Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g069500.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XQS1_CYNCS)
Sequence	ATGTTGTTTCAAAGCAAGAACATCTGTTCAATCTACAGAAGGAGTATCTCAGTCGCTGCT GCATTTTCCTCAAAACCCAATTCCCCTTTCATCCAAGATTCAGTTATTCACTGCACAGAA GAAGTTTTAGCATCGAAACTAGCTCCAATTTTGCAATCTTGCAACAGTTCTGCAGAAAAT CTTGGTTCTGTTATTCGTAAAGGGGAGCAGGTTCATGCCCAGGTAACTGTAAATGGAATT GACAACTTGGGTATTCTTGGTACGAGAATCTTGGGGATGTATGTTTTGTGTAACAGGTTT ATCGATGCCAAGAAATTGTTTTTTCAGCTTCGGTTGTGTTATGCTTCTCCTTGGAATTGG ATGATTAGAGGGTATACAATAATGGGTCGTTTTGATCTTGCAATCTTGTTGTTCTTTAAG ATGTTGGTGTTTGGTACTTACCCTGATAAATACACTTTTCCTTATGTGATTAAGGCTTGT GCTGGTGTAAATGCTGTGAGTTTCGGTAAATGGCTACATCGGTTGGTACAAAGTTTAGGT TTTGAGGATGATGTGTTTGTAGGTAGTGCTTTTATTAAGTTTTATGCGGAGAATGGTTGT TTGGATGATGCTCGTCTTTTGTTCGACAAAATGTATCAAAGGGATAGTGTATTGTGGAAT GTGATGCTTAATGGTTATGCTAAAGATGAACAGTCTGTGAATGATGTGGTTGGGTTATTT ATGGAAATGAGGAAAAGTGAAACTAAGCCTAATTCAGTAACATATGCTTGTGTTCTTTCT GTTTGTGCGTCGGAAACAATGGTTAAATTTGGTTGTCAGCTTCATGGGCTTGTTGTGCGA TGTGGGTTGGAAATGGATTCTCCAGTAGCTAATACATTGATTGCGATGTACGCTAAATTC TGTTCCTTGTTTGATGCACGCAAGATCTTTGATTTAGTGTCACAAGCAGATCGTGTGACT TGGAATGGGATGATTGGAGGGTATGTACAGAATGGGTATATCGATGAGGCGCTGGATTTA TTTCGGGAAATGGTAGCTAGCAGTGTCAAGCCAGACTCTATCACCTTTGCCAGTTTGCTC CCCTCTGTTTCTATATCGGAAGATTTGTACCAGGGGAAGGCGATTCATGGTTATATCGTG AGAAATGATGTATCTATTGATGTTTTCTTAAAGAATGCCATTATTGACATGTACTTTAAG TGCAGGAATGTTGTGGCAGCACGCAACATATTTAGCTGCAGCCCTGCGGTGGATGTTGTT ATTTGTACTGCTATGATTTCAGGATTTATTCTTAATGCCATGAGTTCTGATGCCATAGAT GTTTTCCGATGGTTACTTAATAAGAATATGAGGCCCAATCCTGTTACTCTAGCAAGTACC TTACCCGCTTGTTCTGGTTTGGCTGCTTTGAGATTAGGTAAGGAACTGCATGGTGTCATT GTTAAGCGCAGCTTTCAAGGAATACTTTATGTGGGAAGTGCGGTGATGGACATGTATGCA AAGTGTGGAAGATTGGATCTTGCTCAACAAGTTTTCAGAAGGATGCCTGAAAGAGATGTC GTTTGTTGGAATTCGATGATCACGAGCTGTTGCCAGAATGCTGAACCGGAATTGGCCATT GACTTCTTCCAACAGATGGGTGCAATTGGAGCCAAGTATGATTGTGTCAGCATATCCAGT GCTCTTTCTGCTTGTGCGAATTTGCCAGCTCTCCATTATGGGAAAGAGATCCATGGCTTC GTTATGAAAAGTGCATTAAGCTCTGATCTTTTTGTGGAAAGTGCGTTAATAGATATGTAT GCTAAATGTGGGAACTTAGAGGTAGCTTGGCGCGTATTTGACTTAATGGCACACAAGAAT GAAGTATCATGGAATAGTATTATTGCAGCTTATGGAAATCATGGCCGACTGAAGGACTGC CTGAATTTGTTTCATGGAATGAGAAAAGATGGATTCCAGCCTGACCACGTCACTTTTCTT GCGATCATATCTGCTTGTGGCCACTCTGGTCGAGTTGAAGAGGGAAAACACTACTTCAAT TGCATGACTAATGAATATGGGATTACACCGCGAACAGAGCATTATGCATGCATGGTTGAC TTGTTTGGGAGAGCTGGTCTCGTGGAAGAAGCATTTGGCGTGATTAAGAGCATGCCATTT GCTCCAGATGCAGGCATTTGGGGGACATTACTTGGGGCTTGTCGATTACATGGCAATACC GAGCTTGCTGAAATGGCTTCTGAGCATCTTTTGAGCCTGGACCCCCAAAATTCCGGCTAC TATATGTTACAATCAAATCTACATGCTAACGCTGGCAAATGGGATATGGTTTCTAAAATT CGACATATGATGAAGGAAAGAGGAGTGCAGAAAGTACCTGGTTACAGCTGGACTGAAGTT AACAACAGCACTCATATTTTTGTTGCTGCAGATGCGAGTCACCCGCAGTCTGCTCAGATA TATCTTTTATTAGACAATCTTCTAATAGAGCTGCAAAATGAGGGTTATGTTCCTCAAATG AATCTTCAAATACAACAGTCATCATCCCCAGAACTCTGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g069500.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XQS1_CYNCS)
Sequence	MLFQSKNICSIYRRSISVAAAFSSKPNSPFIQDSVIHCTEEVLASKLAPILQSCNSSAEN LGSVIRKGEQVHAQVTVNGIDNLGILGTRILGMYVLCNRFIDAKKLFFQLRLCYASPWNW MIRGYTIMGRFDLAILLFFKMLVFGTYPDKYTFPYVIKACAGVNAVSFGKWLHRLVQSLG FEDDVFVGSAFIKFYAENGCLDDARLLFDKMYQRDSVLWNVMLNGYAKDEQSVNDVVGLF MEMRKSETKPNSVTYACVLSVCASETMVKFGCQLHGLVVRCGLEMDSPVANTLIAMYAKF CSLFDARKIFDLVSQADRVTWNGMIGGYVQNGYIDEALDLFREMVASSVKPDSITFASLL PSVSISEDLYQGKAIHGYIVRNDVSIDVFLKNAIIDMYFKCRNVVAARNIFSCSPAVDVV ICTAMISGFILNAMSSDAIDVFRWLLNKNMRPNPVTLASTLPACSGLAALRLGKELHGVI VKRSFQGILYVGSAVMDMYAKCGRLDLAQQVFRRMPERDVVCWNSMITSCCQNAEPELAI DFFQQMGAIGAKYDCVSISSALSACANLPALHYGKEIHGFVMKSALSSDLFVESALIDMY AKCGNLEVAWRVFDLMAHKNEVSWNSIIAAYGNHGRLKDCLNLFHGMRKDGFQPDHVTFL AIISACGHSGRVEEGKHYFNCMTNEYGITPRTEHYACMVDLFGRAGLVEEAFGVIKSMPF APDAGIWGTLLGACRLHGNTELAEMASEHLLSLDPQNSGYYMLQSNLHANAGKWDMVSKI RHMMKERGVQKVPGYSWTEVNNSTHIFVAADASHPQSAQIYLLLDNLLIELQNEGYVPQM NLQIQQSSSPELC*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g069500.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XQS1_CYNCS)
Sequence	ATGTTGTTTCAAAGCAAGAACATCTGTTCAATCTACAGAAGGAGTATCTCAGTCGCTGCT GCATTTTCCTCAAAACCCAATTCCCCTTTCATCCAAGATTCAGTTATTCACTGCACAGAA GAAGTTTTAGCATCGAAACTAGCTCCAATTTTGCAATCTTGCAACAGTTCTGCAGAAAAT CTTGGTTCTGTTATTCGTAAAGGGGAGCAGGTTCATGCCCAGGTAACTGTAAATGGAATT GACAACTTGGGTATTCTTGGTACGAGAATCTTGGGGATGTATGTTTTGTGTAACAGGTTT ATCGATGCCAAGAAATTGTTTTTTCAGCTTCGGTTGTGTTATGCTTCTCCTTGGAATTGG ATGATTAGAGGGTATACAATAATGGGTCGTTTTGATCTTGCAATCTTGTTGTTCTTTAAG ATGTTGGTGTTTGGTACTTACCCTGATAAATACACTTTTCCTTATGTGATTAAGGCTTGT GCTGGTGTAAATGCTGTGAGTTTCGGTAAATGGCTACATCGGTTGGTACAAAGTTTAGGT TTTGAGGATGATGTGTTTGTAGGTAGTGCTTTTATTAAGTTTTATGCGGAGAATGGTTGT TTGGATGATGCTCGTCTTTTGTTCGACAAAATGTATCAAAGGGATAGTGTATTGTGGAAT GTGATGCTTAATGGTTATGCTAAAGATGAACAGTCTGTGAATGATGTGGTTGGGTTATTT ATGGAAATGAGGAAAAGTGAAACTAAGCCTAATTCAGTAACATATGCTTGTGTTCTTTCT GTTTGTGCGTCGGAAACAATGGTTAAATTTGGTTGTCAGCTTCATGGGCTTGTTGTGCGA TGTGGGTTGGAAATGGATTCTCCAGTAGCTAATACATTGATTGCGATGTACGCTAAATTC TGTTCCTTGTTTGATGCACGCAAGATCTTTGATTTAGTGTCACAAGCAGATCGTGTGACT TGGAATGGGATGATTGGAGGGTATGTACAGAATGGGTATATCGATGAGGCGCTGGATTTA TTTCGGGAAATGGTAGCTAGCAGTGTCAAGCCAGACTCTATCACCTTTGCCAGTTTGCTC CCCTCTGTTTCTATATCGGAAGATTTGTACCAGGGGAAGGCGATTCATGGTTATATCGTG AGAAATGATGTATCTATTGATGTTTTCTTAAAGAATGCCATTATTGACATGTACTTTAAG TGCAGGAATGTTGTGGCAGCACGCAACATATTTAGCTGCAGCCCTGCGGTGGATGTTGTT ATTTGTACTGCTATGATTTCAGGATTTATTCTTAATGCCATGAGTTCTGATGCCATAGAT GTTTTCCGATGGTTACTTAATAAGAATATGAGGCCCAATCCTGTTACTCTAGCAAGTACC TTACCCGCTTGTTCTGGTTTGGCTGCTTTGAGATTAGGTAAGGAACTGCATGGTGTCATT GTTAAGCGCAGCTTTCAAGGAATACTTTATGTGGGAAGTGCGGTGATGGACATGTATGCA AAGTGTGGAAGATTGGATCTTGCTCAACAAGTTTTCAGAAGGATGCCTGAAAGAGATGTC GTTTGTTGGAATTCGATGATCACGAGCTGTTGCCAGAATGCTGAACCGGAATTGGCCATT GACTTCTTCCAACAGATGGGTGCAATTGGAGCCAAGTATGATTGTGTCAGCATATCCAGT GCTCTTTCTGCTTGTGCGAATTTGCCAGCTCTCCATTATGGGAAAGAGATCCATGGCTTC GTTATGAAAAGTGCATTAAGCTCTGATCTTTTTGTGGAAAGTGCGTTAATAGATATGTAT GCTAAATGTGGGAACTTAGAGGTAGCTTGGCGCGTATTTGACTTAATGGCACACAAGAAT GAAGTATCATGGAATAGTATTATTGCAGCTTATGGAAATCATGGCCGACTGAAGGACTGC CTGAATTTGTTTCATGGAATGAGAAAAGATGGATTCCAGCCTGACCACGTCACTTTTCTT GCGATCATATCTGCTTGTGGCCACTCTGGTCGAGTTGAAGAGGGAAAACACTACTTCAAT TGCATGACTAATGAATATGGGATTACACCGCGAACAGAGCATTATGCATGCATGGTTGAC TTGTTTGGGAGAGCTGGTCTCGTGGAAGAAGCATTTGGCGTGATTAAGAGCATGCCATTT GCTCCAGATGCAGGCATTTGGGGGACATTACTTGGGGCTTGTCGATTACATGGCAATACC GAGCTTGCTGAAATGGCTTCTGAGCATCTTTTGAGCCTGGACCCCCAAAATTCCGGCTAC TATATGTTACAATCAAATCTACATGCTAACGCTGGCAAATGGGATATGGTTTCTAAAATT CGACATATGATGAAGGAAAGAGGAGTGCAGAAAGTACCTGGTTACAGCTGGACTGAAGTT AACAACAGCACTCATATTTTTGTTGCTGCAGATGCGAGTCACCCGCAGTCTGCTCAGATA TATCTTTTATTAGACAATCTTCTAATAGAGCTGCAAAATGAGGGTTATGTTCCTCAAATG AATCTTCAAATACAACAGTCATCATCCCCAGAACTCTGTTGA