACTAATCACAAAGATTTTAGATGTGATTAGTGAAGGATTAGGACTTG AAAAGGGGTATTTTGGAGGTGAATTAAGCAAAGTTCAAATGCTATCAGCTAATTATTATC CTCCATGTCCTGACCCAAATTTGGCACTTGGAATGCATAGCCATTGTGACCCAAATTTGC TCACAATTTTGCTTCAAGACAGTCATGTTTATGGCTTACAAATCTTCAAGAATGGAAAAT GGATTGCTGTTGAACCTATTCCTAATGCATTTGTGGTCATCATTGGTTGCCAATTACAGA TTATCAGTAACGATAGGCTAAAAAGTGTGATTCATCGAGCAGTGACAAATTCAAAAGAAA CTAGAATTTGTGTGGGTAATTTTGTGATTCCTTCTTCAGATTGTCACATTGAACCTGCAA GTGAATTGGTTAAAAAAACAACAAATATTGCAGCATACAAATCTTATCAGTACAAAGAGT TCTTGCACGCCTATGAAATAAAACATGGAGATTTTGAAGCTCTACTTCAATCTTATAAGC TCTAATTTATAAACTTAATTATGTATGTGTCATGTGTGTCACTATATATATCCTTTGCAA ATAAAATATATTTCTATGTTACACTTTGCTTACATATGATTAATTATTACTATTTTCTGG GTACGTGTCGCGCGCGTAGCTAAGTGTATTCATTACTATTAAATGTTAAATATTTTTGTT GCACTAAAAATTTTGAATGAATGATGCATATACATAAGAAGAATTTTTACCAGTTACTGT TACGCGGATAATTGTTAGAGTAAGAGTATTTGTTTGAAAATTAAAATAGTTATCTAATTT TGTATGGATCATTGATAATGAACTTTATACTTTTAGATCTCTTTAATATTAATTAAATAG ACAATATACTAATTCATGAGACAATGAACTAATTATAAATGCATGTATTGTCATTCAACA TATCTGCTAAGTATTTCATATTTTTCATATAAAACACAAATAATCTAATATATATAATAA TATATCTAATCTGTTATTGAGATACTTTTAATTTTATTTGAAAATAAGAAATATAACATT ATACATGTTGCACGTCAATAATTATATAAAGTCTAATAAGTAATATCTATTTAATTGTAA TGTAGACATAAAAAATTTTAAACCTATCTAACTAAAAAGGAATAAAAAAAATACATTAAA AGAACATTTAAAACTAATATAATAATCACTTACAAATAGTCATCACTATATTTTATATAA AATAGTACAAATAATTGATTATTTTGTCGTAATTCATACTACATGATTACAAAAAACGTA TTATTTCCTTCCAAGCATTTTTTTACAATTAATTAATCAATCAATCATAACGTTCTCAAT GCCATAAATAACAATAATGTTATTACCCTTAACAGTTTCTATAAAGATTGATGACAAAAA AAAATTTACGATGTATAATTATGACCAGAAAAAAAAAGAATAAGAAAATAAATATAACAA AGATGAGATAATGGATCTTAATTTATAAAGGAAAATTGACATTAACATACTTTAGTAAAA AAATCAGATATGAAATTTATAAATTCGAAAACAACTTTGATAGATTAGCGAAAGTGAAGA CAAAAATTGATCCAACAAATTTCTTTAGGTATGAACAAAGTATTCCTGCTCTATTATCTT AATTTAATTAGTAGTAATCTATGCAGTTAATTGCAAAGCCATTATATTATCGGTTTCATA AAATAGGGTTTTTATGTATTAAATAGAAGCATGATATATCGAGAAAAAATAGTGTAACAT AG