Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g014360.3.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G14850.1)
Sequence	ATGCCCTTGCTGAACGCCAACGCTCTTGGATGGCTGATTGAATCGGCTTTATCAACTCAA TCGCTTCTTCTTGGTCGAGCTATTCATGCCCATATCATCAGAACTATTGAACCCCCTTTT CCACCTTTTCTCTCTAACCATCTCATCAACTTCTATTCCAAACTTGATTCCCTCAACTCA GCTCAACTCCTTCTTTCACTCACTCCGCCCCCTTTCCGTTCCGTCGTCACCTGGACCGCT CTCATTGCTGGCTCCGTTCAAAATGGTCATTTTACTTCTGCCCTTCTACATTTCTCTGAC ATGCGTTGCCAGTCTGTTCAACCCAATGACTTCACCTTCCCTTGTCTTTTCAAAGCTTCC GCTTTCTTGCATTACCCCCTCATGGGCCTGCAGCTTCATGCACTGGCACTGAAAGGTAGC TTCATTAACGATGCGTTTGTTGGCTGTAGCGCATTTGATATGTATTGTAAAACCGGTCTG CGGGAATATGCGCAGAAGGTGTTTGATGAAATGCCGCACAGGAATATTGCAACGTGGAAC GCTTGTATTTCTAATTCCGTGCTTGACGGAAGACCTTATGATGCTTCTCTAAAATTTGTT GAGCTTTTAAGACTAGGTGAAGAGCCACCTAATTCTATTACTTTTTCTGTGTTTTTGAAT GCTTGCTCGGATGGTTTGTATTTGAAGCTTGGGCAGCAGTTGCATGGTTATGTTATTCGA CTTGGCTTTGGATCAGATGTCTCTGTTCTAAATGGAATGGTTGATTTTTATGGAAAATGT CACCAGGTGAAGTATTCAGAGCTAGTTTTCAATGAGATAAATGTGTGTAATGGTGTATCA TGGTCCACCATGTTGGCAGTGTATGAACAGAATGATATATGGGACAAAGCTTTTATGCTG TTTCTTAAGGCAAGGAAGGAAGGTATTAAGCCAACTGAATTCATGGTTTCAAGTGTGCTT AGTGCTTGTGCAGGAACGGCAGTGCTTGAGCTGGGGAGGTCTATTCATGGTCTTGCAGTA AAGGCTTGTATCGAGCATAACGTATTTGTTGGCAGTGCACTTGTTGACATGTATGGTAAA TGTGGTAGCATAGAAAATTGTGAGAGCGCCTTCTATGAAATGCCCGAGAGGAATTTGATA ACTTGGAATGCAGTAATGGGTGGTTATGCTCATCAAGGGTGTGCAGATATGGCATTGCGT TTGTTTGAGGAGATGACTAGTGAAAGTCATGATGTGGTGCCTAGTTATGTGACATTTATT TGTGTATTGACAGCTTGTAGTAGGGCTGGAGCTGTTAAAATAGGCATGGATATCTTTGAA TCTATGCGGAAGAAGTATGGGATCGAACCAGGGCCAGAGCATTATGCATGTGTTGTGGAC ATACTTGGAAGGGCTGGTTTGGTAGAGCGTGCATACGACTTTATCAAGAAAATGCCTGTT CCACCTACAGTATCAGTCTGGGGAGCTCTTTTAGGGGCTTGTAGAGTTCATGGGAAACCT GAACTAGGGAAGGTTGCGGCTGACAATTTGTTTCGACTTGATCCTTTGGACTCTGGAAAC CATGTCGTTCTTTCTAATATGTTTGCTGCTGCTGGAAGGTGGCATGAGGCTAATCTTGTT AGAAAGGAGATGAAGGATGTTGGCATCACAAAAGGGGCTGGAATTAGTTGGATATCTGCA AAGAATTCTATCCATGTTTTCCAAGCTAAGGATACAACTCATGAGAGATACCCAGAGATT CAAGCAATGCTGGCCAAGTTAAGGAGAGATATGAAAGCAGAAGGTTATATTGCCGACACA AATTCTGCACTATACGACTTAGAGGAGGAAGAGAAGGAATCAGAAGTTTGGCATCACAGT GAAAAAATTGCACTTGCATTTGGTCTCATTACTATACCTCCTGGAGTCCCAATAAGGATT ACAAAAAACCTGAGGGTTTGTGTGGATTGCCATAGTGCAATAAAGTTCATCTCGGGCATT ACTGGTAGAGAAATTGTTGTGAGAGATAACAACCGCTTCCATTCCTTCAAGGACTACCAG TGCTCATGTAGAGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g014360.3.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G14850.1)
Sequence	MPLLNANALGWLIESALSTQSLLLGRAIHAHIIRTIEPPFPPFLSNHLINFYSKLDSLNS AQLLLSLTPPPFRSVVTWTALIAGSVQNGHFTSALLHFSDMRCQSVQPNDFTFPCLFKAS AFLHYPLMGLQLHALALKGSFINDAFVGCSAFDMYCKTGLREYAQKVFDEMPHRNIATWN ACISNSVLDGRPYDASLKFVELLRLGEEPPNSITFSVFLNACSDGLYLKLGQQLHGYVIR LGFGSDVSVLNGMVDFYGKCHQVKYSELVFNEINVCNGVSWSTMLAVYEQNDIWDKAFML FLKARKEGIKPTEFMVSSVLSACAGTAVLELGRSIHGLAVKACIEHNVFVGSALVDMYGK CGSIENCESAFYEMPERNLITWNAVMGGYAHQGCADMALRLFEEMTSESHDVVPSYVTFI CVLTACSRAGAVKIGMDIFESMRKKYGIEPGPEHYACVVDILGRAGLVERAYDFIKKMPV PPTVSVWGALLGACRVHGKPELGKVAADNLFRLDPLDSGNHVVLSNMFAAAGRWHEANLV RKEMKDVGITKGAGISWISAKNSIHVFQAKDTTHERYPEIQAMLAKLRRDMKAEGYIADT NSALYDLEEEEKESEVWHHSEKIALAFGLITIPPGVPIRITKNLRVCVDCHSAIKFISGI TGREIVVRDNNRFHSFKDYQCSCRDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g014360.3.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G14850.1)
Sequence	TAATATGTAAGGGGTGGAATAATAGACAAAAGGAGATGGTTTCCTATATTTATCAGCGTA GTGAATTATTTTAAAGGTTTTTTAAATTATAGAACATTGGCGTGGCTAAGTAGGTAGGGA GTGGATGCCCTTGCTGAACGCCAACGCTCTTGGATGGCTGATTGAATCGGCTTTATCAAC TCAATCGCTTCTTCTTGGTCGAGCTATTCATGCCCATATCATCAGAACTATTGAACCCCC TTTTCCACCTTTTCTCTCTAACCATCTCATCAACTTCTATTCCAAACTTGATTCCCTCAA CTCAGCTCAACTCCTTCTTTCACTCACTCCGCCCCCTTTCCGTTCCGTCGTCACCTGGAC CGCTCTCATTGCTGGCTCCGTTCAAAATGGTCATTTTACTTCTGCCCTTCTACATTTCTC TGACATGCGTTGCCAGTCTGTTCAACCCAATGACTTCACCTTCCCTTGTCTTTTCAAAGC TTCCGCTTTCTTGCATTACCCCCTCATGGGCCTGCAGCTTCATGCACTGGCACTGAAAGG TAGCTTCATTAACGATGCGTTTGTTGGCTGTAGCGCATTTGATATGTATTGTAAAACCGG TCTGCGGGAATATGCGCAGAAGGTGTTTGATGAAATGCCGCACAGGAATATTGCAACGTG GAACGCTTGTATTTCTAATTCCGTGCTTGACGGAAGACCTTATGATGCTTCTCTAAAATT TGTTGAGCTTTTAAGACTAGGTGAAGAGCCACCTAATTCTATTACTTTTTCTGTGTTTTT GAATGCTTGCTCGGATGGTTTGTATTTGAAGCTTGGGCAGCAGTTGCATGGTTATGTTAT TCGACTTGGCTTTGGATCAGATGTCTCTGTTCTAAATGGAATGGTTGATTTTTATGGAAA ATGTCACCAGGTGAAGTATTCAGAGCTAGTTTTCAATGAGATAAATGTGTGTAATGGTGT ATCATGGTCCACCATGTTGGCAGTGTATGAACAGAATGATATATGGGACAAAGCTTTTAT GCTGTTTCTTAAGGCAAGGAAGGAAGGTATTAAGCCAACTGAATTCATGGTTTCAAGTGT GCTTAGTGCTTGTGCAGGAACGGCAGTGCTTGAGCTGGGGAGGTCTATTCATGGTCTTGC AGTAAAGGCTTGTATCGAGCATAACGTATTTGTTGGCAGTGCACTTGTTGACATGTATGG TAAATGTGGTAGCATAGAAAATTGTGAGAGCGCCTTCTATGAAATGCCCGAGAGGAATTT GATAACTTGGAATGCAGTAATGGGTGGTTATGCTCATCAAGGGTGTGCAGATATGGCATT GCGTTTGTTTGAGGAGATGACTAGTGAAAGTCATGATGTGGTGCCTAGTTATGTGACATT TATTTGTGTATTGACAGCTTGTAGTAGGGCTGGAGCTGTTAAAATAGGCATGGATATCTT TGAATCTATGCGGAAGAAGTATGGGATCGAACCAGGGCCAGAGCATTATGCATGTGTTGT GGACATACTTGGAAGGGCTGGTTTGGTAGAGCGTGCATACGACTTTATCAAGAAAATGCC TGTTCCACCTACAGTATCAGTCTGGGGAGCTCTTTTAGGGGCTTGTAGAGTTCATGGGAA ACCTGAACTAGGGAAGGTTGCGGCTGACAATTTGTTTCGACTTGATCCTTTGGACTCTGG AAACCATGTCGTTCTTTCTAATATGTTTGCTGCTGCTGGAAGGTGGCATGAGGCTAATCT TGTTAGAAAGGAGATGAAGGATGTTGGCATCACAAAAGGGGCTGGAATTAGTTGGATATC TGCAAAGAATTCTATCCATGTTTTCCAAGCTAAGGATACAACTCATGAGAGATACCCAGA GATTCAAGCAATGCTGGCCAAGTTAAGGAGAGATATGAAAGCAGAAGGTTATATTGCCGA CACAAATTCTGCACTATACGACTTAGAGGAGGAAGAGAAGGAATCAGAAGTTTGGCATCA CAGTGAAAAAATTGCACTTGCATTTGGTCTCATTACTATACCTCCTGGAGTCCCAATAAG GATTACAAAAAACCTGAGGGTTTGTGTGGATTGCCATAGTGCAATAAAGTTCATCTCGGG CATTACTGGTAGAGAAATTGTTGTGAGAGATAACAACCGCTTCCATTCCTTCAAGGACTA CCAGTGCTCATGTAGAGATTATTGGTGAATCTAGTTTAAGCTCCTTGCCGTTGATTCAGG CATTGAGTCACACTCGTGATACTGCTGCAGCAATAGGAGTGATGTTAGGATTGAGGATCT GAACTAGAAGATATCACCTCCATAATTTTTCTTCACTTCCAAGGCCAAGCTGTAATTGCA TACAAGGTGCACCATCCCTTGCTAGAGTCTTTATTGTGTATTTTAGTGCCTTGGATGTTA CTTTCCTCCGCAGCATTACATTTGCACGGTGA