Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc02g069730.3.1
CDS Infomation

CASP-like protein (AHRD V3.3 *** K4B7V5_SOLLC)
Sequence

ATGGCTCAAGAAGGAAATGGACAAAAAATAGATGTGGCTAAGTCTAAGGTATACTATAAT
TGGGTGATGCCATTGTTGAGGTTATTGGCATTTGGTGCAACAATTTCAGCAACATTAGTT
ATGGCACTTAACAACCAAAAGAAAACTATTGTTGTTGCCACTATTGGTACCACTCCTATT
CAAGCTACTCTCAATGCTAAGTTCCAACATACTCCAGCTTTTGTGTTCTTTGTTATAGCA
AACGGACTAGTTAGTCTCCATAACCTCCTCATGCTAGCATTTTGTTTTATTGGAAATAAA
TATGATTACAAGGGACTACGATTTTATGTAATTGGAATCCTAGACATGATAAATGTGGCA
TTAATCTCTGGTGGAGCAAGTTCAGCAGCATTTATGGGACAACTTGGTAGGAATGGAAAT
TCTCATGCAAGATGGAATAAAATTTGTGATAAATTTTATACATTTTGTAACCATGGTGAA
GGAGCTATTATTGCTTCTTTTATTGGTTTGCTCTTAATGATAATTACTACTGCAATTAAT
ATAATTAAGCTTAAAAACATCAATAATTGTGCCATTAATATTCCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc02g069730.3.1
PEP Infomation

CASP-like protein (AHRD V3.3 *** K4B7V5_SOLLC)
Sequence

MAQEGNGQKIDVAKSKVYYNWVMPLLRLLAFGATISATLVMALNNQKKTIVVATIGTTPI
QATLNAKFQHTPAFVFFVIANGLVSLHNLLMLAFCFIGNKYDYKGLRFYVIGILDMINVA
LISGGASSAAFMGQLGRNGNSHARWNKICDKFYTFCNHGEGAIIASFIGLLLMIITTAIN
IIKLKNINNCAINIP*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc02g069730.3.1
Transcript Infomation

CASP-like protein (AHRD V3.3 *** K4B7V5_SOLLC)
Sequence

GCTCAGACACACTGCATATACCTACTTAGAAGATTATGTCTAAACTTGTTGCATACTTCA
TACAAAAATCTTCCTTTTTCCCACCAACTGATTAACCTAATTTGATGACTCTTTCTATAT
AAAGTGTCAGTAGGATGAAAAACAAAACATATAATACAAAATGGCTCAAGAAGGAAATGG
ACAAAAAATAGATGTGGCTAAGTCTAAGGTATACTATAATTGGGTGATGCCATTGTTGAG
GTTATTGGCATTTGGTGCAACAATTTCAGCAACATTAGTTATGGCACTTAACAACCAAAA
GAAAACTATTGTTGTTGCCACTATTGGTACCACTCCTATTCAAGCTACTCTCAATGCTAA
GTTCCAACATACTCCAGCTTTTGTGTTCTTTGTTATAGCAAACGGACTAGTTAGTCTCCA
TAACCTCCTCATGCTAGCATTTTGTTTTATTGGAAATAAATATGATTACAAGGGACTACG
ATTTTATGTAATTGGAATCCTAGACATGATAAATGTGGCATTAATCTCTGGTGGAGCAAG
TTCAGCAGCATTTATGGGACAACTTGGTAGGAATGGAAATTCTCATGCAAGATGGAATAA
AATTTGTGATAAATTTTATACATTTTGTAACCATGGTGAAGGAGCTATTATTGCTTCTTT
TATTGGTTTGCTCTTAATGATAATTACTACTGCAATTAATATAATTAAGCTTAAAAACAT
CAATAATTGTGCCATTAATATTCCTTAATCAAGAATATCCTAATTGTCATTTCATTTTTT
TTTTCTCAAACTTGTATGGTTTTCGATTGTTGTATTGTAATGTCCTCTTAATGTAATGTT
CATTTTAATGATAATTTTCGTATTGGCTTTAATGCATTAATTCCCCCACCCCCACCCCCC
CCAAAAAAAAACAAAAAAAAAATGTATATATGTAAGTTTAATTTATGATATCGATATTAT
AAAGAAATTCTTATGTTATCATGTTTTTAAAATATTATAAGGTTTTCTTTTATATATATA
TATATATATATATATATATATATATATATATGATTTTCAAGAGGTTCATATTTAAAGTAA
TCATTTTGATAGCAAAATTAACGTACAATATGTGTGTCGGTTTCAAGATATACAATTCAT
TATTCTTCTTCTTTGTATAATTTTATACTTACTAAATTTGTTAAAATGACCTAGTTTTTT
ATAGTTGATATAGGAAAAAAGGTACTATGAGTTATTTTTTGTT