Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g068640.3.1
CDS Infomation	Pyrroline-5-carboxylate reductase (AHRD V3.3 *** A0A0V0HW05_SOLCH)
Sequence	ATGGCGAATGTTTGTCCAATTCCAACCGATTCATACAAGCTGGGCTTTATAGGAGCTGGT AAAATGGCTGAAAGTATAGCTAGAGGTGTGGTTAAGTCTGGGATATTGCCTGCTTCTCGT ATTCGAACAGCCCATTCTGGATCAGCTCGTCGTACTGCTTTTGAGTCTATTGGGGTTACT GTTTTAGATAATAATAGTCAGGTGGTTGAAGATAGTGATGTGATTATATTCTCTGTGAAG CCTCAAGTGGTTAAAAATGTGGTGTCAGAGTTGAAGCCAATCCTTTCAGAGAAGAAGCTT TTGGTGTCAGTTGCTGCTGGTATTAAGTTAAAGGATTTGCAGGAATGGGCAGGTCAAGGC CGATTTATTAGGGTGATGCCAAACACTCCCTCTGCTGTTGGTGAAGCCGCCACTGTCATC ACTTTGGGGGAAAAGGCAACAACCGAAGATGGAGAGTTAATTTCCCAGTTATTTGGAGCT ATTGGTAAGGTGTGGAAAGCTGATGAGAAGCTGTTTGATGCAGTTACAGGTTTAAGTGGT AGTGGACCAGCCTATGTTTTTCTAGCAATAGAGGCATTGGCTGATGGAGGGGTGGCTGCT GGTTTACCGAGGGAGCTTGCACTTGGACTAGCCTCTCAAACCGTACTAGGAGCAGCATCA ATGGTCTCCGGTATGAGCAAGCATCCTGGTCAACATAAAGATGATGTTGCATCACCTGGG GGTACAACCATTGCTGGAATTCACGAGTTGGAGAAGTCTGGATTTCGCGGTATCTTGATG AATGCAGTTGTTGCTGCAGCTAAACGAAGTAAAGAGCTTTCTCAGAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g068640.3.1
PEP Infomation	Pyrroline-5-carboxylate reductase (AHRD V3.3 *** A0A0V0HW05_SOLCH)
Sequence	MANVCPIPTDSYKLGFIGAGKMAESIARGVVKSGILPASRIRTAHSGSARRTAFESIGVT VLDNNSQVVEDSDVIIFSVKPQVVKNVVSELKPILSEKKLLVSVAAGIKLKDLQEWAGQG RFIRVMPNTPSAVGEAATVITLGEKATTEDGELISQLFGAIGKVWKADEKLFDAVTGLSG SGPAYVFLAIEALADGGVAAGLPRELALGLASQTVLGAASMVSGMSKHPGQHKDDVASPG GTTIAGIHELEKSGFRGILMNAVVAAAKRSKELSQN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g068640.3.1
Transcript Infomation	Pyrroline-5-carboxylate reductase (AHRD V3.3 *** A0A0V0HW05_SOLCH)
Sequence	AGTTATCACAAAAATAGCGGCATATGGTACATAATATTATTTTTTATTTATATAAAGATA ATTTTATGAGTTAGATATGAGTGGCGATGTATTTAACAAAAAATTTGTTTAAAATAGTAC CTAATATATAGACCTAGAAATACAAATTTGTGCCGAGTATTAAGGCCCTAAACAGTCGCT TAAATAAGAAGAAGAGTGATGCATTAAAACACATCAGCTACTCTTCGTCTTGCCGCCTTC ACTGATTTCAGAAGAAAAGTTGTATCTTTACTGTTACATAATTTCCAAATGGCGAATGTT TGTCCAATTCCAACCGATTCATACAAGCTGGGCTTTATAGGAGCTGGTAAAATGGCTGAA AGTATAGCTAGAGGTGTGGTTAAGTCTGGGATATTGCCTGCTTCTCGTATTCGAACAGCC CATTCTGGATCAGCTCGTCGTACTGCTTTTGAGTCTATTGGGGTTACTGTTTTAGATAAT AATAGTCAGGTGGTTGAAGATAGTGATGTGATTATATTCTCTGTGAAGCCTCAAGTGGTT AAAAATGTGGTGTCAGAGTTGAAGCCAATCCTTTCAGAGAAGAAGCTTTTGGTGTCAGTT GCTGCTGGTATTAAGTTAAAGGATTTGCAGGAATGGGCAGGTCAAGGCCGATTTATTAGG GTGATGCCAAACACTCCCTCTGCTGTTGGTGAAGCCGCCACTGTCATCACTTTGGGGGAA AAGGCAACAACCGAAGATGGAGAGTTAATTTCCCAGTTATTTGGAGCTATTGGTAAGGTG TGGAAAGCTGATGAGAAGCTGTTTGATGCAGTTACAGGTTTAAGTGGTAGTGGACCAGCC TATGTTTTTCTAGCAATAGAGGCATTGGCTGATGGAGGGGTGGCTGCTGGTTTACCGAGG GAGCTTGCACTTGGACTAGCCTCTCAAACCGTACTAGGAGCAGCATCAATGGTCTCCGGT ATGAGCAAGCATCCTGGTCAACATAAAGATGATGTTGCATCACCTGGGGGTACAACCATT GCTGGAATTCACGAGTTGGAGAAGTCTGGATTTCGCGGTATCTTGATGAATGCAGTTGTT GCTGCAGCTAAACGAAGTAAAGAGCTTTCTCAGAATTAATCTACTTATCTCTATTAAGGT CATGGAGAACCAGCCGGAAGCTATTATATATGTCTAGCAGAGTTTTTTAAGTGCTAAATT ATTATGTGAAAGGTGCTGAGCTTTTTGACCAAAATAAAGCACCGTATCTGTTAAACTTTT TGGACCAACATGCCCACATTTTATTAAAGAGGCTTGTGGCACAATCACAATCACTATAAA TAAACATTATTTATAGTTATTGCTCTC